Podcast
Questions and Answers
מהו תפקידו העיקרי של חלבון MutS בתהליך התיקון באי-קולי?
מהו תפקידו העיקרי של חלבון MutS בתהליך התיקון באי-קולי?
- הוספת קבוצות מתיל לגדיל ה-DNA החדש
- זיהוי אי-התאמות (mismatches) ברצף ה-DNA (correct)
- הסרת נוקליאוטידים פגומים מה-DNA
- זיהוי גדילים חדשים שאינם ממותלים
כיצד מערכת התיקון באי-קולי מבדילה בין הגדיל החדש לגדיל הישן?
כיצד מערכת התיקון באי-קולי מבדילה בין הגדיל החדש לגדיל הישן?
- על ידי גודל הגדיל
- על ידי רמת המתילציה השונה בין הגדילים (correct)
- על ידי טמפרטורת ההתכה של הגדיל
- על ידי זיהוי רצפים ייחודיים לגדיל החדש
מהו היתרון העיקרי של מנגנון ה-proofreading של דנא פולימראז, בהשוואה לפעילותו הבסיסית?
מהו היתרון העיקרי של מנגנון ה-proofreading של דנא פולימראז, בהשוואה לפעילותו הבסיסית?
- הפחתת שכיחות הטעויות פי 100,000. (correct)
- תיקון טעויות שנעשו על ידי מערכת ה-mismatch repair.
- יצירת מוטציות מועילות בדנא.
- העלאת שכיחות הטעויות פי 10.
כיצד מערכת ה-mismatch repair system תורמת לדיוק השכפול של הדנא?
כיצד מערכת ה-mismatch repair system תורמת לדיוק השכפול של הדנא?
מה יקרה אם חלבון MutS לא יתפקד כראוי בתא?
מה יקרה אם חלבון MutS לא יתפקד כראוי בתא?
איזה מהבאים אינו מאפיין של תהליך התיקון באי-קולי?
איזה מהבאים אינו מאפיין של תהליך התיקון באי-קולי?
מהי שכיחות הטעויות הסופית בשכפול הדנא לאחר פעולתם של דנא פולימראז ומערכת ה-mismatch repair?
מהי שכיחות הטעויות הסופית בשכפול הדנא לאחר פעולתם של דנא פולימראז ומערכת ה-mismatch repair?
איזו מהפעולות הבאות אינה מתבצעת על ידי דנא פולימראז במהלך שכפול?
איזו מהפעולות הבאות אינה מתבצעת על ידי דנא פולימראז במהלך שכפול?
מה החשיבות של מתילציה בגדילי ה-DNA בתהליך התיקון באי-קולי?
מה החשיבות של מתילציה בגדילי ה-DNA בתהליך התיקון באי-קולי?
מה יהיה ההשפעה העיקרית של פגיעה במערכת ה-mismatch repair על תאים?
מה יהיה ההשפעה העיקרית של פגיעה במערכת ה-mismatch repair על תאים?
מהו התפקיד העיקרי של מנגנון התיקון mismatch repair?
מהו התפקיד העיקרי של מנגנון התיקון mismatch repair?
מה קורה כאשר דנא פולימראז מזהה בסיס שגוי במהלך שכפול?
מה קורה כאשר דנא פולימראז מזהה בסיס שגוי במהלך שכפול?
מדוע חשובה ההבחנה בין גדיל DNA ממותל להמי-ממותל בתהליך התיקון?
מדוע חשובה ההבחנה בין גדיל DNA ממותל להמי-ממותל בתהליך התיקון?
מה קורה לאחר שהמרווח נוצר בתהליך תיקון ה-DNA?
מה קורה לאחר שהמרווח נוצר בתהליך תיקון ה-DNA?
מהו התפקיד העיקרי של דנא פולימראז בתהליך השכפול?
מהו התפקיד העיקרי של דנא פולימראז בתהליך השכפול?
איזה אנזים ממלא תפקיד חיוני בשלב הסופי של תיקון mismatch repair?
איזה אנזים ממלא תפקיד חיוני בשלב הסופי של תיקון mismatch repair?
כיצד מבטיח דנא פולימראז דיוק גבוה בשכפול הדנא?
כיצד מבטיח דנא פולימראז דיוק גבוה בשכפול הדנא?
באיזה מרחק מתרחש פירוק הגדיל ביחס ל-mismatch?
באיזה מרחק מתרחש פירוק הגדיל ביחס ל-mismatch?
מה יקרה אם דנא פולימראז יכשל בזיהוי בסיס שגוי במהלך השכפול?
מה יקרה אם דנא פולימראז יכשל בזיהוי בסיס שגוי במהלך השכפול?
מה ההבדל העיקרי בין פעולת דנא פולימראז לפעולת רנא פולימראז?
מה ההבדל העיקרי בין פעולת דנא פולימראז לפעולת רנא פולימראז?
מה יקרה אם מערכת תיקון DNA תסיר את הנוקלאוטיד הנכון במהלך תיקון?
מה יקרה אם מערכת תיקון DNA תסיר את הנוקלאוטיד הנכון במהלך תיקון?
כיצד מבדילה מערכת התיקון של אי-קולי בין גדיל DNA חדש לישן?
כיצד מבדילה מערכת התיקון של אי-קולי בין גדיל DNA חדש לישן?
מהו התפקיד של קבוצות המתיל בגדיל ה-DNA הישן בחיידקי אי-קולי?
מהו התפקיד של קבוצות המתיל בגדיל ה-DNA הישן בחיידקי אי-קולי?
מה יקרה אם מערכת התיקון תטעה ותסיר את הנוקלאוטיד הנכון בגדיל הישן במקום את השגוי בגדיל החדש?
מה יקרה אם מערכת התיקון תטעה ותסיר את הנוקלאוטיד הנכון בגדיל הישן במקום את השגוי בגדיל החדש?
מה החשיבות של הבחנה נכונה בין גדיל DNA ישן לחדש בתהליך התיקון?
מה החשיבות של הבחנה נכונה בין גדיל DNA ישן לחדש בתהליך התיקון?
מה יקרה אם במהלך שכפול דנ"א, נוקלאוטיד שגוי משובץ מול נוקלאוטיד בתבנית המקורית, וטעות זו לא מתוקנת לפני השכפול הבא?
מה יקרה אם במהלך שכפול דנ"א, נוקלאוטיד שגוי משובץ מול נוקלאוטיד בתבנית המקורית, וטעות זו לא מתוקנת לפני השכפול הבא?
מה ההשלכה העיקרית של קצב שגיאות נמוך בשכפול דנ"א (לדוגמה, טעות אחת למיליארד בסיסים)?
מה ההשלכה העיקרית של קצב שגיאות נמוך בשכפול דנ"א (לדוגמה, טעות אחת למיליארד בסיסים)?
כיצד ישפיע שינוי בקצב השגיאות של שכפול דנ"א (למשל, מעלייה משמעותית) על תהליך האבולוציה?
כיצד ישפיע שינוי בקצב השגיאות של שכפול דנ"א (למשל, מעלייה משמעותית) על תהליך האבולוציה?
אילו מנגנונים קיימים בתא כדי למזער את ההשפעות של טעויות שכפול דנ"א?
אילו מנגנונים קיימים בתא כדי למזער את ההשפעות של טעויות שכפול דנ"א?
מהו היתרון האבולוציוני של שמירה על רמת דיוק גבוהה בשכפול דנ"א, למרות שטעויות עדיין מתרחשות?
מהו היתרון האבולוציוני של שמירה על רמת דיוק גבוהה בשכפול דנ"א, למרות שטעויות עדיין מתרחשות?
Flashcards
פעולת דנ"א פולימראז
פעולת דנ"א פולימראז
הוספת בסיסים חדשים לשרשרת הדנ"א במהלך שכפול.
אופן הוספת בסיסים
אופן הוספת בסיסים
הדנ"א פולימראז מוסיף בסיס אחד בכל פעם לשרשרת הדנ"א.
תיקון טעויות
תיקון טעויות
במקרה של טעות, הדנ"א פולימראז מסיר את הבסיס השגוי ומנסה בסיס אחר.
התמדה בחיפוש
התמדה בחיפוש
Signup and view all the flashcards
חשיבות התיקון
חשיבות התיקון
Signup and view all the flashcards
מהו דנ"א פולימראז?
מהו דנ"א פולימראז?
Signup and view all the flashcards
מהי תכונת proofreading?
מהי תכונת proofreading?
Signup and view all the flashcards
מהו mismatch repair system?
מהו mismatch repair system?
Signup and view all the flashcards
מהי שכיחות השגיאות לאחר proofreading?
מהי שכיחות השגיאות לאחר proofreading?
Signup and view all the flashcards
מהי שכיחות השגיאות לאחר mismatch repair?
מהי שכיחות השגיאות לאחר mismatch repair?
Signup and view all the flashcards
שיעור טעויות בשכפול DNA
שיעור טעויות בשכפול DNA
Signup and view all the flashcards
תוצאת שכפול טעות
תוצאת שכפול טעות
Signup and view all the flashcards
השלכות הטעות בשכפול
השלכות הטעות בשכפול
Signup and view all the flashcards
מערכת תיקון DNA
מערכת תיקון DNA
Signup and view all the flashcards
תוצאה של תיקון מוצלח
תוצאה של תיקון מוצלח
Signup and view all the flashcards
הבחנה בין גדילי DNA
הבחנה בין גדילי DNA
Signup and view all the flashcards
גדיל ממותל
גדיל ממותל
Signup and view all the flashcards
מתילציה באי-קולי
מתילציה באי-קולי
Signup and view all the flashcards
MutS
MutS
Signup and view all the flashcards
הבדלה בין גדילים באי-קולי
הבדלה בין גדילים באי-קולי
Signup and view all the flashcards
רצפי A ממותלים באי-קולי
רצפי A ממותלים באי-קולי
Signup and view all the flashcards
הבחנה בין גדילים
הבחנה בין גדילים
Signup and view all the flashcards
חלבונים לתיקון באי-קולי
חלבונים לתיקון באי-קולי
Signup and view all the flashcards
מהו פירוק גדיל?
מהו פירוק גדיל?
Signup and view all the flashcards
השלמת המרווח
השלמת המרווח
Signup and view all the flashcards
מהו דנ"א הֶמי-מְמותָל?
מהו דנ"א הֶמי-מְמותָל?
Signup and view all the flashcards
חשיבות ההמי-מתילציה
חשיבות ההמי-מתילציה
Signup and view all the flashcards
Mismatch repair והמי-מתילציה
Mismatch repair והמי-מתילציה
Signup and view all the flashcards
Study Notes
- אנו מתבוננים על הולואנזים, קרי על כל תתי היחידות של פולימראז ה-DNA
- הולואנזים מורכב מ-α, ε, ו-θ
- יחידת האלפא היא זו שמבצעת את הפילמור
- אפסילון הוא ה- Exonuclease שמבצע תיקונים וקורא 3 ל-5
- יחידת טאטא רק מחברת בין היחידות
- תתי יחידות בטא הן חלבונים (שתי יחידות של דימרים) הנקראים sliding clamps, והם אחראים על תפיסת פולימראז ה-DNA על ה-DNA, ומונעים ממנו ליפול
- קומפלקס גמא (γ) נקרא גם clamp loader, מורכב ממספר תתי יחידות, והוא טוען את ה-DNA לתוך ה-sliding clamp
הגהה (Proofreading)
- כאשר פולימראז ה-DNA מוסיף בסיסים, הוא מוסיף בסיס אחד בכל פעם
- אם הוא נכון, הוא ממשיך; אם לא, הוא מסיר אותו ומכניס בסיס אחר עד שהוא מוצא את הבסיס הנכון
- התנהגות זו נקראת הגהה 3 ל-5: הוא יכול לקרוא את הבסיס האחרון שהוא הציב ולתקן אותו במידת הצורך
- אם טעה בבסיס והמשיך, לא יוכל לחזור ולתקן
- ה-DNA פולימראז עושה טעות אחת לכל 10,000 בסיסים, אך בזכות ההגהה הוא עושה טעות אחת לכל 10 מיליון
- מערכת הפועלת אחרי ה-DNA פולימראז נקראת מערכת לתיקון שגיאות (mismatch repair system), ומקטינה את תכיפות הטעויות לאחת למיליארד בסיסים
- משמעות הדבר היא שבזמן שכפול ה-DNA, שאורכו מיליארד בסיסים, תהיה טעות סטטיסטית אחת
סוגי תיקון שגיאות
- אם הייתה טעות מול נוקלאוטיד מהתבנית, בפעם הבאה השכפול יניב גדיל נכון וגדיל מוטעה, כך ש-50% מהמולקולות יהיו מוטציות
- אם המערכת מזהה אי-התאמה, אך לא יודעת איזו נוקלאוטיד שגוי, יווצרו 100% מולקולות מוטנטיות אם תוציא את הנוקלאוטיד השגוי
- אם המערכת מזהה אי-התאמה, ומתקנת את הנוקלאוטיד הנכון שאליו הוא תואם, יתקבלו 100% מולקולות תקינות
- כדי שהמערכת תסיר את הנוקלאוטיד השגוי, היא צריכה לדעת איזה גדיל חדש ומי ישן
- באיי-קולי, לגדיל הישן יש מתילים (קבוצות מתיל), ולחדש אין
- למרות שגם למערכות אוקריוטיות יש מתילים, המערכת לא יכולה לזהות אותם
- למרות זאת, הוא מזהה את הגדיל החדש לפי שברים חד-גדיליים הנקראים "ניקים" (nicks)
חלבוני תיקון שגיאות באיי-קולי
- לאיי-קולי יש אנזים הנקרא dam methylase שמוסיף מתיל לנוקלאוטיד A ברצף GATC3'5
- לאיי-קולי יש הרבה רצפים כאלה עם הרבה A ממותלים
- לגדיל החדש אין עדיין מתילים
- MutS - מזהה אי-התאמה
- MutH - נקשר לאתר חצי ממותל (hemimethylated)
- MutL - מחבר בין שני החלבונים הראשונים. הפעולה שלו משופעל רק לאחר החיבור
- יוצר ניקים בגדיל החדש ליד האתר hemimethylated, הליקאז מבצע פתיחה, ונוקלאז מעכל את ה-DNA. הגדיל מפורק כמה נוקלאוטידים לפני ה-mismatch, וממשיך מספר נוקלאוטידים לאחר מכן. בסוף DNA פולימראז משלים את הפער.
- "חצי-ממותל" פירושו שגדיל אחד ממותל והשני לא
Studying That Suits You
Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.
Related Documents
Description
בחן את הידע שלך על מנגנון התיקון mismatch repair בדנ"א. בחן את תפקידי החלבונים MutS, דנ"א פולימראז, ואת החשיבות של מתילציה בגדילי הדנ"א. בחן את השלכות הפגיעה במערכת התיקון על תאים