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Questions and Answers
Qual è il ruolo principale della proteina Dicer nel processo di silenziamento dell'RNA?
Qual è il ruolo principale della proteina Dicer nel processo di silenziamento dell'RNA?
- Dicer agisce come una ribonucleasi, tagliando il pre-microRNA in un duplex di RNA. (correct)
- Dicer sintetizza il pre-microRNA.
- Dicer facilita la traslazione del mRNA target.
- Dicer si lega al pre-microRNA e lo trasporta nel nucleo.
Quale caratteristica del duplex di RNA è essenziale per il suo ruolo nel silenziamento dell'espressione genica?
Quale caratteristica del duplex di RNA è essenziale per il suo ruolo nel silenziamento dell'espressione genica?
- Il duplex di RNA è formato da due filamenti identici.
- La presenza di un'ansa (loop) al centro del duplex.
- Le estremità del duplex sono sfalsate (non perfettamente appaiate). (correct)
- Le estremità del duplex sono appaiate perfettamente.
Qual è la funzione principale del complesso RISC?
Qual è la funzione principale del complesso RISC?
- Il complesso RISC elabora il pre-microRNA in un duplex di RNA.
- Il complesso RISC sintetizza il mRNA target.
- Il complesso RISC seleziona il filamento guida (guide strand) del duplex di RNA. (correct)
- Il complesso RISC produce il pre-microRNA.
Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo al complesso RISC?
Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo al complesso RISC?
Cosa succede al pre-microRNA una volta che è entrato nel citoplasma e ha incontrato la proteina Dicer?
Cosa succede al pre-microRNA una volta che è entrato nel citoplasma e ha incontrato la proteina Dicer?
Qual è la funzione del RISC nel processo di silenziamento dell'espressione genica?
Qual è la funzione del RISC nel processo di silenziamento dell'espressione genica?
Quale tipo di molecola è la chiave nel processo di silenziamento dell'espressione genica, come descritto nel testo?
Quale tipo di molecola è la chiave nel processo di silenziamento dell'espressione genica, come descritto nel testo?
Quale filamento del duplex di RNA è convenzionalmente considerato il filamento senso (sense strand)?
Quale filamento del duplex di RNA è convenzionalmente considerato il filamento senso (sense strand)?
Quale meccanismo di protezione viene attivato quando l'mRNA è riconosciuto come aberrante?
Quale meccanismo di protezione viene attivato quando l'mRNA è riconosciuto come aberrante?
Cosa accade all'mRNA de-adenilato?
Cosa accade all'mRNA de-adenilato?
In che modo la degradazione esonucleotidica dell'mRNA de-adenilato è peculiare?
In che modo la degradazione esonucleotidica dell'mRNA de-adenilato è peculiare?
Quali sono i corpuscoli p?
Quali sono i corpuscoli p?
Cosa accade agli mRNA che vengono riconosciuti dai miRNA?
Cosa accade agli mRNA che vengono riconosciuti dai miRNA?
Quali sono le principali funzioni dei corpuscoli p?
Quali sono le principali funzioni dei corpuscoli p?
Quale ruolo gioca Argonauta nel processo di degradazione dell'mRNA?
Quale ruolo gioca Argonauta nel processo di degradazione dell'mRNA?
Quale delle seguenti affermazioni è FALSA riguardo al processo di degradazione dell'mRNA?
Quale delle seguenti affermazioni è FALSA riguardo al processo di degradazione dell'mRNA?
Qual è la differenza principale tra il meccanismo di silenziamento genico mediato da miRNA nelle piante e negli animali?
Qual è la differenza principale tra il meccanismo di silenziamento genico mediato da miRNA nelle piante e negli animali?
Qual è il ruolo del complesso miRISC nel processo di silenziamento genico mediato da miRNA?
Qual è il ruolo del complesso miRISC nel processo di silenziamento genico mediato da miRNA?
Quale dei seguenti passaggi NON è coinvolto nella degradazione del messaggero target tramite appaiamento perfetto del miRNA?
Quale dei seguenti passaggi NON è coinvolto nella degradazione del messaggero target tramite appaiamento perfetto del miRNA?
Quale dei seguenti è un esempio di meccanismo di repressione traduzionale mediato da miRNA?
Quale dei seguenti è un esempio di meccanismo di repressione traduzionale mediato da miRNA?
Perché, a differenza del meccanismo canonico di degradazione dell'RNA, la degradazione del messaggero target mediata da miRNA avviene in direzione 5'-3'?
Perché, a differenza del meccanismo canonico di degradazione dell'RNA, la degradazione del messaggero target mediata da miRNA avviene in direzione 5'-3'?
Nel caso di un appaiamento imperfetto tra il miRNA e il messaggero target, cosa accade al messaggero target?
Nel caso di un appaiamento imperfetto tra il miRNA e il messaggero target, cosa accade al messaggero target?
Quale tra le seguenti affermazioni è VERA riguardo al complesso miRNA-Argonauta?
Quale tra le seguenti affermazioni è VERA riguardo al complesso miRNA-Argonauta?
Quale delle seguenti condizioni favorisce la degradazione del messaggero target tramite appaiamento perfetto del miRNA?
Quale delle seguenti condizioni favorisce la degradazione del messaggero target tramite appaiamento perfetto del miRNA?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo l'interazione del miRNA con l'mRNA è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo l'interazione del miRNA con l'mRNA è corretta?
Come influiscono i miRNA legati all'estremità 3'UTR dell'mRNA sulla traduzione?
Come influiscono i miRNA legati all'estremità 3'UTR dell'mRNA sulla traduzione?
Quale struttura cellulare è responsabile dell'eliminazione degli mRNA che non riescono a essere tradotti?
Quale struttura cellulare è responsabile dell'eliminazione degli mRNA che non riescono a essere tradotti?
Quale dei seguenti fattori può impedire l'interazione del ribosoma con l'mRNA?
Quale dei seguenti fattori può impedire l'interazione del ribosoma con l'mRNA?
Qual è il ruolo di Argonauta nel processo di regolazione della traduzione mediata dai miRNA?
Qual è il ruolo di Argonauta nel processo di regolazione della traduzione mediata dai miRNA?
Qual è il risultato finale dell'interazione tra un miRNA e il suo mRNA bersaglio?
Qual è il risultato finale dell'interazione tra un miRNA e il suo mRNA bersaglio?
Quale tra le seguenti affermazioni è corretta riguardo al meccanismo di blocco dell'inizio della traduzione mediato dai miRNA?
Quale tra le seguenti affermazioni è corretta riguardo al meccanismo di blocco dell'inizio della traduzione mediato dai miRNA?
Quale dei seguenti è un esempio di segnale che potrebbe portare alla degradazione dell'mRNA?
Quale dei seguenti è un esempio di segnale che potrebbe portare alla degradazione dell'mRNA?
Quale ruolo svolge la subunità Argonauta del complesso RISC nel processo di silenziamento genico mediato dai microRNA?
Quale ruolo svolge la subunità Argonauta del complesso RISC nel processo di silenziamento genico mediato dai microRNA?
Quale dominio di Argonauta è coinvolto nel riconoscimento dell'estremità 5' del microRNA?
Quale dominio di Argonauta è coinvolto nel riconoscimento dell'estremità 5' del microRNA?
Perché la natura ha selezionato un RNA a doppio filamento come precursore del miRNA invece di un singolo filamento?
Perché la natura ha selezionato un RNA a doppio filamento come precursore del miRNA invece di un singolo filamento?
Come si lega Argonauta al duplex di RNA?
Come si lega Argonauta al duplex di RNA?
Quale evento attiva l'attività endonucleasica di Argonauta?
Quale evento attiva l'attività endonucleasica di Argonauta?
Quali sono le conseguenze della degradazione del filamento passeggero?
Quali sono le conseguenze della degradazione del filamento passeggero?
In che modo Argonauta impedisce al miRNA maturo di essere degradato?
In che modo Argonauta impedisce al miRNA maturo di essere degradato?
Cosa rende Argonauta una molecola importante nel silenziamento indotto da miRNA?
Cosa rende Argonauta una molecola importante nel silenziamento indotto da miRNA?
Flashcards
Complesso RISC
Complesso RISC
Un complesso multiproteico che utilizza miRNA per silenziare mRNA.
Argonauta (Ago)
Argonauta (Ago)
Subunità del complesso RISC che lega e processa l'RNA duplex.
RNA duplex
RNA duplex
Struttura di RNA a doppio filamento lungo 20-22 bp.
Filamento senso
Filamento senso
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Filamento passenger
Filamento passenger
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Attività endonucleasica
Attività endonucleasica
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Dominio PIWI
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Stabilità del miRNA
Stabilità del miRNA
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Proteina Dicer
Proteina Dicer
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Funzione dell'RNA duplex
Funzione dell'RNA duplex
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Struttura dell'RNA duplex
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Selezione del filamento
Selezione del filamento
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Acidi nucleici e silenziamento
Acidi nucleici e silenziamento
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Dimensioni del RISC
Dimensioni del RISC
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miRNA-Argonauta
miRNA-Argonauta
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Complementarità perfetta
Complementarità perfetta
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Degradazione dell'mRNA
Degradazione dell'mRNA
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Direzione di degradazione
Direzione di degradazione
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Appaiamento non perfetto
Appaiamento non perfetto
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Repressione traduzionale
Repressione traduzionale
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Blocco dell'elongazione
Blocco dell'elongazione
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Esonucleasi specifica
Esonucleasi specifica
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mRNA aberrante
mRNA aberrante
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De-adenilazione
De-adenilazione
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Processo di degradazione 5' -> 3'
Processo di degradazione 5' -> 3'
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p-bodies
p-bodies
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Controllo a livello citoplasmatico
Controllo a livello citoplasmatico
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Traduzione rallentata
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miRNA
miRNA
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Corpo di Argonauta
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Ingombro sterico
Ingombro sterico
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mRNA nei P-bodies
mRNA nei P-bodies
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Blocco dell'inizio della traduzione
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Formazione tridimensionale aberrante
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RISC
RISC
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Corpuscoli P
Corpuscoli P
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Study Notes
MicroRNA e RNA Duplex
- Il pre-microRNA, a forma di forcina, entra nel citoplasma e viene riconosciuto dalla proteina Dicer.
- Dicer è una ribonucleasi che taglia l'RNA a doppio filamento, eliminando la bolla (ansa).
- Il risultato è un RNA duplex, un doppio filamento di RNA con estremità sfalsate (lunghezza 20-22 nucleotidi), con un fosfato in 5' e un ossidrile libero in 3'.
- Questo duplex è fondamentale per il silenziamento genico.
- Gli acidi nucleici a doppio filamento sfalsato silenzia l'espressione dei trascritti per la loro natura chimica.
Complesso RISC
- Il complesso RISC (RNA-induced silencing complex) sceglie il filamento guida (guide strand) dall'RNA duplex.
- Il filamento senso (guide strand) è quello con il 5' a sinistra e il 3' a destra.
- Il complesso RISC è una macchina molecolare altamente efficiente e conservata, fondamentale per il processo di silenziamento.
- Argonauta (Ago) è la subunità del complesso RISC fondamentale nel processo di silenziamento.
Struttura di Argonauta
- Dopo aver legato l'RNA duplex, Argonauta attiva la sua attività endonucleasica e degrada il filamento passenger.
- Argonauta individua il duplex RNA, lo lega e lo lega in maniera funzionale all'appaiamento del miRNA all'mRNA bersaglio.
- Il modo in cui Argonauta sceglie il filamento da conservare non è ancora noto.
- Argonauta ha due domini critici: il primo riconosce l'estremità 3' e il secondo (PIWI domain) si ancora all'estremità 5' fosfato del miRNA.
Meccanismi di Silenziamento
- Complementarietà Perfetta: Il metodo preferito dalle cellule vegetali. Il miRNA, legato ad Ago, si lega alla regione 3'UTR dell'mRNA bersaglio. Avvengono tre step che portano alla degradazione dell'mRNA: de-adenilazione, de-capping e degradazione esonucleotidica 5'-3'.
- Complementarietà Imperfetta: Il miRNA si lega all'mRNA bersaglio con appaiamento non perfetto, con bolle nelle regioni non complementari. Ciò può portare a un blocco dell'elongazione (dovuto all'ingombro sterico) o blocco dell'inizio della traduzione (impedendo l'interazione ribosomale).
P-Bodies
- Gli mRNA non tradotti vengono concentrati nei P-bodies.
- I P-bodies rappresentano stazioni intermedie per mettere in pausa la traduzione.
- In questi corpuscoli, gli mRNA legati al miRNA possono essere degradati o riutilizzati.
Degradazione dell'mRNA
- La degradazione dell'mRNA avviene tramite de-adenilazione, de-capping e degradazione esonucleotidica 5'-3'.
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