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Questions and Answers
Quel type d'hôte est particulièrement sensible aux infections ?
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Quel diagnostic ne signifie pas nécessairement infection ?
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Quel test microbiologique est utilisé pour déterminer la nature d'un microorganisme ?
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Quelle technique est utilisée pour identifier des microbes lorsque les méthodes traditionnelles échouent ?
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Quelle caractéristique n'est pas propre aux bactéries ?
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Quel microorganisme a le chiffre le plus bas de gènes connus ?
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Parmi ces techniques, laquelle n'est pas traditionnellement utilisée en microbiologie ?
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Quel type de microorganisme peut causer la méningite ?
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Qui est considéré comme le premier à avoir découvert les microorganismes et les a appelés 'animalcules'?
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Quelle était la croyance générale concernant la cause des maladies avant 1840?
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Quel scientifique a mis en évidence le lien entre le streptocoque A et la fièvre puerpérale?
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Quel est le nom de l'agent infectieux responsable de la tuberculose découvert par Koch?
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Quels étaient les postulats de Koch concernant les microorganismes et les maladies?
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Que signifie 'culture pure' selon la définition de Koch?
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La fièvre puerpérale était autrefois fréquente chez les femmes en couches. Quelle était sa cause selon Pasteur?
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Quel était le rôle de Robert Koch dans l'histoire de la microbiologie?
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Quelle caractéristique définit la virulence du Staphylococcus aureus ?
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Quelles sont les caractéristiques des bactéries pyogènes ?
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Quelle est la principale voie de transmission des staphylocoques ?
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Quelle espèce de staphylocoque est considérée comme pathogène majeur ?
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Comment les bactéries échappent-elles aux défenses immunitaires ?
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Quel est le diamètre typique des staphylocoques ?
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Quelle est une mesure préventive importante contre les infections à staphylocoques ?
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Quelle approche est essentielle pour le diagnostic des infections bactériennes ?
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Quel est le rôle des fimbriae dans les bactéries?
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Comment le Violet de Gentiane affecte-t-il les bactéries à Gram + et Gram -?
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Quelle est la principale fonction des pili dans les bactéries?
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Pourquoi la Safarine ne change-t-elle pas la coloration des bactéries à Gram +?
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Quel type de plasmide permet aux bactéries ETEC de s'attacher aux cellules épithéliales de l'intestin?
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Quelle est la différence principale entre les fimbriae et les pili?
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Quel mélange est utilisé pour décolorer les bactéries à Gram lors du processus de coloration?
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Quelle méthode n'est pas un moyen de transfert de matériel génétique chez les microorganismes?
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Quelles structures sont principalement touchées par une infection osseuse suite à un traumatisme ?
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Quel est l'effet de la compression des vaisseaux sanguins lors d'une infection osseuse ?
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Quelles sont les conséquences si une infection osseuse n'est pas traitée précocement ?
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Quels sont les symptômes les plus courants associés aux infections osseuses ?
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Quelle est la méthode diagnostique recommandée pour les infections osseuses ?
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Quel est le principal traitement chirurgical proposé pour une infection osseuse avec formation de séquestres ?
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Chez les enfants, quelle est la particularité de la physe lors d'infections osseuses ?
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Quel est un des symptômes caractéristiques de l'arthrite résultant d'une infection ?
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Quel est l'impact potentiel à long terme des infections valvulaires sur le cœur ?
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Quelles sont les conséquences possibles des végétations sur une valve saine ?
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Quels agents pathogènes sont souvent responsables de l'adénite cervicale aiguë chez les enfants ?
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Quelle est une complication grave de la pneumonie causée par le staphylocoque doré ?
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Quel est le syndrome causé par les souches à exfoliatine du staphylocoque ?
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Quel mécanisme est souvent impliqué dans la formation d'un pneumothorax suite à une pneumonie ?
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Quelle est la fonction des souches à lipase du staphylocoque ?
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Quelle caractéristique des pneumonies causées par le staphylocoque doré est observable en radiologie ?
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Study Notes
Microbiologie : Dr. Van Der Linden
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Introduction à la microbiologie:
- Historique: Leeuwenhoek fut le premier à observer les micro-organismes.
- Pasteur et Koch ont établi le lien entre germes et maladies (ex: fièvre puerpérale, tuberculose).
- Les postulats de Koch (actuellement désuets) concernent la présence d'un micro-organisme dans chaque cas de maladie, mais absent des organismes sains, ainsi qu'une culture pure et l'existence d'une maladie chez un hôte sain.
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Nomenclature: Les micro-organismes incluent les virus, champignons, bactéries et parasites avec différentes tailles et niveaux d'évolution.
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Bactéries:
- Caractéristiques: Les bactéries sont des procaryotes unicellulaires dénuées de mitochondries et d'enveloppe nucléaire.
- Formes: Coques, bacilles, spirilles, coccobacilles.
- Auxotrophie: Certaines bactéries dépendent d'éléments du milieu pour survivre.
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Bactéries Gram +:
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Caractéristiques: Présence d'une épaisse couche de peptidoglycanes dans la paroi cellulaire.
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Exemples: Staphylococcus aureus (staphylocoque doré), Staphylococcus epidermidis (staphylocoque blanc)
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Ecologie et transmission: Présents en grande quantité sur la peau, le nez, mais surtout en zone de transit
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Pouvoir invasif: Résistance à la sécheresse et à certaines températures.
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Pouvoir défensif: Présence de capsule pour éviter la phagocytose.
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Pouvoir agressif: Possède des enzymes (hyaluronidase, DNase…) et toxines (PVL, exfoliatine…) qui détruisent les tissus de l'hôte et provoquent des infections.
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Échange de matériel génétique: Conjugaison, transduction, et transformation.
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Microbiome:
- Définition: Ensemble des génomes microbiens présents sur ou dans l'organisme d'un individu.
- Importance: influence notre métabolisme et notre santé (ex: immunité)
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Endroits où l'on retrouve TOUJOURS des bactéries: Peau, muqueuses respiratoires au-dessus de la trachée.
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Endroits où l'on ne retrouve JAMAIS des bactéries: SNC, sinus, oreille moyenne, trompes d'Eustache, glandes salivaires, voies biliaires, pancréas, cavité vaginale, cavité utérine, extrémité distale de l'urètre, reins, uretères et vessie.
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Facteurs influent positif sur le microbiote:
- Probiotiques: micro-organismes vivants
- Prébiotiques: aliments ou compléments alimentaires favorisant la croissance des bactéries bénéfiques
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Différences à retenir entre bactérie gram +/-:
- Epaisseur de la paroi cellulaire.
- Réponse à la coloration de Gram.
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Infection- inflammation: Les 5 causes principales d'inflammation sont: les traumatismes, les brûlures, les maladies inflammatoires, les phénomènes allergiques et les infections virales ou bactériennes.
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Coloration de Gram:
- Gram positif et négatif : La coloration de Gram distingue les bactéries en fonction de la capacité de leur paroi de retenir une coloration de cristal violet.
- Différences: La paroi cellulaire des bactéries Gram+ est beaucoup plus épaisse que celle des bactéries Gram-.
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Infection d'un foyer infectieux: Après l'invasion d'un foyer infectieux par un germe nécrosant, un tissu de granulation s'installe autour du foyer afin d'assurer sa réparation car les bactéries qui sont en transit peuvent s'en aller une fois que la zone est moins nécrotique.
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Les diverses infections (parfois difficiles à diagnostiquer) chez les personnes à risque.
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Bactériémies et métastases : L'entrée est essentiellement la translocation (inoculum important). Les sites prioritaires (os, articulations, valves cardiaques)
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Présentation de la classification des principaux agents pathogènes en microbiologie, les facteurs de risques ainsi que les mécanismes d'identification.
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Cas cliniques variés pour illustrer les concepts.
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Tuberculose:
- Écologie: principalement transmise par inhalation.
- Etiologie: mycobacterium tuberculosis
- Variantes: tuberculose bovines,
- Infection: Infection pulmonaire, latente, cas grave.
- Diagnostic: difficiles à obtenir
-
Mycobactéries non tuberculeuses:
- Diversité: nombreuses espèces responsables de multiples affections (cutanées, pulmonaires, etc.).
- Diagnostic difficultés: les mêmes milieux que pour l’identification de mycobactéries tbc.
- Risque important pour ID: Les germes nécrotiques
- Problèmes de diagnostic: il faut isoler les germes et les identifier avec certitude.
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Infection liée aux mycobactéries (non-tuberculeuses) : Nombreuses affections (ulcères de Buruli, granulome des aquariums, etc.).
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Clostridium difficile:
- Ecologie: présent dans le sol et dans le TD.
- Pouvoir agressif: toxines A et B qui perturbent les tissus et détruisent le chorion empêchant la guérison. Cela entraine des diarrhées.
- Diagnostic: basé sur la présence des toxines via PCR et culture.
- Traitement: antibiotiques ciblés et pour éviter les rechutes : transplantation fécale.
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Clostridium perfringens:
- Ecologie: présent dans le sol, TD.
- Pouvoir agressif: toxines qui détruisent les cellules épithéliales et donc la paroi cellulaire, ce qui conduit à une nécrose et à une septicémie.
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Clostridium botulinum:
- Ecologie: présent dans le sol, TD des animaux et conserves alimentaires.
- Pouvoir agressif: provoque une paralysie neurologique souvent grave du fait d'une inhibition de la libération de l'acétylcholine des synapses.
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Bacillus cereus:
- Ecologie: présent dans le sol, les aliments.
- Pouvoir agressif: toxines thermolabiles(ETEC type) ou thermostables.
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Infections liées aux BGN fastidieux (respiration, sphère uro-génitale, ...) Myco, Bordetella, Kingella, ...) ainsi que les cocco-bacilles (H.influenzae), les agents responsables d'infections plus graves et/ou nosocomiales
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Flore de substitution (en cas d'antibiothérapie): une flore nouvelle se développe dans l'organisme, et est souvent résistante. Il existe des infections polymicrobienne à plusieurs BGN liés à cela, nécessitant donc une surveillance microbiologique approfondie.
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Les Spirochètes
- Ecologie: peuvent vivre en tant que parasite de sang ou en milieu aqueux/humide.
- Pathologies (transmission) : Les pathologies sont surtout liées à la transmission via des tiques (maladie de Lyme, Borreliose) ou sexuellement (Syphilis).
- Diagnostic: Culture complexe, surtout sur fond noir ou par fluorescence.
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Infections liées au VIH:
- Complications: L'idéal est d'éviter les complications par prévention des infections, mais parfois l'infection sera difficile à traiter.
- Risque: Les personnes immuno-déprimés sont très à risque.
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Infection par les virus liés à la bouche, système respiratoire, oropharyngé, urinaire, génital, peau et système musculaire
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Cas cliniques variés pour tous les germes.
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Spécificité des tests: sérologies (IgM et IgG), PCR (très spécifique)
- Diagnostic: Culture, microscopie, tests rapides, PCR.
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