32 Questions
En el método de Sanger, la incorporación de los ddNTPs es… :
Al azar
En la pirosecuenciación la reacción de detección viene dada por la liberación previa de …:
Pirofosfato o P2O7^4-
Existe un método de secuenciación por semiconductores …:
que carece de un sistema óptico de detección, se trata de una detección electroquímica
En la secuenciación por reversión del terminador (CRT) …:
Se usan nucleótidos con el extremo 3' OH bloqueado
Es importante recordar que la molécula de ADN está formada por tres componentes:
Un azúcar, una base nitrogenada y un grupo fosfato
La característica más importante de la Taq polimerasa que la distingue de otras polimerasas es:
Actúa a elevadas temperaturas
Los primers generalmente oscilan entre ............ pares de bases:
15-25
Otra característica interesante Los primers es que …:
Deben tener un máximo del 55 % de cantidad de G-C
Recordar que en la desnaturalización, las cadenas de ADN son calentadas a 95 ºC durante:
20-30 segundos
En la etapa de hibridación la Tª correcta es:
50-60 ºC
En la etapa de extensión ...:
la Tª es de 72 ºC y el sentido de amplificación o extensión de cadenas es 5'-->3'
En Secuenciación de lectura corta por síntesis Illumina ...:
Todas son correctas
El ADN fragmentado se liga a secuencias adaptadoras y se adhiere a microperlas. Las perlas se incrustan en micropocillos en un semiconductor, se trata de ...:
Torrente Ion
Señale la incorrecta acerca de Oxford Nanopore ...:
el ADN replicado se une a la abertura del poro por donde se alimenta una molécula de ADN polimerasa
....... se pueden usar para medir la abundancia de transcritos específicos de una manera de rendimiento bastante bajo. Aprovechando el concepto de transcripción inversa y acoplándolo a tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, los transcritos pueden secuenciarse y mapearse a un genoma para representar la cantidad de transcritos representados por el número de lecturas:
b y c
En el método de secuenciación enzimático de terminación de cadena o método didesoxi de Sanger, se requieren nucleótidos didesoxi que son:
Los nucleótidos didesoxi son nucleótidos modificados que han perdido el grupo hidroxilo de la posición 3' de la desoxirribosa
Indique la correcta sobre el método didesoxi de Sanger:
la ADN polimerasa I comienza a añadir nucleótidos por el extremo 3' OH
En primer lugar, deben realizarse en cuatro tubos diferentes, cuatro mezclas de reacción. Cada mezcla de reacción contiene los cuatro nucleótidos trifosfato (dATP, dCTP, de dTTP y dGTP), la enzima y …:
un cebador marcado radiactivamente y un nucleótido dideoxi
Señale la correcta:
En cada mezcla de reacción se producen una serie de moléculas de ADN de nueva síntesis de diferente longitud que terminan todas en el mismo nucleótido y marcadas todas radiactivamente por el extremo 5' (todas contienen en el extremo 5' el cebador utilizado)
En vista de la siguiente autorradiografía indique el fragmento de secuencia correcta de ADN obtenido en dirección 5’à 3’:
AAATCAATTCTG…
Una modificación de la técnica anterior facilita un análisis más rápido y económico, además de su automatización:
secuenciación mediante colorantes acoplados al cebador" (dye-primer sequencing)
La mayor ventaja de este método es que la secuenciación se puede llevar a cabo en una sola reacción, en lugar de en cuatro reacciones como en el método del cebador marcado, cuál es:
Marcado de los terminadores de la cadena
En el método de la cuestión anterior, el sistema de detección y secuenciación es:
Electroforesis capilar
Indique la correcta sobre Secuenciación alelo-específica por bisulfito:
Permite realizar un mapeo de metilaciones alelo-específicas en las islas CpG, añadiendo la posibilidad de observar las metilaciones además de la secuencia nucleotídica
Qué es la pirosecuenciación:
es un método de secuenciación de ADN en tiempo real basado en la liberación de los pirofosfatos (PPi) que tiene lugar en la reacción de polimerización del ADN a partir de sus dNTPs
El método tSMS (True Single-Molecule Sequencing) consiste en:
Secuenciar a partir de una única molécula monocatenaria de ADN
Una forma de incrementar la especificidad en la técnica de PCR es mediante:
Un aumento en la temperatura de alineamiento
Entre las características técnicas más importantes de las polimerasas de alta fidelidad no se encuentran:
mayores producciones de producto con cantidades mínimas de enzimas (0,5-1 mg/50 µL de reacción)
Las curvas de desnaturalización pueden utilizarse cuando ...:
Cuando se emplean agentes intercalantes y sondas de hibridación
La síntesis de ADN termina cuando se añade ...:
Cuando se añade un ddNTP
En medicina forense, se puede amplificar un ADN desde:
Todas ellas
La amplificación con arranque en caliente ...:
Comenzar la reacción cuando y sólo cuando la temperatura de la mezcla es suficientemente alta, de forma que no se produzcan hibridaciones, y por consiguiente amplificaciones, inespecíficas
Preguntas sobre los métodos de secuenciación de ADN, incluyendo el método de Sanger y la pirosecuenciación. Pon a prueba tus conocimientos sobre cómo se incorporan los ddNTPs en el método de Sanger y la reacción de detección en la pirosecuenciación.
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