SIMULACRO TEST 7E Métodos de secuenciación de ADN

Choose a study mode

Play Quiz
Study Flashcards
Spaced Repetition
Chat to Lesson

Podcast

Play an AI-generated podcast conversation about this lesson
Download our mobile app to listen on the go
Get App

Questions and Answers

En el método de Sanger, la incorporación de los ddNTPs es… :

  • Al azar (correct)
  • En orden
  • De menor a mayor
  • De mayor a menor

En la pirosecuenciación la reacción de detección viene dada por la liberación previa de …:

  • Pirofosfato o P2O7^4- (correct)
  • ddNTP
  • dNTP
  • Pirofosfato o ATP

Existe un método de secuenciación por semiconductores …:

  • No
  • en que se ancla la polimerasa al chip
  • está en estudio
  • que carece de un sistema óptico de detección, se trata de una detección electroquímica (correct)

En la secuenciación por reversión del terminador (CRT) …:

<p>Se usan nucleótidos con el extremo 3' OH bloqueado (C)</p> Signup and view all the answers

Es importante recordar que la molécula de ADN está formada por tres componentes:

<p>Un azúcar, una base nitrogenada y un grupo fosfato (B)</p> Signup and view all the answers

La característica más importante de la Taq polimerasa que la distingue de otras polimerasas es:

<p>Actúa a elevadas temperaturas (C)</p> Signup and view all the answers

Los primers generalmente oscilan entre ............ pares de bases:

<p>15-25 (B)</p> Signup and view all the answers

Otra característica interesante Los primers es que …:

<p>Deben tener un máximo del 55 % de cantidad de G-C (D)</p> Signup and view all the answers

Recordar que en la desnaturalización, las cadenas de ADN son calentadas a 95 ºC durante:

<p>20-30 segundos (B)</p> Signup and view all the answers

En la etapa de hibridación la Tª correcta es:

<p>50-60 ºC (A)</p> Signup and view all the answers

En la etapa de extensión ...:

<p>la Tª es de 72 ºC y el sentido de amplificación o extensión de cadenas es 5'--&gt;3' (B)</p> Signup and view all the answers

En Secuenciación de lectura corta por síntesis Illumina ...:

<p>Todas son correctas (D)</p> Signup and view all the answers

El ADN fragmentado se liga a secuencias adaptadoras y se adhiere a microperlas. Las perlas se incrustan en micropocillos en un semiconductor, se trata de ...:

<p>Torrente Ion (A)</p> Signup and view all the answers

Señale la incorrecta acerca de Oxford Nanopore ...:

<p>el ADN replicado se une a la abertura del poro por donde se alimenta una molécula de ADN polimerasa (C)</p> Signup and view all the answers

....... se pueden usar para medir la abundancia de transcritos específicos de una manera de rendimiento bastante bajo. Aprovechando el concepto de transcripción inversa y acoplándolo a tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, los transcritos pueden secuenciarse y mapearse a un genoma para representar la cantidad de transcritos representados por el número de lecturas:

<p>b y c (A)</p> Signup and view all the answers

En el método de secuenciación enzimático de terminación de cadena o método didesoxi de Sanger, se requieren nucleótidos didesoxi que son:

<p>Los nucleótidos didesoxi son nucleótidos modificados que han perdido el grupo hidroxilo de la posición 3' de la desoxirribosa (D)</p> Signup and view all the answers

Indique la correcta sobre el método didesoxi de Sanger:

<p>la ADN polimerasa I comienza a añadir nucleótidos por el extremo 3' OH (A)</p> Signup and view all the answers

En primer lugar, deben realizarse en cuatro tubos diferentes, cuatro mezclas de reacción. Cada mezcla de reacción contiene los cuatro nucleótidos trifosfato (dATP, dCTP, de dTTP y dGTP), la enzima y …:

<p>un cebador marcado radiactivamente y un nucleótido dideoxi (B)</p> Signup and view all the answers

Señale la correcta:

<p>En cada mezcla de reacción se producen una serie de moléculas de ADN de nueva síntesis de diferente longitud que terminan todas en el mismo nucleótido y marcadas todas radiactivamente por el extremo 5' (todas contienen en el extremo 5' el cebador utilizado) (D)</p> Signup and view all the answers

En vista de la siguiente autorradiografía indique el fragmento de secuencia correcta de ADN obtenido en dirección 5’à 3’:

<p>AAATCAATTCTG… (C)</p> Signup and view all the answers

Una modificación de la técnica anterior facilita un análisis más rápido y económico, además de su automatización:

<p>secuenciación mediante colorantes acoplados al cebador&quot; (dye-primer sequencing) (A)</p> Signup and view all the answers

La mayor ventaja de este método es que la secuenciación se puede llevar a cabo en una sola reacción, en lugar de en cuatro reacciones como en el método del cebador marcado, cuál es:

<p>Marcado de los terminadores de la cadena (D)</p> Signup and view all the answers

En el método de la cuestión anterior, el sistema de detección y secuenciación es:

<p>Electroforesis capilar (D)</p> Signup and view all the answers

Indique la correcta sobre Secuenciación alelo-específica por bisulfito:

<p>Permite realizar un mapeo de metilaciones alelo-específicas en las islas CpG, añadiendo la posibilidad de observar las metilaciones además de la secuencia nucleotídica (C)</p> Signup and view all the answers

Qué es la pirosecuenciación:

<p>es un método de secuenciación de ADN en tiempo real basado en la liberación de los pirofosfatos (PPi) que tiene lugar en la reacción de polimerización del ADN a partir de sus dNTPs (D)</p> Signup and view all the answers

El método tSMS (True Single-Molecule Sequencing) consiste en:

<p>Secuenciar a partir de una única molécula monocatenaria de ADN (A)</p> Signup and view all the answers

Una forma de incrementar la especificidad en la técnica de PCR es mediante:

<p>Un aumento en la temperatura de alineamiento (C)</p> Signup and view all the answers

Entre las características técnicas más importantes de las polimerasas de alta fidelidad no se encuentran:

<p>mayores producciones de producto con cantidades mínimas de enzimas (0,5-1 mg/50 µL de reacción) (A)</p> Signup and view all the answers

Las curvas de desnaturalización pueden utilizarse cuando ...:

<p>Cuando se emplean agentes intercalantes y sondas de hibridación (A)</p> Signup and view all the answers

La síntesis de ADN termina cuando se añade ...:

<p>Cuando se añade un ddNTP (B)</p> Signup and view all the answers

En medicina forense, se puede amplificar un ADN desde:

<p>Todas ellas (D)</p> Signup and view all the answers

La amplificación con arranque en caliente ...:

<p>Comenzar la reacción cuando y sólo cuando la temperatura de la mezcla es suficientemente alta, de forma que no se produzcan hibridaciones, y por consiguiente amplificaciones, inespecíficas (C)</p> Signup and view all the answers

Flashcards

Sanger Sequencing: ddNTPs

Incorporation of ddNTPs is essential for chain termination.

Pyrosequencing Detection

Pirosequencing detects nucleotide incorporation via pyrophosphate release.

Semiconductor Sequencing

Oxford Nanopore uses semiconductor technology for sequencing.

DNA Components

DNA is composed of sugars, phosphates, and nitrogenous bases.

Signup and view all the flashcards

Taq Polymerase Feature

Taq polymerase is heat-stable, unlike other polymerases.

Signup and view all the flashcards

Primer Length

Primers are typically 18-24 base pairs long.

Signup and view all the flashcards

Primers Bind Where?

Primers bind to a specific region of the genome.

Signup and view all the flashcards

Denaturation Temperature

DNA strands are heated to 95°C for 30 seconds.

Signup and view all the flashcards

Hybridization Temperature

The correct temperature is approximately 55-65°C.

Signup and view all the flashcards

Extension Temperature

The temperature is 72 ºC

Signup and view all the flashcards

Illumina Sequencing

DNA is ligated to adapters and binds to micro-beads in wells.

Signup and view all the flashcards

Sanger's Method

Sanger sequencing uses dideoxy nucleotides to terminate the chain.

Signup and view all the flashcards

Bisulfite Sequencing

Measuring specific transcript abundance via bisulfite conversion

Signup and view all the flashcards

Pyrosequencing Mechanism

Pyrosequencing detects nucleotide incorporation by pyrophosphate release.

Signup and view all the flashcards

tSMS Meaning

Sequencing a strand of DNA, one at a time

Signup and view all the flashcards

PCR Specificity

Increase specificity in PCR via strategic primer design.

Signup and view all the flashcards

Forensic Amplification

A single cell or degraded DNA can be useful is forensics.

Signup and view all the flashcards

Study Notes

Técnicas de Secuenciación

  • En el método de Sanger, la incorporación de los ddNTPs es un proceso fundamental.
  • En la pirosecuenciación, la reacción de detección se produce mediante la liberación previa de pirofosfato.
  • Existe un método de secuenciación por semiconductores que utiliza la tecnología de Oxford Nanopore.

Estructura del ADN

  • La molécula de ADN está formada por tres componentes: azúcares, fosfatos y bases nitrogenadas.
  • La Taq polimerasa se caracteriza por ser termoestable, lo que la distingue de otras polimerasas.

PCR y Primers

  • Los primers generalmente oscilan entre 18-24 pares de bases.
  • Otra característica interesante de los primers es que son específicos para una región determinada del genoma.
  • En la desnaturalización, las cadenas de ADN se calientan a 95 ºC durante 30 segundos.
  • En la etapa de hibridación, la temperatura correcta es de 55-65 ºC.
  • En la etapa de extensión, la temperatura es de 72 ºC.

Secuenciación de Lectura Corta

  • En la secuenciación de lectura corta por síntesis Illumina, el ADN se liga a secuencias adaptadoras y se adhiere a microperlas que se incrustan en micropocillos en un semiconductor.
  • El método de secuenciación enzimático de terminación de cadena o método didesoxi de Sanger requiere nucleótidos didesoxi.

Otros Métodos de Secuenciación

  • La secuenciación alelo-específica por bisulfito se utiliza para medir la abundancia de transcritos específicos.
  • La pirosecuenciación es un método de secuenciación que utiliza la liberación previa de pirofosfato para detectar la incorporación de nucleótidos.
  • El método tSMS (True Single-Molecule Sequencing) consiste en la secuenciación de una sola molécula de ADN a la vez.
  • Una forma de incrementar la especificidad en la técnica de PCR es mediante la utilización de primers específicos.
  • En medicina forense, se puede amplificar un ADN desde una sola célula o incluso desde un fragmento de ADN degradado.

Studying That Suits You

Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.

Quiz Team

More Like This

Estructura del ADN
15 questions

Estructura del ADN

ScenicThunderstorm avatar
ScenicThunderstorm
¿Cuánto sabes sobre el ADN?
19 questions
Secuenciación del ADN y métodos
26 questions
Use Quizgecko on...
Browser
Browser