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Questions and Answers
Welche Art von Membranproteinen ist durch Segmente der Sequenz in der Membran verankert?
Welche Art von Proteinen ist so hydrophob, dass es permanent in der Membran verankert ist?
Welche Art von Proteinen besteht aus mehr als einer Polypeptidkette, wobei nur eine als integrales Membranprotein gilt?
Welche Art von Proteinen ist nicht in der Definition von Membranproteinen enthalten, obwohl sie Teil eines Membranproteinkomplexes sein können?
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Welche Proteine sind im Vergleich zum Proteinkern hydrophober?
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Welche Art von Proteinen kann nur eine einzelne Helix enthalten?
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Welche Art von Proteinen bildet ein Fass, um in der Lipiddoppelschicht verbleiben zu können?
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Welche Art von Proteinen weist eine sehr hydrophobe Oberfläche auf?
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Welche Proteine weisen manchmal eine hydrophile Innenseite auf?
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Welche Proteine kommen in unterschiedlichen Membranen vor?
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Was ist die Hauptfunktion von Albumin im Blut?
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Was ist der Zweck des Transportproteins in Bezug auf den vermittelten Transport durch die Zellmembran?
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Was macht etwa 50% der Masse einer typischen biologischen Membran aus?
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Was ist der grundlegende Unterschied zwischen passivem und aktivem Transport?
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Was treibt den passiven Transport entlang eines Konzentrationsgradienten an?
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Warum ist es wichtig, dass der aktive Transport gegen den Konzentrationsgradienten erfolgt?
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Was ist eine wichtige Rolle, die Schleusentore bei dem Vergleich des Transports mit einer Schleuse spielen?
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Welche Analogie wird verwendet, um den Transportprozess in biologischen Systemen zu illustrieren?
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Was wäre ein Beispiel für passiven Transport in biologischen Systemen?
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Welches Gerät wird zur Messung der Membranpolarisation verwendet?
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Was charakterisiert die Innenseite von polarisierten Membranen im Vergleich zu den Außenseiten?
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Was ist eine fundamentale wichtige Funktion von Membranen?
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Was ist die Dicke der hydrophoben Schicht in Membranen?
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Welche Substanz kann durch Membranen ungehindert diffundieren?
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Welche Art von Molekülen wird sehr langsam diffundieren und abgewiesen, auch wenn es sie innerhalb der Zelle gibt?
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Welche Art von Molekülen kann langsamer durch Membranen diffundieren, aber die Mehrheit wird abgewiesen?
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Welche Art von Molekülen muss von Transportproteinen begleitet werden, da sie sonst nur partiell in Membranen partitionieren und feststehen?
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Welche Art von Elementen weisen Membranproteine und membran-assoziierte Proteine häufig an ihrer Oberfläche auf?
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Wie interagieren Membranproteine mit der Membranoberfläche im Vergleich zu anderen Proteinen?
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Welche Information über die Topologie von Membranproteinen ist korrekt?
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Was macht die Anzahl der Transmembransegmente bei Membranproteinen aus?
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Welche Art von Strukturen können Membranproteine aufweisen?
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Wofür wird das von Harold Kite und Jack Dolittle entwickelte Hydrophobieskalensystem verwendet?
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Was untersucht der experimentelle Ansatz der Hydrophobieskalierung?
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Was ergibt der experimentelle Ansatz der Hydrophobieskalierung?
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Was ist die Grundlage des Kiten-Do-Little-Plots?
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Was wird getan, um den Kiten-Do-Little-Plot zu generieren?
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Was ist die Rolle der Slider Windows bei der Generierung des Kiten-Do-Little-Plots?
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Welche Annahmen liegen der Analyse des Kiten-Do-Little-Plots zugrunde?
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Was repräsentiert der Kiten-Do-Little-Plot in Bezug auf Transmembran-Segmente?
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Warum ist es schwierig, in manchen Fällen zwei Transmembran-Helices zu trennen?
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Welche Rolle spielen die Loops zwischen Transmembran-Helices bei der Darstellung im Kiten-Do-Little-Plot?
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Wie interagieren globuläre Proteine mit der Membran im Vergleich zu integralen Membranproteinen?
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Welche Rolle spielen assoziierte Komponenten eines Membranproteinkomplexes in Bezug auf die Definition von Membranproteinen?
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Was charakterisiert die hydrophobe Einheit, die globuläre Proteine in der Membran verankert?
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Was ist das Besondere an den assoziierten Komponenten eines Membranproteinkomplexes in Bezug auf die Definition von Membranproteinen?
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Welche Art von Molekülen kann durch Membranen ungehindert diffundieren?
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Was ist die Hauptfunktion von Albumin im Blut?
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Welche Art von Molekülen wird sehr langsam diffundieren und abgewiesen, auch wenn es sie innerhalb der Zelle gibt?
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Welche Art von Molekülen kann langsamer durch Membranen diffundieren, aber die Mehrheit wird abgewiesen?
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Was charakterisiert die Innenseite von polarisierten Membranen im Vergleich zu den Außenseiten?
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Welche Art von Molekülen muss von Transportproteinen begleitet werden, da sie sonst nur partiell in Membranen partitionieren und feststehen?
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Welche Art von Proteinen bildet ein Fass, um in der Lipiddoppelschicht verbleiben zu können?
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Welche Art von Molekülen hat eine große energetische Barriere für die Mehrheit biologisch wichtiger Substanzen?
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Was ist die Rolle der Slider Windows bei der Generierung des Kiten-Do-Little-Plots?
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Welche Art von Proteinen ist durch Segmente der Sequenz in der Membran verankert?
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Was ist die fundamentale wichtige Funktion von Membranen?
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Welche Art von Proteinen weist eine sehr hydrophobe Oberfläche auf?
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Was ist der Zweck des von Harold Kite und Jack Dolittle entwickelten Hydrophobieskalensystems?
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Was untersucht der experimentelle Ansatz der Hydrophobieskalierung?
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Was ergibt der experimentelle Ansatz der Hydrophobieskalierung?
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Was ist die Grundlage des Kiten-Do-Little-Plots?
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Was repräsentiert der Kiten-Do-Little-Plot in Bezug auf Transmembran-Segmente?
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Welche Art von Proteinen bildet ein Fass, um in der Lipiddoppelschicht verbleiben zu können?
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Was ist eine fundamentale wichtige Funktion von Membranen?
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Welche Information über die Topologie von Membranproteinen ist korrekt?
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Wie interagieren Membranproteine mit der Membranoberfläche im Vergleich zu anderen Proteinen?
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Was macht die Anzahl der Transmembransegmente bei Membranproteinen aus?
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Was charakterisiert die Innenseite von polarisierten Membranen im Vergleich zu den Außenseiten?
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Welche Art von Strukturen können Membranproteine aufweisen?
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Was ist der Zweck des Kiten-Do-Little-Plots?
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Was sind die Annahmen, die der Analyse des Kiten-Do-Little-Plots zugrunde liegen?
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Was ist die Rolle der Slider Windows bei der Generierung des Kiten-Do-Little-Plots?
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Was repräsentiert der Kiten-Do-Little-Plot in Bezug auf Transmembran-Segmente?
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Warum ist es schwierig, in manchen Fällen zwei Transmembran-Helices zu trennen?
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Was untersucht der experimentelle Ansatz der Hydrophobieskalierung?
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Welche Proteine weisen manchmal eine hydrophile Innenseite auf?
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Was ergibt der experimentelle Ansatz der Hydrophobieskalierung?
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Was ist eine fundamentale wichtige Funktion von Membranen?
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Was macht etwa 50% der Masse einer typischen biologischen Membran aus?
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Was treibt den passiven Transport entlang eines Konzentrationsgradienten an?
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Was ist eine wichtige Rolle, die Schleusentore bei dem Vergleich des Transports mit einer Schleuse spielen?
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Was charakterisiert das Verhalten der Hydrophobie in alpha-helikalen Transmembranproteinen?
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Was zeigt das Oberflächenpotenzial (ISP) in der ersten Näherung?
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Warum enthalten Transmembranhelices im Vergleich zum Proteinkern eine höhere Hydrophobität?
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Warum können Alpha-helikale Transmembranproteine nur eine einzelne Helix enthalten?
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Was müssen Beta-Proteine bilden, um in der Lipiddoppelschicht verbleiben zu können?
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Was interagiert in Beta-Barrel-Membranproteinen mit Lipiden?
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Wann weisen Beta-Barrel-Membranproteine kein starkes Signal im Kite and Do Little Plot auf?
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In welcher Hinsicht kommen Alpha-helikale Transmembranproteine und Beta-Barrel-Membranproteine in unterschiedlichen Membranen vor?
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Was ist eine Eigenschaft der meisten biologischen Membranen in Bezug auf die doppelte Asymmetrie?
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Was ist ein charakteristisches Merkmal von Membranen in Bezug auf die Hydrophobizität?
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Was ist ein Unterschied zwischen Alpha-helikalen Transmembranproteinen und Beta-Barrel-Membranproteinen in Bezug auf die Anzahl der enthaltenen Helices?
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Was ist der Hauptzweck von Albumin im Blut?
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Was ist der Unterschied zwischen passivem Transport und aktivem Transport?
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Welche Art von Transportprotein ermöglicht einen sehr effektiven und schnellen Transport?
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Was ist die Analogie, die verwendet wird, um den Protein-vermittelten Transportprozess zu illustrieren?
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Was ist die treibende Kraft für den passiven Transport entlang eines Konzentrationsgradienten?
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Was ist die Rolle der Schleusentore bei der Illustration des Transportprozesses mittels einer Schleuse?
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Was ist die fundamentale wichtige Funktion von Membranen?
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Welche Art von Substanzen kann passiv durch Membranen diffundieren?
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Was ist die Grundlage des aktiven Transports?
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Welche Art von Transport ist entlang eines Konzentrationsgradienten möglich?
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Was stellt das Bild mit den Wasserniveaus oben und unten im Transportprozess dar?
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Was repräsentiert die Schleuse in Bezug auf den Transportprozess?
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Ordnen Sie die folgenden Aussagen den entsprechenden Konzepten der Membranproteine zu:
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Verknüpfen Sie die folgenden Begriffe mit den entsprechenden Beschreibungen der Hydrophobieskalierung:
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Ordnen Sie die folgenden Personen den von ihnen entwickelten Analysen und Skalen zu:
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Ordnen Sie die folgenden Aussagen zu den Eigenschaften von biologischen Membranen den entsprechenden Beschreibungen zu:
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Ordnen Sie die folgenden Moleküleigenschaften den entsprechenden Diffusionsverhalten in Membranen zu:
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Ordnen Sie die folgenden Funktionen von Membranen den entsprechenden Beschreibungen zu:
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Ordnen Sie die folgenden Arten von Membranproteinen ihren Interaktionsweisen mit der Membran zu:
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Verknüpfen Sie die folgenden Beschreibungen mit den entsprechenden Arten von Membranproteinen:
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Ordnen Sie die folgenden Arten von Proteinen ihren Interaktionsweisen mit biologischen Membranen zu:
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Verknüpfen Sie die folgenden Definitionen mit den entsprechenden Arten von Proteinen, die mit biologischen Membranen interagieren:
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Ordnen Sie die folgenden Aussagen den entsprechenden Eigenschaften des Kiten-Do-Little-Plots zu:
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Ordnen Sie die folgenden Aussagen den entsprechenden Annahmen und Funktionen des Kiten-Do-Little-Plots zu:
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Ordnen Sie die folgenden Aussagen den entsprechenden Eigenschaften und Funktionen des Kiten-Do-Little-Plots zu:
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Ordnen Sie die folgenden Aussagen den richtigen Typen von Membranproteinen zu:
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Ordnen Sie die folgenden Aussagen den richtigen Merkmalen von Membranen zu:
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Ordnen Sie die folgenden Aussagen den richtigen Eigenschaften von Membranproteinen zu:
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Ordnen Sie die folgenden Transportarten ihren Beschreibungen zu:
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Verknüpfen Sie die folgenden Konzepte mit ihren entsprechenden Illustrationen:
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Ordnen Sie die folgenden Bestandteile der biologischen Membran ihren prozentualen Anteilen zu:
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Study Notes
Der Kiten-Do-Little-Plot ist eine Methode, die 40 Jahre alt ist, um die Hydrophobie von Aminosäurerieseitenketten in Proteinen zu analysieren. Es basiert auf der Annahme, dass ein Transmembran-Segment die Eigenschaft hat, eine Reihe hydrophober Aminosäuren aufzuspannen, die im Durchschnitt genügend Hydrophobie haben, um mit Lipiden interagieren zu können.
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Die Skala für Hydrophobie von Aminosäuren hat einen Mittelwert von 0, mit Hydrophobiewerten von +4,5 für extrem hydrophobe und -4,5 für extrem hydrophile Aminosäuren.
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Jede von den 20 natürlichen Aminosäuren hat einen bestimmten Hydrophobiewert zugeordnet.
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Die Tabelle hilft uns, zu verstehen, was die Grundlage für Hydrophobie in Proteinen und warum gewisse Segmente Transmembransegmente werden.
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Man generiert "Slider Windows" von einer ungeraden Anzahl an Aminosäuren, zum Beispiel 11, und addiert die Hydrophobiewerte dieser Aminosäuren zusammen.
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Der Wert der mittleren Aminosäure (z.B. die Nummer 6) wird dann mit dem Wert des Slider Windows multipliziert und abgezogen.
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Dieser Prozess wird für jede Aminosäure fortgesetzt und das Ergebnis ist ein Kiten-Do-Little-Plot, das die Durchschnittshydrophobie von Aminosäuren und ihrer Nachbarn darstellt.
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Durch dieses Verfahren können Transmembran-Segmente identifiziert werden, da sie genügend hydrophobe Aminosäurerieseitenketten aufweisen, um mit der Membran interagieren zu können.
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Dieser Analyse liegen die Annahmen zugrunde, dass der Kern von Proteinen hydrophobe Aminosäurerieseitenketten benötigt, um gefaltet zu werden, und dass der hydrophobe Effekt die Faltung generiert.
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Der Kiten-Do-Little-Plot zeigt unterschiedliche Klarheit in der Darstellung von Transmembran-Helices, abhängig von der Länge der Loops zwischen diesen Helices.
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In manchen Fällen überlappen zwei Transmembran-Helices und es kann schwierig sein, sie durch einen Wert mit negative Hydrophobie zu trennen.
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Dieser Analyse basierender Plot hilft bei der Identifikation von Transmembran-Domainen in Proteinen.
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Das Verhalten der Hydrophobie in alpha-helikalen Transmembranproteinen ist unterschiedlich, je nachdem, ob sie mit Lipiden interagieren oder im Proteininnern verborgen sind.
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Das Oberflächenpotenzial (ISP) zeigt in der ersten Näherung die erwarteten Ladungen an der Proteinoberfläche und zeigt auf, dass der hydrophile Teil des Proteins mit Lipiden interagiert.
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Transmembranhelices enthalten im Vergleich zum Proteinkern höhere Hydrophobität, weswegen sie nicht nur andere Typen von Proteinen sind.
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Alpha-helikale Transmembranproteine können nur eine einzelne Helix enthalten, da sie im Vergleich zu einer ausgestreckten Polypeptid-Segmente eine höhere Anzahl von hydrophober Aminosäureseitenketten aufweisen.
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Beta-Proteine sind ausgestreckte Segmente, die ein Fass bilden müssen, um in der Lipiddoppelschicht verbleiben zu können.
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In Beta-Barrel-Membranproteinen sind es die ausgeglichenen Polypeptid-Stränge, die nach außen zeigen, die die sehr hydrophobe Oberfläche mit Lipiden interagieren lassen.
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Innerhalb von Beta-Barrel-Membranproteinen kann die Innenseite manchmal hydrophil sein, weswegen sie kein starkes Signal im Kite and Do Little Plot aufweisen.
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Alpha-helikale Transmembranproteine und Beta-Barrel-Membranproteine kommen in unterschiedlichen Membranen vor.
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Die meisten biologischen Membranen weisen eine doppelte Asymmetrie auf, und unterschiedliche Phospholipide sind auf der Innenseite und auf der Außenseite unterschiedlich vertreten.
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Das Verhalten der Hydrophobie in alpha-helikalen Transmembranproteinen ist unterschiedlich, je nachdem, ob sie mit Lipiden interagieren oder im Proteininnern verborgen sind.
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Das Oberflächenpotenzial (ISP) zeigt in der ersten Näherung die erwarteten Ladungen an der Proteinoberfläche und zeigt auf, dass der hydrophile Teil des Proteins mit Lipiden interagiert.
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Transmembranhelices enthalten im Vergleich zum Proteinkern höhere Hydrophobität, weswegen sie nicht nur andere Typen von Proteinen sind.
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Alpha-helikale Transmembranproteine können nur eine einzelne Helix enthalten, da sie im Vergleich zu einer ausgestreckten Polypeptid-Segmente eine höhere Anzahl von hydrophober Aminosäureseitenketten aufweisen.
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Beta-Proteine sind ausgestreckte Segmente, die ein Fass bilden müssen, um in der Lipiddoppelschicht verbleiben zu können.
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In Beta-Barrel-Membranproteinen sind es die ausgeglichenen Polypeptid-Stränge, die nach außen zeigen, die die sehr hydrophobe Oberfläche mit Lipiden interagieren lassen.
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Innerhalb von Beta-Barrel-Membranproteinen kann die Innenseite manchmal hydrophil sein, weswegen sie kein starkes Signal im Kite and Do Little Plot aufweisen.
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Alpha-helikale Transmembranproteine und Beta-Barrel-Membranproteine kommen in unterschiedlichen Membranen vor.
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Die meisten biologischen Membranen weisen eine doppelte Asymmetrie auf, und unterschiedliche Phospholipide sind auf der Innenseite und auf der Außenseite unterschiedlich vertreten.
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Description
Dieses Quiz befasst sich mit der Interaktion von Helices mit Lipiden in Proteinen und dem Oberflächenpotenzial, das durch die Elektrostatik entsteht. Es werden wichtige Punkte zur Hydrophobie und zur Darstellung des Oberflächenpotenzials behandelt.