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Questions and Answers
¿Qué disciplinas se combinan en la bioinformática para analizar y gestionar grandes conjuntos de datos biológicos?
¿Qué disciplinas se combinan en la bioinformática para analizar y gestionar grandes conjuntos de datos biológicos?
- Bioquímica, estadística e informática
- Biología, informática y física
- Química, informática y matemáticas
- Biología, informática y matemáticas (correct)
¿Cuál es uno de los objetivos principales de la bioinformática?
¿Cuál es uno de los objetivos principales de la bioinformática?
- Desarrollar nuevas técnicas de laboratorio
- Crear modelos matemáticos complejos para simular procesos celulares
- Diseñar fármacos para enfermedades genéticas
- Organizar y actualizar los datos biológicos para facilitar el acceso a los investigadores (correct)
¿Qué distingue a los estudios bioinformáticos de los estudios biológicos tradicionales?
¿Qué distingue a los estudios bioinformáticos de los estudios biológicos tradicionales?
- No hay diferencia significativa entre ambos tipos de estudios
- Los estudios biológicos utilizan herramientas informáticas avanzadas, mientras que los bioinformáticos se basan en métodos experimentales
- Los estudios bioinformáticos se centran en el análisis global de la información, mientras que los biológicos se enfocan en sistemas individuales. (correct)
- Los estudios bioinformáticos se centran en sistemas individuales, mientras que los biológicos estudian sistemas completos
¿Qué tipo de información se organiza en grupos, teniendo en cuenta las funciones específicas o rutas metabólicas?
¿Qué tipo de información se organiza en grupos, teniendo en cuenta las funciones específicas o rutas metabólicas?
De los siguientes, ¿cuál es un desafío actual en el campo de la bioinformática?
De los siguientes, ¿cuál es un desafío actual en el campo de la bioinformática?
¿Cuál es el propósito del 'Dogma Central de la Biología Molecular'?
¿Cuál es el propósito del 'Dogma Central de la Biología Molecular'?
En el contexto de la cascada 'omics', ¿qué estudia la genómica?
En el contexto de la cascada 'omics', ¿qué estudia la genómica?
Si un investigador está interesado en estudiar cómo la estructura y función de las proteínas interactúan dentro de una célula, ¿a qué nivel 'ómico' debería enfocarse?
Si un investigador está interesado en estudiar cómo la estructura y función de las proteínas interactúan dentro de una célula, ¿a qué nivel 'ómico' debería enfocarse?
¿A qué se refiere el término 'genotipo'?
¿A qué se refiere el término 'genotipo'?
Para un estudio que simula interacciones biológicas con modelos informáticos, ¿qué término describe mejor este tipo de experimento?
Para un estudio que simula interacciones biológicas con modelos informáticos, ¿qué término describe mejor este tipo de experimento?
¿Cuál de las siguientes opciones describe mejor el objetivo de la secuenciación en biología molecular?
¿Cuál de las siguientes opciones describe mejor el objetivo de la secuenciación en biología molecular?
En el contexto de la secuenciación, ¿qué representa el 'input' y 'output' de un secuenciador?
En el contexto de la secuenciación, ¿qué representa el 'input' y 'output' de un secuenciador?
¿Cuál es una ventaja clave de los secuenciadores de nueva generación (NGS) en comparación con los de Sanger?
¿Cuál es una ventaja clave de los secuenciadores de nueva generación (NGS) en comparación con los de Sanger?
¿Cuál es una característica distintiva de los secuenciadores de tercera generación?
¿Cuál es una característica distintiva de los secuenciadores de tercera generación?
En la secuenciación de Sanger, ¿qué función tienen los dideoxinucleótidos?
En la secuenciación de Sanger, ¿qué función tienen los dideoxinucleótidos?
Durante la preparación de la muestra para la secuenciación de Illumina, ¿cuál es el propósito de agregar secuencias conocidas en ambos extremos de los fragmentos de ADN?
Durante la preparación de la muestra para la secuenciación de Illumina, ¿cuál es el propósito de agregar secuencias conocidas en ambos extremos de los fragmentos de ADN?
En la secuenciación por síntesis, ¿cómo se determina el orden de los nucleótidos?
En la secuenciación por síntesis, ¿cómo se determina el orden de los nucleótidos?
¿Cuál es la diferencia principal entre la secuenciación 'single-end' (SE) y 'paired-end' (PE)?
¿Cuál es la diferencia principal entre la secuenciación 'single-end' (SE) y 'paired-end' (PE)?
Si necesitas secuenciar un genoma completo, ¿qué formato de archivo sería más adecuado para almacenar los datos y por qué?
Si necesitas secuenciar un genoma completo, ¿qué formato de archivo sería más adecuado para almacenar los datos y por qué?
¿Qué tipo de información se encuentra en un archivo FASTQ que no está presente en un archivo FASTA?
¿Qué tipo de información se encuentra en un archivo FASTQ que no está presente en un archivo FASTA?
¿Cuál es el propósito principal de FASTQC en el análisis de datos de secuenciación de nueva generación (NGS)?
¿Cuál es el propósito principal de FASTQC en el análisis de datos de secuenciación de nueva generación (NGS)?
¿Qué significa 'Trimmear' una secuencia en el contexto del análisis de datos de secuenciación?
¿Qué significa 'Trimmear' una secuencia en el contexto del análisis de datos de secuenciación?
Si al analizar la calidad de las secuencias obtenidas observamos una baja calidad en los extremos ¿Qué tipo de acción correctiva sería más adecuada?
Si al analizar la calidad de las secuencias obtenidas observamos una baja calidad en los extremos ¿Qué tipo de acción correctiva sería más adecuada?
De las siguientes opciones, ¿cuál define mejor el concepto de 'librería' en el contexto de la secuenciación de ADN o ARN?
De las siguientes opciones, ¿cuál define mejor el concepto de 'librería' en el contexto de la secuenciación de ADN o ARN?
¿Qué diferencia una librería metagenómica de una genómica tradicional?
¿Qué diferencia una librería metagenómica de una genómica tradicional?
¿En qué consiste el proceso de 'anotación de secuencias' en bioinformática?
¿En qué consiste el proceso de 'anotación de secuencias' en bioinformática?
¿Cuál es la función principal de GenBank?
¿Cuál es la función principal de GenBank?
¿Cuál es el método de alineamiento de secuencias que busca alinear completamente dos secuencias de extremo a extremo?
¿Cuál es el método de alineamiento de secuencias que busca alinear completamente dos secuencias de extremo a extremo?
¿Cuál de los siguientes esquemas de puntuación utilizados en el alineamiento de secuencias es más adecuado para alinear proteínas evolutivamente distantes?
¿Cuál de los siguientes esquemas de puntuación utilizados en el alineamiento de secuencias es más adecuado para alinear proteínas evolutivamente distantes?
¿Qué indica un E-value bajo en un resultado de BLAST?
¿Qué indica un E-value bajo en un resultado de BLAST?
¿Cuál es el propósito principal de un árbol filogenético?
¿Cuál es el propósito principal de un árbol filogenético?
En un árbol filogenético, ¿qué representa un 'nodo interno'?
En un árbol filogenético, ¿qué representa un 'nodo interno'?
¿Qué tipo de caracteres se tienen en cuenta al en la construcción cladística de un árbol filogenético?
¿Qué tipo de caracteres se tienen en cuenta al en la construcción cladística de un árbol filogenético?
¿Qué criterio se utiliza para la construcción de arboles filogenéticos a partir de la metodología de Máxima Verosimilitud?
¿Qué criterio se utiliza para la construcción de arboles filogenéticos a partir de la metodología de Máxima Verosimilitud?
¿Para qué sirve realizar un análisis de selección en las secuencias evolutivas?
¿Para qué sirve realizar un análisis de selección en las secuencias evolutivas?
Para los alineamientos de secuencias biológicas, ¿Qué es UPGMA?
Para los alineamientos de secuencias biológicas, ¿Qué es UPGMA?
En bioinformática, ¿la interpretación de la información generada mediante tecnologías modernas de biología molecular se limita exclusivamente a la transcriptómica?
En bioinformática, ¿la interpretación de la información generada mediante tecnologías modernas de biología molecular se limita exclusivamente a la transcriptómica?
La bioinformática se define como una disciplina estrictamente dedicada al desarrollo de algoritmos para optimizar el rendimiento de superordenadores en simulaciones biológicas, dejando de lado el análisis directo de datos experimentales.
La bioinformática se define como una disciplina estrictamente dedicada al desarrollo de algoritmos para optimizar el rendimiento de superordenadores en simulaciones biológicas, dejando de lado el análisis directo de datos experimentales.
En el contexto de la bioinformática, la biología molecular es tratada como una entidad metafórica abstracta, sin aplicar técnicas informáticas directas para su estudio y manipulación.
En el contexto de la bioinformática, la biología molecular es tratada como una entidad metafórica abstracta, sin aplicar técnicas informáticas directas para su estudio y manipulación.
El único objetivo de la bioinformática es la mera recolección de datos biológicos, ignorando la coordinación y el análisis profundo que permiten extraer conclusiones significativas.
El único objetivo de la bioinformática es la mera recolección de datos biológicos, ignorando la coordinación y el análisis profundo que permiten extraer conclusiones significativas.
La bioinformática se restringe a organizar datos para que los investigadores puedan accederlos, sin permitir la actualización continua de estos a medida que se descubren nuevos hallazgos.
La bioinformática se restringe a organizar datos para que los investigadores puedan accederlos, sin permitir la actualización continua de estos a medida que se descubren nuevos hallazgos.
El desarrollo de herramientas bioinformáticas se centra en la creación de instrumentos físicos de laboratorio, dejando de lado la generación de recursos computacionales para el análisis de datos.
El desarrollo de herramientas bioinformáticas se centra en la creación de instrumentos físicos de laboratorio, dejando de lado la generación de recursos computacionales para el análisis de datos.
La bioinformática se distingue por su enfoque reduccionista, analizando sistemas biológicos individuales de forma aislada, sin considerar sus interacciones con otros sistemas relacionados.
La bioinformática se distingue por su enfoque reduccionista, analizando sistemas biológicos individuales de forma aislada, sin considerar sus interacciones con otros sistemas relacionados.
En la organización de la información genómica, los genes se distribuyen aleatoriamente a lo largo del genoma, sin considerar sus funciones específicas o rutas metabólicas.
En la organización de la información genómica, los genes se distribuyen aleatoriamente a lo largo del genoma, sin considerar sus funciones específicas o rutas metabólicas.
En la secuenciación de un genoma, la predicción precisa de la estructura de las proteínas se limita al uso de plantillas preexistentes y no permite la creación de modelos de novo.
En la secuenciación de un genoma, la predicción precisa de la estructura de las proteínas se limita al uso de plantillas preexistentes y no permite la creación de modelos de novo.
El diseño racional de inhibidores de moléculas pequeñas se basa principalmente en la experimentación empírica, sin recurrir a modelos computacionales o bioinformáticos complejos.
El diseño racional de inhibidores de moléculas pequeñas se basa principalmente en la experimentación empírica, sin recurrir a modelos computacionales o bioinformáticos complejos.
Las ontologías genéticas efectivas se fundamentan en descripciones narrativas ambiguas, rechazando el uso de vocabularios controlados y estructuras formales para describir la función de genes y proteínas.
Las ontologías genéticas efectivas se fundamentan en descripciones narrativas ambiguas, rechazando el uso de vocabularios controlados y estructuras formales para describir la función de genes y proteínas.
En el contexto del dogma central de la biología molecular, la transcripción del ADN al ARN ocurre exclusivamente en los ribosomas, donde también tiene lugar la traducción a proteínas.
En el contexto del dogma central de la biología molecular, la transcripción del ADN al ARN ocurre exclusivamente en los ribosomas, donde también tiene lugar la traducción a proteínas.
Dentro del marco del dogma central, la metilación del ADN representa un proceso estático e irreversible, carente de influencia dinámica sobre la expresión génica en respuesta a señales ambientales.
Dentro del marco del dogma central, la metilación del ADN representa un proceso estático e irreversible, carente de influencia dinámica sobre la expresión génica en respuesta a señales ambientales.
La genómica se centra exclusivamente en el estudio de genes individuales, sin considerar el conjunto completo del ADN de un organismo ni su influencia en el fenotipo.
La genómica se centra exclusivamente en el estudio de genes individuales, sin considerar el conjunto completo del ADN de un organismo ni su influencia en el fenotipo.
La transcriptómica analiza la estructura tridimensional de los ARNs mensajeros, con el fin de predecir las modificaciones post-transcripcionales y su impacto traduccional en las proteínas.
La transcriptómica analiza la estructura tridimensional de los ARNs mensajeros, con el fin de predecir las modificaciones post-transcripcionales y su impacto traduccional en las proteínas.
La proteómica, a diferencia de la genómica, es un campo estático que estudia la estructura de las proteínas sin considerar las dinámicas interacciones y funciones celulares.
La proteómica, a diferencia de la genómica, es un campo estático que estudia la estructura de las proteínas sin considerar las dinámicas interacciones y funciones celulares.
La metabolómica se centra en el estudio de la secuencia lineal de los metabolitos, sin considerar las vías metabólicas ni los procesos energéticos celulares.
La metabolómica se centra en el estudio de la secuencia lineal de los metabolitos, sin considerar las vías metabólicas ni los procesos energéticos celulares.
El fenotipo de un organismo está determinado únicamente por su genotipo, sin influencia del ambiente o las interacciones entre ambos.
El fenotipo de un organismo está determinado únicamente por su genotipo, sin influencia del ambiente o las interacciones entre ambos.
Los estudios in vivo se limitan a simulaciones computacionales de interacciones biológicas, ofreciendo una visión abstracta sin la complejidad de los sistemas biológicos reales.
Los estudios in vivo se limitan a simulaciones computacionales de interacciones biológicas, ofreciendo una visión abstracta sin la complejidad de los sistemas biológicos reales.
Los experimentos in vitro replican con exactitud las condiciones fisiológicas de un organismo vivo, eliminando la necesidad de validación in vivo posterior.
Los experimentos in vitro replican con exactitud las condiciones fisiológicas de un organismo vivo, eliminando la necesidad de validación in vivo posterior.
La secuenciación de Sanger, aunque precisa para fragmentos cortos de ADN, es actualmente la técnica de elección para el análisis de genomas completos debido a su eficiencia y coste reducido.
La secuenciación de Sanger, aunque precisa para fragmentos cortos de ADN, es actualmente la técnica de elección para el análisis de genomas completos debido a su eficiencia y coste reducido.
En la secuenciación de nueva generación (NGS), la amplificación de ADN es un paso opcional que solo se realiza cuando la cantidad de muestra inicial es insuficiente para la detección.
En la secuenciación de nueva generación (NGS), la amplificación de ADN es un paso opcional que solo se realiza cuando la cantidad de muestra inicial es insuficiente para la detección.
La principal ventaja de los secuenciadores de tercera generación reside en su capacidad para leer secuencias de ARN directamente, sin requerir la conversión previa a ADN complementario.
La principal ventaja de los secuenciadores de tercera generación reside en su capacidad para leer secuencias de ARN directamente, sin requerir la conversión previa a ADN complementario.
En la secuenciación de Sanger, el uso de dideoxinucleótidos marcados con isótopos radiactivos es indispensable para la detección de los fragmentos de ADN en la electroforesis capilar.
En la secuenciación de Sanger, el uso de dideoxinucleótidos marcados con isótopos radiactivos es indispensable para la detección de los fragmentos de ADN en la electroforesis capilar.
La eficiencia de la secuenciación de Illumina se deriva de un proceso de amplificación clonal que ocurre in situ sobre microesferas en un reactor, previo a la secuenciación por síntesis.
La eficiencia de la secuenciación de Illumina se deriva de un proceso de amplificación clonal que ocurre in situ sobre microesferas en un reactor, previo a la secuenciación por síntesis.
En la secuenciación por síntesis, cada nucleótido se agrega de forma secuencial a la cadena de ADN, y la identificación se realiza mediante espectrometría de masas de alta resolución.
En la secuenciación por síntesis, cada nucleótido se agrega de forma secuencial a la cadena de ADN, y la identificación se realiza mediante espectrometría de masas de alta resolución.
En la secuenciación de nanoporos, la amplificación de la secuencia diana es obligatoria para asegurar una señal detectable al pasar el ADN a través del poro.
En la secuenciación de nanoporos, la amplificación de la secuencia diana es obligatoria para asegurar una señal detectable al pasar el ADN a través del poro.
La tecnología de secuenciación PacBio se basa en la detección de la señal lumínica emitida por la incorporación de nucleótidos modificados con grupos fluorescentes durante la síntesis de ADN.
La tecnología de secuenciación PacBio se basa en la detección de la señal lumínica emitida por la incorporación de nucleótidos modificados con grupos fluorescentes durante la síntesis de ADN.
En la secuenciación paired-end, solo se secuencia un extremo de cada fragmento de ADN, y la información del otro extremo se infiere mediante algoritmos bioinformáticos complejos.
En la secuenciación paired-end, solo se secuencia un extremo de cada fragmento de ADN, y la información del otro extremo se infiere mediante algoritmos bioinformáticos complejos.
En un archivo FASTQ, la calidad de cada base se representa mediante un valor numérico directamente proporcional a la probabilidad de error en la secuenciación.
En un archivo FASTQ, la calidad de cada base se representa mediante un valor numérico directamente proporcional a la probabilidad de error en la secuenciación.
El software FASTQC evalúa la precisión de las anotaciones del genoma, corrigiendo errores y ajustando automáticamente las coordenadas de los genes.
El software FASTQC evalúa la precisión de las anotaciones del genoma, corrigiendo errores y ajustando automáticamente las coordenadas de los genes.
El proceso de 'trimmear' secuencias implica exclusivamente la eliminación de adaptadores, sin considerar la posibilidad de mejorar la calidad general removiendo bases de baja calidad.
El proceso de 'trimmear' secuencias implica exclusivamente la eliminación de adaptadores, sin considerar la posibilidad de mejorar la calidad general removiendo bases de baja calidad.
El gen KRAS, al ser un represor transcripcional clave, inhibe la proliferación celular y previene la formación de tumores.
El gen KRAS, al ser un represor transcripcional clave, inhibe la proliferación celular y previene la formación de tumores.
La codominancia genética ocurre cuando un alelo enmascara completamente la expresión de otro, resultando en un fenotipo que exhibe solamente el rasgo del alelo dominante.
La codominancia genética ocurre cuando un alelo enmascara completamente la expresión de otro, resultando en un fenotipo que exhibe solamente el rasgo del alelo dominante.
El alineamiento global de secuencias busca identificar las regiones más similares entre dos secuencias, sin considerar la necesidad de alinear las secuencias completas.
El alineamiento global de secuencias busca identificar las regiones más similares entre dos secuencias, sin considerar la necesidad de alinear las secuencias completas.
En algoritmos de alineamiento, la penalización por gaps es un costo fijo que se añade independientemente de la longitud del hueco introducido.
En algoritmos de alineamiento, la penalización por gaps es un costo fijo que se añade independientemente de la longitud del hueco introducido.
El algoritmo de Clustal Omega se basa en la programación dinámica para garantizar la alineación óptima de secuencias, priorizando la precisión sobre la velocidad y la escalabilidad.
El algoritmo de Clustal Omega se basa en la programación dinámica para garantizar la alineación óptima de secuencias, priorizando la precisión sobre la velocidad y la escalabilidad.
T-Coffee utiliza exclusivamente información de alineamientos globales por pares para construir un alineamiento múltiple más consistente.
T-Coffee utiliza exclusivamente información de alineamientos globales por pares para construir un alineamiento múltiple más consistente.
BLAST garantiza la identificación del alineamiento óptimo entre una secuencia de consulta y una base de datos, asegurando la máxima precisión en la búsqueda de homologías.
BLAST garantiza la identificación del alineamiento óptimo entre una secuencia de consulta y una base de datos, asegurando la máxima precisión en la búsqueda de homologías.
En el algoritmo Smith-Waterman, los valores negativos en la matriz de puntuación se conservan para reflejar la divergencia evolutiva entre las secuencias analizadas.
En el algoritmo Smith-Waterman, los valores negativos en la matriz de puntuación se conservan para reflejar la divergencia evolutiva entre las secuencias analizadas.
BLOSUM62 es más apropiada para comparar secuencias con alta divergencia evolutiva, mientras que BLOSUM80 es mejor para secuencias muy similares.
BLOSUM62 es más apropiada para comparar secuencias con alta divergencia evolutiva, mientras que BLOSUM80 es mejor para secuencias muy similares.
En el contexto de la filogenia, un árbol no arraigado representa las relaciones evolutivas entre los taxones, pero indica la dirección del tiempo ni el ancestro común.
En el contexto de la filogenia, un árbol no arraigado representa las relaciones evolutivas entre los taxones, pero indica la dirección del tiempo ni el ancestro común.
Flashcards
¿Qué es la bioinformática?
¿Qué es la bioinformática?
Disciplina interdisciplinaria que combina biología, informática y matemáticas para analizar datos biológicos.
¿Objetivo de la bioinformática?
¿Objetivo de la bioinformática?
Organizar y actualizar los datos biológicos para facilitar el acceso e interpretación por parte de los investigadores.
Estudios bioinformáticos
Estudios bioinformáticos
Estudios a nivel global de toda la información, analizando sistemas completos y determinando principios generales.
¿Dogma central de biología molecular?
¿Dogma central de biología molecular?
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¿Qué es la cascada ómica?
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¿Qué es la proteómica?
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¿Qué es el genotipo?
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¿Qué es el fenotipo?
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¿Qué significa 'in vivo'?
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¿Qué significa 'in vitro'?
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¿Qué significa 'in silico'?
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¿Qué es secuenciación?
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¿Qué es un secuenciador?
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Secuenciadores de Sanger
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Secuenciación de nueva generación
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Secuenciación por síntesis
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Clusterización
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Nanoporos
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PacBio
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¿Qué son single-end y paired-end?
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¿Single-end?
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¿Paired-end?
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¿Formato FASTA?
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¿Formato FASTQ?
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¿FASTQC?
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¿Qué es 'Trimmear'?
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¿Qué son las librerías?
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¿Librerías genómicas?
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¿Librerías transcriptómicas?
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¿Qué es la genómica?
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¿Metagenómica?
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¿Anotación de secuencias?
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¿Qué es GenBank?
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¿Estado homocigoto?
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¿Estado heterocigoto?
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GAPS
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Scoring matrices
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Habilidades en bioinformática
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Flujo de info genética
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¿Qué expresa la interacción?
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¿Qué son las READS?
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Sanger
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Tecnología actualizada
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Preparación de la muestra
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¿Qué evalua el software?
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colecciones de genes
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Referencia del Gen
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Allelo
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Alineamiento
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¿Similitud?
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¿Identidad?
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¿Homología?
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¿Ortólogo?
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¿Parálogo?
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¿Qué es BLOSUM?
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¿Qué es BLAST?
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