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Questions and Answers
¿Cuál es la principal función de las nucleasas programables en el sistema CRISPR/Cas9?
¿Cuál es la principal función de las nucleasas programables en el sistema CRISPR/Cas9?
¿Cuál de las siguientes estrategias se utiliza para la inactivación génica mediante un mecanismo de recombinación homóloga?
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La interferencia por RNA (RNAi) se basa principalmente en la acción de qué tipo de moléculas?
La interferencia por RNA (RNAi) se basa principalmente en la acción de qué tipo de moléculas?
¿Cuál es el resultado potencial de la reparación de DSBs inducidos por Cas9 a través del mecanismo NHEJ?
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¿Qué técnica implica el silenciamiento de genes mediante el corte del RNA en moléculas de 21-25 nucleótidos?
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La acción de los elementos transponibles se asocia con qué tipo de proceso de inactivación génica?
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¿Cuál es un método simple utilizado para la búsqueda de genes en la genómica estructural?
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¿Qué limitación tiene la búsqueda de ORFs en eucariotas en comparación con procariotas?
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¿Cuál de los siguientes métodos tiene en cuenta las señales de poliadenilación en eucariotas?
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¿Qué tipo de genoma se beneficia especialmente de los programas específicos para el análisis de ncRNAs?
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¿Cuál de las siguientes técnicas se utiliza para la manipulación del ADN a nivel genómico?
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¿Qué papel cumple RISC en el proceso de regulación de genes?
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La sobreexpresión de un gen es principalmente utilizada cuando:
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¿Qué define la genómica comparativa?
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¿Qué elemento es crucial para la secuenciación de genomas?
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La bioinformática se utiliza principalmente para:
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La técnica de CRISPR/Cas9 permite:
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¿Qué es la cobertura en la secuenciación de genomas?
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Estrategias de secuenciación...
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Study Notes
Inactivación génica
- La inactivación de genes permite identificar fenotipos mutantes, utilizando la genética reversa.
- Existen dos tipos de mutagénesis: dirigida (ej: recombinación homóloga) y al azar (ej: transposones).
Estrategias de inactivación génica
-
Recombinación homóloga:
- Interrumpe un gen con un segmento de DNA no relacionado.
- Se utiliza en organismos modelo como levadura y ratón.
- La recombinación ocurre entre la copia del gen y una versión interrumpida incluida en un vector de clonación.
-
Sistema CRISPR/Cas9:
- Utiliza nucleasas programables para editar el genoma al reconocer secuencias específicas de DNA.
- Produce rupturas de doble cadena (DSBs) que pueden ser reparadas por vías NHEJ o HDR.
- La edición mediante Cas9 permite modificar el genoma de manera precisa.
-
Interferencia por RNA (RNAi):
- Silenciamiento génico mediado por RNA de doble cadena, donde Dicer corta RNA en siRNAs.
- El complejo RISC degrada el ARN mensajero (RNAm) objetivo, reduciendo su expresión.
-
Elementos transponibles:
- Inactivan genes al insertar un elemento en la región transcrita o promotora.
- Utilizados en organismos como Drosophila o C. elegans.
- Puede resultar en escisiones imprecisas, generando deleciones.
Sobreexpresión génica
- Se utiliza cuando la inactivación del gen resulta letal o no produce un fenotipo detectable debido a redundancia funcional.
Determinación de la función de los genes
- Requiere conocer la secuencia del genoma, localizar los genes y definir su estructura (anotación estructural).
- La localización y estructura de genes se determina mediante:
- Análisis de secuencias mediante métodos informáticos que buscan características propias de un gen.
- Predicción de novo mediante búsqueda de marcos de lectura abiertos (ORFs); eficaces en procariotas, pero limitados en eucariotas debido a intrones y DNA intergénico.
Anotación funcional
- Implica asignar funciones a los genes tras su localización.
- Puede hacerse mediante:
- Comparación con secuencias homólogas en otras especies, utilizando herramientas informáticas y bases de datos.
- Análisis más complejos que consideran señales promotoras, secuencias de splicing y señales de poliadenilación en eucariotas.
Herramientas y metodología
- Herramientas como ORFfinder y GeneScan se utilizan para la identificación de genes.
- Estudio de sesgos en el uso de codones y señales de terminación/transcripción para mejorar la precisión en la predicción de genes.
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Description
Este cuestionario explora la inactivación génica a través de la mutagénesis dirigida y aleatoria. Se enfoca en la recombinación homóloga como estrategia para interrumpir genes en organismos modelo como levaduras y ratones, identificando fenotipos mutantes. Prueba tus conocimientos sobre genética reversa y técnicas de manipulación genética.
