GFP e piccole RNA: Vantaggi e Funzioni
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Questions and Answers

Qual è il principale vantaggio dell'uso della GFP nelle analisi cellulari?

  • Aumenta la stabilità delle proteine nell'ambiente cellulare
  • Permette di modificare geneticamente le proteine
  • Consente di visualizzare il traffico e la localizzazione delle proteine nella cellula (correct)
  • Riduce le dimensioni delle proteine
  • Qual è la struttura principale della GFP?

  • Una catena polipeptidica priva di struttura secondaria
  • Un composto globulare senza foglietti beta
  • Una semplice proteina fibrosa
  • Un barile-beta con segmenti di alfa elica (correct)
  • Cosa succede alla proteina VSVG quando viene incubata a 40°C per 60 minuti?

  • Non può uscire dal reticolo endoplasmatico (correct)
  • Si accumula nell'apparato di Golgi
  • Viene completamente distrutta
  • Può lasciare il reticolo endoplasmatico
  • Qual è la temperatura a cui la proteina GFP associata al gene virale si sposta nell'apparato di Golgi?

    <p>32°C</p> Signup and view all the answers

    Quale funzione svolge il fluoroforo presente nella GFP?

    <p>Assorbe luce e emette fluorescenza</p> Signup and view all the answers

    Che tipo di gene viene utilizzato nell'esperimento con la GFP e il virus VSV?

    <p>Gene termosensibile</p> Signup and view all the answers

    In quali organismi è stata originariamente scoperta la GFP?

    <p>Nella medusa Aequorea victoria</p> Signup and view all the answers

    Qual è l'unità di massa molecolare della GFP?

    <p>27.000 dalton</p> Signup and view all the answers

    Qual è l'effetto principale della mutazione sec12 sul reticolo endoplasmatico?

    <p>Impedisce la formazione delle vescicole nel RE</p> Signup and view all the answers

    Qual è il ruolo dei piccoli RNA (smallRNA) nell'organismo?

    <p>Regolano l'espressione genica</p> Signup and view all the answers

    Come influenzano le mutazioni sec17 il citosol?

    <p>Portano a un aumento delle vescicole nel citosol</p> Signup and view all the answers

    Qual è la lunghezza tipica dei siRNA?

    <p>21-22 nucleotidi</p> Signup and view all the answers

    Quale funzione NON è associata ai siRNA?

    <p>Rafforzamento della sintesi proteica</p> Signup and view all the answers

    Quale di queste affermazioni riguardanti la mannosidasi II è corretta?

    <p>Si trasferisce dal reticolo endoplasmatico al Golgi</p> Signup and view all the answers

    Qual è l'effetto del siRNA quando si lega all'mRNA complementare?

    <p>Implica la degradazione dell'mRNA</p> Signup and view all the answers

    Quale processo è influenzato dalla mutazione sec12 nello studio dei lieviti?

    <p>Formazione delle vescicole dal reticolo endoplasmatico</p> Signup and view all the answers

    Quale delle seguenti affermazioni riguarda la via secretoria costitutiva?

    <p>È un processo che avviene continuamente per il mantenimento dell'ambiente extracellulare.</p> Signup and view all the answers

    Quale tecnica è utilizzata per rilevare la posizione del materiale marcato radioattivamente all'interno di una cellula?

    <p>Autoradiografia</p> Signup and view all the answers

    Qual è la principale funzione delle cellule acinose del pancreas nel contesto del sistema delle endomembrane?

    <p>Secrezione di enzimi digestivi attraverso i dotti del pancreas.</p> Signup and view all the answers

    Cosa si intende per via endocitica nel sistema delle endomembrane?

    <p>La captazione di materiali esterni da parte della cellula.</p> Signup and view all the answers

    Quale affermazione descrive meglio la tecnica di autoradiografia per lo studio delle cellule?

    <p>Permette di vedere la radioattività grazie ai granuli di argento sviluppati.</p> Signup and view all the answers

    In quale situazione si verifica la secrezione regolatoria da parte di una cellula?

    <p>Solo in risposta a specifici stimoli esterni.</p> Signup and view all the answers

    Qual è il principale scopo degli esperimenti condotti da Palade e Jamlenson sulle cellule acinose del pancreas?

    <p>Comprendere il meccanismo di sintesi delle proteine di secrezione.</p> Signup and view all the answers

    Le cellule muscolari hanno un reticolo endoplasmatico liscio più sviluppato per quale motivo?

    <p>Per la contrazione muscolare.</p> Signup and view all the answers

    Qual è la funzione principale dell'ubiquitina?

    <p>Marcare le proteine per la distruzione</p> Signup and view all the answers

    Dove è localizzata la proteina disolfuro isomerasi (PDI)?

    <p>Nel lume del RER</p> Signup and view all the answers

    Quale affermazione descrive meglio le sequenze topogeniche?

    <p>Determinano l’orientamento sulla membrana</p> Signup and view all the answers

    Qual è il ruolo principale del reticolo endoplasmatico rugoso (RER)?

    <p>Controllare la qualità delle proteine</p> Signup and view all the answers

    Cosa viene trasportato al proteasoma per la proteolisi?

    <p>Proteine poliubiquitinate</p> Signup and view all the answers

    Qual è il meccanismo attraverso cui il PDI facilita il folding delle proteine?

    <p>Crea legami disolfuro</p> Signup and view all the answers

    Cosa avviene durante il processo di poliubiquitinazione?

    <p>Molte molecole di ubiquitina si attaccano a una proteina bersaglio</p> Signup and view all the answers

    Qual è l'importanza delle alfa-eliche transmembrana nella catena polipeptidica?

    <p>Permettono di ancorare la proteina alla membrana</p> Signup and view all the answers

    Quale dichiarazione riguardo i mielomi è corretta?

    <p>I mielomi sono tumori maligni dei linfociti B.</p> Signup and view all the answers

    Quale processo permette il trasferimento di catene leggere all'interno delle vescicole?

    <p>La traduzione in vitro tramite ribosomi legati a membrana.</p> Signup and view all the answers

    Come attraversano le membrane le proteine integrali?

    <p>Mediante regioni alfa-elica di 20-25 aminoacidi idrofobici.</p> Signup and view all the answers

    Quale affermazione sull'inserimento delle proteine nel reticolo endoplasmatico è falsa?

    <p>Le sequenze segnale vengono sempre rimosse dopo l'inserimento.</p> Signup and view all the answers

    Quale fase avviene quando il traslocone riconosce una sequenza transmembrana durante la traduzione?

    <p>La proteina esce lateralmente dal traslocone.</p> Signup and view all the answers

    In quale modo il termine N-terminale è orientato durante l'inserimento della proteina nelle membrane?

    <p>Verso il lume del reticolo endoplasmatico.</p> Signup and view all the answers

    Quale affermazione riguardo la sintesi delle proteine e l'orientamento è corretta?

    <p>Le proteine possono avere orientamenti diversi all'interno della membrana.</p> Signup and view all the answers

    Qual è il ruolo delle alfa-eliche idrofobiche nell'inserimento delle proteine di membrana?

    <p>Facilitare l'inserimento della proteina nella membrana.</p> Signup and view all the answers

    Qual è la funzione principale delle sequenze segnale nelle proteine?

    <p>Indirizzare le proteine verso il Reticolo Endoplasmatico Ruvido</p> Signup and view all the answers

    Quali delle seguenti affermazioni descrive correttamente la destinazione delle proteine?

    <p>Le proteine secernenti terminano la sintesi nel Reticolo Endoplasmatico.</p> Signup and view all the answers

    Cosa determina il passaggio delle proteine dal citosol al Reticolo Endoplasmatico Ruvido?

    <p>La presenza di sequenze segnale sull'estremità N-terminale delle proteine</p> Signup and view all the answers

    Qual è il ruolo principale delle vescicole nel trasporto cellulare?

    <p>Trasportare proteine in direzioni opposte nella cellula</p> Signup and view all the answers

    Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo ai mielomi?

    <p>Sono cellule che producono immunoglobuline</p> Signup and view all the answers

    In che modo la struttura delle proteine influisce sulla loro destinazione?

    <p>Le proteine con sequenze segnale appropriate vengono indirizzate agli organelli specifici</p> Signup and view all the answers

    Per quale motivo le proteine ribosomiali possono restare nel citosol?

    <p>Non hanno sequenze segnale</p> Signup and view all the answers

    Qual è la funzione principale del Reticolo Endoplasmatico Ruvido?

    <p>Sintesi e modificazione delle proteine destinate al trasporto</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    SISTEMA DELLE ENDOMEMBRANE

    • Le vie biosintetiche secretorie ed endocitiche collegano le endomembrane creando una rete interconnessa.
    • La via secretoria inizia nel reticolo endoplasmatico (RE), prosegue nell'apparato di Golgi e poi attraverso vescicole per l'esocitosi.
    • Le vescicole trasportano le molecole all'esterno della cellula.
    • La via endocitica internalizza materiale esterno tramite endocitosi.
    • Le vie secretorie ed endocitiche scambiano materiale all'interno della cellula.
    • La via secretoria può essere di due tipi:
      • Costitutiva: la secrezione avviene continuamente, rilasciando sostanze essenziali per l'ambiente extracellulare.
      • Regolatoria: la secrezione è stimolata da segnali esterni ed è specifica per le sostanze rilasciate.

    AUTORADIOGRAFIA

    • La tecnica autoradiografica consente di individuare la posizione del materiale marcato radioattivamente all'interno di una cellula o tessuto.
    • Un campione marcato con una sostanza radioattiva viene posto a contatto con una emulsione fotografica.
    • I siti di radioattività sul film appaiono come granuli d'argento durante lo sviluppo.
    • La tecnica è stata utilizzata per studiare le cellule delle ghiandole pancreatiche.

    STUDIO DELLE ENDOMEMBRANE

    • Le proteine di secrezione vengono sintetizzate nel reticolo endoplasmatico rugoso (RER), trasportate attraverso l'apparato di Golgi e infine secrete dalla cellula.
    • La tecnica "pulse-chase" permette di seguire le proteine attraverso le diverse stazioni delle endomembrane.
    • Le cellule acinose del pancreas sono state studiate per approfondire la sintesi e la secrezione degli enzimi digestivi.

    GREEN FLUORESCENT PROTEIN (GFP)

    • La GFP è una proteina fluorescente scoperta in una medusa.
    • Emette fluorescenza quando viene illuminata con luce di una specifica lunghezza d'onda.
    • Può essere utilizzata per studiare il percorso delle proteine nelle cellule, in quanto la sua fluorescenza rende visibili le loro posizioni.
    • Le piccole dimensioni della GFP la rendono adatta ad essere fusa con altre proteine per studiare la loro localizzazione all'interno delle cellule.

    STUDIO DEI MUTANTI

    • Gli esperimenti su cellule di lievito hanno mostrato il ruolo di specifiche proteine nel processo di secrezione.
    • In particolare, sono state rilevate due mutazioni: sec12 e sec17.
    • La mutazione sec12 impedisce la formazione di vescicole dal reticolo endoplasmatico, mentre la mutazione sec17 impedisce la fusione delle vescicole con l'apparato di Golgi.

    siRNA

    • I siRNA sono RNA a doppia elica di piccole dimensioni che possono silenziare l'espressione di un gene bersaglio.
    • Sono utilizzati per studiare il ruolo di specifiche proteine in un determinato processo biologico.
    • Possono silenziare l'RNA messaggero complementare.
    • Lo studio della mannosidasi II ha dimostrato il ruolo dei siRNA nel regolare l'espressione genica.

    ORGANELLI

    • Gli organelli sono compartimenti delimitati da membrane che svolgono specifiche funzioni nella cellula.
    • Comprensivi di reticolo endoplasmatico, Golgi, lisosomi e mitocondri.

    RETICOLO ENDOPLASMATICO

    • Il reticolo endoplasmatico è composto da una rete di membrane interconnesse che comprende regioni lisce e ruvide.
    • Il reticolo endoplasmatico rugoso (RER) presenta ribosomi sulla sua membrana.
    • Il reticolo endoplasmatico liscio (REL) non ha ribosomi.
    • Il RER è coinvolto nella sintesi e modificazione delle proteine, oltre che nel trasporto delle molecole.
    • Il REL è impegnato nella sintesi dei lipidi e nel metabolismo del glucosio.

    L'IPOTESI DEL SEGNALE

    • La sequenza segnale sulle proteine neosintetizzate dirige il trasporto delle proteine al reticolo endoplasmatico.
    • La sequenza segnale viene riconosciuta da una particella di riconoscimento del segnale (SRP), che blocca la traduzione e porta il ribosoma alla membrana del reticolo endoplasmatico.
    • Il ribosoma si lega ad un traslocone e la proteina inizia ad essere traslocata nel reticolo endoplasmatico.
    • La sequenza segnale viene rimossa da una peptidasi del segnale.
    • Le proteine sintetizzate nel reticolo endoplasmatico vengono poi trasferite ad altri organelli o secrete dalla cellula.

    INSERIMENTO DI PROTEINE NELLE MEMBRANE DEL RE

    • Differenti tipologie di proteine vengono integrate nelle membrane del reticolo endoplasmatico con modalità diverse.
    • Le proteine integrali di membrana possono attraversare la membrana una sola volta o più volte.
    • Le proteine attraversano la membrana con regioni alfa elica idrofobiche.
    • Le sequenze segnale interna possono determinare l'orientamento della proteina nella membrana.

    TRASPORTO NEL RETICOLO

    • Le proteine possono entrare nel RER con sequenze segnale rimovibili (tipo I) o non rimovibili (tipo II e III).
    • Le sequenze segnale, che sono riconosciute da proteine di smistamento, guidano il movimento delle proteine alle diverse destinazioni.
    • Le proteine che devono essere secrete o destinate alle membrane cellulari, sono inserite nella membrana del RER grazie alla sequenza segnale, che è poi rimossa.

    MODIFICAZIONI POST-TRADUZIONALI E CONTROLLO DI QUALITÀ NEL RER

    • Le proteine subiscono molte modificazioni dopo la sintesi, incluso il ripiegamento, la glicosilazione e la formazione di ponti disolfuro.
    • Le attività proteiche sono monitorate nel RER attraverso chaperone molecolari per garantire la corretta funzione delle proteine.
    • Il processo di controllo di qualità consente alle cellule di rimuovere le proteine ripiegate in modo non corretto.

    GLICOSILAZIONE

    • La glicosilazione è una modificazione post-traduzionale in cui gli zuccheri vengono aggiunti a una proteina.
    • Questo processo può aiutare nel trasporto e nell'attività della proteina.
    • Le catene di zuccheri possono essere aggiunte prima o dopo la traslocazione nel RER e nel Golgi.

    RIPIEGAMENTO DELLE PROTEINE

    • Le proteine devono ripiegarsi correttamente per svolgere le loro funzioni.
    • Le proteine mal ripiegate vengono normalmente degradate nel proteasoma.
    • Le proteine vengono riportate nel citoplasma per la degradazione se il ripiegamento è compromesso.
    • Sono presenti chaperon proteiche che aiutano le proteine a ripiegarsi correttamente.

    PROTEINA DISOLFURO ISOMERASI

    • La PDI si trova all'interno del reticolo endoplasmatico e ha il ruolo di catalizzare i legami disolfuro.
    • Catalizzare il riarrangiamento dei legami disolfuro all'interno, ed esterni, delle proteine.

    STRESS ER

    • Lo stress ER si verifica quando c'è un accumulo di proteine mal ripiegate nel reticolo endoplasmatico.
    • Le cellule attivano la risposta allo stress ER per cercare di ripristinare l'omeostasi.
    • Attraverso diverse vie di segnalazione si aumenta la capacità del reticolo endoplasmatico di ripiegare le proteine.
    • L'omologo di C/EBP (CHOP ) si attiva inducendo l'apoptosi.

    PERK E IRE1α

    • PERK e IRE1α sono due proteine che svolgono un ruolo nella risposta allo stress ER, che determinano diversi processi cellulari.
    • Sono importanti in risposta al ripiegamento errato delle proteine nel reticolo endoplasmatico.
    • Queste due proteine regolano la trascrizione di geni implicati in risposta, ripiegamento delle proteine e riparazione del reticolo.

    MECCANISMO MEDIATO DA ATF6

    • ATF6 è un fattore di trascrizione che rileva lo stress ER e si lega ad altre proteine, regolando l'espressione genica per il controllo delle proteine ripiegate erroneamente nel lume del reticolo endoplasmatico.
    • Questo meccanismo porta alla trascrizione dei geni corrispondenti per incrementare il ripiegamento proteico e il funzionamento del reticolo.
    • Alcuni farmaci o sostanze chimiche possono indurre lo stress ER.

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    Description

    Questo quiz esplora i principali vantaggi dell'uso della GFP nelle analisi cellulari e il ruolo dei piccoli RNA negli organismi. Attraverso una serie di domande dettagliate, gli studenti possono testare la loro comprensione sulla struttura della GFP, le mutazioni associate e le funzioni cellulari. È un'opportunità ideale per approfondire conoscenze in biologia cellulare e molecolare.

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