Fase di Inizio e Allungamento Trascrizione
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Questions and Answers

Quale di queste affermazioni riguardo al DNA scrunching è corretta?

  • Non è necessario modificare la struttura del DNA.
  • Il DNA si apre per esporre il filamento templato. (correct)
  • La denaturazione avviene senza l'uso di energia.
  • Il DNA rimane sempre in una struttura a doppia elica.

    • Qual è la sequenza consenso più comune nei promotori dei batteri?

  • TATAAT (correct)
  • ATCGGC
  • CCTAGG
  • GCGCAG

    • Qual è la funzione principale del promotore nel processo di trascrizione?

  • Fornire energia per l'attività dell'enzima
  • Attivare la sintesi di proteine
  • Consentire il legame della RNA polimerasi per avviare la trascrizione (correct)
  • Rendere il DNA resistente alla denaturazione

    • Quale ruolo svolge il fattore sigma70 durante la formazione del complesso binario aperto?

    <p>Rilascia energia dal superavvolgimento.</p> Signup and view all the answers

    Cosa rappresentano le sequenze consenso nel promotore?

    <p>Sequenze comuni in diversi promotori</p> Signup and view all the answers

    Cosa accade durante gli inizi abortivi?

    <p>Si sintetizzano i primi 2-10 nucleotidi ma il complesso si stacca.</p> Signup and view all the answers

    Qual è il ruolo specifico del fattore sigma nell'assemblaggio dell'oloenzima?

    <p>Identificare e legare le sequenze -10 e -35 del promotore</p> Signup and view all the answers

    Qual è il ruolo dell'energia potenziale liberata dalla rottura del superavvolgimento negativo?

    <p>Stabilizzare il complesso ternario.</p> Signup and view all the answers

    Quale delle seguenti affermazioni è falsa riguardo al complesso binario chiuso?

    <p>Il core dell'oloenzima si stacca dal DNA.</p> Signup and view all the answers

    Cosa accade durante il passaggio dal complesso binario chiuso a quello aperto?

    <p>Il fattore sigma si stacca dall'oloenzima</p> Signup and view all the answers

    Quale affermazione descrive correttamente la struttura del complesso binario chiuso?

    <p>Il DNA è ancora a doppia elica e non è stato denaturato</p> Signup and view all the answers

    Qual è la direzione di sintesi durante l'attività della polimerasi RNA?

    <p>5' --&gt; 3'</p> Signup and view all the answers

    Qual è il risultato del fenomeno del DNA scrunching?

    <p>Si determina la curvatura di un filamento di DNA</p> Signup and view all the answers

    Cosa causa la curvatura del DNA durante il legame con il fattore sigma70?

    <p>Il ripiegamento del DNA a 90°.</p> Signup and view all the answers

    Cosa impedisce alla RNA polimerasi di avanzare immediatamente dopo la formazione del complesso aperto?

    <p>Le interazioni specifiche tra RNA polimerasi e fattore sigma</p> Signup and view all the answers

    Perché il fattore sigma non lega il promotore come monomero?

    <p>Perché la regione 1.1 mima il DNA</p> Signup and view all the answers

    Qual è il ruolo specifico della proteina N nel ciclo del fago lambda?

    <p>Funziona come anti-terminatore legandosi alla polimerasi</p> Signup and view all the answers

    Cosa avviene in presenza della proteina N in un operone Trp con mutazione nonsense?

    <p>La polarità viene invertita e i geni vengono espressi</p> Signup and view all the answers

    Quali elementi sono coinvolti nel processo di terminazione della trascrizione nei batteri?

    <p>Attenuatori e anti-terminatori</p> Signup and view all the answers

    In che modo gli anti-terminatori influenzano il ciclo di trascrizione nei fagi?

    <p>Permettono la transizione tra geni early e geni late</p> Signup and view all the answers

    Quale effetto si osserva quando non è presente la proteina N durante la trascrizione?

    <p>Si verifica terminazione della trascrizione con conseguente polarità</p> Signup and view all the answers

    Qual è il principale risultato della formazione del complesso binario aperto?

    <p>Rilascio di energia per l'inserimento del filamento stampo</p> Signup and view all the answers

    Cosa avviene durante la transizione dalla fase di inizio alla fase di allungamento?

    <p>Il fattore sigma si distacca permettendo l'allungamento</p> Signup and view all the answers

    Quali sono le porzioni della RNA polimerasi che partecipano al processo di allungamento?

    <p>Porzioni delle subunità β e β’</p> Signup and view all the answers

    Che ruolo ha il pirofosfato nel processo di trascrizione?

    <p>Rilascia l'energia necessaria per la formazione del legame fosfodiesterico</p> Signup and view all the answers

    Perché è fondamentale studiare la trascrizione nei batteri per i futuri medici?

    <p>Per comprendere il meccanismo di resistenza agli antibiotici</p> Signup and view all the answers

    Qual è il meccanismo d'azione della rifampicina?

    <p>Blocca la trascrizione interferendo con il sito catalitico</p> Signup and view all the answers

    Quale affermazione riguardo alla RNA polimerasi è corretta?

    <p>È altamente conservata tra diversi organismi</p> Signup and view all the answers

    Qual è la funzione del canale di uscita dell'RNA nella RNA polimerasi?

    <p>Permettere l'uscita dell'RNA sintetizzato</p> Signup and view all the answers

    Quale delle seguenti affermazioni sull'RNA polimerasi è corretta?

    <p>L'RNA polimerasi può fermarsi per vari motivi, inclusa l'introduzione di un nucleotide sbagliato.</p> Signup and view all the answers

    Cosa avviene durante l'attività di editing pirofosfolitico dell'RNA polimerasi?

    <p>Il pirofosfato appena staccato viene rilegato al nucleotide incorporato.</p> Signup and view all the answers

    Quale di queste affermazioni sulla topologia del DNA è corretta?

    <p>Il DNA è una doppia elica destrogira con solco maggiore e minore.</p> Signup and view all the answers

    Cos'è necessario per rilassare il DNA superavvolto?

    <p>Rompe i microdomini presenti nel DNA.</p> Signup and view all the answers

    Qual è uno dei meccanismi attraverso cui l'RNA polimerasi corregge gli errori?

    <p>Editing pirofosfolitico.</p> Signup and view all the answers

    Per quale motivo l'RNA polimerasi può interrompere la trascrizione?

    <p>Quando incontra una sequenza di DNA che arresta la trascrizione.</p> Signup and view all the answers

    Quale affermazione descrive accuratamente il cromosoma batterico?

    <p>È circolare e associato a circa 400 sottodomini.</p> Signup and view all the answers

    Quale comportamento caratterizza la DNA polimerasi rispetto all'RNA polimerasi?

    <p>La DNA polimerasi ha una maggiore accuratezza nella replicazione.</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    FASE DI INIZIO

    • Il fattore sigma si lega al promotore con elevata affinità
    • Il promotore è una sequenza di DNA che regola l'inizio della trascrizione
    • Le sequenze consenso, come la box -10 e la box -35, sono tipiche dei promotori batterici
    • Il DNA scrunching, un processo di denaturazione del DNA, porta alla formazione del complesso binario aperto (DNA a doppia elica diventa a singola)
    • Il fattore sigma si stacca dall'oloenzima durante il passaggio al complesso binario aperto
    • Lo spostamento della regione sigma 1.1 apre il canale di uscita dell'RNA
    • Il fattore sigma rimane legato al promotore, tenendo ferma la polimerasi fino al distacco

    FASE DI ALLUNGAMENTO

    • Il movimento dell'RNA polimerasi avviene tramite un canale di entrata del DNA, un canale di uscita del DNA e un canale di uscita dell'RNA
    • Il ponte proteico della RNApol subisce un cambio conformazionale durante l'allungamento
    • La rottura del legame covalente del nucleotide entrante libera l'energia per la formazione di un nuovo legame fosfodiesterico
    • La RNApol batterica è un bersaglio per gli antibiotici, come le rifampicine e la fidaxomicina
    • Gli antibiotici si legano al sito catalitico o allostericamente inibendo la trascrizione

    ATTIVITÀ DI CORREZIONE DI BOZZE (PROOFREADING ACTIVITY)

    • La RNApol corregge gli errori durante la trascrizione utilizzando l'editing pirofosfolitico o l'editing idrolitico
    • L'editing pirofosfolitico è una reazione inversa della formazione del legame fosfodiesterico
    • L'editing idrolitico comporta la rimozione di una sequenza di RNA errata

    TOPOLOGIA DEL DNA

    • Il DNA batterico è superavvolto e associato a proteine, formando circa 400 sottodomini
    • I sottodomini sono porzioni di DNA superavvolte da proteine, indipendenti tra loro
    • La struttura superavvolta è necessaria per impacchettare il DNA nella cellula batterica

    REGOLAZIONE DELLA TERMINAZIONE

    • La terminazione della trascrizione nei batteri può essere regolata da attenuatori e anti-terminatori
    • Gli attenuatori terminano prematuramente la trascrizione
    • Gli anti-terminatori impediscono la terminazione
    • Il fago lambda utilizza gli anti-terminatori per regolare la trascrizione dei suoi geni
    • L'attività anti-terminatrice della proteina N del fago lambda è dimostrata dalla sua capacità di invertire la polarità di un operone con codone di stop prematuro

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    Description

    Questo quiz esplora i dettagli della fase di inizio e allungamento della trascrizione. Scoprirete come il fattore sigma interagisce con il promotore e il ruolo dell'RNA polimerasi nel processo. Testate la vostra comprensione delle sequenze di consenso e dei cambiamenti conformazionali durante l'allungamento.

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