Podcast
Questions and Answers
מה יקרה אם מערכת תיקון DNA תוציא את הנוקלאוטיד הנכון במהלך שכפול?
מה יקרה אם מערכת תיקון DNA תוציא את הנוקלאוטיד הנכון במהלך שכפול?
- מספר מולקולות ה-DNA התקינות יקטן.
- לא יהיה שינוי במספר המולקולות התקינות.
- מספר המוטציות יגדל.
- תיווצרנה 100% מולקולות DNA תקינות. (correct)
מה נדרש כדי שמערכת תיקון DNA תוציא נוקלאוטיד שגוי?
מה נדרש כדי שמערכת תיקון DNA תוציא נוקלאוטיד שגוי?
- לזהות את מיקום הטעות בגדיל ה-DNA.
- להעריך את יציבות מבנה הסליל הכפול.
- לדעת איזה גדיל הוא החדש ומי הישן. (correct)
- לזהות את הנוקלאוטיד בעל הפוטנציאל המוטגני הגבוה ביותר.
כיצד אי-קולי מבדיל בין גדיל DNA ישן לחדש לצורך תיקון?
כיצד אי-קולי מבדיל בין גדיל DNA ישן לחדש לצורך תיקון?
- על ידי רמת הביטוי של הגנים הסמוכים.
- על ידי אורך הגדיל, כאשר הגדיל החדש קצר יותר.
- על ידי נוכחות RNA פריימרים על הגדיל החדש.
- על ידי קבוצות מתיל הקיימות בגדיל הישן. (correct)
מה תהיה ההשפעה של פגיעה במנגנון המבדיל בין גדיל ישן לחדש בתהליך התיקון?
מה תהיה ההשפעה של פגיעה במנגנון המבדיל בין גדיל ישן לחדש בתהליך התיקון?
מה יקרה אם קבוצות המתיל יוסרו בטעות מהגדיל הישן ב-אי קולי?
מה יקרה אם קבוצות המתיל יוסרו בטעות מהגדיל הישן ב-אי קולי?
מהי המשמעות של מנגנון proofreading 3 ל-5?
מהי המשמעות של מנגנון proofreading 3 ל-5?
באיזה מצב מנגנון proofreading 3 ל-5 לא יוכל לתקן שגיאה?
באיזה מצב מנגנון proofreading 3 ל-5 לא יוכל לתקן שגיאה?
מהו הכיוון שבו פועל מנגנון ה-proofreading?
מהו הכיוון שבו פועל מנגנון ה-proofreading?
איזה תרחיש ימחיש בצורה הטובה ביותר את פעולתו של מנגנון proofreading 3 ל-5?
איזה תרחיש ימחיש בצורה הטובה ביותר את פעולתו של מנגנון proofreading 3 ל-5?
מה יקרה אם אנזים DNA פולימראז טעה בהוספת בסיס, המשיך הלאה, ומנגנון ה- proofreading לא תיקן את הטעות?
מה יקרה אם אנזים DNA פולימראז טעה בהוספת בסיס, המשיך הלאה, ומנגנון ה- proofreading לא תיקן את הטעות?
מהו תפקידו של האנזים Dam methylase בחיידקי E. coli?
מהו תפקידו של האנזים Dam methylase בחיידקי E. coli?
כיצד מערכת השחזור של אי-קולי מזהה את גדיל ה-DNA החדש?
כיצד מערכת השחזור של אי-קולי מזהה את גדיל ה-DNA החדש?
מה ההבדל העיקרי בזיהוי גדיל ה-DNA החדש בין תאים אאוקריוטיים לתאי E. coli?
מה ההבדל העיקרי בזיהוי גדיל ה-DNA החדש בין תאים אאוקריוטיים לתאי E. coli?
מה נכון לגבי מתילציה של DNA?
מה נכון לגבי מתילציה של DNA?
מה יקרה אם אנזים ה-Dam methylase יהיה לא פעיל ב-E. coli?
מה יקרה אם אנזים ה-Dam methylase יהיה לא פעיל ב-E. coli?
מה יקרה כאשר טעות בשכפול תיצור זוג בסיסים שגוי בדנ"א, והדנ"א הזה ישוכפל שוב?
מה יקרה כאשר טעות בשכפול תיצור זוג בסיסים שגוי בדנ"א, והדנ"א הזה ישוכפל שוב?
מה תהיה ההשפעה של שילוב נוקלאוטיד שגוי במהלך שכפול דנ"א על הדור הבא של מולקולות דנ"א?
מה תהיה ההשפעה של שילוב נוקלאוטיד שגוי במהלך שכפול דנ"א על הדור הבא של מולקולות דנ"א?
כיצד ישפיע נוקלאוטיד שגוי ששולב במהלך שכפול דנ"א על תהליך השכפול הבא, בהקשר של שני הגדילים?
כיצד ישפיע נוקלאוטיד שגוי ששולב במהלך שכפול דנ"א על תהליך השכפול הבא, בהקשר של שני הגדילים?
מהי התוצאה המידית של שכפול דנ"א המכיל זוג בסיסים שגוי שנוצר משגיאה בשכפול קודם?
מהי התוצאה המידית של שכפול דנ"א המכיל זוג בסיסים שגוי שנוצר משגיאה בשכפול קודם?
איזה תיאור מתאר בצורה הטובה ביותר את ההשלכות של נוקלאוטיד לא נכון המשולב במהלך שכפול דנ"א מבחינת יציבות המידע הגנטי?
איזה תיאור מתאר בצורה הטובה ביותר את ההשלכות של נוקלאוטיד לא נכון המשולב במהלך שכפול דנ"א מבחינת יציבות המידע הגנטי?
מה מאפשר למערכת התיקון של אי-קולי להבדיל בין גדיל ה-DNA החדש לגדיל הקיים?
מה מאפשר למערכת התיקון של אי-קולי להבדיל בין גדיל ה-DNA החדש לגדיל הקיים?
מה תפקידו העיקרי של החלבון MutS במערכת התיקון של אי-קולי?
מה תפקידו העיקרי של החלבון MutS במערכת התיקון של אי-קולי?
אילו מהבאים יכול להתרחש אם חלבון MutS אינו פועל כראוי?
אילו מהבאים יכול להתרחש אם חלבון MutS אינו פועל כראוי?
מה יהיה ההבדל העיקרי בין גדיל DNA חדש לגדיל DNA קיים בתא אי-קולי מיד לאחר הכפלת ה-DNA?
מה יהיה ההבדל העיקרי בין גדיל DNA חדש לגדיל DNA קיים בתא אי-קולי מיד לאחר הכפלת ה-DNA?
כיצד מתילציה של גדיל ה-DNA הקיים מסייעת במנגנון התיקון של אי-קולי?
כיצד מתילציה של גדיל ה-DNA הקיים מסייעת במנגנון התיקון של אי-קולי?
מהו התפקיד של דנא פולימראז בתהליך תיקון ה-mismatch לאחר פירוק הגדיל?
מהו התפקיד של דנא פולימראז בתהליך תיקון ה-mismatch לאחר פירוק הגדיל?
מה המשמעות של המונח 'המי-ממותל' בהקשר של תיקון שגיאות ב-DNA?
מה המשמעות של המונח 'המי-ממותל' בהקשר של תיקון שגיאות ב-DNA?
כיצד משפיע המרחק של הנוקלאוטידים מנקודת ה-mismatch על תהליך הפירוק?
כיצד משפיע המרחק של הנוקלאוטידים מנקודת ה-mismatch על תהליך הפירוק?
איזה מהבאים הוא ההסבר ההגיוני ביותר לחשיבות של מיתול בהקשר של תיקון DNA?
איזה מהבאים הוא ההסבר ההגיוני ביותר לחשיבות של מיתול בהקשר של תיקון DNA?
מה יקרה אם תהליך הפירוק של הגדיל הלקוי לא יתרחש כראוי לפני פעולת ה-DNA פולימראז?
מה יקרה אם תהליך הפירוק של הגדיל הלקוי לא יתרחש כראוי לפני פעולת ה-DNA פולימראז?
Flashcards
מהו Proofreading?
מהו Proofreading?
פעולה של קריאת הבסיס האחרון שנוסף ותיקונו במידת הצורך.
מהי יכולת Proofreading של אנזים?
מהי יכולת Proofreading של אנזים?
יכולת של אנזים לקרוא ולתקן את הבסיס האחרון שנוסף במהלך השכפול.
מה מתקן Proofreading?
מה מתקן Proofreading?
תיקון שגיאות מיידי של הבסיס האחרון שנוסף במהלך שכפול.
מהן מגבלות Proofreading?
מהן מגבלות Proofreading?
Signup and view all the flashcards
מתי מתרחש Proofreading?
מתי מתרחש Proofreading?
Signup and view all the flashcards
מהי מוטציה?
מהי מוטציה?
Signup and view all the flashcards
באיזה כיוון משוכפל גדיל ה-DNA החדש?
באיזה כיוון משוכפל גדיל ה-DNA החדש?
Signup and view all the flashcards
מה קורה בשכפול לאחר טעות?
מה קורה בשכפול לאחר טעות?
Signup and view all the flashcards
מה קורה לנוקלאוטיד הלא נכון?
מה קורה לנוקלאוטיד הלא נכון?
Signup and view all the flashcards
מה הכי חשוב בשכפול DNA?
מה הכי חשוב בשכפול DNA?
Signup and view all the flashcards
מערכת תיקון DNA
מערכת תיקון DNA
Signup and view all the flashcards
הבחנה בין גדילים
הבחנה בין גדילים
Signup and view all the flashcards
מתילציה בגדיל הישן
מתילציה בגדיל הישן
Signup and view all the flashcards
קבוצות מתיל
קבוצות מתיל
Signup and view all the flashcards
תיקון מושלם
תיקון מושלם
Signup and view all the flashcards
זיהוי גדיל חדש באאוקריוטים
זיהוי גדיל חדש באאוקריוטים
Signup and view all the flashcards
Nicks
Nicks
Signup and view all the flashcards
Dam methylase
Dam methylase
Signup and view all the flashcards
רצף GATC
רצף GATC
Signup and view all the flashcards
מתילציה על ידי Dam methylase
מתילציה על ידי Dam methylase
Signup and view all the flashcards
רצפי A ממותלים באי-קולי
רצפי A ממותלים באי-קולי
Signup and view all the flashcards
MutS
MutS
Signup and view all the flashcards
חלבונים לתיקון באי-קולי
חלבונים לתיקון באי-קולי
Signup and view all the flashcards
תפקיד MutS
תפקיד MutS
Signup and view all the flashcards
פירוק הגדיל בתיקון שגיאות
פירוק הגדיל בתיקון שגיאות
Signup and view all the flashcards
הֶמי-מְמותָל
הֶמי-מְמותָל
Signup and view all the flashcards
דנ"א פולימראז (בתיקון שגיאות)
דנ"א פולימראז (בתיקון שגיאות)
Signup and view all the flashcards
Mismatch (אי התאמה)
Mismatch (אי התאמה)
Signup and view all the flashcards
מִתִילציה
מִתִילציה
Signup and view all the flashcards
Study Notes
- מסתכלים על הולואנזים (holoenzyme), קומפלקס המורכב מכל תתי היחידות של פולימראז
- הפולימראז מורכב מיחידת אלפא (α), אפסילון (ε)ו תטא (θ), יחידת האלפא היא זו שמבצעת את הפילמור
תתי יחידות
- אפסילון: מבצעת פעילות אקסונוקלאז (Exonuclease) - פעילות תיקון
- קוראת מ-3 ל-5
- תטא: מחברת בין היחידות האחרות
- בטא: חלבונים דימרים הנקראים sliding clamp שאחראים על תפיסת הדנא פולימראז לדנא ומונעים ממנו ליפול (בניגוד לרנא פולימראז)
- גמא (γ): נקרא גם clamp loader המורכב מכמה תתי יחידות וטוען את הדנא לתוך ה-sliding clamp
- קיימים שני מבנים של sliding clamp ומבנה אחד של clamp loader
תהליך הוספת בסיסים
- הדנא פולימראז מוסיף בסיסים באופן יחידני
- במידה והוא תקין הוא ממשיך, אם לא, הוא מוציא אותו ומכניס בסיס אחר עד שנמצא הבסיס המתאים
- להתנהגות הזו קוראים proofreading 3 ל-5 כלומר לקרוא את הבסיס האחרון ולתקן במידת הצורך
- במידה ונעשתה טעות והוא המשיך הלאה, הוא לא יכול לחזור אחורה ולתקן
- הדנא פולימראז עושה טעות אחת ל-10,000 בסיסים, בזכות תכונת הproofreading הוא עושה אחת ל-10 מיליון
- מערכת שרצה אחרי הדנא פולימראז נקראת mismatch repair system והיא מורידה את שכיחות הטעויות לאחת למיליארד בסיסים
- בזמן שכפול של מיליארד בסיסים תהיה טעות אחת (סטטיסטית)
תיקון שגיאות
- אם הייתה טעות ומול הנוקלאוטיד מהתבנית המקורית יש נוקלאוטיד לא נכון, בפעם הבאה הגדיל הנכון ישוכפל נכון אך הגדיל השני עם הנוקלאוטיד הלא נכון ותיווצר מוטציה ב-50% מהמולקולות
- אם יש זיהוי של mismatch אבל לא ידוע מה השגוי, אם המערכת משארת שה-T הוא השגוי, היא תוציא אותו ותחליף ויתקבלו 100% מוטציות
- אם המערכת תוציא את הנוקלאוטיד הנכון, יתקבלו 100% מולקולות תקינות
- על מנת שהמערכת תוציא את הנוקלאוטיד השגוי, היא צריכה לדעת איזה מהגדילים החדש ומי הישן
- E-coli: הגדיל הישן הוא ממותל (קבוצות מתיל), על החדש אין עדיין
- למרות שבמערכת אאוקוריוטית גם יכולה להיות מתילציות, המערכת מזהה את הגדיל החדש על ידי שברים חד-גדיליים הנקראים nicknames
אנזימים ושיטת תיקון
- dam methylas: אנזים שעושה מתילציה לנוקלאוטיד A שנמצא ברצף 5'GATC3, לגדיל החדש אין מתילציה ולכן המערכת יכולה להבדיל ביניהם
- MutS: יודע לזהות את ה-mismatch
- MutH: נקשר לאתר שהוא המי-ממותל (hemimethylated)
- MutL: מקשר בין השניים (MutH+MutS) ורק אז יש אקטיבציה של MutH
- MutH: יוצר nicks בגדיל החדש, הליקאז פותח את הגדילים ונוקלאז מפרק את הדנא, פירוק הגדיל קורה כמה נוקלאוטידים לפני ה-mismatch וממשיך כמה נוקלאוטידים אחריו, בסוף דנא פולימראז משלים את המרווח
- הכוונה בהמי ממותל היא שגדיל אחד ממותל והשני לא
Studying That Suits You
Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.
Related Documents
Description
שאלות ותשובות על מנגנוני תיקון DNA ושכפול, כולל תפקיד ה- proofreading, האנזים Dam methylase וזיהוי גדילי DNA חדשים וישנים. הבוחן בוחן גם מה קורה כאשר מנגנונים אלה נפגעים או תפקודם לקוי.