DNA Structure and Function Quiz

<p>36° (C)</p> Signup and view all the answers

<p>20 Å (C)</p> Signup and view all the answers

<p>Attraverso il solco maggiore (A)</p> Signup and view all the answers

<p>Collegare i nucleotidi tra loro (A)</p> Signup and view all the answers

<p>10 nucleotidi (A)</p> Signup and view all the answers

<p>Il DNA si muove verso il polo positivo a causa della sua carica negativa (B)</p> Signup and view all the answers

<p>Con il bromuro di etidio che emette luce visibile sotto UV (D)</p> Signup and view all the answers

<p>Facilita l'assorbimento di luce visibile nel gel (B)</p> Signup and view all the answers

<p>Denatura il DNA rompendone i legami idrogeno (A)</p> Signup and view all the answers

<p>I frammenti di DNA vengono trasferiti dal gel a un filtro di nitrocellulosa (C)</p> Signup and view all the answers

<p>La velocità di migrazione dipende dalla lunghezza del frammento. (A)</p> Signup and view all the answers

<p>Sintetizzare un filamento di DNA utilizzando uno stampo (D)</p> Signup and view all the answers

<p>La registrazione delle modifiche covalenti delle code istoniche prima della duplicazione (C)</p> Signup and view all the answers

<p>Un pozzetto per l'inserimento dei fragmenti di DNA (A)</p> Signup and view all the answers

<p>Un primer che termina con un gruppo 3'-OH (A)</p> Signup and view all the answers

<p>Agisce come matrice per facilitare la separazione delle molecole (C)</p> Signup and view all the answers

<p>Avanza in direzione 5'-3' (B)</p> Signup and view all the answers

<p>La sintesi del filamento si blocca (B)</p> Signup and view all the answers

<p>Il fosfato più vicino allo zucchero (C)</p> Signup and view all the answers

<p>Fornire energia per il legame dei nucleotidi (A)</p> Signup and view all the answers

<p>Aggiunge nucleotidi secondo le regole di appaiamento (B)</p> Signup and view all the answers

<p>Attivano la molecola d'acqua per l'attacco nucleofilo (B)</p> Signup and view all the answers

<p>Tagliano sia in prossimità sia a distanza dalla sequenza riconosciuta (A)</p> Signup and view all the answers

<p>EcoRV induce cambiamenti conformazionali nel DNA solo con sequenze corrette (B)</p> Signup and view all the answers

<p>L'ossigeno dell'acqua attacca il fosforo parzialmente positivo nel legame fosfodiesterico (D)</p> Signup and view all the answers

<p>Perché il taglio avviene in prossimità di diverse basi non correlate (B)</p> Signup and view all the answers

<p>Legame fosfodiesterico tra nucleotidi (A)</p> Signup and view all the answers

<p>Come dimero (C)</p> Signup and view all the answers

<p>Che la sequenza è riconoscibile da entrambe le direzioni (A)</p> Signup and view all the answers

<p>Stabilizza il complesso giunzione innesco-stampo e controlla l’appaiamento delle basi (B)</p> Signup and view all the answers

<p>Viene idrolizzato in due molecole di fosfato (B)</p> Signup and view all the answers

<p>Stabilizzano i nucleotidi e facilitano l'attacco nucleofilo (C)</p> Signup and view all the answers

<p>Ostacola i contatti nel solco minore e riduce la velocità di polimerizzazione (D)</p> Signup and view all the answers

<p>È composto da un foglietto beta e ospita il sito attivo dell'enzima (D)</p> Signup and view all the answers

<p>La reazione è favorita termodinamicamente (A)</p> Signup and view all the answers

<p>La coordinazione degli aspartici nel sito attivo (D)</p> Signup and view all the answers

<p>Controllando l'appaiamento corretto delle basi (D)</p> Signup and view all the answers

<p>Assemblare la sliding clamp in corrispondenza della giunzione primer-stampo (B)</p> Signup and view all the answers

<p>Si genera un'ansa di ssDNA che cambia forma (C)</p> Signup and view all the answers

<p>Mantenere le polimerasi associate alla forcella replicativa (A)</p> Signup and view all the answers

<p>Le DNA polimerasi si alternano grazie alla sliding clamp (D)</p> Signup and view all the answers

<p>Formazione di un nuovo punto di inizio per la sintesi (C)</p> Signup and view all the answers

<p>Synthesizes a new RNA primer on the lagging strand (A)</p> Signup and view all the answers

<p>Viene rilasciata dalla sliding clamp (D)</p> Signup and view all the answers

<p>Sintesi simultanea e più veloce di entrambi i filamenti (C)</p> Signup and view all the answers

La forma del DNA descritta da Watson e Crick, caratterizzata da una doppia catena polinucleotidica, antiparallela e complementare, con un diametro costante di 20 A.

Le basi azotate sono impilate una sull'altra, creando una forza di attrazione che stabilizza la molecola di DNA. Queste interazioni sono fondamentali per la stabilità complessiva del DNA.

L'orientamento dei due filamenti di DNA, in cui un filamento corre in direzione 5'-3' e l'altro in direzione 3'-5'.

La capacità dei due filamenti di DNA di formare coppie di basi specifiche (A-T e C-G) attraverso legami a idrogeno.

I legami che si formano tra le basi azotate (A-T e C-G), in cui un'adenina (A) si lega a una timina (T) con due legami a idrogeno e una citosina (C) si lega a una guanina (G) con tre legami a idrogeno.

L'avvolgimento della doppia elica del DNA in senso orario, come una scala a chiocciola che gira verso destra.

Le due fessure che si formano tra i due filamenti di DNA, quando si avvolgono tra loro, esponendo le basi azotate all'ambiente acquoso.

Il solco maggiore è più ampio e informativo del solco minore, perché contiene una maggiore varietà di gruppi funzionali e permette alle proteine di riconoscere in modo più preciso l'appaiamento corretto delle basi.

Tecnica di laboratorio che separa molecole di DNA in base alla loro dimensione, utilizzando un campo elettrico e un gel poroso.

Il materiale poroso utilizzato nell'elettroforesi del DNA, contenente una soluzione salina, attraverso cui passano le molecole di DNA.

Enzimi che tagliano il DNA in punti specifici, creando frammenti di diverse dimensioni.

Una molecola che si intercala nella doppia elica del DNA, rendendolo visibile alla luce UV.

Il processo di separazione delle due catene di DNA, rendendolo più accessibile per l'ibridazione.

Una tecnica che trasferisce le molecole di DNA da un gel di agarosio a un filtro di nitrocellulosa.

Un filtro che lega gli acidi nucleici, utilizzato nel Southern Blotting.

Un tipo di molecola biologica che contiene informazioni genetiche.

Gli enzimi di restrizione di tipo I e III riconoscono sequenze specifiche di DNA, ma tagliano fuori da queste sequenze. Alcuni tagliano vicino, altri a grande distanza.

La reazione principale coinvolge un attacco nucleofilo da parte di una molecola d'acqua su un legame fosfodiesterico.

Gli ioni bivalenti come il magnesio (Mg) sono fondamentali per l'attività catalitica delle endonucleasi di restrizione.

La sequenza riconosciuta dall'enzima EcoRV presenta una simmetria rotazionale binaria.

EcoRV lega con uguale affinità la sequenza corretta e quelle sbagliate.

EcoRV cambia configurazione solo quando riconosce la sequenza corretta.

I dimeri sono comuni tra le endonucleasi di restrizione.

Gli enzimi di restrizione riconoscono e tagliano il DNA in modo specifico, influenzando la struttura e la funzione del DNA.

Dopo la replicazione del DNA, le nuove molecole di DNA ereditano il "pattern" di modifiche e condensazione della cromatina dalla molecola di DNA "madre". Le modifiche alle code istoniche influenzano il grado di condensazione della cromatina e questo processo (imprinting) assicura che il DNA "figlio" abbia la stessa struttura generale della cromatina del DNA "madre".

Il processo che permette la replicazione del DNA, utilizzando un filamento di DNA come stampo per sintetizzare un nuovo filamento complementare.

L'enzima che sintetizza il nuovo filamento di DNA durante la replicazione, usando un filamento pre-esistente come stampo.

Un breve frammento di DNA a doppio filamento necessario per avviare la replicazione del DNA. È composto da uno stampo di DNA a singolo filamento e da un innesco/primer complementare allo stampo.

Un filamento di DNA a singolo filamento che serve come modello per la sintesi del nuovo filamento di DNA da parte della DNA polimerasi.

Un breve frammento di DNA complementare allo stampo, necessario per l'avvio della replicazione da parte della DNA polimerasi.

I mattoni di base del DNA, costituiti da una base azotata, dal desossiribosio e da 3 fosfati legati al 5'.

La DNA polimerasi aggiunge i nucleotidi solo all'estremità 3' del filamento di DNA, perché l'estremità 5' è "blindata".

L'enzima DNA polimerasi svolge il compito di replicare il DNA, aggiungendo nucleotidi uno dopo l'altro a un filamento esistente (l'innesco).

La DNA polimerasi assomiglia a una mano destra con il palmo, le dita e il pollice. Ogni parte ha il suo ruolo specifico nella replicazione del DNA.

La regione del palmo della DNA polimerasi contiene il sito attivo, dove si posiziona la giunzione innesco-stampo. Qui viene inserito il nuovo nucleotide.

Il palmo della DNA polimerasi stabilizza la giunzione innesco-stampo, mantenendola ferma durante l'aggiunta dei nucleotidi.

Il palmo contiene due ioni magnesio che aiutano a rendere il processo di aggiunta di nucleotidi più efficiente.

Il primo ione magnesio scherma le cariche negative del nucleotide in arrivo, permettendogli di inserirsi nella catena di DNA.

Il secondo ione magnesio si lega all'OH del 3' del ribosio, rendendolo più reattivo per l'aggiunta del nucleotide.

Il palmo della DNA polimerasi controlla che le basi siano appaiate correttamente, verificando se la nuova catena di DNA è corretta.

Il filamento in ritardo, durante la replicazione del DNA, forma un'ansa che si allunga e si accorcia, simile allo stantuffo di una tromba. Questa ansa permette alle due DNA polimerasi del filamento discontinuo di alternarsi nella sintesi dei frammenti di Okazaki.

Il caricatore della sliding clamp assembla una sliding clamp sulla giunzione primer-stampo appena formatasi, permettendo alla DNA polimerasi di iniziare la sintesi di un nuovo frammento di Okazaki.

La DNA polimerasi III è formata da tre copie, una delle quali duplica in maniera continua il filamento guida, mentre le altre due si alternano nella replicazione del filamento in ritardo.

I frammenti di Okazaki sono brevi segmenti di DNA sintetizzati sul filamento in ritardo durante la replicazione.

Il filamento guida viene sintetizzato in modo continuo, dalla DNA polimerasi III, nella direzione 5'-3'.

Il filamento in ritardo è sintetizzato in modo discontinuo, con la DNA polimerasi III che sintetizza brevi frammenti di Okazaki.

La primasi sintetizza un nuovo primer a RNA sul filamento discontinuo, permettendo alla DNA polimerasi III di iniziare la sintesi dei frammenti di Okazaki.

L'elicasi è un enzima che svolge la doppia elica del DNA, separando i due filamenti stampo.