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Questions and Answers
¿Cuál es la principal ventaja del sistema CRISPR-Cas9 en comparación con otras técnicas de edición genética?
¿Cuál es la principal ventaja del sistema CRISPR-Cas9 en comparación con otras técnicas de edición genética?
- Requiere un gran número de recursos para su implementación.
- Es más caro que otras técnicas.
- Solo puede usarse en organismos vegetales.
- Permite editar cualquier región del genoma de manera altamente eficaz y precisa. (correct)
¿Qué función cumplen los primers químicos en el proceso de amplificación genética?
¿Qué función cumplen los primers químicos en el proceso de amplificación genética?
- Bloquean el proceso de replicación del ADN.
- Facilitan la recombinación homóloga durante la amplificación del gen. (correct)
- Descomponen el ADN amplificado después del proceso.
- Introducen errores al replicar el ADN.
¿Qué es un sgRNA y cuál es su función en el sistema CRISPR-Cas9?
¿Qué es un sgRNA y cuál es su función en el sistema CRISPR-Cas9?
- Una secuencia de ARN que guía a la endonucleasa Cas9 hacia la región específica del ADN. (correct)
- Un gen que produce la proteína Cas9.
- Es un tipo de proteína que protege el ADN de la degradación.
- Un compuesto que mejora la eficiencia de la PCR.
¿Cuál de las siguientes afirmaciones es verdadera sobre el sistema CRISPR?
¿Cuál de las siguientes afirmaciones es verdadera sobre el sistema CRISPR?
¿Qué aspecto se debe evaluar en relación a la modificación genética utilizando CRISPR-Cas9?
¿Qué aspecto se debe evaluar en relación a la modificación genética utilizando CRISPR-Cas9?
¿Qué proteína es responsable de la incorporación de los protoespaciadores en el sistema CRISPR-Cas9 de tipo II?
¿Qué proteína es responsable de la incorporación de los protoespaciadores en el sistema CRISPR-Cas9 de tipo II?
¿Cuál es el resultado del procesamiento del pre-crRNA por la endonucleasa RNAasa III?
¿Cuál es el resultado del procesamiento del pre-crRNA por la endonucleasa RNAasa III?
¿Qué función no tiene el tracrRNA en el sistema CRISPR-Cas?
¿Qué función no tiene el tracrRNA en el sistema CRISPR-Cas?
¿Qué función cumple el crRNA en el sistema CRISPR?
¿Qué función cumple el crRNA en el sistema CRISPR?
¿Qué genera Cas9 al activar su función en la etapa de interferencia?
¿Qué genera Cas9 al activar su función en la etapa de interferencia?
¿Qué es el NHEJ en el contexto de la edición genética?
¿Qué es el NHEJ en el contexto de la edición genética?
¿Qué ocurre con el pre-crRNA después de ser transcrito?
¿Qué ocurre con el pre-crRNA después de ser transcrito?
¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre las nucleasas TALENs es correcta?
¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre las nucleasas TALENs es correcta?
¿Cuál es la función principal del sgRNA en el proceso de edición genética?
¿Cuál es la función principal del sgRNA en el proceso de edición genética?
¿En cuál etapa se une el crRNA maduro al tracrRNA?
¿En cuál etapa se une el crRNA maduro al tracrRNA?
¿Qué representa el término PAM en la edición genética?
¿Qué representa el término PAM en la edición genética?
¿Cuál es la función principal de la proteína verde fluorescente (GFP)?
¿Cuál es la función principal de la proteína verde fluorescente (GFP)?
¿Qué función cumple el crRNA en el sistema CRISPR-Cas?
¿Qué función cumple el crRNA en el sistema CRISPR-Cas?
¿Qué diferencia a las nucleasas ZFNs de otras herramientas de edición genética?
¿Qué diferencia a las nucleasas ZFNs de otras herramientas de edición genética?
¿Cómo se define el término DSB en la edición genética?
¿Cómo se define el término DSB en la edición genética?
¿Qué característica define al dCas en el sistema CRISPR?
¿Qué característica define al dCas en el sistema CRISPR?
¿Cuál fue la contribución clave de Jennifer Doudna y Emmanuelle Charpentier en 2012?
¿Cuál fue la contribución clave de Jennifer Doudna y Emmanuelle Charpentier en 2012?
¿Cómo funciona el sistema CRISPR-Cas en procariotas?
¿Cómo funciona el sistema CRISPR-Cas en procariotas?
¿Qué componentes principales conforman el lugar CRISPR?
¿Qué componentes principales conforman el lugar CRISPR?
¿Qué hacen los crRNAs en el sistema CRISPR-Cas?
¿Qué hacen los crRNAs en el sistema CRISPR-Cas?
¿Cuál es una característica distintiva de la Clase 1 del sistema CRISPR?
¿Cuál es una característica distintiva de la Clase 1 del sistema CRISPR?
En la etapa de adquisición del sistema CRISPR-Cas, ¿qué sucede?
En la etapa de adquisición del sistema CRISPR-Cas, ¿qué sucede?
¿Cuántas clases de sistemas CRISPR existen?
¿Cuántas clases de sistemas CRISPR existen?
¿Cuál es una función importante del operón cas en el sistema CRISPR?
¿Cuál es una función importante del operón cas en el sistema CRISPR?
¿Cuál es la principal ventaja de CRISPR-Cas sobre ZFNs y TALENs en el diseño de modificaciones genéticas?
¿Cuál es la principal ventaja de CRISPR-Cas sobre ZFNs y TALENs en el diseño de modificaciones genéticas?
¿Qué microorganismo se utiliza como modelo para ingeniería genética en el contenido?
¿Qué microorganismo se utiliza como modelo para ingeniería genética en el contenido?
¿Qué secuencias se seleccionan para facilitar la inserción de genes mediante recombinación homóloga?
¿Qué secuencias se seleccionan para facilitar la inserción de genes mediante recombinación homóloga?
¿Cuál es el rol de la proteína GFP en el proceso descrito?
¿Cuál es el rol de la proteína GFP en el proceso descrito?
¿Por qué el proceso de edición genética con CRISPR-Cas es considerado más eficiente?
¿Por qué el proceso de edición genética con CRISPR-Cas es considerado más eficiente?
¿Qué se necesita para el diseño de un sgRNA para la edición del genoma?
¿Qué se necesita para el diseño de un sgRNA para la edición del genoma?
¿Cuántos cromosomas tiene el genoma de Saccharomyces cerevisiae?
¿Cuántos cromosomas tiene el genoma de Saccharomyces cerevisiae?
¿Qué método se utiliza para amplificar el gen GFP junto con su promotor y terminador?
¿Qué método se utiliza para amplificar el gen GFP junto con su promotor y terminador?
¿Cuál es la función del dominio HNH en el sistema CRISPR-Cas9?
¿Cuál es la función del dominio HNH en el sistema CRISPR-Cas9?
¿Qué característica define el mecanismo NHEJ en la reparación del ADN?
¿Qué característica define el mecanismo NHEJ en la reparación del ADN?
¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre HDR es correcta?
¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre HDR es correcta?
¿Qué tipo de modificaciones permite el mecanismo NHEJ?
¿Qué tipo de modificaciones permite el mecanismo NHEJ?
¿Cuál es la ventaja principal de utilizar HDR en la ingeniería genética?
¿Cuál es la ventaja principal de utilizar HDR en la ingeniería genética?
¿Qué resultado puede ocasionar un indel causado por NHEJ?
¿Qué resultado puede ocasionar un indel causado por NHEJ?
¿Por qué es importante la secuencia nucleotídica exógena en HDR?
¿Por qué es importante la secuencia nucleotídica exógena en HDR?
¿Qué papel cumple el sistema CRISPR-Cas9 en la edición genómica?
¿Qué papel cumple el sistema CRISPR-Cas9 en la edición genómica?
Flashcards
Sistema CRISPR-Cas9
Sistema CRISPR-Cas9
Tecnología que permite la edición precisa y eficiente del ADN genómico en cualquier organismo.
sgRNA
sgRNA
ARN guía que dirige la enzima Cas9 al lugar específico del ADN para su edición.
PCR
PCR
Técnica de amplificación de ADN.
CRISPy-Web
CRISPy-Web
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Edición genómica en levadura
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CRISPR-Cas
CRISPR-Cas
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NHEJ
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Cas9
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Indel
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Función de CRISPR-Cas
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¿Qué son los crRNAs?
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Enzimas Cas
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Región CRISPR
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¿Cómo se clasifica CRISPR?
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Etapa de Adquisición de CRISPR-Cas
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Protoespaciadores
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Dominio HNH
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Dominio RuvC
Dominio RuvC
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¿Qué es una DSB?
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NHEJ (Unión de extremos no homólogos)
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¿Qué son los indels?
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HDR (Reparación dirigida por homología)
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¿Qué es una secuencia exógena?
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Edición genómica
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CRISPR-Cas: ¿Qué lo hace único?
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Edición con CRISPR-Cas: ¿Cómo funciona?
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Saccharomyces cerevisiae: ¿Para qué se usa?
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Secuencias delta: ¿Qué son?
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GFP: ¿Por qué se usa?
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Diseño de cebadores: ¿Por qué es importante?
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Recombinación homóloga: ¿Cómo funciona?
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Edición genómica en levadura: ¿Qué pasos se siguen?
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Study Notes
CRISPR-Cas Sistema de Edición Genómica en Levaduras
- CRISPR-Cas permite la edición de cualquier genoma de forma precisa y económica.
- Se utiliza la técnica de PCR y CRISPR-Cas9 en la levadura Saccharomyces cerevisiae.
- Se amplifica el gen gfp junto con promotor y terminador específico usando primers.
- Se diseñan mega cebadores para la inserción de gfp-delta en el genoma.
- Se utiliza CRISPy-Web para diseñar un sgRNA que guíe a Cas9 a la región deseada de ADN.
- Se discuten implicaciones éticas y efectos a largo plazo.
Glosario
- bp: Par de bases
- Cas: Proteínas asociadas a CRISPR
- CRISPR: Repeticiones palindrómicas cortas regularmente interespaciadas.
- CRISPR-Cas: Repeticiones CRISPR asociadas a nucleasas Cas.
- CRISPR-Cpf1: Repeticiones CRISPR de Prevotella y Francisella.
- crRNA: RNA transcrito de CRISPR
- dCas: Cas9 defectiva para la actividad nucleasa
- Di-CRISPR: CRISPR-Cas de integración en delta
- DSB: Doble corte en la cadena
- GFP: Proteína verde fluorescente
- HDR: Reparación directa por homología
- Indel: Inserción o deleción
- nCas: Cas9 nicasa
- NHEJ: Reparación de unión de extremos no homólogos
- nt: Nucleótido
- NUC: Lóbulo con actividad nucleasa de Cas9
- HNH: Dominio nucleasa de Cas9
- ORF: Pauta abierta de lectura
- PAM: Motivo adyacente al protoespaciador
- PI: Dominio de reconocimiento de la secuencia PAM
- REC: Lóbulo de reconocimiento de Cas9
- SRSR: Repeticiones cortas regularmente interespaciadas.
- tracrRNA: ARN trans-activador no codificante
- TALENS: Nucleasas tipo activadores de transcripción.
- Tm: Temperatura de fusión de oligonucleótidos
- ZFNs: Nucleasas de dedos de zinc
Introducción
- En 1953, Watson y Crick publicaron la estructura tridimensional del ADN.
- En los años 70 surge la biotecnología y la ingeniería genómica para modificar el ADN.
- En los años 90, las nuevas técnicas de secuenciación permitieron conocer genomas completos.
- El sistema CRISPR-Cas se destaca como una herramienta eficaz, accesible y económica para edición genómica.
Objetivo
- Analizar el sistema CRISPR-Cas9 y su aplicación a la edición genómica.
- Diseñar un sgRNA para editar un gen en Saccharomyces cerevisiae.
- Redactar una memoria incluyendo el diseño experimental teórico.
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