Chimica degli Amminoacidi e Peptidi

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Questions and Answers

Quale dei seguenti gruppi si trova in alto nella struttura di un α-amminoacido?

  • Idrogeno
  • Gruppo amminico
  • Gruppo carbossilico
  • Catena laterale R (correct)

Quale affermazione riguarda la proiezione di Fischer degli amminoacidi?

  • Il gruppo amminico è a destra.
  • La catena laterale R è in basso.
  • Il gruppo amminico è a sinistra. (correct)
  • Il gruppo carbossilico è a sinistra.

Cosa sono i peptidi?

  • Strutture non proteiche.
  • Amminoacidi privi di catena laterale.
  • Catene di amminoacidi con più di 50 unità.
  • Catene di amminoacidi corte. (correct)

Qual è la funzione principale del carbonio alfa nella struttura degli amminoacidi?

<p>Agire come punto centrale della struttura. (B)</p> Signup and view all the answers

Quali sono gli amminoacidi standard?

<p>Prodotti di idrolisi delle proteine. (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa implica invertire due sostituenti in una struttura di Fischer?

<p>Si inverte la configurazione. (C)</p> Signup and view all the answers

Quali amminoacidi sono considerati 'non proteici'?

<p>Metaboliti liberi. (A)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo agli amminoacidi?

<p>Esistono amminoacidi standard e non standard. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è la caratteristica principale degli amminoacidi L in soluzione?

<p>Ruotano la luce polarizzata in senso antiorario (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa indica la lettera 'D' negli amminoacidi?

<p>Enantiomero in grado di ruotare la luce in senso orario (B)</p> Signup and view all the answers

Qual è l'eccezione al principio che afferma che gli amminoacidi nelle proteine sono tutti della serie L?

<p>L-glicina (D)</p> Signup and view all the answers

Dove possono generalmente essere trovati gli amminoacidi D?

<p>Nelle pareti cellulari batteriche (D)</p> Signup and view all the answers

Cos'è il punto isoelettrico in relazione agli amminoacidi?

<p>Il valore di pH in cui un amminoacido non ha carica netta (A)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo la formazione degli amminoacidi D?

<p>Generalmente non sono incorporati nelle proteine (A)</p> Signup and view all the answers

Quale di queste affermazioni è vera riguardo al Calpha degli amminoacidi?

<p>È un atomo di carbonio asimmetrico (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa si usa per misurare l'attività ottica degli amminoacidi?

<p>Un polarimetro (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è il significato del punto isoelettrico per un amminoacido?

<p>È il pH al quale l'amminoacido esiste principalmente nella sua forma neutra. (B)</p> Signup and view all the answers

Come può un amminoacido essenziale essere ottenuto dall'organismo?

<p>Tramite l'alimentazione. (A)</p> Signup and view all the answers

Quale dei seguenti metodi non è utilizzato per ottenere amminoacidi?

<p>Immagazzinamento di amminoacidi per la sintesi. (A)</p> Signup and view all the answers

Cos'è un legame peptidico?

<p>Un legame chimico che unisce più amminoacidi in una catena. (B)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni riguardo agli amminoacidi non è corretta?

<p>Gli amminoacidi essenziali possono essere sintetizzati dall'organismo. (C)</p> Signup and view all the answers

A cosa serve calcolare la media dei valori di pKa di un amminoacido?

<p>Per identificare il punto isoelettrico. (A)</p> Signup and view all the answers

Quali sono gli aspetti chiave trattati durante la lezione sugli amminoacidi?

<p>Classificazione e struttura degli amminoacidi. (A)</p> Signup and view all the answers

Cosa rappresenta il gruppo R in un amminoacido?

<p>Il tipo di amminoacido e le sue proprietà. (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la caratteristica principale degli amminoacidi che costituiscono le proteine naturali?

<p>Sono esclusivamente L-amminoacidi. (D)</p> Signup and view all the answers

Quali sono le cinque famiglie di amminoacidi basate sulla natura della catena laterale?

<p>Alifatica non polare, aromatica, non carica, carica positivamente e negativa. (D)</p> Signup and view all the answers

Quale amminoacido appartiene alla categoria degli AA solforati?

<p>Cisteina (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa distingue gli amminoacidi L dagli amminoacidi D?

<p>Il senso di rotazione della luce polarizzata. (A)</p> Signup and view all the answers

Quali amminoacidi sono considerati AA acidi?

<p>Aspartato e glutammato (C)</p> Signup and view all the answers

Quale affermazione è vera riguardo gli amminoacidi non standard?

<p>Provengono da modificazioni chimiche post-traduzionali di amminoacidi standard. (C)</p> Signup and view all the answers

Quali sono gli amminoacidi carichi negativamente?

<p>Acido aspartico e acido glutammico (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è un esempio di amminoacido aromatico?

<p>Triptofano (B)</p> Signup and view all the answers

Quale amminoacido è noto per il suo anello imidazolico?

<p>Istidina (D)</p> Signup and view all the answers

Quale amminoacido si ottiene dall'unione di quattro residui di lisina ad un anello aromatico?

<p>Elastina (D)</p> Signup and view all the answers

Flashcards

Carbonio alfa

È il centro della struttura degli amminoacidi. A esso sono legati quattro gruppi distinti.

Gruppo carbossilico

Un gruppo funzionale composto da un atomo di carbonio legato a un gruppo ossidrile (-OH) e un gruppo carbonile (=O).

Gruppo amminico

Un gruppo funzionale composto da un atomo di azoto legato a due atomi di idrogeno.

Catena laterale R

La parte variabile della struttura di un amminoacido, che determina le sue proprietà chimiche e fisiche.

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Proiezione di Fischer

Una forma di rappresentazione molecolare che mostra i gruppi funzionali di un amminoacido su un piano bidimensionale immaginario.

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Amminoacidi proteici o standard

Amminoacidi che hanno la struttura standard e si trovano nelle proteine cellulari.

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Amminoacidi non proteici

Amminoacidi che si trovano nella cellula ma non nelle proteine.

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Idrolisi delle proteine

Il processo di rottura dei legami peptidici che tengono insieme gli amminoacidi nelle proteine.

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Quali sono le famiglie di amminoacidi?

Gli amminoacidi che costituiscono le proteine sono 20 e sono codificati a livello del genoma. Sulla base della natura della catena laterale sono raggruppati in 5 famiglie:

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Che tipo di stereoisomeri sono gli amminoacidi L?

Gli amminoacidi L sono enantiomeri che ruotano la luce polarizzata piana in senso antiorario (lato sinistro).

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Che tipo di stereoisomeri sono gli amminoacidi D?

Gli amminoacidi D sono enantiomeri che ruotano la luce polarizzata piana in senso orario (lato destro).

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Quali sono i gruppi funzionali ionizzabili di un amminoacido?

I gruppi funzionali ionizzabili di un amminoacido sono il gruppo amminico (NH2) e il gruppo carbossilico (COOH).

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Da cosa deriva l'elastina?

L'elastina è una proteina che deriva dall'unione di quattro residui di lisina ad un anello aromatico.

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Da dove derivano gli amminoacidi non standard?

Gli amminoacidi non standard derivano dai 20 amminoacidi standard mediante modificazione chimica post-traduzionale.

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Cosa sono gli amminoacidi standard?

Gli amminoacidi standard sono i 20 amminoacidi che sono codificati dal codice genetico.

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Che tipo di amminoacidi costituiscono le proteine?

Le proteine naturali sono costituite esclusivamente da amminoacidi L.

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Cosa sono gli amminoacidi non proteici?

Gli amminoacidi non proteici sono amminoacidi che non sono incorporati nelle proteine.

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Cosa sono gli amminoacidi acidi?

Gli amminoacidi acidi sono quelli che contengono due gruppi carbossilici (-COOH).

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Amminoacido L

La forma di un amminoacido che ruota la luce polarizzata piana in senso antiorario. È indicata dalla lettera 'L', che deriva dalla parola latina "Laevus" (sinistra).

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Amminoacido D

La forma di un amminoacido che ruota la luce polarizzata piana in senso orario. È indicata dalla lettera 'D', che deriva dalla parola latina "Dexter" (destra).

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Chiralità degli amminoacidi

Proprietà che permette a un amminoacido di esistere in due forme speculari, una immagine speculare dell'altra (L e D). La Gly è l'unica eccezione.

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Punto isoelettrico

È il valore del pH a cui un amminoacido è elettricamente neutro (zwitterione) e la sua solubilità è minima.

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Zwitterione

È un composto con carica netta uguale a zero, con gruppi positivi e negativi bilanciati.

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Legami peptidici

I legami che uniscono gli amminoacidi per formare le proteine.

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Che cos'è il punto isoelettrico (pI)?

Il punto isoelettrico (pI) di un amminoacido è il pH al quale la sua carica netta è zero. In altre parole, l'amminoacido esiste principalmente nella sua forma neutra.

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Quali sono gli amminoacidi essenziali?

Gli amminoacidi essenziali sono quelli che il nostro corpo non può sintetizzare e devono essere assunti con la dieta. Sono cruciali per la crescita, la riparazione dei tessuti e altre funzioni corporee.

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Quali sono gli amminoacidi non essenziali?

Gli amminoacidi non essenziali sono quelli che il nostro corpo può sintetizzare dai precursori metabolici. Non devono essere introdotti necessariamente con la dieta.

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Cos'è il legame peptidico?

Il legame peptidico è un legame covalente speciale che si forma tra il gruppo carbossilico di un amminoacido e il gruppo amminico di un altro amminoacido. È il legame chiave che tiene uniti gli amminoacidi per formare le proteine.

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Cos'è una catena amminoacidica?

Una catena amminoacidica è una sequenza lineare di amminoacidi uniti da legami peptidici.

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Cosa sono i monomeri?

I monomeri sono le unità di base che si ripetono per formare i polimeri. Nel caso degli amminoacidi, sono i 'mattoncini' che costruiscono le proteine.

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Cosa sono i polimeri?

I polimeri sono grandi molecole formate dall'unione di molte sottounità monomeriche. Le proteine sono un esempio di polimero formato dall'unione di molti amminoacidi.

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Cosa sono i peptidi?

I peptidi sono catene di pochi amminoacidi uniti da legami peptidici. Sono più piccoli delle proteine e svolgono diverse funzioni biologiche.

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Study Notes

Introduzione alla Lezione

  • La lezione è dedicata agli amminoacidi
  • Il docente è Sara Baldelli
  • L'università è San Raffaele a Roma

Struttura degli Amminoacidi

  • Il carbonio alfa è centrale nella struttura
  • Quattro sostituenti sono legati a questo carbonio: gruppo carbossilico, gruppo amminico, idrogeno e catena laterale (R)
  • La catena laterale (R) varia per ogni amminoacido

Struttura Lineare degli Amminoacidi

  • Gli amminoacidi si legano per formare catene lineari (peptidi o proteine)
  • La proiezione di Fischer modificata è utilizzata per disegnarli (gruppo amminico a sinistra, gruppo carbossilico a destra, catena laterale in alto e idrogeno in basso)
  • L'inversione di due sostituenti in una proiezione di Fischer inverte la configurazione

Tabella degli Amminoacidi

  • Elenco di 20 amminoacidi con sigle a 3 lettere e a 1 lettera, e nomi
  • Gli amminoacidi sono classificati in base alla natura della loro catena laterale (R) (alifatica non polare, polare non carica, aromatica, carica positivamente, carica negativamente)

Amminoacidi Cellulari

  • Gli amminoacidi cellulari sono prodotti dall'idrolisi delle proteine
  • Alcuni amminoacidi sono rari o non standard
  • Altri sono metaboliti liberi

AA Proteici o Standard

  • Le proteine naturali sono formate esclusivamente da L-amminoacidi
  • Vengono raffigurati L-Alanina e D-Alanina

Famiglie di AA

  • Gli amminoacidi strutturalmente correlati sono raggruppati in 5 famiglie (alifatica non polare, polare non carica, aromatica, carica positivamente, carica negativamente)

Non Polare, Gruppo R Alifatico

  • Presenta i diagrammi di struttura per Glicina, Alanina, Valina, Leucina, Isoleucina, Metionina

Polari, Gruppo R Non Carico

  • Presenta i diagrammi di struttura per Serina, Treonina, Cisteina, Asparagina, Glutammina

Gruppo R Aromatico

  • Presenta i diagrammi di struttura per Fenilalanina, Tirosina e Triptofano

Gruppo R Positivamente Carico

  • Presenta i diagrammi di struttura per Lisina, Arginina e Istidina

Gruppo R Negativamente Carico

  • Presenta i diagrammi di struttura per Aspartato e Glutammato

AA raggruppati in base al gruppo R

  • Tabella che raggruppa gli AA in base alle loro caratteristiche chimiche, con sigle a 3 lettere e a 1 lettera.

Altre Classificazioni degli AA

  • Gli amminoacidi sono classificati anche come acidi (glutammato e aspartato), basici (arginina e lisina), solforati (cisteina e metionina) e aromatici (fenilalanina, triptofano e tirosina)

Tavola degli AA

  • Tabella con dati molecolari (peso molecolare, numero di residui, numero di catene polipeptidiche) sulle proteine.

AA Non Standard

  • Derivano dai 20 amminoacidi standard con modificazione post-traduzionale
  • Esempi: 4-idrossiprolina, 5-idrossilisina, 6-N-metilisina, g-carbossiglutammati, selenocisteina

Elastina

  • Proteina caratteristica della pelle con proprietà elastiche
  • Deriva dall'unione di quattro residui di lisina ad un anello aromatico

AA Non Proteici

  • Ornitina e citrullina sono derivati aminoacidici intermedi del ciclo dell'urea, presenti in organismi viventi
  • Altri AA non proteici servono per processi fisiologici

Gruppi Ionizzabili

  • Gli amminoacidi contengono gruppi ionizzabili (carbossilico e amminico) che contribuiscono alla loro natura anfotera.

Isomeri De L

  • Gli isomeri D e L degli amminoacidi differiscono nell'orientamento spaziale dei gruppi attorno al carbonio alfa
  • Le proteine sono composte prevalentemente da L-amminoacidi

Punto Isoelettrico

  • Il punto isoelettrico (pI) di un amminoacido è il pH al quale l'amminoacido ha carica netta zero

AA Essenziali e Non Essenziali

  • Gli aa essenziali non possono essere sintetizzati dall'organismo e devono essere introdotti con la dieta
  • Gli aa non essenziali possono essere sintetizzati dall'organismo

AA e Nutrizione

  • Gli alimenti di origine animale sono generalmente ricchi di aa essenziali
  • Gli alimenti di origine vegetale possono essere poveri di specifici aa essenziali

Legame Peptidico

  • Descrizione chimica del legame peptidico tra due amminoacidi adiacenti

Catena Amminoacidica

  • Descrizione del legame peptidico e sequenza degli amminoacidi

Monomeri e Polimeri

  • Definizione di monomeri e polimeri con esempi nelle proteine (catena lineare e ramificata)

Peptidi

  • Breve descrizione dei peptidi e di alcune proteine di tipo ormonale

Catena Polipeptidica

  • Struttura e composizione della catena polipeptidica

Dati Molecolari su Alcune Proteine

  • Dati molecolari su diverse proteine.

Conclusioni

  • L'autore riassume i contenuti principali della lezione.

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