Biyokimya TCA Döngüsü ve PDC Soruları

Podcast

Play an AI-generated podcast conversation about this lesson

Questions and Answers

Oluşan FADH2'nin elektronlarını hangi bileşiğe aktararak NADH + H+ oluşturur?

Asetil-KoA

NADH

KoA

NAD+ (correct)

PDC'nin aktivasyonunu sağlayan bileşenler hangileridir?

KoA ve Asetil-KoA

Asetil-KoA ve NADH

KoA ve NAD+ (correct)

NADH ve NAD+

PDC'nin inhibisyonunu sağlayan bileşikler nelerdir?

Asetil-KoA ve NADH (correct)

NADH ve FAD

Asetil-KoA ve FADH2

NAD+ ve KoA

Aşağıdakilerden hangisi PDC'yi aktive eden enzimlerin kontrolünden biri değildir?

Asetil-KoA artışı Signup and view all the answers

Aşağıdaki bileşenlerden hangisi PDC'nin aktivasyonunu sağlar?

KoA Signup and view all the answers

TCA döngüsü hangi molekül ile başlar?

Asetil-KoA Signup and view all the answers

TCA döngüsünün ana özelliklerinden biri nedir?

Anabolik ve katabolik özellikleri barındırması Signup and view all the answers

TCA döngüsünde kaç basamaktan oluşur?

8 Signup and view all the answers

TCA döngüsünde hangi moleküller açığa çıkar?

3 NADH, 1 FADH, 1 GTP Signup and view all the answers

TCA döngüsü en çok hangi organın içinde gerçekleşir?

Karaciğer Signup and view all the answers

Sitrata çevrimi sırasında hangi molekül, reaksyonun katalizörüdür?

Sitrata sentaz Signup and view all the answers

Asetil-KoA'nın metil karbonunun, okzaloasetat ile etkileşimi sonucu ne oluşur?

Sitril-KoA Signup and view all the answers

Sitrata dönüşümündeki kondensasyon reaksiyonu nasıl tanımlanır?

Egzergonik bir bağ oluşumu Signup and view all the answers

Asetil-KoA'nın sitrat oluşturmasına dair hangi bilgi doğrudur?

Oluşan sitrat, tiyoester bağına sahiptir. Signup and view all the answers

ATP kullanıldığında reaksiyon nasıl adlandırılır?

Sentetaz Signup and view all the answers

Süksinatın OAA' çevriminde hangi basamak yağ asidi β-oksidasyonundaki reaksiyonlara benzer?

Karbon-karbon arasında çift bağ oluşumu Signup and view all the answers

Süksinatın OAA' çevrimindeki ikinci basamak hangi süreçtir?

Hidrasyon Signup and view all the answers

Aşağıdakilerden hangisi süksinatın OAA' çevriminde yer almayan bir basamaktır?

Dehidratasyon Signup and view all the answers

Süksinatın OAA' çevriminde ilk basamak hangi tür bir reaksiyondur?

Oksidasyon-reduksiyon reaksiyonu Signup and view all the answers

Süksinatın OAA döngüsündeki süreçler, genellikle hangi metabolik süreçle benzerlik gösterir?

Yağ asidi β-oksidasyonu Signup and view all the answers

Prüvatın dekarboksilasyonu sırasında hangi koenzim gerekli değildir?

Süksinil-CoA Signup and view all the answers

Prüvatın oksidatif dekarboksilasyonu sırasında hangi moleküller üretilir?

NADH ve CO2 Signup and view all the answers

Prüvatın PDC ile dekarboksilasyonu hangi enzimi içermektedir?

Dihidrolipoil transasetilaz (E2) Signup and view all the answers

Hidroksietil kısmının TPP'den okside lipoik aside transferini gerçekleştiren enzim nedir?

Dihidrolipoil transasetilaz (E2) Signup and view all the answers

Kinazın etkin olduğu durumda PDC hangi formdadır?

İnaktif formda Signup and view all the answers

Prüvat + KoA ve NAD+ tepkimesinin ürünleri arasında hangisi yer almaz?

FADH2 Signup and view all the answers

Asetil-KoA ve NADH hangi enzim aracılığıyla türetilir?

Kinaz Signup and view all the answers

Hangi element PDC'nin defosforilasyonunu etkiler?

Ca2+ Signup and view all the answers

Riboflavin, hangi biçimde sitrik asit döngüsünde görev alır?

Kofaktör olarak Signup and view all the answers

Sitrik asit döngüsünde rol oynayan dehidrogenaz enzimleri arasında hangisi bulunmamaktadır?

Laktat dehidrogenaz Signup and view all the answers

Study Notes

Sitrik Asit (TCA) Döngüsü

Sitrik Asit Döngüsü'nün (Krebs Döngüsü) keşfi 1937 yılında Hans Adolf Krebs tarafından yapılmıştır.
1953 yılında Fizyoloji ve Tıp Nobel Ödülü'ne layık görülmüştür.
İlk makalesi "Nature" dergisinde kabul görmemiştir, ancak başka bir dergide yayımlanmıştır.
Krebs, reddedilen makalelerinin eleştirisine pozitif bir yaklaşımı vurguluyordu.

Biyomedikal Önem

Diğer adı TCA (üç karbonlu asit) veya Krebs döngüsüdür.
Karbohidrat, lipid ve proteinlerin aerobik oksidasyonunun ortak son yoludur.
Glukoneogenez, lipogenez ve amino asitlerin birbirine dönüşümünde merkezi rol oynar.
Çok sayıda maddenin öncüsü olarak görev yapar.
En çok karaciğerde gerçekleşir.
Mitokondride gerçekleşir.
Genetik anormallikleri nadirdir ve yaşam ile uyumlu değildir.

Sitrik Asit Döngüsü Solunum Zinciri İçin Substrat Sağlar

Döngü, iki karbonlu asetil-KoA ile dört karbonlu okzaloasetatın altı karbonlu sitrat oluşturmasıyla başlar.
OAA, katalitik rol oynar, benzeri bir yapıya sahiptir.
8 basamaktan oluşur.
2 mol CO2 açığa çıkar ve okzaloasetat yeniden oluşur.
3 NADH, 1 FADH2 ve 1 GTP üretir.
Hem anabolik hem de katabolik bir yoldur (amfibolik yol).
Sitoplazma dışı TCA enzimlerinin tamamı mitokondri matriksinde bulunur.

TCA Döngüsü Ürünleri

Oksidasyon basamakları
Dekarboksilasyon basamakları
Substrat düzeyinde GTP (ATP)

Sitratın İzositrat Çevrimi

Sitrat, akonitaz tarafından izositrata izomerize edilir.
İki basamakta gerçekleşir.
Sitrat simetrik bir molekül olmasına rağmen, akonitaz ile asimetrik reaksiyon verir; bu nedenle asetil-KoA'dan kaynaklanmayan iki karbon atomunu kaybeder.

İzositratın α-Ketoglutarata Çevrimi

Enzim izositrat dehidrogenazdır.
Regülasyon basamaklardan biridir.
İzositrat, dekarboksilasyona uğrayarak a-ketoglutarata dönüşür.
Kofaktörler Mg2+ ve Mn2+'dir.
ATP ve NADH, enzimi inhibe ederken ADP ve Ca2+ enzimi aktive eder.

α-Ketoglutaratın Süksinil-KoA 'ya Çevrimi

Enzim a-Ketoglutarat dehidrogenazdır.
Bir oksidatif dekarboksilasyondur.
Tiyamin difosfat (pirofosfat), lipoat, NAD+, FAD ve KoA kofaktörleri gereklidir.
Süksinil-KoA oluşturur.
Reaksiyon süksinil-KoA lehinedir.
Arsenik, reaksiyonu inhibe eder.

Süksinil-KoA'nın Süksinata Dönüşümü

Süksinat tiyokinaz (süksinil-KoA sentetaz) katalizörlüğünde gerçekleşir.
Substrat düzeyinde enerji elde edilen tek bir basamaktır.
Glukoneogentik dokular için ADP'ye özgüdür.
Ekstrahepatik dokularda keton cisimcikleri metabolize edildiğinde alternatif bir reaksiyon vardır.

TCA'da Substrat Düzeyinde Enerji Elde Edilmesi

Süksinil-KoA sentetaz kullanılır ve GTP oluşur.

Süksinanın OAA'ya Çevrimi

4 basamaktan oluşur.
İlk basamak karbon-karbon arasında çift bağ oluşturan dehidrogenasyondur.
İkinci basamak su eklenerek bir hidroksil grubu elde edilmesidir (hidrasyon).
Üçüncü basamak, tekrar dehidrogenasyonla bir okso-grubunun oluşmasıdır (okzaloasetat).
İlk dehidrogenasyon mitokondri iç zarına bağlı süksinat dehidrogenaz tarafından katalizlenir; fumarat oluşturur.
Fumaraz, çift bağa su ekleyerek malata dönüştürür.
Malat, malatdehidrogenaz ile okzaloasetata dönüşür.

FAD Bağlı Süksinat Dehidrogenaz

FAD bağımlı bir enzimdir.

Sitrik Asit Döngüsünden Elde Edilen ATP Miktarı

Toplamda 10 ATP üretir.
Pruvat'tan asetil-KoA'ya dönüştürülmesi dahil edilirse 12,5 ATP olur.

TCA Döngüsü'nün Metabolizmadaki Rolü

Enerji çevrimi
Amino asit metabolizması
Tranaminasyon ve deaminasyon
Glukoneogenez
Yağ asidi ve kolesterol sentezi
Hem sentezi

TCA ve Glikoliz Arasındaki Koordinasyon

Glikoliz reaksiyonları ile birlikte koordineli çalışır.
TCA döngüsü, farklı enzimlerin aktiviteleri tarafından kontrol edilir.

TCA İnhibitörleri

Akonitaz: Floroasetat
α-Ketoglutarat: Arsenik
Süksinat dehidrogenaz: Malonat

Floroasetat

TCA döngüsünü inhibe eder.
Floroasetil-KoA'nın oluşumuna neden olur.
Florositratın oluşumuna neden olur.
Akonitazı inhibe eder.

Arsenik Zehirlenmesi

Arsenit ve arsenattan kaynaklanır.
Prüvat dehidrogenaz ve ketoglutarat dehidrogenazı inhibe eder.
TCA döngüsünü ve fosforilasyon reaksiyonlarını bozar.

Prüvat Dehidrogenaz Kompleksi (PDC)

Mitokondriyal matrikste bulunur.
Prüvatı oksidatif dekarboksilasyon yoluyla asetil-KoA'ya dönüştürür.
5 (4 vitamin türevi) koenzim gerektirir.
Üç enzimden oluşur:
Prüvat dekarboksilaz (E1)
Dihidrolipoil trans asetilaz (E2)
Dihidrolipoil dehidrogenaz (E3)

PDC Kompleksi Çalışması

Basamakların sırası
Olaylar

Prüvatın PDC İle Oksidatif Dekarboksilasyon ve Asetil-KoA Oluşumu

TPP varlığında prüvat reaksiyonlar aracılığıyla asetil-KoA'ya dönüştürülür.
Hidroksietil kısmı TPP'ye bağlanır.
Okside lipoik asid, substratı KoA ile birleştirerek asetil-KoA üretir.
Oluşan FADH2 ise NAD+ ile elektron aktararak NADH+ H+ üretir.

PDC Kompleksinin Regülasyonu

PDC'nin substratlarla kontrolü.
Aktivasyon yolları: KoA ve NAD+
İnhibisyon yolları: Asetil-KoA ve NADH
PDC'yi aktive ve inhibe eden enzimlerin kontrolü
Kinaz ve fosfataz, PDC aktivasyon ve inhibisyonu düzenlemektedir.

Vitaminlerin TCA Döngüsü'ndeki Rolü

TCA döngüsünde çok çeşitli enzim işlemlerinde rol oynarlar, örneğin;
a-ketoglutarat dehidrogenaz (FAD, TPP)
İzositrat dehidrogenaz (NAD)
Prüvat dehidrogenaz (TPP, NAD+)
Süksinat dehidrogenaz (FAD)
Malat dehidrogenaz (NAD+)
Bu vitaminler, ilgili enzimin yapısına katılarak veya kofaktör işlevini görerek reaksiyonlara katılır.

Diğer Yolakların TCA Bağıntıları

Glukoz, prüvata dönüştürülerek TCA döngüsüne dahil olur.
TCA döngüsü, birçok metabolit metabolizması yolunda merkezi bir rol oynar.

Studying That Suits You

Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.

Description

Bu quiz, TCA döngüsü ve Pirüvat Dehidrojenaz Kompleksi (PDC) ile ilgili önemli kavram ve mekanizmaları test eder. Katılımcılar, PDC aktivasyonu, inhibisyonu ve TCA döngüsünün başlangıç noktaları gibi konular üzerinde düşünmelidir. Biyokimya dersleri için faydalı bir değerlendirme kaynağıdır.