Podcast
Questions and Answers
Jakie białka pełnią kluczową rolę w replikacji RNA wirusa SARS-CoV-2?
Jakie białka pełnią kluczową rolę w replikacji RNA wirusa SARS-CoV-2?
Jakie białko jest kluczowe dla aktywacji polimerazy RNA zależnej od RNA w wirusie SARS-CoV-2?
Jakie białko jest kluczowe dla aktywacji polimerazy RNA zależnej od RNA w wirusie SARS-CoV-2?
Czym charakteryzuje się genotyp wirusa SARS-CoV-2?
Czym charakteryzuje się genotyp wirusa SARS-CoV-2?
Jaką funkcję pełnią białka strukturalne wirusa?
Jaką funkcję pełnią białka strukturalne wirusa?
Signup and view all the answers
Jakie białka kodowane są przez genom SARS-CoV-2?
Jakie białka kodowane są przez genom SARS-CoV-2?
Signup and view all the answers
Co usuwane jest w trakcie naprawy błędów typu NER w ssDNA?
Co usuwane jest w trakcie naprawy błędów typu NER w ssDNA?
Signup and view all the answers
Jaka jest rola proteazy Mpro w replikacji wirusa?
Jaka jest rola proteazy Mpro w replikacji wirusa?
Signup and view all the answers
Jakie białko jest odpowiedzialne za kodowanie polimerazy RNA zależnej od RNA?
Jakie białko jest odpowiedzialne za kodowanie polimerazy RNA zależnej od RNA?
Signup and view all the answers
Jakie rodzaje wirusów mają osłonkę lipidowo-białkową?
Jakie rodzaje wirusów mają osłonkę lipidowo-białkową?
Signup and view all the answers
Która z wymienionych polimeraz DNA nie jest zaangażowana w odbudowę uszkodzonego DNA?
Która z wymienionych polimeraz DNA nie jest zaangażowana w odbudowę uszkodzonego DNA?
Signup and view all the answers
Jaką rolę odgrywa ligaza DNA w procesie naprawy DNA?
Jaką rolę odgrywa ligaza DNA w procesie naprawy DNA?
Signup and view all the answers
Który wirus wymaga przepisania RNA na komplementarną nić RNA przed replikacją?
Który wirus wymaga przepisania RNA na komplementarną nić RNA przed replikacją?
Signup and view all the answers
Jakie działanie wykonują endonukleazy w kontekście uszkodzonego DNA?
Jakie działanie wykonują endonukleazy w kontekście uszkodzonego DNA?
Signup and view all the answers
Która z poniższych polimeraz DNA jest stymulowana przez PCNA?
Która z poniższych polimeraz DNA jest stymulowana przez PCNA?
Signup and view all the answers
Jakie wirusy są klasyfikowane jako wirusy dsDNA?
Jakie wirusy są klasyfikowane jako wirusy dsDNA?
Signup and view all the answers
Czym charakteryzują się wirusy ssDNA?
Czym charakteryzują się wirusy ssDNA?
Signup and view all the answers
Jaka jest rola podjednostki S1 wirusa Sars-Cov-2 w interakcji z komórkami ludzkimi?
Jaka jest rola podjednostki S1 wirusa Sars-Cov-2 w interakcji z komórkami ludzkimi?
Signup and view all the answers
Jakie działanie mają grupy metylowe dołączane do łańcucha DNA?
Jakie działanie mają grupy metylowe dołączane do łańcucha DNA?
Signup and view all the answers
Co to są szczepionki podjednostkowe?
Co to są szczepionki podjednostkowe?
Signup and view all the answers
Jakie jest działanie receptora ACE 2 w kontekście metabolizmu angiotensyny?
Jakie jest działanie receptora ACE 2 w kontekście metabolizmu angiotensyny?
Signup and view all the answers
Jaką rolę odgrywają adiuwanty w szczepionkach?
Jaką rolę odgrywają adiuwanty w szczepionkach?
Signup and view all the answers
Jakie są skutki metylacji DNA?
Jakie są skutki metylacji DNA?
Signup and view all the answers
Jakie są możliwe zastosowania wirusów bakteriofagów w terapii nowotworowej?
Jakie są możliwe zastosowania wirusów bakteriofagów w terapii nowotworowej?
Signup and view all the answers
Czym jest inżynieria fagowa w kontekście terapii nowotworowej?
Czym jest inżynieria fagowa w kontekście terapii nowotworowej?
Signup and view all the answers
Study Notes
Biologia molekularna
- To interdyscyplinarna dziedzina nauki
- Zajmuje się wyjaśnianiem zjawisk biologicznych
- Poprzez ustalanie budowy i funkcji cząsteczek
- Wchodzących w skład organizmów żywych
- Głównie bada DNA, RNA i białka
Genom
- To ogół materiału genetycznego w komórce lub wirusach
- Niosącego informację genetyczną w postaci kwasów nukleinowych
- Paproć Tmesipteris truncata ma największy znany genom
- Grzyb Encephalitozoon intestinalis ma najmniejszy znany genom
Rodzaje DNA
- mtDNA – mitochondrialne DNA
- nDNA – jądrowe DNA
- cpDNA – chloroplastowe DNA
Porównanie komórek prokariotycznych i eukariotycznych
- Nie podano szczegółów porównania
Nowe organellum – eksluzosomy
- Zawiera DNA pozachromosomalne
- Na zewnątrz jądra komórkowego ssaków
Elementy budujące kwasy nukleinowe
-
Zasady azotowe:
- Puryny (dwa pierścienie): adenina, guanina
- Pirymidyny (jeden pierścień): cytozyna, tymina, uracyl
-
Pentozy (cukry):
- β-D-ryboza (RNA)
- β-D-2-deoksyryboza (DNA)
Genom bakteryjny a eukariotyczny
- Bakterie nie posiadają intronów (niekodujących sekwencji)
- Introny obecne są w eukariontach
Zmienność genetyczna
- Naturalne różnice w sekwencji DNA między osobnikami
- Genotyp - indywidualna sekwencja DNA
- Polimorfizmy DNA to wynik mutacji i błędów w rekombinacji. Mogą być pojedyncze nukleotydy (SNP) lub dłuższe sekwencje (np. mikrosatelitarne).
Epigenetyka
- Wpływ czynników środowiskowych na ekspresję genów
- Wpływają na ekspresję genów, ale nie zmieniają sekwencji DNA
Nowe biocząsteczki – glikoRNA
- Glikozylowane cząsteczki RNA
- Występują na powierzchni komórek w chorobach autoimmunologicznych
Long noncoding RNA (IncRNA)
- 2% całości RNA
- Funkcja w regulacji ekspresji genów np. w rozwoju nowotworów
- Mogą działać w 3 sposoby
Farmakogeny
- Geny odpowiedzialne za metabolizm leków
Regulacja procesów replikacji DNA i RNA (SARS-CoV-2), naprawa DNA
- Replikacja DNA zachodzi w fazie S cyklu komórkowego.
- Mechanizm replikacji DNA u eukariontów jest semikonserwatywny.
- Wyróżniamy trzy fazy replikacji: aktywacja, elongacja, terminacja.
- Replikacja DNA opiera się na dwóch niciach: wiodącej i opóźnionej
- Inne białka biorące udział w replikacji np. Helikaza, Topoizomeraza
- Polimerazy DNA różnią się w zależności od organizmu (prokarioty/eukarioty)
- Naprawa pęknięć dwuniciowych DNA odbywa się przez rekombinację homologiczna (HR) lub system łączenia końców niehomologicznych (NHEJ)
- Naprawa pęknięć jednoniciowych DNA zachodzi przez wycinanie i resyntezę (BER, NER, MMR)
Naprawa DNA przez wycinanie i resyntezę (BER i NER)
- Dwa mechanizmy naprawy uszkodzeń DNA
- Ustalenie uszkodzonej zasady, jej usunięcie, naprawa dobudowania nowych zasad
Regulacja molekularna replikacji u SarsCov-2
- Wirusy dzielą się na osłonkowe i bezosłonkowe
- Wirusy ssDNA – bez osłonek; parwowirusy, HPV-B19
- Wirusy dsDNA – bez osłonek; wirusy brodawczaków człowieka HPV-16, adenowirusy Adv12
- Wirusy ssRNA – wirusy; wirus grypy, wirus wścieklizny.
- Wirusy +ssRNA
- Wirusy dsRNA - bez osłonek; rotawirusy
Replikacja RNA u wirusów
- Białka niestrukturalne są zlokalizowane w ORF 1a i ORF 1b
- Istnieją białka uczestniczące w replikacji wirusów, tj. Polimeraza, Proteaza Mpro.
- Genom wirusa SarsCov-2 to RNA
Markery białkowe polimorfizmu – immunodetekcja
- Białka mogą występować w 4 formach: 1-rzędowa, 2-rzędowa, 3-rzędowa i 4-rzędowa
- Markery genetyczne to cząsteczki molekularne warunkujące łatwe do zidentyfikowania cechy.
- Markery białkowe są kodowane przez jeden lub więcej genów
Markery izoenzymatyczne
- Różnią się budową aminokwasową
- Katalizują te same reakcje biochemiczne
- Wyróżnia się je poprzez stężenie ich, rozróżniane na prążki na żelu
Główne antygeny Sars-Cov-2
- Białko nukleokapsydu NCP
- Białko kolca (spike) – wysoka swoistość, wiąże receptor ACE2
Metody immunodetekcji
- Diagnostyka molekularna i analiza polimorfizmów
Homestaza
- Utrzymywanie stałości warunków w komórkach organizmu
- Reakcje metaboliczne
- Enzymy, które potrzebują ATP do działania: kinazy białkowe, P3, itp.
- Procesy energochłonne: transport aktywny, podziały komórkowe
Bakteriofagi
- Lityczne: zbudowane z główki, ogona, nóżek, cząsteczki RNA i receptora
- Lizogeniczne: integrują swój genom do chromosomu bakterii
Układ hormonalno-enzymatyczny RAAS
- Wirus Sars-Cov-2 ma RNA otoczone otoczką
- Geny białek strukturalnych, białko kolca, białko błonowe, białko nukleokapsydu
- Podjednostka S1 i S2 w białku kolca
Typy szczepionek
- Żywe, atenuowane
- Zabite chemicznie lub termicznie
- Podjednostkowe (z białek, peptydów lub materiału genetycznego)
- Z adiuwantów (metale ciężkie dla wzmocnienia odpowiedzi immunologicznej)
Markery jądrowe i organellowe DNA
- Marker molekularny to wyróżniony fragment DNA lub białek
- Markery z wysoką frekwencją w genomie, łatwe do wykrycia, zapewniają naturalną selekcję i prostą metodę wykrywania
- Izolacja DNA, reakcja PCR, genotypowanie w sekwenatorze, odczyt i interpretacja profili genetycznych
- Metody: magnetyczna, elektroforeza
Studying That Suits You
Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.
Related Documents
Description
Quiz dotyczący biologii molekularnej, koncentrujący się na budowie i funkcjach DNA, RNA oraz białek. Obejmuje też zagadnienia związane z genomami organizmów oraz różnicami między komórkami prokariotycznymi a eukariotycznymi. Sprawdź swoją wiedzę na temat struktury kwasów nukleinowych oraz eksluzosomów.