Podcast
Questions and Answers
מהו האנזים הייחודי לחיידקים ומאפשר לאנטיביוטיקות מסוימות לפעול נגדו?
מהו האנזים הייחודי לחיידקים ומאפשר לאנטיביוטיקות מסוימות לפעול נגדו?
- DNA Gyrase (correct)
- RNA פולימראז
- DNA ליגאז
- הליקאז
מהו ה-Replisome?
מהו ה-Replisome?
- קומפלקס של מספר חלבונים המשתתפים בתהליך השעתוק.
- קומפלקס של מספר חלבונים המשתתפים בתהליך הרפליקציה. (correct)
- אנזים האחראי על תיקון שגיאות ברצף ה-DNA.
- מבנה ה-DNA הסלילי לאחר הכפלה.
כיצד פועלות אנטיביוטיקות מסוימות כנגד חיידקים בהקשר של DNA Gyrase?
כיצד פועלות אנטיביוטיקות מסוימות כנגד חיידקים בהקשר של DNA Gyrase?
- על ידי חיזוק מבנה הסליל הכפול של ה-DNA.
- על ידי הפרעה ליכולת ה-DNA Gyrase לשחרר מתח פיתולי במהלך שכפול ה-DNA. (correct)
- על ידי קידום שחרור המתח הפיתולי ב-DNA.
- על ידי עיכוב ישיר של סינתזת ה-DNA.
מה יהיה ההשפעה העיקרית של חסימת פעילות ה-DNA Gyrase בחיידק?
מה יהיה ההשפעה העיקרית של חסימת פעילות ה-DNA Gyrase בחיידק?
מה ההבדל העיקרי בין ה-Replisome לבין DNA Gyrase?
מה ההבדל העיקרי בין ה-Replisome לבין DNA Gyrase?
מה ההבדל המרכזי במבנה של רנא פולימראז בין שלוש הממלכות?
מה ההבדל המרכזי במבנה של רנא פולימראז בין שלוש הממלכות?
מה תפקידו של סיגמא-פקטור ברנא פולימראז בחיידקים?
מה תפקידו של סיגמא-פקטור ברנא פולימראז בחיידקים?
אילו מהבאים אינו מתאר בצורה נכונה את רנא פולימראז?
אילו מהבאים אינו מתאר בצורה נכונה את רנא פולימראז?
מה ניתן להסיק לגבי האבולוציה של רנא פולימראז על סמך המידע?
מה ניתן להסיק לגבי האבולוציה של רנא פולימראז על סמך המידע?
איזו מהטענות הבאות נכונה לגבי רנא פולימראז וסיגמא-פקטור?
איזו מהטענות הבאות נכונה לגבי רנא פולימראז וסיגמא-פקטור?
מהו התפקיד העיקרי של חלבון ה-rho במנגנון סיום התעתוק?
מהו התפקיד העיקרי של חלבון ה-rho במנגנון סיום התעתוק?
כיצד מזהה רנא פולימראז את האות לסיום התעתוק במנגנון התלוי ב-rho?
כיצד מזהה רנא פולימראז את האות לסיום התעתוק במנגנון התלוי ב-rho?
מה קורה לפעילות של רנא פולימראז כאשר חלבון ה-rho מגיע לאזור הלולאה?
מה קורה לפעילות של רנא פולימראז כאשר חלבון ה-rho מגיע לאזור הלולאה?
מהו הגורם הראשוני שמאפשר לחלבון ה-rho להתחיל את פעולתו?
מהו הגורם הראשוני שמאפשר לחלבון ה-rho להתחיל את פעולתו?
מה יקרה אם חלבון ה-rho לא יוכל להיקשר לרנא שזה עתה סונתז?
מה יקרה אם חלבון ה-rho לא יוכל להיקשר לרנא שזה עתה סונתז?
מה נכון לגבי מבנה רבעוני של חלבונים?
מה נכון לגבי מבנה רבעוני של חלבונים?
אילו מהבאים מתאר בצורה הטובה ביותר את השלבים הנדרשים לחלבון כדי להפוך לפעיל לאחר תרגומו?
אילו מהבאים מתאר בצורה הטובה ביותר את השלבים הנדרשים לחלבון כדי להפוך לפעיל לאחר תרגומו?
מה המטרה העיקרית של קיפול חלבון למבנים שניוניים ושלישוניים לאחר תרגומו?
מה המטרה העיקרית של קיפול חלבון למבנים שניוניים ושלישוניים לאחר תרגומו?
אילו מהתהליכים הבאים עשויים להתרחש לחלבון לאחר תרגומו?
אילו מהתהליכים הבאים עשויים להתרחש לחלבון לאחר תרגומו?
מה יכול להשפיע על הצורך של חלבון לעבור מודיפיקציה נוספת לאחר יצירת המבנים השניוניים והשלישוניים שלו?
מה יכול להשפיע על הצורך של חלבון לעבור מודיפיקציה נוספת לאחר יצירת המבנים השניוניים והשלישוניים שלו?
מהי המטרה העיקרית של בקרת ביטוי גנים בחיידקים?
מהי המטרה העיקרית של בקרת ביטוי גנים בחיידקים?
איזו מהבאים מתאר בצורה הטובה ביותר בקרת ביטוי גנים חיובית?
איזו מהבאים מתאר בצורה הטובה ביותר בקרת ביטוי גנים חיובית?
מה משותף לגנים באופרון מבחינת בקרה?
מה משותף לגנים באופרון מבחינת בקרה?
אילו מהבאים אינו מהווה רמה של בקרת ביטוי גנים בחיידקים?
אילו מהבאים אינו מהווה רמה של בקרת ביטוי גנים בחיידקים?
כיצד בקרת ביטוי גנים שלילית משפיעה על תהליך השעתוק?
כיצד בקרת ביטוי גנים שלילית משפיעה על תהליך השעתוק?
מהו ה-Expressosome בהקשר של ביולוגיה מולקולרית?
מהו ה-Expressosome בהקשר של ביולוגיה מולקולרית?
מהו תפקידם העיקרי של גנים מסוג Housekeeping genes באורגניזם?
מהו תפקידם העיקרי של גנים מסוג Housekeeping genes באורגניזם?
איזה מהבאים הוא מאפיין ייחודי של Expressosome שאינו קיים בתהליכי שעתוק ותרגום נפרדים?
איזה מהבאים הוא מאפיין ייחודי של Expressosome שאינו קיים בתהליכי שעתוק ותרגום נפרדים?
אילו מהפעולות הבאות אינה סביר שתבוצע על ידי תוצרי גנים מסוג Housekeeping?
אילו מהפעולות הבאות אינה סביר שתבוצע על ידי תוצרי גנים מסוג Housekeeping?
כיצד סביר להניח שתא פרוקריוטי ינצל את ה-Expressosome כדי להגיב במהירות לשינוי סביבתי?
כיצד סביר להניח שתא פרוקריוטי ינצל את ה-Expressosome כדי להגיב במהירות לשינוי סביבתי?
Flashcards
rho מהו חלבון
rho מהו חלבון
חלבון הנקשר לרנא שזה עתה סונתז ומקדם סיום שעתוק.
מנגנון תלוי rho
מנגנון תלוי rho
מנגנון סיום שעתוק בו חלבון rho נקשר לרנא וגורם לפולימראז רנא לעצור.
לולאת עצירה
לולאת עצירה
אזור ברנא שזה עתה סונתז אליו מגיע חלבון rho, הגורם לרנא פולימראז לעצור.
סיום שעתוק (תלוי rho)
סיום שעתוק (תלוי rho)
Signup and view all the flashcards
זיהוי הלולאה
זיהוי הלולאה
Signup and view all the flashcards
DNA Gyrase
DNA Gyrase
Signup and view all the flashcards
Replisome
Replisome
Signup and view all the flashcards
תפקיד DNA Gyrase
תפקיד DNA Gyrase
Signup and view all the flashcards
מטרה של אנטיביוטיקות מסוימות
מטרה של אנטיביוטיקות מסוימות
Signup and view all the flashcards
רפליקציה (שכפול)
רפליקציה (שכפול)
Signup and view all the flashcards
אקספרסוזום
אקספרסוזום
Signup and view all the flashcards
Housekeeping genes
Housekeeping genes
Signup and view all the flashcards
רנ"א פולימראז
רנ"א פולימראז
Signup and view all the flashcards
סיגמא-פקטור
סיגמא-פקטור
Signup and view all the flashcards
שלוש הממלכות
שלוש הממלכות
Signup and view all the flashcards
קומפלקס בסיסי של רנ"א פולימראז
קומפלקס בסיסי של רנ"א פולימראז
Signup and view all the flashcards
מבנה רנ"א פולימראז משתנה
מבנה רנ"א פולימראז משתנה
Signup and view all the flashcards
מהו עיבוד חלבון?
מהו עיבוד חלבון?
Signup and view all the flashcards
מהו מבנה שניוני ושלישוני?
מהו מבנה שניוני ושלישוני?
Signup and view all the flashcards
מהו מבנה רבעוני?
מהו מבנה רבעוני?
Signup and view all the flashcards
מהי מודיפיקציה?
מהי מודיפיקציה?
Signup and view all the flashcards
מדוע עיבוד חלבון חשוב?
מדוע עיבוד חלבון חשוב?
Signup and view all the flashcards
בקרה חיובית
בקרה חיובית
Signup and view all the flashcards
בקרה שלילית
בקרה שלילית
Signup and view all the flashcards
פרומוטור
פרומוטור
Signup and view all the flashcards
אופרון
אופרון
Signup and view all the flashcards
רמות בקרת ביטוי גנים בחיידקים
רמות בקרת ביטוי גנים בחיידקים
Signup and view all the flashcards
Study Notes
- לחיידקים יש כרומוזום אחד המכיל מידע גנטי
- בנוסף, ישנם מבנים מחוץ לכרומוזום, כמו פלסמידים, המשכפלים את עצמם באופן עצמאי
- לחיידק e-coli כ-5 מיליון בסיסים וגם מעל 4300 גנים המקודדים לחלבונים
- גנים המקודדים חלבונים עבור מסלול מטבולי ספציפי, נמצאים בסמיכות במבנה שנקרא אופרון
- Supercoiling מאפשר לדנ"א להיכנס לחיידק
- טופואיזומראזות יוצרות מבנה זה על ידי יצירת שבר בסליל דנ"א והסתובבות סביב עצמו
- DNA Gyrase מבצע פעולה זו, הוא ייחודי לחיידקים, ולכן אנטיביוטיקה מסוימת יכולה לתקוף אותו
- רפליזום הוא קומפלקס של חלבונים המעורבים ברפליקציה
RNA פולימראז
- RNA פולימראז מבצע את אותה הפעולה בשלוש הממלכות ביולוגיות, עם זאת, המבנה משתנה בין כל אחת מהן
- לחלבון הפולימראז בחיידקים יש חלבון הנקרא סיגמא-פקטור, שאינו חלק מקומפלקס הליבה של RNA פולימראז
סיגמא-פקטור
- במהלך סינתזה של RNA, הפולימראז מזהה אזורים להתחברות בעזרת יחידת הסיגמא פקטור
- (sigma factor), מזהה רצפים ספציפיים בגדיל שאינו מקודד
- הרצפים המזוהים מרוחקים זה מזה במרחקים שווים והם רצפי פרומוטור
- פקטור הסיגמא האחראי לשעתוק רוב הגנים נקרא סיגמא-פקטור-70
- קיימים פקטורים נוספים המאפשרים תעתוק של גנים המבוטאים בתנאי סביבה שונים
- רצפי קונצנזוס צבועים באדום
- יחידת הסיגמא נקשרת לרצף ספציפי, אך היא יכולה להיקשר גם לרצפים דומים
- ככל שהרצף דומה יותר לרצף קונצנזוס, הקישור ליחידת הסיגמא יהיה חזק יותר
- תא יכול לשלוט ביצירת ה-RNA מרצפים מסוימים, באמצעות האמור לעיל
סיום שעתוק
- ישנם שני מנגנונים לסיום השעתוק בחיידקים: אחד תלוי Rho ואחד לא תלוי
- מנגנון שאינו תלוי ב-rho: אזורים עשירים ב-GC מתקפלים ויוצרים מבנה לולאה ואחריו רצפים חוזרים של U
- כאשר ה-RNA פולימראז מזהה מבנה זה, הוא מתנתק מהדנ"א ועוצר את השעתוק
- מנגנון תלוי ב-rho: נקשר לרנ"א שזה עתה סונתז ומתקדם לאורכו, כשהוא מגיע לאזור הלולאה, הוא מאט, וה-RNA פולימראז מזהה את המבנה
- חלבון ה-rho עוצר את פעילותו ומפסיק את השעתוק
- טרמינציה Rho-independent תלויה ב-U וטרמינציה Rho-dependent תלויה בחלבון Rho
אופרון
- אופרון הוא אלמנט בכרומוזום חיידקי הכולל מספר גנים סמוכים המנוטרים תחת אותו מרכז בקרה
- כאשר מתחיל השעתוק מהפרומוטור, האופרון כולו מתורגם למרנ"א המקודד למספר חלבונים המתורגמים באופן עצמאי
- לכל גן נקשר ריבוזום נפרד
תעתיק הפוך
Reverse transcription
- אנזימים הנקראים טרנסקריפטאז הפוך יכולים להשתמש ברנ"א כתבנית כדי ליצור דנ"א
- retrovirus וירוסים יכולים לעשות זאת, כמו וירוס ה-HIV
הקוד הגנטי
- יש 64 קודונים, 3 מהם מסמנים עצירה
- למרות שקודון ההתחלה הוא AUG, קודונים אחרים יכולים ליזום שעתוק אך ביעילות נמוכה יותר (AUG, GUG, UUG) הם היעילים ביותר
- על מנת להתחיל בתרגום, יש צורך בפקטורים נוספים מלבד קודון ההתחלה, כגון רצפי Shine-Dalgarno, אליהם הריבוזום נקשר
סינתזת חלבונים
- הריבוזום מורכב מתתי יחידות, יחידה קטנה (30S) ויחידה גדולה (50S) היוצרות את הריבוזום (70S)
- התרגום יכול להתרחש בעזרת מספר ריבוזומים בו זמנית
- כאשר מספר ריבוזומים נקשרים לרנ"א בודד מתורגמים לאותו חלבון, המבנה נקרא polysomes
- לאחר התרגום, החלבון עובר עיבוד, ורוכש מבנים שניוניים ושלישוניים להפיכתו לפעיל
- לעתים נדרשת אפילו מבנה רבעי
- חלבונים לפעמים דורשים שינוי לפני שהם פעילים
- כאשר תרגום ושעתוק מתרחשים בו זמנית על אותו רנ"א, המכונה Expressosome
בקרה על ביטוי גנים בחיידקים
- גנים אשר באים לידי ביטוי תמידי, גם בפרוקריוטים וגם איקריוטים genes Housekeeping
- גנים אלו חיוניים לאורגניזם
- חלק מהגנים אינם מסוג genes Housekeeping, ויש לבטא אותם בהתאם לנסיבות הסביבתיות ולפעילות האורגניזם
- ביטויים אינו הכרחי אלא אם כן הסוכר נמצא בסביבה
לחיידק יש 3 רמות של בקרת ביטוי גנים
- רמת שעתוק
- רמת רנ"א ויציבותו
- שליטה על תפקוד החלבון
- בקרות יכולות להיות חיוביות-להגברת ביטוי הגנים, או שליליות-לדיכוי ביטוי של גנים אלו
- מנגנון זה נובע מכך שלגנים מסוימים שנמצאים באותו אופרון יש בדרך כלל את אותו יזם שמבקר אותם, ולכן הם בדרך כלל מוקדשים להשתתפות באותו מסלול פיזיולוגי
Regulon רגולון
- צבר גנים או אופרונים מבוקר על ידי אותו גורם שעתוק או גורמי בקרה אחרים
Studying That Suits You
Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.