Semana 6 PDF - Apuntes de Biología Celular

📌 Semana 6 Núcleo Funciones: Replicación: división celular → mitosis Transcripción: ADN → mRNA Cisterna perinuclear - membrana nuclear interna y externa Membrana nuclear externa (hacia el citoplasma)...

📌 Semana 6 Núcleo Funciones: Replicación: división celular → mitosis Transcripción: ADN → mRNA Cisterna perinuclear - membrana nuclear interna y externa Membrana nuclear externa (hacia el citoplasma): Se asocia los ribosomas al mRNA para convertirlo en proteínas (van trayendo un aminoácido en particular) Con el retículo endoplasmático Membrana nuclear interna (núcleo al citosol): Asociada con la lámina nuclear Ahí se adhiere la cromatina Se forma un espacio entre las dos membranas que se nombra cisterna Semana 6 1  La membrana nuclear interna esta conectada con la lámina nuclear Semana 6 2  Sistemas membranosos Membrana plasmática Sistemas membranosos internos Sistema que comprende una membrana cerrada que separa el citoplasma del interior del sistema Para eso existe el retículo endoplasmático rugoso - production proteínas de membrana, exportación de lisosoma, Retículo endoplasmático liso - elabora otras sustancias que necesita la célula, como los lípidos (grasas) y los carbohidratos (azúcares) Complejo de Golgi - termina de formar moléculas particulares y exportarlas Lisosomas - se derivan del endoplasmático rugoso, complejo Golgi, peroxisomas Retículo endoplasmático rugoso: Semana 6 3  Paranuclear; siempre asociado al núcleo La información que necesita el retículo endoplasmático esta en el núcleo → tiene que estar cerca para poder estar cerca a esa información. Sistema de membranas aplanadas interconectadas entre sí (cisternas). El lado de adentro es cisternal y el de afuera citoplasmático. En la superficie presenta ribosomas, por lo cual es rugoso, aquí se producen las proteínas. Aunque pueden haber ribosomas no asociadas a este organelo (en el citoplasma). Ribosomas: Estructura que presenta dos subuniudades (grande y chiquita) Ambas conformadas con RNA ribosomal, cuya información se encuentra en el núcleolo y proteínas. Subunidad grande: uno de los ARN tiene función enzimática, por lo que se llama peptidil transferasa (transfiere péptidos). Subunidad pequeña: solo tiene un tipo de ARN, ribosomas y proteínas. ARN mensajero: Copia en espejo de una secuencia de ADN. Organizado por tripletas de bases nitrogenadas que se denominan cordones → cada codón codifica para un aminoácido. Como hay mas codones que aminoácidos, se da que un codón codifique para un mismo aminoácido, pero solo para ese. No para dos distintos. Codón de iniciación: metionina (AUG). Codón de finalización: no codifica para ningún aminoácido (UAG) ARN de transferencia: Su secuencia esta en el nucleolo. La estructura de los azucares permite que esta molécula se pliegue con uniones, tomando una Semana 6 4  forma de trébol. Es un trébol de tres hojas y un tario. En la hoja de la mitad, presenta una secuencia de bases que es complementaria a un codón y se llama anticodón. Este carga el aminoácido que codifica el codón del cual es complementario. Con energía y una enzima que se llama aminoacil-RNA transferasa, queda cargado para que una aa- AMP - ampicodón que corresponde al codón de ese aminoácido. Aminoacil-RNAt- sintetaza. Para unir la enzima, usa ATP, el aminoácido al extremo Factores de iniciación correspondientes a cada actor se van a unir a aquello para poder acoplar la maquina. Semana 6 5 Semana 6 6  Traducción ocurre en el citoplasma Poliribosomas - cadena polipeptídica en crecimiento Proteínas pueden salir al citoplasma y se les va a unir chaperonas (acompañantes). Evita una alteración en el plegamiento de la proteína y la lleva a donde toca. (Algunas llegan a la mitocondria). Proteínas de membrana de secreción/lisosomales también se forman en un lisosoma leyendo un mensajero. La lectura se inicia en el citoplasma. Sobre un mismo ARN mensajero, pueden ir actuando varios procesos de transcripción. Síntesis de proteínas en RER: Semana 6 7  Se empieza a leer y sale un péptico señal. Un factor que se llama partícula de reconocimiento de la señal la reconoce y se une al péptico señal y bloquea al ribosoma (ya no se puede seguir leyendo). Induce que ese ribosoma en particular o cadena de ribosomas se vayan al retículo. El retículo es un sistema de membrana (bicapa lipídica). Tienen proteínas de coro - riboforinas asociadas a un receptor de la partícula de reconocimiento de la señal que cuando está vacía, el poro esta cerrado. Serie de proteínas que se juntan y cuando están juntas cierran el poro, separadas abren un hueco. Cuando el receptor está vacío, el poro esta cerrado. La partícula se abre cuando llega la partícula de reconocimiento a su receptor. La partícula de reconocimiento se va, deja el ribosoma fijado al poro. Cómo la partícula se va, se puede seguir leeyendo. En el lado cisternal hay un enzima que se llama péptidasa de la señal que coge el péptico de señal y lo retira. Se sigue leeyendo hasta que se tienen todos los aminoácidos. Hasta que llega el factor de finalización y el ribosoma suelta a la proteína en la cara citosolica y el ribosoma se va. Se cierra el poro otra vez. Se forma estructura primaria Semana 6 8  Alfa hélice 💡 ¿Cómo se forman las vesículas? 1. El RAB se activa con una molécula de GDP 2. El RAB al ser activado llama a los SNARES quienes se unen a la vesícula 3. El SNARE atrae una molécula 4. El efector del RAB se activa también y trae un receptor (adaptor) quien se une a la membrana. 5. Las proteínas de cubierta (cómo la clatrina) cambian de forma al ser activadas y jalan la membrana 6. Se forma la vesícula y la dinamina llega y cierra después. Se forman las vesículas que pueden ser lisosomas (RAB reclute proteínas lisosomicas, bombas de protones, y esa membrana la va a recubrir con clatrina y Semana 6 9  se forma el organelo) Tipos de secreción: Secreción constitutiva: toda célula produce su material celular, y dependiendo del material extracelular, se va a tener un tejido acorde a su función. El material extracelular le da la textura aguado/dureza. Se produce de materia continua para renovar la matriz del tejido de manera continua. Estás vesículas se forman con COP1. Se produce una vesícula y se espera ahi mismo Secreción regulada: se forman con clatrina. Se forma a partir del golgi una vesícula del golgi en la que se guardara hasta que haya una señal glandular. La secreción de una glándula; se secreta a medida que es estimulada. Una glándula endocrina tiene un estimulo, la célula secretara si es estimulada Se activan cuando se esté haciendo una función específica. Chaperonas: van a ayudar a que se pliegue bien. Estructuras secundaria, terciaria, y cuaternaria KDL: ayuda a reconocer que la proteína este donde tiene que estar PERK/IRE: ayuda a ver si las proteínas se plegaron bien. Sistema de reconocimiento de proteínas mal plegadas (cuando quedan mal plegadas se les quita la chaperona → así se activa PERK) BiP: ayudan a plegarla https://drive.google.com/file/d/1b4LYr_lT8E9e-jGDVaO-KNiAdCcNdjpY/vie w?usp=drivesdk Resúmen taller 1. Se retira la peptidoseñal Semana 6 10  2. Las chaperonas (que siempre deben haber chaperonas en los receptores de estrés) recubren la proteina para asegurar que su plegamiento esté bien 3. Se glicocilan las proteínas (glicocilación-N) 4. Se empieza a plegar la proteína a. Estructura primaria: puentes disulfuro con la disulfuroisomerasa (enzima) 5. Se puede fosforilar la proteína si es el caso para identificar el tipo de proteína 6. Las chaperorinas (calnexina - tiene un punto para pegar el azúcar) pliegan las proteínas (dos anillos que van moviendose y van plegando las proteínas - unen las partes hidrófobas de la proteína plegandolas a la estructura secundaria) 7. El azúcar se pega a un receptor lipídico que se encuentra en la membrana y se cuelga (al azúcar está pegada la proteína) a. Si esto no es posible o si queda mal plegada la proteína, las chaperoninas devuleven la proteína a la chaperona quien se vuelve a encargar del buen plegamiento b. Si después no es posible (después de que volvieron a donde las chaperonas aún no se puede), la membrana se abre y sale la proteína al citoplasma donde se intentan reutilizar os aminoácidos que tiene la proteína para otra funcion o se excreta de la célula. c. UPR (proteínas NO plegadas): los receptores IR1, se dan cuenta del estrés que se causa que estén mal plegadas las proteínas o de la sobreproducción de proteínas. i. Expansión del RER ii. Producción de más chaperonas : las chaperonas están ocupadas intentando plegar las proteínas, entonces se activa la respuesta del ER para aumentar la producción de chaperonas y parar la producción de proteínas. iii. Reducir la cantidad de proteínas sintetizadas en la célula. Semana 6 11  8. Las proteínas llegan a la zona “desnuda” del RE y 9. Se unen dos proteínas con complejos de proteinas de cubierta cómo la clatrina (que recubren la membrana) quienes jalan la membrana y forman una vesícula. En el golgi la proteína de cubierta es la COP2 10. La vesícula se fusiona con la membrana del Golgi y la proteína queda dentro del golgi donde empiezan otros procesos de sintetización a. KDEL: Es una secuencia de 4 aminoácidos quienes marcan las proteínas que se deben quedar dentro del retículo o deben salir para volver. i. Las vesículas solo chupan y cuando se van componentes que no deberían ir al golgi (marcados con KDEL) se devuelven al ER con compuro. b. RAB: los RAB direccionan a la vesícula a donde tienen que ir viajando a través del citoesqueleto con proteínas motores (dineína y actina) i. Efectores de RAB: ii. SMADE: Hay uno para cada vesícula para cada destino - dirección y GPS quienes son activados por el RAB. Aparato golgi Vesículas Retículo endoplasmico liso No tiene lisos afuera En vez de cisternas tiene sacos Tubos interconectados En vez de tener las cosas para hacer sus funciones adentros, las tiene para el lado citoplasmatico de la membrana Semana 6 12  Funciones Detoxificacion: en la parte externa de la membrana (citoplasmatica) presenta un complejo plasmatico - Complejo CYP (nombre?). Este permite oxidar o reducir y después de hacer esto, unirle un metil, hidroxilo, carboxilo, acido, u otra cosa. Esto con el fin de modificar esa molécula para que se convierta en hidrofilica y poderla excretar en agua → disolver en agua y excretar. El ejemplo típico es la bilirubina y el hepatocito. La billuribina se une a la albumina (como es soluble en ácidos grasos se puede meter por la membrana; se mete en sus congéneres - grasa con grasa), esta la lleva al hígado, en el hígado le unen un acido glucorinico en ese sistema y cuando es glucoronico 2 de albumina ya es hidrosoluble y se va a la bilis y chao. El metabolito se puede volver activo siendo carcinogénico por ejemplo → malo Foto diagrama. Hacer algo más soluble mediante el CYP para que se pueda excretar por la orina. Entre mas se consuma on tóxico, mas se produce el CYP Todas las células tienen una parte del retículo que cumplen esa función, pero hay unas especificas para esa como hepatocitos. Síntesis de fosfolipidos de membrana y su distribución: enzimas por fuera forman los lípidos de membrana, los incluyen dentro de esta. Pero como están por fuera, solamente los incluyen en la bicapa citolsolica de la membrana. Como todo se va aglomerando a un lado, enzimas llamadas flipasas la voltean al lado tubular para que quede mas distribuida, fluida y menos compacta. Aquí se produce cerámica, glicerofosfolipidos, colesterol. Los fosfolipidos que están aquí también se pueden modificar en el Golgi Síntesis de lípidos (hormonas esteroides) Metabolismo del glucogeno: se guarda el azúcar por si se necesita energía Liberación y reaceptacion de iones: almacenamiento de calcio Lisosomas: Se necesita una bomba de protones acá Salen del Golgi en una membrana, vesículas recubiertas de membrana. Semana 6 13  Contienen hidrolasas acidas: enzima que rompe con agua, cambiando la concentración de H+ → a pH ácidos. Se bombean hidrogenos para poder activar. (Proteasa, lipasa, etc.) Función: digestion. Se pueden digerir muchas cosas distintas: material extracelular. Organelo viejo. Autofogasoma: envuelve la membrana. Productos de degradacion se llevan al citoplasma para reutilizacion y reciclaje de aminoácidos. Se pueden degradar cosas ingeridas. No siempre hay la enzima para degradar. Enzimas lisosomicas para un sustrato en particular; el residuo queda metido dentro de la vesícula y se llama cuerpo residual. Empieza a funcionar mal si hay mucha acumulación Enfermedades de deposito: Fagocitocis: se necesita receptor de membrana. LA ACTIOVACION DE varios receptores hace que la célula citoesquelete para que pueda abrazar el solido que se quiera meter. (31:00) Como es una cosa solida. El citoesqueleto son microtubulos, filamentos que hacen el armazón de la célula para darle su forma, y para poder montar cosas y llevarlas a otras partes de la célula. Macrofagos tienen receptores muy inespecíficos que pueden unir cosas muy distintas Endosoma temprano y tardío Semana 6 14  Peroxisomas: contienen peroxido de hidrogeno. Enzima que contiene la catalasa. Libera mucha energía en forma de calor Detoxificacion Síntesis de lipidos Proteosoma: degrada las proteínas marcadas con ubicutina por proteasas A veces no degrada todas las proteínas para que se vayan a la membrana complejo mayor de histocompatibilidad (pH de proteínas autoinmune) Semana 6 15