Lab 3 Chi cuadrado 2019 PDF

Lab 3. Prueba de Chi cuadrado Por: Melissa ColónCesario Departamento de Biología Universidad de Puerto Rico Humacao Estadística Para determinar si la data de un cruce genético es consistente con un patrón de herencia. – Determinar si la herencia de una característica sigue o no el patrón de herencia...

Lab 3. Prueba de Chi cuadrado Por: Melissa ColónCesario Departamento de Biología Universidad de Puerto Rico Humacao Estadística Para determinar si la data de un cruce genético es consistente con un patrón de herencia. – Determinar si la herencia de una característica sigue o no el patrón de herencia de Mendel Se usa métodos estadísticos para determinar si la data del cruce es consistente con las predicciones basado en las leyes cuantitativas de la herencia. Estadística El razonamiento: evaluar el “goodnes of fit” entre la data observada y la data predecida en la hipótesis. – Hipótesis nula – se asume que no hay diferencias entre los valores observados y esperados. Si la data es similar a las predicciones se puede concluir que la hipótesis es consistente con lo observado. En ocaciones el análisis estadístico demuestra un pobre ajuste entre la hipótesis y la data. – Existe gran desviación entre los valores observados y esperados, entonces se rechaza la hipótesis. Prueba de Ji Cuadrado Método estadístico para determinar el “goodness of fit”. Se analiza la data de la población en donde los miembros de la población caen en diferentes categorías. Apropiado en genética porque la progenie tiene diferentes fenotipos. 4 Chi cuadrado de contingencia ¿Qué asume la prueba de Chi cuadrado? – Que los datos son seleccionados de forma aleatoria. – Los datos son conteos de un caso, no porcientos. – Las categorías se excluyen mutuamente. – Un sujeto contribuye a los datos de solo una celda. – Los grupos estudiados han de ser independientes. – Hay dos variables y ambas son medidas categóricas. Tabla de contingencia En la tabla de contingencia observada los datos son el número de sujetos para cada categoría. Observa que las columnas se excluyen mutuamente, al igual que las líneas. Los datos en las columnas no están pareados. Usualmente la columna de la izquierda tabula los individuos con la enfermedad. La línea superior tabula el número de individuos expuestos a un factor, la línea inferior los no expuestos. 1. Una máquina de cartas de póker está supuesta a tirar cartas al azar, como mesa infinita. En una prueba usted contó 2000 cartas y observó lo siguiente: Espadas 504 Corazón 520 Diamantes 500 Trébol 476 Análisis de Chi cuadrado La fórmula observada en la ilustración es utilizada para calcular el Chi cuadrado en donde: – O = observados (valores recolectados) – E = esperados (valores que hay que calcular) – χ2 = valor de Chi cuadrado para la celda – ∑ χ2 = la suma de todos los valores de Chi cuadrado para cada celda Cartas Observadas Espadas 504 Corazón 520 Diamantes 500 Trébol 476 Total de cartas: 2000 Esperadas O-E (O-E)2 Chi Square Suma Σ= Análisis de Chi cuadrado (O-E)2/E Tabla de probabilidades Línea de búsqueda de valor de Chi ∑ χ2 = 1.984 P > 0.05 Grado de libertad = (# columnas - 1) X (# líneas – 1) Mayor de 0.05 se acepta la hipótesis Igual o menor de 0.05 se rechaza la hipótesis Ejercicio de Práctica Situación: se generó un cruce para obtener la siguiente progenie, pero se desconoce el gentopido de los parentales. Algunos estudiantes indican que el cruce fue el siguiente: AaBb X AaBb; otros estudiantes indican que es Aabb X AaBb. Utilizando el chi cuadrado indique cuál cruce debe dar origen a la progenie observada. Progenie Observada: Alto violeta- 290 Alto verde- 309 Enano violeta- 106 Enano verde- 95 A- Alto; a- enano B- violeta; b- verde