Les Étapes De La Glycolyse PDF

La Glycolyse I. Introduction  Le métabolisme des glucides est l'ensemble des processus biochimiques responsables de la formation, la dégradation et de l'interconversion des glucides chez les organismes vivants.  Les glucides fournissent 50 à 60% de la ration énergétique quotidienne.  8...

La Glycolyse I. Introduction  Le métabolisme des glucides est l'ensemble des processus biochimiques responsables de la formation, la dégradation et de l'interconversion des glucides chez les organismes vivants.  Les glucides fournissent 50 à 60% de la ration énergétique quotidienne.  80 à 90% de cette énergie sont absorbés sous forme de glucose qui est le principale carburant de la plupart des organismes et occupe une position centrale dans le métabolisme cellulaire.  Le glucose et d'autres glucides font partie d'une grande variété de voies métaboliques: La Glycolyse Le Cycle de Krebs La Voie des Pentoses Phosphates Vue d’ensemble du métabolisme des glucides II. Définition La glycolyse ou voie d’EMBDEN MEYERHOFF-PARNAS:  la voie du catabolisme oxydatif anaérobie du glucose en Pyruvate ne nécessite pas d’oxygène avec production d’ATP et de métabolites;  a lieu dans toutes les cellules (procaryotes, eucaryote) mais à des degrés différents;  C’est une série de 10 réactions enzymatiques catalysées par 10 enzymes localisées dans le cytoplasme;  Tous les intermédiaires de la glycolyse sont phosphorylés.  Le groupement phosphoryle a 3 fonctions essentielles : Page 1   Il affecte chaque intermédiaire d’un groupe polaire chargé négativement qui le rend incapable de traverser la membrane cellulaire par simple diffusion.  Le groupement phosphate intervient comme un groupe de liaison et de reconnaissance pour la formation des complexe enzyme- substrat qui contribue à la catalyse enzymatique.  Intervient dans la conservation de l’énergie qui contribuera à la formation d’ATP III. Les étapes de la glycolyse On distingue 2 grandes phases :  Phase préparatoire d’investissement énergétique (activation avec utilisation d’ATP)  Phase de remboursement ou phase de retour d’investissement (oxydation avec production d’ATP et de NADH)  Réaction 1 : Phosphorylation du glucose par l’ATP  Réaction irréversible  Catalysée par l’hexokinase  La liaison du glucose conduit à un changement conformationnel de l’enzyme.  L’hexokinase est constituée de 2 lobes qui se rapprochent lorsque le glucose se lie  Hexokinase comme toutes les autres kinases nécessite Mg2+ pour être active.  L’ion métallique divalent forme un complexe avec l’ATP  Les cations font écran aux charges négatives sur les oxygènes des groupes phosphates  Réaction 2 : Isomérisation du glucose-6-phosphate  L’isomérisation d’un aldose en un cétose est catalysée par la glucose-6-phosphate isomérase.  Réaction réversible.  réarrangement d’atomes pour former des isomères  Conversion d’un aldose en cétose Réaction 3 : Synthèse de fructose 1,6-bisphosphate  Réaction irréversible  Catalysée par la Phosphofructokinase (PFK1)  Consomme de l’énergie (ATP)  Réaction similaire à celle catalysée par l’hexokinase.  La PFK1 à un rôle très important dans la régulation de la glycolyse, cette étape engage définitivement le glucose vers le catabolisme. Réaction 4 : Clivage du fructose1-6-bisphosphate  Réaction réversible  Catalysée par l’aldolase Réaction 5 : Interconversion des trioses phosphates Seul le Glycéraldéhyde 3P sera utilisé dans la voie glycolytique. Le Dihydroxyacétone phosphate est convertie en Glycéraldéhyde 3P.  Réaction d’isomérisation  Conversion d’un cétose(DHAP) en aldose(G3P)  Catalysée par la triose phosphate isomérase  Dernière étape de la phase I. Réaction 6 : Synthèse du 1,3-bisphosphoglycérate  Oxydation couplée à la phosphorylation  Formation d’une liaison anhydride d’acide, riche en énergie  Production de NADH coenzyme d’oxydoréduction  Catalysée par la Glycéraldéhyde 3P déshydrogénase Réaction 7 : Synthèse de 3-phosphoglycérate  Réaction réversible  Catalysée par la Phosphoglycerate kinase  Formation de la 1ere molécule d’ATP  L’aspect de la Phosphoglycérate Kinase est remarquablement similaire à celui de l’Hexokinase.  Réaction 8 : Synthèse de 2-phosphoglycerate  Réaction réversible  Réaction d’isomérisation avec transfert intramoléculaire de radical  Le phosphate est déplacé de la position 3 à la position 2  Catalysée par la Phosphoglycérate mutase Réaction 9: Synthèse du phosphoénolpyruvate  Réaction réversible  Déshydratation catalysée par l’Enolase  Formation d’une liaison riche en énergie(PEP) Réaction 10 : Synthèse du Pyruvate  Transfert de phosphoryle par une Pyruvate kinase.  Réaction irréversible  production de l’énergie(ATP)  IV. Bilan énergétique de la Glycolyse Pour chaque molécule de glucose, il y’a eu:  Consommation de 2 ATP lors de la formation du glucose 6 P et du fructose 1-6 bisphosphate.  Chaque molécule de glucose donne 2 glycéraldéhyde 3 P. Au niveau de chaque triose phosphate il y’a formation d’un NADH, H+, de 2 ATP et d’un pyruvate.  Le bilan final conduit à la formation de 2 ATP. La dégradation d’une molécule de glucose dans la glycolyse conduit donc à la synthèse de 2 ATP et à la formation de 2 NADH’H+ et de 2 pyruvates, d’où la réaction globale : Glucose + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD+ → 2 pyruvate + 2 ATP + 2 NADH, H+ V. Régulation de la Glycolyse Dans les voies métaboliques, les enzymes qui catalysent des réactions essentiellement irréversibles sont des sites potentiels de contrôle. Différents types de contrôles: a. Contrôle allostérique: l’activité de l’enzyme est régulée par la liaison d’un produit, d’un cofacteur de la voie au niveau d’un site différent du site actif. Ex: contrôle rétrograde ou à feed-back. b. Modification covalente: l’activité est différente dans chacun de deux états de l’enzyme. Ceux‐ci sont déterminés par une modification covalente, comme la phosphorylation. c. Contrôle transcriptionnel: l’expression ou la répression d’un gène codant pour une enzyme peuvent aussi contrôler le flux dans la voie métabolique.  Dans la glycolyse les réactions catalysées par l’hexokinase, la phosphofructokinase et la pyruvate kinase sont pratiquement irréversibles et leur contrôle détermine le flux dans la voie.  1. Phosphofructokinase 1 (PFK1)  Inhibée par:  les fortes concentrations cellulaires d'ATP (ATP/AMP élevé) Régulation allostérique: L'ATP se fixe sur un site régulateur différent du site catalytique de l’enzyme. L’inhibition de la PFK par l’ATP est levée par AMP.  NADH,H+: contrôle allostérique.  le citrate, premier produit formé dans le cycle de Krebs. Un taux élevé de citrate indique que les précurseurs biosynthétiques sont en quantité suffisante. Dans ces conditions la dégradation du glucose n'est plus nécessaire.  Activée par:  Fructose 2,6‐bisphosphate (F2,6BP) synthétisé par la PFK2 hépatique L’insuline active une série de signaux qui active la Le glucagon active une série de signaux qui inhibe production de F2,6BP qui active la glycolyse F2,6BP, élimination de l’activateur de la glycolyse  2. Hexokinase  Inhibée par le produit (glucose 6-P). Rétrocontrôle allostérique exercé par le G6P. Cas de la Glucokinase: L’activité de la glucokinase dans le foie est proportionnelle à la concentration intracellulaire de glucose (reflet de la concentration plasmatique). Elle phosphoryle le glucose uniquement lorsqu’il est abondant car elle a un Km élevé. 3. Pyruvate kinase La pyruvate kinase est régulée allostériquement et ceci de façon ubiquitaire  Activée par:  L'AMP,  Le fructose-1,6-bisphosphate.  Inhibée par:  L'ATP,  L'acétyl-CoA ,  L'alanine. Au niveau du foie, elle est également régulée de façon covalente (par l'action d'hormones)  Le glucagon va phosphoryler cette enzyme pour l'inhiber.  L'insuline va réaliser l'action inverse pour l'activer. VI. DEVENIR DU PYRUVATE  1. EN ANAÉROBIOSE A. FERMENTATION LACTIQUE  Le Pyruvate est réduit en lactate par le NADH H+  La réaction catalysée par la lactate déshydrogénase régénère le NAD+ pour la glycolyse, quand la consommation en ATP surpasse sa production par la respiration.  La fermentation lactique se produit Lorsque la cellule:  ne dispose pas de mitochondries cas des hématies  ou privée d’oxygène (anaérobiose)  ou en condition hypoxique tissu musculaire en contraction. B. FERMENTATION ALCOOLIQUE  Cette réaction a aussi la fonction de rendre disponible NAD+ pour la glycolyse.  Chez la levure, par ex. Pyruvate est décarboxylé en acétaldéhyde par la Pyruvate décarboxylase dont le coenzyme est la thiamine pyrophosphatase(TPP).  L’acétaldéhyde formé est réduit par l’alcool déshydrogénase en éthanol.  Cette réaction est irréversible.  2. EN AEROBIOSE A. DECARBOXYLATION OXYDATIVE DU PYRUVATE EN ACETYL COA  Après l’entrée du pyruvate dans la mitochondrie, sa décarboxylation oxydative par la pyruvate déshydrogénase entraine la formation d’une molécule énergétiquement activée (acétyl‐CoA) et NADH  Cette réaction est irréversible.  L’acétyl-CoA intégrera le cycle de Krebs, ou sera le précurseur de la synthèse des lipides