Gastroentérites virales – PAYAN Past Paper PDF

UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 UE / ENSEIGNANT : Agents infec eux - Payan DATE : 04/10/24 GROUPE : Alexandre THOMAS, Benjamin coquoin, Loiz orvoen REMARQUES : Pas de changeme...

UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 UE / ENSEIGNANT : Agents infec eux - Payan DATE : 04/10/24 GROUPE : Alexandre THOMAS, Benjamin coquoin, Loiz orvoen REMARQUES : Pas de changements, les par es en gris n’ont pas été dites ou détaillées. GASTROENTÉRITES VIRALES Table des ma ères I) Introduc on II) Virus en cause III) Mode de contamina on IV) Les GE Rotavirus V) Les autres gastroentérites virales A) Gastroentérites Norovirus B) Gastroent rites Ad novirus 40/41 C) Gastroent rites Astrovirus VI) Conclusion 1 sur 14 à ti é é ti à à à é ti ti ti  UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 I) Introduc on Ques on (1) : Les Gastroentérites Virales... A) sont la 3 me cause mondiale de décès par infec on B) sont fréquemment retrouvés chez les sujets 75 ans C) sont retrouvés tout le long de l’année Réponses : AB A) Vrai : c’est la troisième cause après les causes respiratoires et le SIDA dans le monde et surtout dans les pays du sud. La probléma que est liée au niveau de l’hygiène. Plus l’hygiène est basse, plus on aura des épidémies importantes. Ques on de promiscuité, dans le nord personne plus isolées donc moins de risques de di usion. B) Vrai C) Faux même si on peut en retrouver toute l’année mais on a des périodes épidémiques plus importantes la n de l’automne, période hivernale et début du printemps « vous savez, les GE virus se retrouvent l’hiver, on a un caractère saisonnier... ») Les chi res : 3 millions de décès par an dans les pays en voie de développement (Amérique centrale, Afrique, Inde) cause de l’insalubrité́ et de l’eau (3 me cause de décès après les infec ons respiratoires et le SIDA). Les points rouges sont les foyers épidémiques dans le monde et qui vont entrainés les décès (chaque point correspond env. 1000 décès par les GE) En France : diarrhée > 3 millions de personnes chaque année, incidence de 8000 cas pour 100 000 habitants (en période hivernale : augmenta on +++, de novembre jusqu’à mars). Décès par déshydrata on (c’est la déshydrata on qui est probléma que et non la gastro en elle-même), notamment chez le sujet jeune (75 ans). Le seul remède est la réhydrata on (perfusion de solutés ioniques ++). Les pa ents peuvent vomir ce qui 2 sur 14 à ti ff è ti à à à ti fi ti ti ti ff ti ti è ti é ti ti ti  UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 limite la prise alimentaire. On a une inversion des uides avec le sang qui va pénétrer la lumière intes nale, ce qui donne des selles liquides. => Seule solu on contre ce e fuite de liquide et ce e limita on alimentaire = perfusion de solu on salée isotonique Pas d’infec ons chroniques sauf chez les enfants immunodéprimés. Les infec ons virales sont le plus souvent en cause par transmission oro-f cale (eau et aliments contaminés)(sort par les selles) (dans 75% des cas) : 1er mo f de consulta on en médecine générale (devant la grippe) ! Chez les personnes âgés (>65-75 ans) : retard de la réponse immunitaire (plus lente à se me re en œuvre), on observe donc plus de cas graves d’infec ons virales (dont gastro- entérites). On a les mêmes courbes chaque année, cependant durant le covid-19 ça à changé un peu dû au confinement (diminution des contacts humains) mais le masque n'empêche pas la propagation. => dynamique de transmission cassée Les points rouges sont les foyers épidémiques dans le monde et qui vont entrainés les décès (chaque point correspond env. 1000 décès par les GE) NB : le site InVS = maintenant Santé Publique France Remarque : < 5 ans -> la réponse immunitaire est immature donc les virus circulent plus > 75 -> la réponse immunitaire est retardée donc la maladie se déclare. Dans les deux cas les diarrhées sont augmentées avec des a eintes plus importantes pouvant provoquer la mort. 3 sur 14 tt ti ti ti ti ti à tt tt tt fl ti ti ti é ti  UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 Quand on sera aux Urgences et qu’on sera face une personne ayant poten ellement une GE, on peut se référer au site de l’INVS « Sant public France » a n de voir si nous sommes dans une période d’épidémie. II) Virus en cause LES 3 PRINCIPAUX ++ : rotavirus, adenovirus, norovirus - Rotavirus (enfants +++ et adultes) (orange) Groupe A (+ 50 %) , groupes B et C (On diagnos c les 3) - Adenovirus 40 et 41 (bleu clair, virus non enveloppé) (40/41 sont les s rotypes sp ci ques des ad novirus causant des GE, plutôt chez l’adulte, mais aussi possible chez les enfants). Il existe d’autres adénovirus causant des infec ons pulmonaires et ayant des impacts sur la conjonc ve - Norovirus (Norwalkvirus) (surtout chez les adultes +++ surtout dans les EPHAD, on les retrouve un peu plus tôt que les infec ons à rotavirus) (bleu fonc ), caractère saisonier - Astrovirus (dans des phases plutôt épidémiques) - Sapovirus (retrouvé tout le long de l’année comme adénovirus) Rotavirus, adénovirus et norovirus sont recherchés de manière systéma que. De plus ce sont tous des virus à ARN sauf l’Adénovirus qui est un virus à ADN. On retrouve aussi des entérovirus. En g n ral on observe des pics successifs de di érents virus (rarement tous en même temps). C’est le cas aussi pour les virus des infec ons respiratoires. RB : nouveaux problèmes en Bretagne,notamment avec le dérèglement clima que. En e et les épisodes de grosse pluie (qui n’existaient pas avant) font déborder les bassins des sta ons d’épura ons et donc contaminent les eaux avec des virus en par culier les virus de la GE. On observe donc des épisodes épidémiques de GE suite aux grosses pluies. 4 sur 14 é ti é é ti ti ti é é ti ti à ff ti fi ti é ti ti é fi ti ff  UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 NB : en France, la probabilité d’être contaminé à cause de l’eau est quasiment nulle, sauf parfois les coquillages crus (mais rare). Diagramme : déclarations qui sont faites sur Brest d s qu’on identifie ces virus -bleu : norovirus -rouge : rotavirus, les 2 les plus fréquents. - petites barres vertes : ad novirus, un peu tout le long de l’année, pas de pic particulier car ne donne pas de grosses épidémies. Les pics peuvent varier d’une année sur l’autre. Les 2 virus sont des virus ARN (bcp de mutations, grippe) III) Mode de contamina on Essen ellement interhumaine (dans la famille) Sur des périodes épidémiques plus courtes. Le mode de contamina on est très proche de celui des Hépa te A et E (car ce sont également des virus nus, donc très résistants). La di érence est que l'a einte sera plutôt diges ve. Transmission par l’environnement ◊ Les animaux peuvent être porteurs de virus (bovins : rotavirus et porc : calicivirus) ◊ Les aliments préparés par r d’aliments crus (virus sont en général détruits la cuisson). Infec ons des entérocytes de l’intes n grêle. ◊ L’eau peut être contaminée par les selles (qui viennent des sta ons d’épura on qui peuvent être saturées en cas de fortes pluies) et elle contamine elle-même les fruits ( ltrent les virus donc on peut les consommer en général) et les coquillages (consomma on crue de coquillages notamment les huîtres, on retrouve généralement du rotavirus ou norovirus. Les virus sont sensibles à la cuisson, donc destruc on des par cules virales qui concentrent les virus (fréquent en Bretagne). Touche par culièrement les pays o le niveau d’hygiène est rela vement faible ++ (c’est pour ça qu’on dit de ne pas consommer l’eau courante dans les pays du Sud mais plutôt les eaux de sources) Transmissions interhumaines : ◊ Symptoma ques ◊ « Asymptoma ques » avec des « pe tes nausées, cad des GE qui passent inaperçu » 5 sur 14 fi ti ti è ti ti ti ti ti ti ti à é à ti ti ti ù ti ti ff ti ti ti tt ti à  UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 Seuil de contamina on : il faut peu de par cules virales (10 100 par cules virales, donc très peu) pour contaminer quelqu’un qui entrent par la bouche et vont se loger dans l’intes n grêle. Le diagnos c est essen ellement clinique ++, guérison spontanée en qlqs jours. IV) Les GE à Rotavirus Ques on (2) : Les Gastroentérites Rotavirus A. Sont dues des virus envelopp ADN peu résistant B. Sont fréquemment retrouvés chez les enfants >B et C chez l’homme, et >30 variant recombinants) - Capside externe VP4 et VP7 (spicules immunogènes/ Ac neutralisant (s rotypes G et P)). => réac on Ag/Ac (Rota A -> 50% des GE. Pour les Rota A-G-B-C on a poten ellement trouv des vaccins. Les s rogroupes sont surtout u lisés pour les vaccins) Hôte : Homme et animaux (mammifères et oiseaux) Ubiquitaires. Entrée par voie orale A einte de la muqueuse entérique (au niveau du jéjunum-duodénum) Incuba on rapide (24 à 48h) Il provoque rapidement une déshydrata on (dû aux vomissements et diarrhée), par une fuite électroly que provenant du sang, causée par une perméabilisa on de la muqueuse entérique. On retrouve des Ac neutralisant la capside. 7 sur 14 é tt ti ti ti é ti ti ti ff ti ti fi é é  UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 GE aigu (88% chez les enfants) - Diarrhée + vomissement + èvre > 38°C, - Avec déshydrata on chez les enfants < 2 ans, conduisant l’hospitalisa on dans 50% des cas pour la mise en disposi on du traitement IV le temps de la guérison. - Guérison en 4-7 jours : assez rapide, il faut juste passer le cap de ce e déshydrata on qui peut être importante. (Chez les enfants ça prendra un peu plus de temps sachant que leur système immunitaire n’est pas encore développé) (On retrouve souvent des plis cutanés causés par la déshydrata on) Autres manifesta ons plus rares : - A einte respiratoire - Exanthème - Infec on chronique chez l’enfant immunodéprimé́ Pic en hiver (novembre-mars, plus tôt que les norovirus qui commencent en septembre- octobre) sous forme épidémique(plus forte ou moins en forte en fonc on des années), les réinfec ons sont fréquentes (62%, car existence de variants). Hospitalisa on et qui dit hospitalisa on dit infec ons nosocomiales fréquentes (virus très résistants donc les mesures d’hygiène doivent être très strictes : linges contaminés, mains, vêtements, les changes, les poignées de porte...). Le rotavirus du groupe A, représente 95% des cas avec : 53%G1P(8), 14%G4P(8), 11%G2P(4), 5%G3P(8). (Di érentes souches avec chacune une réac on an corps qui lui est propre) (Les groupages n’ont pas d'intérêt thérapeu que mais plutôt épidémiologique) Les IgA maternel par allaitement protège les nourrissons < 6 mois (d’où le pic d’infec ons entre 6 mois et 2 ans) 90% des enfants sont immunisés < 3 ans. (Donc qui ont rencontré le virus dans les 3 premières années de vie) /!\ A en on, l’immunisa on n’est que par elle chez l’adulte (IgG+A VP7 VP4). Donc on peut quand même avoir GE si on en a déjà eu mais elles seront moins sévères (pas d’hospitalisa on). /!\ On peut avoir des cas asymptoma ques. DIAGNOSTIC : Assez simple : prélèvement de selles (liquides, molles...) Le diagnos c se fait souvent cliniquement mais on peut ajouter un diagnos c biologique pour iden er le virus mis en cause a n de signaler On a di érent types de test: 8 sur 14 tt tt ti ti ff ë ti ti ti ti fi ti ff ti ti ti ti ti fi ti fi ti ti ti à ti ti tt ti ti ti ti ti ti  UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 Test rapide la recherche d’an gènes RotaVirus dans les selles (reprises dans un soluté́ physiologique pour les rendre plus liquides) par agglu na on de par cules de latex sensibilisées (Ac RV+) ○ soit par test au latex (photo de gauche) : billes de latex sensibilisées avec des Ac qui vont perme re de capter les Ag de rota vrus qui sont présents dans les selles. Il su t de me re en contact une gou e de latex avec une gou e de selles, et en 5min ça agglu ne (système d’agglu na on). Ça va donner des grains et on peut alors dire que c’est posi f au rotavirus. très simple à faire pour diagnos c des GE ○ soit par immuno-chromatographie (photo de droite) (IC) : on l'u lise plus souvent. C’est comme les tests de grossesses. On met des AC an -RV et on met dans le puits une gou e de selles liquides et comme il y a énormément de par cules ce n’est pas di cile détecter. Ça va migrer sur la membrane o il y a les AC qui vont les a raper et donner la bande posi ve (la bande supérieure est juste le témoin). Il n’y a pas de culture cellulaire pour ces virus (très di cilement cul vables). Génotype du groupe A par PCR (dans les centres de référence, pour Brest le centre est à Dijon) et variant GP par analyse de segments ARN en électrophorèse : - Intérêt diagnos que pour éliminer une é ologie bactérienne (évic on d’un traitement an bio que). - Échan llon de selles conserv 4°C (=> virus très résistant dans l’environnement). (Diagnos c possible de façon di érée dans le tps) La PCR est surtout u lisée pour analyser les groupes et les sous-groupes pour l’épidémiologie. L’intérêt (puisqu’il n’y a pas de traitement) est de porter un diagnos c rotavirus car on sait qu’il va évoluer favorablement après avoir passé la période de diarrhées et de vomissements. Période d’incuba on très courte (1-2 jours) avec 10 jours symptoma ques et en 8-15 jours on a les Ac qui apparaissent (IgM/IgA puis IgG). 9 sur 14 ti ti ti ti ti ffi à ti ti tt tt ti tt ffi ti tt ti ff ti é à à ti ti tt ti ti ffi ti ti ti ti ti ti ti ti ti à ti tt ti ù  UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 La dynamique est très rapide : Les signes cliniques (diarrhées et vomissements) sont concomitants avec la présence du virus dans les selles On ne fait pas de sérologie car ce n’est pas intéressant au niveau du diagnos c, juste intéressant pour l’épidémiologie. On fait des suivis chez les enfants quand les symptômes durent plus longtemps, car pas de TTT disponible. TRAITEMENT : symptoma que : - Réhydrata on, orale si possible (souvent di cile cause des vomissements) ou IV pour les formes graves +++ avec des solutés d’osmolarités plus importantes - Hygiène des mains et désinfec on du matériel réu lisable, pour éviter la propaga on. Il faut privilégier le jetable qui sera incinéré. - Pas de traitement an viral spéci que. - Un vaccin (virus a énué) (il n’est plus recommandé en France depuis 2015 surtout chez les sujets jeunes) peut être donn entre 6 mois-2 ans (un vaccin a été test au début des années 2000 puis 2008-2010 sur Brest en pédiatrie, recommandé en France entre 2006 et 2015. La raison pour laquelle le vaccin n’a pas ét retenu en France c’est qu’on a eu des cas d’invagina on intes nale aiguë avant 2 ans qui serait li cause de ce vaccin a énué. Sur 47 cas en France nous avons eu 2 décès) PRÉVENTION : Vaccin vivant Ag VP7+/-VP4 Rotarix (G1P8) ou RotaTeq (G14P8). Plus de 85% d'e cacité (avec des protec ons croisées sur le génotype 1-4), On observe une réduc on des hospitalisa ons (50% des GE sur les enfants) et un retard des infec ons 2-4 mois (USA CDC 2008, reco 2006). Étude Ivanho Brest, 2008-2010 : réduc on des hospitalisa ons par 2 en pédiatrie Brest mais pas de diminu on de la circula on du virus. Il n'est pas u lisé en France aujourd'hui mais on observe de bons résultats aux USA.( Le vaccin réduit les formes graves mais 10 sur 14 ti ti ti é ffi tt ti ti ti ti ti é ti fi ti ti ti é ffi à ti é à ti ti é ti tt ti à à ti  UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 n'empêchent pas la transmission cf Covid 19) HYGIÈNE +++ (Selon le prof : aucune gastroentérite ne peut être chronique mais plus un risque de surinfec on car on ne sera jamais immunis 100%, par un autre s rogroupe par exemple. Nous n’avons pas de protec on croisée. De plus, pour les personnes immunodéprimées, nous n’avons pas de formes chroniques sur le long terme mais plus une guérison qui sera plus longue au lieu de 4-7 jours mais nira un jour par se débarrasser de ce e infec on. Il y a tout de même une possible surinfec on). V) Les autres GE Ques on (3) : Les autres Gastroentérites virales : A. Sont dues des virus nus ADN ou ARN résistants B. Sont fréquemment retrouvés chez les enfants foyers épidémiques recherchés si les 3 premiers virus ne sont pas repérés, mais rares Virus Aichi (Virus ARN) DIAGNOSTIC : (le plus souvent clinique) ▪ Agglu na on latex, IC ou ELISA : ad no ou norovirus 11 sur 14 ti ti ti fi ti à à é à ti à ti ti é é tt ti  UE 19 Gastroentérites virales – PAYAN 04/10/2024 ▪ PCR ARN : norovirus (la plus u lisée car les tests rapides qui peuvent être u lisés dans les EPHAD par exemple sont dans 1 cas sur 2 faussement néga f), astrovirus, saporovirus, Aichi. ▪ PCR ADN : ad novirus Pour toutes ces infec ons c’est un traitement symptoma que (non spéci que) : réhydrata on par perfusion et préven on (contact et manu- portage), pas de vaccins (seul le rotavirus en possède un, depuis les années 90). A) GE à Norovirus Il touche principalement les adultes mais surtout les personnes âgées mais aussi les enfants. La transmission est majoritairement interhumaine. o Caliciviridae (tous ces virus font par es de familles di érentes) o Virus nu (pas d'enveloppe) de 30 nm (pe t) avec un aspect un peu étoil. o ARN simple brin non segmenté de 7.5 kb polarité + (il peut être directement traduit en protéine) o 5 g nogroupes dont G1, G2, G4 les plus retrouvés chez l’H o 1/3 des GE chez les enfants >3 ans et l’adulte (rotavirus majoritaire centre de référence à Dijon QCMs entraînement : Quelle est la par cularité du rotavirus par rapport à la barrière entéro-diges ve ? A) Il possède une enveloppe qui l’aide à la franchir. B) Il n’a pas d’enveloppe, ce qui lui permet de passer la barrière entéro-diges ve. C) Il a une capside intermédiaire qui l’empêche de la traverser. D) Il peut traverser ce e barrière uniquement chez les enfants de moins de 2 ans. Réponse : B Les gastroentérites virales sont causées par des virus qui sont : A) Nus à ADN ou ARN résistants B) Enveloppés à ARN C) Nus à ARN non résistants D) Enveloppés à ADN Réponse : A 14 sur 14 ti fi ti ti tt tt ti ti ti ti ti ti