فصل 1: ساختار شیمیایی مولکول های زیستی PDF
Document Details
Uploaded by Deleted User
Mahsa Alami
Tags
Summary
این فایل PDF در مورد ساختار شیمیایی مولکول های زیستی اطلاعات ارائه میدهد. فصل اول این فایل به بررسی مواد معدنی و آلی موجود در بدن موجودات زنده می پردازد و انواع کربوهیدرات ها را توضیح می دهد. مباحثی پیرامون اسمز، نمک ها و ایزومرهای قندها در این فایل بررسی شده اند.
Full Transcript
1فصل ساختار شیمیایی مولکول های زیستی Chemical Structure of Biomolecules By: Mahsa Alami کوچک ترین واحد سازنده ماده اتم ( (atomنام دارد. اتم ها به متصل شده و مولکول ها ( )moleculesرا به وجود می آو...
1فصل ساختار شیمیایی مولکول های زیستی Chemical Structure of Biomolecules By: Mahsa Alami کوچک ترین واحد سازنده ماده اتم ( (atomنام دارد. اتم ها به متصل شده و مولکول ها ( )moleculesرا به وجود می آورند. مواد بدن موجودات زنده به دو گروه عمده مواد معدنى( )inorganicو مواد آلى( )organicتقسیم مى شوند. ترکیبات معدنی : آب یکى از مهم ترین مواد معدنى موجود در طبیعت و نیز در بدن موجودات زنده است.مقدار آب موجود در بدن موجودات زنده به طور متوسط بین 65تا 95درصد وزن بدن است. گازها دی اکسید کربن ( (CO2و اکسیژن ) )O2نیز از مواد مهم معدنی هستند که پیوسته بین موجودات زنده و محیط مبادله می شوند. نمکها یا امالح (:)salts ترکیبات معدنى دیگر ،مانند کلریدها ،کربنات ها ،فسفات ها و غیره نیز در ساختار بعضى بخشهاى بدن موجودات زنده وجود دارند و به انجام بسیارى از واکنشهاى زیستى بدن کمک مى کنند. به شکل کلی یونهای معدنی به دو دسته کاتیون ها ( با بار مثبت) و آنیون ها (با بار منفی) تقسیم میشوند. توزیع یون ها در بخش درونی و بیرونی سلول یکنواخت نیست. غلظت یون های پتاسیم و منیزیم در درون سلول ( )intracellularبیشتر بوده و یون های سدیم و کلر اغلب در مایع برون سلولی( )extracellularغلظت بیشتری دارند. برخی از این یون ها در تنظیم فشار اسمزی ،ساختار و اعمال درشت مولکولها ( )macromoleculeو همچنین اجزای مختلف سلولی نقش دارند. اسمز(:)osmosis حرکت خود به خودی مولکول های حالل از غشایی با ویژگی نیمه تراوایی است تا زمانی که غلظت ماده حل شونده در دو طرف یکسان شود. اسمز(:)osmosis در حالت طبیعی ،سلولهای بدن موجودات زنده در محیطی هم غلظت با محتوی خود قرار دارند(.)isotonicاگر سلولهای گیاهی و یا جانوری در محیطی که غلظت آن از غلظت مایع درونی آنها بیشتر است قرار داده شوند( ،)hypertonicآب از درون سلول خارج شده و پروتوپالسم سلول چروکیده میشود که به این حالت پالسمولیز( )plasmolysisمی گویند. اسمز(:)osmosis قرار خود از تر رقیق محیطی در سلولها اگر بگیرند( )hypotonicطبق فرایند اسمز آب به درون آنها وارد شده و سلول متورم میشود که به این حالت تورژسانس ( )turgescenceمی گویند. امکان متالشی شدن سلول های جانوری به علت نداشتن دیواره سلولی در حالت تورژسانس وجود دارد. ترکیبات آلی : مواد آلى موادى هستند که معموالً به وسیله موجودات زنده ساخته مى شوند و در همه آنها کربن به صورت عنصر اصلى وجود دارد. چهار گروه از مهم ترین ترکیبهاى آلى بدن موجودات زنده شامل کربوهیدرات ها ،لیپیدها ،پروتئین و اسید نوکلئیک ها هستند. اسیدهای چرب نوکلئوتیدها مونوساکاریدها اسیدهای آمینه ملکولهای آلی کوچک اغلب ترکیباتی با جرم ملکولی بین 100تا 1000دالتون و حاوی 30کربن یا تعداد کمتری از آن هستند. یک دالتون جرم یک اتم هیدروژن و برابر مقدار زیر است : کربوهیدرات ها: در ساختار کربوهیدراتها ،هیدروژن ،اکسیژن و کربن وجود دارد. نشاسته ،قند و شکر و پنبه ،انواعی از کربوهیدرات هستند. مونو ساکاریدها ،دى ساکاریدها و پلى ساکاریدها سه گروه اصلی کربوهیدرات ها را تشکیل می دهند. مونوساکاریدها کوچک ترین و ساده ترین کربوهیدراتها هستند. معروف ترین آنها گلوکز است. منبع تولید انرژی بسیاری از سلولها گلوکز است ،یعنى سلول براى به دست آوردن انرژى الزم براى انجام واکنشهاى زیستى ،گلوکز را اکسید میکند . مونوساکاریدها در زبان یونانی "مونو" به معنی یک و "ساکارید" به معنی شیرین است. همه مونو ساکاریدها دارای فرمول کلی (CH2O ) nهستند. عدد nدر فرمول بین سه تا هفت متغیر است. این ترکیبات مزه شیرین داشته ولی شیرینی مونوساکاریدهای مختلف متفاوت است. فروکتوز از شیرین ترین قندها و پس از آن گلوکز و گاالکتوز از سایر قندها شیرین تر هستند. منوساکاریدها سه تا هفت کربن داشته و میتوانند آلدوز یا کتوز باشند. آلدوزها در کربن شماره 1عامل آلدهیدی و کتوز ها عامل کتونی دارند. قندهای سه کربنی (تری اوز ) ،چهار کربنی(تتروز) ،پنج کربنی(پنتوز) ،شش کربنی (هگزوز ) و هفت کربنی (هپتوز ) برای نامگذاری قندهای ساده پسوند "وز" ( )oseبه شماره یونانی کربن موجود در قند اضافه می شود. گلیسیرآلدهید یک قند سه کربنه بوده و در آن اتم کربن شماره 2نامتقارن است زیرا با چهار گروه مختلف پیوند تشکیل داده است. چنین کربنی میتواند دو ایزومر Dو Lداشته باشد که تفاوت آنها در محل قرار گرفتن عامل OHدر مولکول است. همه آلدوزها مشتقی از گلیسرآلدهید هستند. قندهای پنج و شش کربنی اهمیت ویژه ای دارند زیرا عالوه بر این که در راههای متابولیسمی شرکت دارند ،در ساختار برخی درشت مولکولها نیز به کار میروند. ریبوز و مشتقات آن که در ساختار اسیدهای نوکلئیک شرکت میکنند از مهمترین قندهای پنج کربنی هستند. قند شش کربنی گلوکز با فرمول ، C6H12O6واحد سازنده نشاسته ،گلیکوژن و سلولز است. این مولکول همچنین در راههای متابولیسمی انرژی زا نقش محوری دارد.قندهای پنج و شش کربنی میتوانند به دو شکل خطی یا حلقوی باشند که البته در محیطهای زیستی تقریبا همیشه شکل حلقوی دارند. دى ساکاریدها : از ترکیب دو نوع مونوساکارید با یکدیگر به وجود مى آیند. معروف ترین دى ساکاریدها ساکارز است که به صورت قند یا شکر مصرف مى شود. ساکارز از اتصال گلوکز و فروکتوز حاصل می شود. پلی ساکاریدها : کربوهیدراتهایی با بیش از ده واحد منوساکاریدی ،در گروه پلی ساکاریدها قرار می گیرند. نشاسته یکى از پلى ساکاریدهاى خوراکى است. یکى دیگر از پلى ساکاریدهاى مهم طبیعت ،سلولز است که براى انسان غذا محسوب نمی شود؛ اما غذاى بسیارى ازجانوران گیاهخوار را تشکیل مىدهد. پنبه ،تقریباً سلولز خالص است. بخش اصلى دیواره سلولهاى گیاهى ،سلولز است. گلیکوژن یکی از پلى ساکاریدهایى است که بسیار شبیه به نشاسته است. نشاسته مخصوص سلولهاى گیاهى و گلیکوژن مخصوص سلولهاى جانورى و قارچها است. گلیکوژن در سلولهاى کبدى و ماهیچه اى به مقدارزیادی وجود داشته و منبع ذخیره اى گلوکز است. لیپیدها لیپیدها نیز مانند کربوهیدراتها از عناصر هیدروژن ،اکسیژن و کربن ساخته شده اند ،اما نسبت این عناصر با یکدیگر در لیپیدها در مقایسه با نسبت آنها در کربوهیدراتها بسیار متفاوت است. روغن ها و چربى ها ،همگى لیپید هستند.یکى از ویژگى هاى لیپیدها این است که هیچ کدام از آنها در آب حل نمى شوند. لیپیدها بخش مهمى از غشاهاى سلولى را مى سازند وهمچنین براى تولید انرژى در سلول، مصرف مى شوند. معروفترین لیپیدها که ترى گلیسرید نامیده مى شود از ترکیب سه مولکول اسید چرب و یک مولکول گلیسرول حاصل مى شوند تشکیل یک مولکول تری گلیسرید از واکنش یک مولکول گلیسرول با سه مولکول اسید چرب و حذف سه مولکول آب ایجاد میگردد.عامل OHاز گلیسرول و عامل Hاز اسیدهای چرب در تشکیل آب شرکت میکنند. پروتئین ها: در پروتئین ها عالوه بر هیدروژن ،اکسیژن و کربن ،عنصر نیتروژن و در بعضی از آنها گوگرد نیز وجود دارد. هر پروتئین از تعداد زیادی اسید آمینه که با یکدیگر پیوند میدهند ،تشکیل می شوند. پروتئین ها نقشهاى عمده اى در بدن دارند.پروتئینى به نام هموگلوبین در خون ،مسئول انتقال گازهاى تنفسى است. پروتئینهاى ماهیچه ،کشش و انقباض ماهیچه را سبب مى شوند. بعضى پروتئینها نقش آنزیمى دارند و از این نظر براى ادامه زندگى سلولها بسیار مهم اند. آنزیم ها: ساختار پروتئینی داشته و باعث آغاز بیشتر واکنش هاى درون سلولها میشوند و از این نظر اهمیت زیادی دارند. براى اکسید شدن گلوکز در درون سلولها ،امکان افزایش دماى سلول تا حد سوختن در خارج از بدن ،وجود ندارد ،بنابراین ،آنزیمها در دماى معمولى بدن ،باعث انجام این واکنشها در دمای پائین تر میشوند. انجام این واکنش ها در بدن ،بدون حضور آنزیم ها امکان پذیر نیست. آنزیم ها: به طور کلى آنزیم ها به انجام واکنشهاى شیمیایى سرعت مى دهند ،اما خود در این واکنش ها مصرف نشده و تغییرى نمى یابند. درون هر سلول در هر لحظه صدها نوع آنزیم در حال فعالیت هستند. براى بیشتر واکنشهایى که در سلول انجام مى شود،حداقل وجود یک آنزیم ضرورى است. گرمای زیاد به آنزیمها آسیب میزند.سرعت یک واکنش آنزیمی در دماهای مختلف متغیر است. معموال دمای پائین سرعت واکنش را کم و دمای باالتر سرعت واکنش را افزایش می دهد. اغلب در دمای بیش از حدود 42درجه سانتیگراد سرعت واکنش آنزیمی به علت تخریب ساختار پروتئینی به سرعت کاهش می یابد دمایی که آنزیم حداکثر فعالیت را دارد ،دمای بهینه نام دارد. مولکول های زیستی: مولکول های زیستی شامل درشت مولکولها مانند پروتئین ها ،کربوهیدرات ها ،چربی ها ،اسیدهای نوکلئیک و مولکول های کوچک مانند متابولیت های اولیه و متابولیت های ثانویه و ترکیبات طبیعی هستند. تقریباً همه مولکولهایى که در سلول ها ساخته مى شوند ،کربن دارند.کربن در این مولکول ها با سایر اتم ها پیوند برقرار مى کند. بعد از آب ،مولکول هاى کربن دار ،بیشترین ترکیبهاى بدن جانداران را تشکیل مىدهند. مواد کربن دارى که در سلول ساخته مى شوند ،مواد آلى نام دارند. اتم کربن در ترکیب با عناصر دیگر مى تواند حداکثر 4پیوند تشکیل دهد. به عبارت دیگر ،ظرفیت عنصر کربن 4است ،یعنى این عنصر مى تواند با چهار عنصر یک ظرفیتى دیگر پیوند کوواالنسی برقرار کند. تنوع حیات سلولها انواع بسیار زیادی از درشت مولکول ها را ،توسط چند نوع مولکول کوچک ،مى سازند. بسیارى از مولکولهاى زیستى نسبت به مولکول هاى غیرزیستى ،بسیار بزرگتر بوده و بنابراین درشت مولکول نامیده مى شوند. هر مولکول پروتئین از هزاران اتم ساخته شده که با پیوندهاى کوواالنسى به یکدیگر متصل شده اند. نوکلئیک اسیدها و کربوهیدرات ها نیز درشت مولکول اند.بسیارى از این درشت مولکول ها در سلول، به صورت پلى مر ساخته مى شوند. تنوع حیات پلى مر مولکولى است که از واحدهایى تقریبا یکسان تشکیل شده است. سلولز یک پُلى مر است که از واحدهای مشابه گلوکزساخته شده است. هریک از واحدهاى سازنده یک مولکول پلى مر ،مونومر ( تک پاره) نامیده مىشود. گوناگونى پلى مرها در دنیاى جانداران بسیار زیاد است. سلول های جانداران مى توانند انواع بسیار متنوعی از پروتئین را فقط با استفاده از 20نوع آمینواسید (اسید آمینه) بسازند. مونومرهاى تشکیل دهنده مولکول هاى (DNAنوکلئوتیدها) در دنیاى زنده فقط 4نوع هستند. تفاوتهاى بین جانداران ،از جمله اختالف هاى فردى که بین افراد یک گونه از جانداران وجود دارد ،به علت تنوع مونومرها ،تعداد ،تکرار و ترکیب قرارگیری متفاوت در آنها است که پلیمرهای متفاوتی به وجود می آورند. یکی از اصول اساسی حیات و جانداران این است که مولکول هاى کوچک که در همه جانداران یکسان هستند ،به صورت درشت مولکولهایى ساخته میشوند که در افراد جانداران گونه های مختلف و حتی افراد یک گونه از جانداران ،متفاوت بوده و باعث ایجاد تفاوت در بین آنها می شوند. هرگونه تغییر در تعداد ،ترتیب ،نوع و تکرار چهار نوع مونومر در مولکول ،DNAسبب تنوع در پروتئین های ساخته شده از 20نوع آمینو اسید شده و می تواند تعداد بسیار زیادی از انواع پروتئین ها و در نتیجه صفات مختلف مانند تنوع رنگ در گل را تولید کند. شماره 1فرایند همانند سازی ،شماره 2رونویسی و شماره 3ترجمه را نشان می دهند. فرمول شیمیاى آب H2Oاست ،بعضى از گروههاى OHو Hکه در مونومرها حضور دارند ،میتوانند با یکدیگر ترکیب و به صورت H2Oاز مونومرها جدا شوند.در نتیجه دو مونومر با هم ترکیب شده و یک مولکول آب ،از بین آن دو آزاد مى شود.این نوع واکنش سنتز آبدهى نام دارد . عکس چنین واکنشى هنگام تجزیه یک پلى مر به مونومرهاى آن اتفاق مى افتد؛ یعنى هنگام تجزیه یک پلى مر به مونومرهاى سازنده آن ،مولکول هاى آب به صورت OHو Hدر آمده و با اتصال به مونومرهای یک مولکول پلى مر ،آن را به مونومرهایش تبدیل مى کنند.چنین واکنشى هیدرولیز نام دارد. واکنش سنتز آبدهی و هیدرولیز کربوهیدرات ها کربوهیدرات ها ساده ترین درشت مولکولهای زیستی هستند که در آنها پیوندهای کوواالن متعددی وجود دارد که کربن در آنها شرکت میکند و در نتیجه شکسته شدن آنها مقدار زیادی انرژی تولید میشود. این ترکیبات عالوه بر انرژی زا بودن ،در ساختار بخش های مختلف سلول مانند غشاهای سلولی نیز نقش دارند. گلوکز که یک مونوساکارید است ایزومرهای متعدد دارد. گاالکتوز یکی از این ایزومرها ،یک قند آلدوزی است و با گلوکز تنها در نحوه قرار گرفتن گروه های هیدروکسیل و هیدروژن متصل به کربن شماره 4تفاوت دارد. فروکتوز یک قند شش کربنی کتوزی است که در آن اکسیژن با پیوند دوگانه به کربن شماره 2 متصل است گلوکز گاالکتوز فروکتوز دی ساکارید ها: هر گاه دو مونو ساکارید با واکنش سنتز آبدهی با هم ترکیب شوند دی ساکارید به وجود می آید. ساکارز مالتوز الکتوز ساکارز :پیوند کوواالن بین کربن شماره 2فروکتوز و کربن شماره 1گلوکز مالتوز :پیوند کوواالن بین کربن شماره 1گلوکز و کربن شماره 4گلوکز الکتوز :پیوند کوواالن بین کربن شماره 1گاالکتوز و کربن شماره 4گلوکز نشاسته نشاسته پلی ساکارید ذخیره ای در گیاهان است. جانوران توانایی هضم نشاسته را دارند و این مولکول در منابع عمده غذایی انسان مانند برنج، گندم و سیب زمینی به مقادیر زیاد یافت میشود. در ساده ترین آزمایش برای معرفی نشاسته از ید استفاده می شود که تشکیل رنگ آبی به علت واکنش بین ید و آمیلوز است. این پلی ساکارید به دو شکل خطی و منشعب وجود دارد. شکل خطی نشاسته آمیلوز نام دارد که در آن پیوند بین کربن شماره 1از یک مولکول گلوکز با کربن شماره 4گلوکز مجاور ایجاد می شود. شکل منشعب نشاسته آمیلوپکتین نام دارد.در این مولکول عالوه بر پیوند 4-1در یک زنجیره ،بین کربن شماره 1یک زنجیره با کربن شماره 6زنجیره مجاور نیز پیوند برقرار میگردد.حاللیت نشاسته در آب کم بوده و با افزایش انشعاب ،حاللیت آن کمتر می شود. گلیکوژن گلیکوژن پلی ساکارید ذخیره ای در جانوران است . در سلولهای کبد و ماهیچه به مقدار زیادی وجود دارد. ساختار آن شبیه آمیلوپکتین اما با تعداد انشعابات بیشتر است. سلولز سلولز که بیشترین ترکیب آلى طبیعت را تشکیل مى دهد ،به صورت رشته هاى محکم در ساختار دیواره سلولى گیاهان شرکت دارد. مولکول سلولز رشته اى و بدون انشعاب است. چند هزار از این رشته ها درکنار یکدیگر قرار مى گیرند و یک فیبریل سلولزى تشکیل مى دهند. الیه هاى سلولزى در دیواره هاى سلولى با سایر مواد ترکیب مى شوند و ساختارى محکم را به وجود مى آورند. این پلی ساکارید برای اغلب جانوران غذا محسوب نمیشود ،زیرا جانوران توانایی شکستن پیوندهای بین واحدهای گلوکز موجود در سلولز را ندارند. نشخوار کنندگان به دلیل داشتن باکتریهای تجزیه کننده سلولز در دستگاه گوارش خود، قادر به هضم سلولز بوده و لذا از آن به عنوان منبع غذایی استفاده می کنند. کیتین کیتین یک پلی ساکارید ساختاری است که در پوشش خارجی بدن بسیاری از حشرات و سخت پوستان وجود دارد. این ماده سخت ومقاوم بوده و ساختاری شبیه سلولز دارد. تفاوت کیتین و سلولز در جایگزینی عامل هیدروکسیل با گروه استامید) ) CH3CONH2در کربن شماره 2کیتین است. مونومر یا همان واحد سازنده کیتین ،مولکول "ان-استیل گلوکز آمین" است. لیپید ها : از مولکول های اصلی تشکیل دهنده غشاها هستند. این مولکول ها در آب غیر قابل حل بوده و در حالل های آلی مانند اتر و کلروفرم حل می شوند. دارای تعداد کمی گروههای قطبی و تعداد زیادی نواحی غیر قطبی می باشد. ساده ترین لیپیدها اسیدهای چرب هستند. انواع لیپیدها : چربی :اسیدهای چرب و تری گلیسرید ها فسفولیپیدها موم ها استروئیدها گلیکولیپیدها اسیدهای چرب از یک زنجیره هیدروکربنی که در یک انتهای آن گروه کربوکسیل ) (COOHقرار دارد ،تشکیل شده است. بخش هیدروکربنی اسید چرب که غیر قطبی است " دم" و گروه کربوکسیل که قطبی است " سر" نامیده می شود. تعداد اتم های کربن در اسیدهای چرب بین 12و 24است. فراوان ترین اسیدهای چرب سلول ها 16یا 18اتم کربن دارند. اگر همه اتم های کربن موجود در زنجیره هیدروکربنی با پیوند یگانه به هم متصل شده باشند ،اسید چرب از نوع اشباع (اسید پالمتیک) است. اگر یک یا چند پیوند دوگانه در زنجیره وجود داشته باشد (اسید اولئیک با یک پیوند دوگانه) ،آن را غیر اشباع می نامند. در اسیدهای چرب غیر اشباع در محل پیوند دوگانه ،خمیدگی وجود داشته و مانند انواع اشباع ساختار میله ای ندارند . نقطه ذوب اسیدهای چرب اشباع بیشتر از انواع غیر اشباع است. تری گلیسریدها از ترکیب سه مولکول اسید چرب و یک مولکول گلیسرول تشکیل می شوند . گلیسرول الکل سه کربنی است که یک گروه هیدروکسیل با هر یک از کربن های آن پیوند دارد. برای تشکیل تری گلیسریدها ،یک مولکول اسید چرب با هریک از گروه های هیدروکسیل موجود در گلیسرول ترکیب و به ازای هر اتصال ،یک مولکول آب ایجاد می شود. عامل OHاز گلیسرول و عامل Hاز اسیدهای چرب در تشکیل آب شرکت می کنند. سه اسید چرب موجود در ساختار هر تری گلیسرید ممکن است از یک نوع و یا از انواع مختلف باشد. تری گلیسریدها لیپیدهای خنثی و مولکول های غیر قطبی هستند زیرا گروه کربوکسیل هر یک از اسیدهای چرب آنها با گلیسرول وارد واکنش شده اند. تری گلیسریدها در سلولها بر اثر آنزیم هایی به نام لیپازها به اسیدهای چرب و گلیسرول تجزیه می شوند. تری گلیسریدها مهمترین شکل های ذخیره ای لیپیدها هستند که در سلولهای جانوری و گیاهی به شکل ذرات چربی وجود دارند. بافت چربی مهمترین بافت ذخیره ای چربی در بدن جانوران است. فسفولیپیدها اجزاى اصلى غشاهاى سلولى تفاوت فسفو لیپید و تری گلیسرید ها :مولکول گلیسرول در فسفولیپیدها به دو اسید چرب و یک گروه فسفات متصل است . فسفولیپیدها مولکولهایی دوگانه دوست هستند که فسفات با بار منفی در یک سر به آنها خاصیت قطبی بودن میدهد و وجود زنجیرههای هیدروکربنی ،ویژگی غیر قطبی بودن آنها را سبب میشود.بخش غیر قطبی اسیدهای چرب از یک زنجیره هیدروکربنی تشکیل شده اما بخش غیر قطبی فسفولیپیدها دو زنجیره هیدروکربنی دارد. فسفولیپیدها بسیار متنوع بوده و از ترکیبات اصلی غشاهای سلولی هستند. انواع فسفو لیپیدها : فسفوگلیسریدها :فسفوگلیسریدها از مهمترین فسفولیپیدها هستند.ساده ترین فسفوگلیسیرید، ساختاری شبیه به تری گلیسریدها دارد با این تفاوت که در آن یک گروه فسفات جایگزین اسید چرب متصل به کربن شماره 2گلیسرول شده است.فسفوگلیسریدهای دیگر همه از مشتقات این فسفوگلیسرید ساده هستند. اسفنگولیپیدها : سایر فسفولیپیدها از الکلی به نام اسفنگوزین مشتق می شوند.اسفنگوزین الکلی آمین دار و پیچیده تر از گلیسرول است که دارای یک زنجیر طویل هیدروکربنی نیز می باشد . در فسفولیپیدهای مشتق شده از اسفنگوزین ،یک اسید چرب به گروه آمین اسفنگوزین و یک گروه قطبی فسفات دار به سر مولکول متصل هستند.اسفنگومیلین فسفولیپید مهم مشتق شده از اسفنگوزین بوده و در غشای سلول های عصبی وجود دارد. فسفولیپیدها در محیط آبی میسل تک الیه یا دو الیه تشکیل می دهند.در این میسل های فسفولیپیدی ،دم های مولکول درون میسل ها مخفی شده و سر آنها با آب واکنش می دهد. در تک الیه ها ،فسفولیپیدها در سطح محیط آبی پخش می شوند به شکلی که سرهای قطبی آنها مجاور آب و دم های غیر قطبی آنها بیرون از آب قرار می گیرند.فسفو لیپیدها در شرایط مناسب می توانند ساختار دو الیه ای تشکیل دهند به شکلی که سر قطبی آنها در دو سطح خارجی این ساختار و مجاور آب و دم های غیر قطبی مولکولها در داخل ساختار و دور از آب قرار بگیرند. اگر مولکولهای فسفولیپیدی در محیط آب تکان داده شوند ،ساختارهایی به نام لیپوزوم ایجاد می شوند که مانندمیسل ها کروی بوده اما از دو الیه فسفولیپیدی ساخته شده اند و مقداری آب در مرکز آنها محصور شده است و امروزه برای استفاده از لیپوزوم ها در صنعت دارو سازی ،تحقیقات زیادی در دست انجام است. موم ها موم ها پلی مر اسیدهای چرب طویل بوده و از چربى ها آب گریزتر هستند. این ویژگى سبب شده است تا موم ها پوشش مناسبى براى بخشهاى جوان گیاهان ،میوه ها و غیره باشند. بسیارى از جانوران ،ازجمله حشراتى مانند زنبور عسل نیز موم تولید مى کنند. استروئید ها: کلسترول یک استروئید است که در غشاهاى سلول جانورى یافت مى شود.سلولها از این ماده براى ساختن سایر استروئیدها ،مثال هورمون هاى استروئیدى استفاده مى کنند. افزایش کلسترول خون ممکن است موجب بیمارى مربوط به رگ ها شود.ساختار کلی همه استروئیدها یکسان و شبیه مولکول کلسترول است. همه استروئیدها یک اسکلت چهار حلقه ای دارند که در انواع مختلف ،تعداد و موقعیت پیوندهای دو گانه و گروههای فعال متصل به آنها متفاوت است . استروئیدها ترکیباتی هستند که ساختار شیمیایی آنها شباهتی به لیپیدهای ذکر شده نداشته و در ساختار آنها اسیدهای چرب وجود ندارد.این ترکیبات به دلیل غیر قابل حل بودن در آب ،جزء لیپیدها طبقه بندی می شوند. این ترکیبات بسیار متنوع بوده و نقشهای متفاوتی در سلولهای جانداران عالی دارند.استروئیدها در اغلب باکتریها وجود ندارند.کلسترول فراوان ترین استروئید در جانوران و تنها استروئید موجود در غشاهای سلولهای آنها است. در غشای سلول های گیاهی عالوه بر کلسترول ،استروئیدهای دیگری که خاص گیاهان هستند، وجود دارند. بسیاری از هورمونهای جانوری مانند هورمونهای جنسی در پستانداران ،استروئیدی هستند. همچنین اسیدهای صفراوی که به هضم لیپیدها کمک می کنند ،نوعی از استروئیدها هستند. گلیکولیپیدها ،لیپیدهایی هستند که به آنها یک یا چند مولکول قند یا زنجیره کربوهیدراتی متصل است گلیکولیپیدها نیز جز ساختار غشای سلولی بوده و در سطح خارجی سلول قرار میگیرند و در دریافت برخی پیام ها توسط سلولها نقش دارند. ترپن ها ترپن ها گروه دیگری از لیپیدها هستند که از تعدادی زیر واحد مشترک به نام ایزوپرن با فرمول شیمیایی ) )C5H8و مشتقات آن تشکیل شده اند. ترپنها در گیاهان فراوان بوده و به آنها رنگ ،طعم و عطر میدهند. کاروتن و کلروفیل که به ترتیب رنگ های سبز و نارنجی گیاهان را تشکیل می دهند ،جزء ترپن های مهم محسوب می شوند. عالوه بر آن ها ،ویتامین های K،E ،Aکه در چربی ها قابل حل هستند نیز در گروه ترپن ها قرار دارند. پروتئین ها : پروتئینها در ساختار و کار سلولى نقش اساسى دارند.پروتئین از واژه یونانی "پروتوس" به معنی اولیه گرفته شده و این بیانگر اهمیت این مولکولها در سلولها است. پروتئین ها ترکیباتی دارای تنوع زیاد بوده و نقشهای گوناگونی در سلول دارند. برخی از پروتئین ها انواعی از واکنشهای شیمیایی را کاتالیز می کنند که می توان به آنزیم ها که از مهمترین پروتئینها هستند ،اشاره نمود. از پروتئینهاى ساختارى میتوان به تار عنکبوت ،ابریشم و حتى مو و ناخن اشاره نمود. همچنین رشته هاى موجود در رُباطها و زردپى ها از پروتئینهاى ساختارى هستند. پروتئین ها از ترکیبات اصلی ساختار غشاهای سلول بوده و در ترابری مواد از غشا سلول ها نقش دارند. این ترکیبات جزء ساختار بیشتر بخش های سلول مانند اسکلت سلولی در سلولهای یوکاریوتی هستند. پروتئینهاى منقبض شونده از رشته هاى پروتئینى هستند که باعث حرکت ماهیچه ها مى شوند. پروتئینها در تنظیم فعالیتهای ژنتیکی نیز دخالت دارند. بسیاری از هورمونها جزء پروتئین های نشانه ای بوده و پیامی را از بخشی به بخش دیگر بدن منتقل میکنند. برخی مولکولهای دستگاه ایمنی مانند پادتن ها از جنس پروتئین بوده و به بدن برای دفاع از خود کمک میکنند. از پروتئینهاى ذخیره اى میتوان به سفیده تخم مرغ که آلبومین نامیده مى شود ،اشاره نمود که منبع مناسبى از آمینواسیدها بوده و جنین جوجه ،درحال رشد و نمو خود از آن استفاده مى کند. کازئین شیر نیز نوعی پروتئین است. پروتئین هاى انتقال دهنده نوع دیگر پروتئین ها هستند. هموگلوبین که پروتئینى آهن دار است ،اکسیژن و دى اکسید کربن را در خون منتقل مى کند. پروتئین ها از واحدهای کوچکتری به نام اسیدهای آمینه (آمینواسید) ساخته شده اند .اسیدهای آمینه در نتیجه جوشاندن پروتئین ها در محلولهای قوی اسیدی و یا قلیایی حاصل می شوند. فقط 20اسید آمینه از 100نوع اسید آمینه شناخته شده در طبیعت ،در ساختار پروتئین ها شرکت دارند. گیاهان و بی مهرگان میتوانند تمام اسیدآمینه های مورد نیاز خود را بسازند.اما بسیاری از جانوران توانایی تولید برخی از اسیدهای آمینه را نداشته و باید از طریق غذا آنها را دریافت کنند. مهره داران توانایی ساختن تنها 10اسید آمینه را دارند که به آنها اسیدهای آمینه غیر ضروری گفته میشود.ده اسید آمینه دیگر که باید از طریق غذا تامین شود به نام اسیدهای آمینه ضروری نامیده می شوند. اسیدهای آمینه مختلف ساختار پایه یکسانی دارند. هر اسید آمینه یک کربن مرکزی به نام کربن آلفا ) )αدارد که سه ظرفیت آن در همه اسیدهای آمینه به اتم هیدروژن ()- COOH )Hگروه کربوکسیل ))-و NH2گروه آمین ) متصل میشود. در ظرفیت چهارم کربن آلفا ،ترکیبی که زنجیره کناری یا گروه Rخوانده میشود ،قرار میگیرد. گروه Rبر حسب نوع اسید آمینه متفاوت بوده و در واقع اختالف بین بیست اسید آمینه به نوع زنجیره کناری آنها بستگی دارد.نام اسید آمینه به علت وجود گروه کربوکسیل که اسیدی است و گروه آمین که در همه اسیدهای آمینه وجود دارد ،به آنها داده شده است. گروه Rدر انواع اسیدهای آمینه از لحاظ اندازه و بار الکتریکی بسیار متنوع است. در گلیسین که ساده ترین اسید آمینه است ،گروه Rتنها یک اتم هیدروژن است در برخی دیگر از اسیدهای آمینه گروه Rپیچیده تر و یا حلقوی است. بسته به خواص شیمیایی گروه ،Rاسیدهای آمینه به گروه های غیر قطبی:اسیدهای آمینه غیر قطبی در آب قابل حل نیستند. قطبی و غیر یونی :اسیدهای آمینه قطبی و غیر یونی به علت نحوه توزیع بار الکتریکی در آنها ،توانایی تشکیل پیوندهای هیدروژنی با مولکول های آب را داشته و بیشتر در آن حل میشوند. قطبی و یونی :اسیدهای آمینه با بار مثبت و یا منفی در آب حل میشوند. در اسیدیته معمولی سلول ()pH =7گروههای کربوکسیل و آمین در اسیدهای آمینه یونیزه شده و به صورت COO-و NH3 +وجود دارند. کربن آلفا در همه اسیدهای آمینه به غیر از گلیسین نامتقارن بوده و به همین دلیل اغلب اسیدهای آمینه میتوانند به دو شکل ایزومر Dو Lوجود داشته باشند که البته تنها نوع Lآنها در پروتئینها وجود دارند. از اتصال اسیدهای آمینه به یکدیگر پلیمرهای خطی با اندازه های مختلف به وجود می آیند. جهت اتصال دو اسید آمینه ،پیوند آمیدی بین گروه کربوکسیل یک اسید آمینه و گروه آمین دیگری تشکیل و یک مولکول آب آزاد می شود.پیوند آمیدی بین دو اسید آمینه را پیوند پپتیدی نیز می نامند. اتصال دو اسید آمینه دی پپتید ،و اتصال سه اسید آمینه تری پپتید را تشکیل می دهند. مولکولهای با حدود 30و یا کمتر تعداد اسید آمینه را الیگوپپتید یا پپتید و مولکولهای با تعداد بیشتر اسید آمینه را پلی پپتید می نامند. در انتهای یک الیگو یا پلی پپتید ،یک گروه آمین آزاد و در انتهای دیگر یک کربوکسیل آزاد وجود دارد که در پیوندهای پپتیدی شرکت نمی کنند.اسیدهای آمینه به ترتیب از انتهای آمین شماره گذاری میشوند . جرم مولکولی پروتئینها معموال بین 5000تا 100000دالتون و گاهی تا چند میلیون دالتون می باشد. در ساختار پروتئین ها ،یک یا چند زنجیره پلی پییتیدی میتواند وجود داشته باشد.پروتئینها معموال به علت پیچ و تاب خوردگی های ویژه می توانند دارا ی ساختار سه بعدی باشند. انواع پروتئین ها بر اساس شکل ظاهری را میتوان به دو نوع پروتئین های میله ای و کروی تقسیم کرد. پروتئین های میله ای اکثرا نقش ساختاری در سلول و محیط خارج آن دارند که میتوان به پروتئین های تشکیل دهنده اسکلت سلولی ،کراتین که در مو و پر یافت می شود و همچنین کالژن که در استخوان ها و تاندون ها وجود دارد ،اشاره نمود. پروتئینهای کروی از نوع میله ای متنوع تر بوده و آنزیم ها از مهمترین پروتئین های کروی هستند.ارتباط مستقیمی بین ساختار و فعالیت پروتئین ها وجود داشته و در واقع ساختار پروتئین ها تعیین کننده فعالیت آنها است. تغییر در ساختار یک پروتئین توسط عوامل گوناگون معموال سبب تغییر در فعالیت آن می شود. چهار سطح ساختاری پروتئین ها ساختار اول پروتئین ها توالی خطی اسیدهای آمینه در آنها است. توالی اسیدهای آمینه از انتهای آمین به انتهای کربوکسیل است. با استفاده از عالئم یک و یا سه حرفی اسیدهای آمینه نوشته می شود. هر گونه تغییر در نوع ،تعداد و یا جایگاه اسیدهای آمینه در زنجیره پروتئین موجب تغییر در ساختار اول آن شده و ممکن است سبب تغییر در فعالیت آن نیز بشود. ساختارهای بعدی پروتئینها به ساختار اولیه آنها بستگی دارد. ساختار دوم پروتئین در نتیجه ایجاد پیوند بین اسیدهای آمینه نزدیک در زنجیره خطی پروتئین به وجود می آید.این ساختار می تواند منظم و یا نا منظم باشد.از نوع منظم که پیوندهای هیدروژنی به آن ساختار پایداری میدهد میتوان به ساختارآلفا( )αو ساختار بتا ( )ßاشاره کرد در ساختار آلفا ،اسیدهای آمینه مارپیچ راست گرد منظمی را تشکیل می دهند که چرخش در این نوع در جهت حرکت عقربه های ساعت است. پیوند هیدروژنی در مارپیچ های چپ گرد این چرخش در خالف جهت حرکت عقربه های ساعت است. در ساختار آلفا ،هر اسید آمینه با چهارمین اسیدآمینه بعد از خود پیوند هیدروژنی تشکیل می دهد که باعث پایداری ساختار می شوند. ساختار بتا صفحه ای بوده و مارپیچی نیست و به همین دلیل صفحه بتا نیز نامیده میشود. صفحه بتا از رشته های بتا که در مجاورت یکدیگر قرار دارند تشکیل میشود. رشته های بتا ممکن است نسبت به یکدیگر همسو (در یک جهت) و یا نا همسو (در دو جهت مخالف) باشند . بین گروههای آمین و کربوکسیل اسیدهای آمینه در رشته های مجاور در صفحه بتا ،پیوندهای هیدروژنی تشکیل می شوند که سبب پایداری ساختار آن می گردند. ساختار سوم پروتئین ها ساختار سه بعدی پلی پپتیدی است که در بسیاری از پروتئین ها کروی شکل است.پیوندهای آب گریز بین گروه های جانبی اسیدهای آمینه غیر قطبی مهمترین نقش را در به وجود آوردن ساختار سوم دارند. مارپیچ های آلفا و صفحه های بتا در پلی پپتید پیچ و تاب می خورند تا تشکیل این پیوندها امکان پذیر شود.ساختار نهایی پروتئین هایی که از یک رشته پلی پپتیدی تشکیل شده اند ،ساختار سوم است. ساختار چهارم پروتئین ها بیش از یک زنجیره پلی پپتیدی دارد. به هر یک از زنجیره های پلی پپتیدی تشکیل دهنده این پروتئینها "زیر واحد" گویند. ساختار چهارم در نتیجه انواع پیوندهای غیر کوواالن مانند پیوندهای هیدروژنی ،یونی و ...بین زیر واحدها تشکیل شده که باعث ثبات ساختار می شوند. ساختار چهارم ،چگونگی قرار گرفتن زیر واحدها نسبت به یکدیگر در فضا را نشان می دهد. هموگلوبین مثال خوبی از پروتئین هایی با چند زیرواحد است.هموگلوبین یکی از اولین پروتئین هایی است که ساختار چهارم آن با روش پراش پرتو ایکس تعیین شد. هیچ یک از زیر واحدهای آلفا و بتا به تنهایی نقش زیستی هموگلوبین را ایفا نمی کنند و برای فعالیت زیستی این مولکول ،وجود هر چهار زیر واحد الزم است. آنزیم ها آنزیم ها از مهم ترین ترکیبات سلول بوده و دارای اهمیت زیادی هستند.آنزیم ها واکنش دهنده هاى زیستى بوده و بسیارى از واکنش هاى شیمیایى در سلولها توسط آنها انجام مى شود. بدون آنزیم ها ،واکنشهاى زیستى بسیار آهسته انجام شده و ادامه زندگی غیر ممکن می شود. این مولکول ها ،کاتالیزورهای زیستی هستند که واکنش شیمیایی های سلول را کاتالیز می کنند. کاتالیزورها موادی هستند که واکنش های شیمیایی را تسریع می کنند بدون آنکه مصرف شوند و فقط تغییر موقتی در طی واکنش در آنها ایجاد میشود. تفاوت آنزیم ها با کاتالیزورهای غیر زیستی در این است که سرعت واکنشها با آنزیم ها بیشتر شده و ضمنا آنزیم ها اختصاصی تر عمل می کنند یعنی یک واکنش دهنده خاص می تواند توسط یک آنزیم به محصول یا محصوالت ویژه ای تبدیل شود. آنزیم ها درون سلول ها ساخته می شوند. بعضى از آنها پس از تولید به بیرون از سلول ترشح شده و فعالیت خود را در خارج از سلول انجام مى دهند.چنین آنزیم هایى برون سلولى نامیده مى شوند. آنزیم هاى گوارشى که به درون معده و روده ترشح مى شوند ،از این گونه آنزیم ها هستند. آنزیم های دیگر درون سلول فعالیت داشته و آنزیم هاى درون سلولى نامیده می شوند. این آنزیم ها باعث افزایش سرعت بیشتر واکنش هاى زیستى درون سلول ها شده و همچنین در تنظیم کار آنزیم هاى دیگر نیز مؤثرند. آنزیم ها ویژگى هاى زیادی دارند که میتوان به برخی از آنها اشاره نمود: بیشتر آنها پروتئینى هستند که البته امروزه چند آنزیم غیر پروتئینى نیز کشف شده است. عمل اختصاصى داشته و هر کدام واکنش خاصى را انجام مى دهند. سلول از هرکدام از آنها چند بار استفاده مى کند ،چون به هنگام شرکت در واکنش ها تغییر نمی کنند. البته مقدار آنزیم پس از تولید ،کاهش مى یابد و براى انجام دائمی واکنشى خاص ،سلول باید به شکل مداوم آن را تولید کند. به تغییرات شدید دما حساس هستند. آنزیم ها نیز مانند سایر پروتئین ها به گرما حساس بوده و در گرماى زیاد ویژگی های خود را از دست مى دهند. بسیارى از آنزیم هاى بدن انسان در دماى باالتر از 42درجه سانتیگراد غیر فعال مى شوند. به تغییرات شدید اسیدیته ( )pHمحیط حساس اند. بسیارى از آنزیم هاى درون بدن در محیط خنثى فعالیت دارند ( pHحدود .) 7 چگونگی عمل آنزیم ها: آنزیمها نیز مانند سایر پروتئین ها ،شکل سه بعدى ویژه اى دارند. قسمتی از آنزیم که به پیش ماده متصل مى شود ،جایگاه فعال نام دارد. پس از اتصال پیش ماده به جایگاه فعال ،واکنش انجام شده و فرآورده تولید شده از آنزیم جدا مى شود. جایگاه فعال آنزیم ها با یکدیگر متفاوت بوده و علت خاص بودن واکنش آنزیمی را نشان می دهد. عواملی مانند گرما و تغییرات pHمحیط ،شکل سه بعدى آنزیم را تغییر داده و اتصال پیش ماده به آن و انجام واکنش آنزیمی را غیر ممکن می کند. آنزیم ها معموال با افزودن پسوند " آز" به نام یا بخشی از نام ماده یا موادی که آنزیم بر آن تأثیر میگذارد ،نام گذاری می شود. آنزیم ها معموال براساس نوع واکنشی که کاتالیز می کنند ،گروه بندی میشوند. پروتئازها آنزیم هایی هستند که پروتئین ها را تجزیه می کنند که از انواع آنها می توان به تریپسین اشاره نمود. دهیدروژنازها واکنش های اکسایش و احیا را کاتالیز می کنند. فسفاتازها گروه فسفات را از مولکول ها بر داشته و کیناز ها سبب اتصال فسفر به مولکولها میشوند. ریبونوکلئازها نیز RNAرا تجزیه می کنند. حدود 5000آنزیم که واکنش های بیوشیمیایی را کاتالیز میکنند ،شناسایی شده اند. مجموعه واکنش هایی که توسط آنزیم ها کاتالیز می شوند ،ویژگی های جانداران را تعیین می کنند. اگر چه همه سلول ها آنزیم های الزم برای واکنش های عمومی سلول را دارند ،ولی هر سلول آنزیم های ویژه خود را نیز می سازد و به کمک آنها واکنش های ویژه آن سلول انجام می شود. مجموعه آنزیم های هر سلول تعیین کننده واکنش هایی است که در آن سلول انجام می گیرند و تفاوت در واکنشهای سلولهای گوناگون به علت تفاوت در مجموعه آنزیم های آنها است.به عنوان مثال آنزیم های موجود در گلبول های قرمز ،سلول های عصبی ،سلول های عضالنی و پوست یکسان نبوده و واکنش های متفاوت در این سلول ها انجام شده و خواص متفاوتی را در آنها ایجاد می کند. فعالیت آنزیم ها بعضی از آنزیم ها برای کاتالیز واکنش های زیست شیمیایی به مواد غیر پروتئینی نیز نیاز دارند که به نام " کوآنزیم" نامیده می شوند. ویتامین های گروه Bاز مهمترین کوآنزیم ها هستند. ویتامین B3یا نیکوتین آمید در گوشت و سبزیجات به مقدار زیادی وجود داشته و کمبود آن موجب بیماری پوستی پالگر می شود. ✓ این مولکول در دو شکل فعال ،یکی نیکوتین آمید آدنین دی نوکلئوتید ()NADو دیگری نیکوتین آمید آدنین دی نوکلئوتید فسفات ( )NADPوجود دارد. ✓ این کوآنزیم ها در واکنش های اکسایش و احیا که توسط دهیدروژناز کاتالیز می شوند ،شرکت داشته و انتقال اتم هیدروژن را از مولکولی به مولکول دیگر انجام می دهند. فالوین آدنین دی نوکلئوتید که مشتقی از ویتامین B2یا ریبوفالوین است ،نیز مانند NAD عمل می کند. FADحالت اکسید شده و FADH2حالت احیا شده آن است . یکی دیگر از مهمترین کوآنزیم ها ،کوآنزیم Aاست که ساختار پیچیده ای داشته و انتقال گروه استیل در سلول را به عهده دارد. اتصال کوآنزیم Aبه گروه استیل سبب تولید استیل کوآنزیم Aشده ،سپس این مولکول می تواند گروه استیل خود را به مولکول پذیرنده منتقل کرده و دوباره به کوآنزیم Aتبدیل شود. اسید های نوکلئیک اسیدهای نوکلئیک شامل ( DNAداکسی ریبونوکلئیک اسید) و ( RNAریبونوکلئیک اسید) ،از مونومرهایی به نام نوکلئوتید ساخته شده اند. مهمترین نقش اسیدهای نوکلئیک ذخیره اطالعات ژنتیک ،انتقال این اطالعات به نسل های بعد و دخالت در تجلی این اطالعات است. فقط از یک نوع مونومر به نام نوکلئوتید تشکیل شده اند. هیدرولیز جزئی اسیدهای نوکلئیک، نوکلئوتیدها را تولید می کند و در ادامه هیدرولیز ،مولکول فسفات از نوکلئوتیدها جدا می شود و ترکیبی به نام نوکلئوزید به وجود می آورد. فسفات موجود در در نوکلئوتیدها به شکل H3PO4است. قند نوکلوتیدهای اسیدهای نوکلئیک پنج کربنی و بر حسب نوع اسید نوکلئیک ،ریبوز یا داکسی ریبوز است . اتم های کربن در قندها با شماره و عالمت پرایم ،مشخص می شوند مانند ’ C1و ’.... C2 در ریبوز گروه هیدروکسیل) )OHبه ’ C2متصل بوده و در دئوکسی ریبوز این گروه با هیدروژن ()Hجایگزین میشود. بازهای حلقوی نیتروژن دار که در ساختار اسیدهای نوکلئیک شرکت می کنند دو نوع می باشند که بازهای پورین و پیریمیدین نامیده می شوند. بازهای پورین از دو حلقه ساخته شده و شامل آدنین ( )Aو گوانین ( )Gهستند. بازهای پیریمیدین از یک حلقه ساخته شده و شامل سیتوزین( ، )Cیوراسیل ( )Uو تیمین ()Tهستند. نوکلئوزید از اتصال یک باز و یک قند ساخته میشود که از طریق پیوند کوواالن بین نیتروژن شماره 1بازهای پیریمیدین و یا نیتروژن شماره 9پورین ها ،با کربن شماره 1قند ایجاد می شود. پیوند حاصل - Nگلیکوزیدی نامیده می شود. داکسی نوکلئوزیدها و ریبونوکلئوزیدها بر اساس باز آلی موجود در مولکول نام گذاری می شوند. آدنوزین ،گوآنوزین ،سیتیدین ،یوریدین و تیمیدین پنج نوع نوکلئوزید هستند. اتصال ملکول فسفات به کربن شماره’ 5قند نوکلئوزید ،نوکلئوتید را به وجود می آورد. نوکلئوزید مونو فسفات نوکلئوزید +یک گروه فسفات نوکلئوزید دی فسفات نوکلئوزید +دو گروه فسفات نوکلئوزید تری فسفات نوکلئوزید +سه گروه فسفات نزدیکترین فسفات به گروه قند ،فسفات آلفا( )αفسفات دوم بتا ( )βو فسفات سوم گاما ()γ نامیده می شوند. نوکلئوزید آدنوزین می تواند به آدنوزین منوفسفات( ، )AMPآدنوزین دی فسفات ( )ADPو آدنوزین تری فسفات ) ) ATPتبدیل شود. نوکلئوتیدها عالوه بر این که واحدهای اسیدهای نوکلئیک هستند ،در تامین انرژی الزم برای فرایندهای زیستی مانند ATPو GTPو همچنین اعمال دیگر نیز نقش دارند. دو نوع اسید نوکلئیک در سلول وجود دارد: ریبونوکلئیک اسید ) )RNAکه واحدهای آن ریبونوکلئوتید بوده و قند ریبوز دارند. دارای چهار باز آدنین ،گوانین ،سیتوزین و یوراسیل هستند. در هسته و سیتو پالسم وجود دارند. داکسی ریبونوکلئیک اسید) (DNAکه تک واحدهای آن داکسی نوکلئوتید بوده و قند داکسی ریبوز دارند. در DNAچهار باز آدنین ،گوانین ،سیتوزین و تیمین وجود دارد. بخش عمده آنها در هسته سلول بوده و مقدار کمی از آنها در میتوکندری و کلروپالست است. در اسیدهای نوکلئیک ،اتصال نوکلئوتیدها از طریق پیوند بین گروه فسفات متصل به کربن’ 5قند یک نوکلئوتید و گروه هیدروکسیل متصل به کربن’ 3قند نوکلئوتید مجاور در یک رشته انجام می شود. ضمن ایجاد این پیوند ،آب آزاد شده و به پیوند به وجود آمده بین دو نوکلئوتید پیوند فسفو دی استری می گویند. از اتصال نوکلئوتیدهای متعدد ،زنجیره های کوتاه یا بلند اسیدهای نوکلئیک تشکیل می گردند که به ترتیب الیگو نوکلئوتید و پلی نوکلئوتید نامیده می شوند. ساختار کروموزوم ها ماده وراثتی در هسته سلول به شکل کروموزوم سازماندهی شده است. کروموزوم ها از کروماتین تشکیل شده است. کروماتین از DNAو پروتئین ساخته شده است. DNAمولکول بسیار طویلى است که دو رشته دارد.این دو رشته مانند دو رشته یک زیپ به هم متصل شده اند.در هر رشته ،هزارها نوکلئوتید وجود دارد. ترتیب قرار گرفتن نوکلئوتیدها در ساختار DNAبه شکلی است که همیشه Aدر مقابل Tو Cدر مقابل Gقرار میگیرد (رابطه مکملی بین نوکلئوتیدها) . معموال مقدار Aبا Tو مقدار Gبا Cبرابر است. طول مولکول های RNAبسیار متنوع و معموال کوتاه تر از DNAاست. در سلولها انواع مختلف RNAوجود دارند که سه نوع اصلی آنها RNAپیک )RNA ،)mRNAناقل ( )tRNAو RNAریبوزومی( (rRNAاست. این RNAها در انتقال اطالعات ژنتیکی از DNAبه پروتئین نقش دارند. همانند سازی DNA به هنگام همانند سازی ،آنزیم هلیکاز دو رشته مولکول DNAرا از هم باز کرده و در مقابل هر رشته ،رشته جدیدی ساخته میشود در این روش با استفاده از نوکلئوتیدهای آزاد که در سیتوپالسم وجود دارند ،در مقابل ، Aباز T و در مقابل Cباز Gقرار می گیرد.چون هر DNAدختر یک رشته جدید و یک رشته ی قدیمی دارد ،به این روش همانند سازی DNAنیمه حفظ شده می گویند. همانند سازی DNAبه کمک آنزیم DNAپلی مراز انجام می شود که در طول DNAحرکت کرده و نوکلئوتیدها را در مقابل نوکلئوتیدهای مکمل خود قرار میدهد. توانایی دیگر این آنزیم ویرایش کردن است به شکلی که اگر نوکلئوتیدی به شکل اشتباهی به DNA دختر اضافه شود ،یعنی مکمل نباشد ،آنزیم DNAپلی مراز نوکلئوتید غلط را جدا نموده و به جای آن نوکلئوتید درست را جایگزین می کند. اگر این اشتباه ها اصالح نشده و نوکلئوتید غلط در DNAدختر باقی بماند ،جهش ایجاد شده و به نسل بعد منتقل می شود که البته احتمال ایجاد این پدیده بسیار کم است. دو راهی همانند سازی در سلولهای یوکاریوتی ،هر کروموزوم از یک رشته DNAطویل تشکیل شده که طول آن به قدری زیاد است که اگر همانند سازی از یک نقطه آن شروع شود تا به نقطه پایان برسد حدود 33روز زمان الزم دارد. به این دلیل همانند سازی در سلولهای یوکاریوتی در نقاط مختلف به نام حباب همانند سازی انجام میشود. در این نقاط دو راهی های همانند سازی تشکیل می شود. همانند سازی یک کروموزوم انسان حدود 8ساعت طول می کشد. در باکتری ها که پروکاریوت بوده و دارای DNAحلقوی هستند ،معموال از یک نقطه خاص ،دو عدد دو راهی همانند سازی در دو جهت مخالف هم تشکیل می شود که به تدریج از یکدیگر دور شده و در نقطه مقابل حلقه DNAبه هم رسیده و دو مولکول حلقوی DNAتشکیل می شود. برخی عوامل مهم در همانند سازی DNA آنزیم هلیکاز :این آنزیم با استفاده از انرژی ،ATPپیوندهای هیدروژنی بین بازهای آلی را شکسته و پیچ خوردگی -های دو رشته را باز میکند. آنزیم توپوایزومراز :که نوع خاصی از آن جیراز است ،از لحاظ فضایی باعث سست شدن پیچ خوردگیهای مضاعف مولکول DNAمیشود. ظاهرا این آنزیم قبل و بعد از آنزیم هلیکاز عمل می کند. آنزیم اصلی DNAپلی مراز DNA :پلی مرازها انواع متفاوتی دارند. این نوع میتواند DNAدو رشته ای را با اضافه کردن نوکلئوتیدها در جهت’ 5به’ 3با سرعت باال ( حدود 1000نوکلئوتید در ثانیه) بسازد. فعالیت آن بعد از جدا شدن دو رشته در محل آغاز همانند سازی شروع می شود. آنزیم لیگاز :این آنزیم قطعات اکازاکی را به یکدیگر وصل می کند.قطعات اکازاکی رشته های DNAکوتاه و جدید ساخته شده از روی الگو هستند که در یوکاریوت ها از حدود 150 نوکلئوتید ساخته می شوند. آنزیم RNAپریماز :نوعی RNAپلی مراز است که RNAپرایمر تولید میکند. پس از ساخته شدن DNAجدید از روی یک رشته از DNAاولیه ،امکان ساخته شدن تک رشته جدید از روی رشته دیگر DNAوجود ندارد. RNAپرایمر توسط آنزیم RNAپریماز یا همان RNAپلی مراز ،ساخته شده و سبب آغاز سنتز رشته جدید DNAتوسط DNAپلی مراز IIIمیشود.این پرایمر بعدا توسط DNAپلی مراز Iجدا می شود. آنزیم های DNAپلی مراز Iو : IIهر دو آنزیم بیشتر نقش ویرایشی دارند.پس از آنکه RNAپرایمر توسط RNase Hجدا شد ،نوع 1آنزیم DNAپلی مراز، محل خالی ایجاد شده بین قطعات اکازاکی را پر کرده و نوکلئوتیدهای غلط را اصالح می کند. نوع 2آنزیم DNAپلی مراز می تواند در همانند سازی DNAشرکت کند ولی سرعت کمتری از نوع 2آن دارد. همچنین نقش ویرایشی در اصالح نوکلئوتیدهای اشتباه قرار داده شده را دارد. پروتئین های متصل شونده به تک رشته ها ) : )SSBعملکرد این پروتئین ها محافظت از تک رشته DNAدر مقابل نوکلئازها و ممانعت از تشکیل ساختار ثانویه یا لوپ در آن ،جهت عملکرد صحیح سایر آنزیم ها است.