Antibiotic Susceptibility Tests PDF
Document Details
Uploaded by IntriguingPhosphorus
University of Kirkuk
Tags
Summary
This document discusses antibiotic susceptibility tests, a key function in clinical microbiology labs. It details the testing methods, the importance of proper identification to prevent misdiagnosis, and related factors.
Full Transcript
Antibiotic Susceptibility Tests اختبارات الحساسية للمضادات الحيوية One of the primary functions of the clinical microbiology laboratory is to determine the antimicrobial susceptibilities of significant bacterial isolates that require treatment. Antimicrobial agents are nontoxic antimicrobial thera...
Antibiotic Susceptibility Tests اختبارات الحساسية للمضادات الحيوية One of the primary functions of the clinical microbiology laboratory is to determine the antimicrobial susceptibilities of significant bacterial isolates that require treatment. Antimicrobial agents are nontoxic antimicrobial therapeutic agents, including antiseptics, antibiotics, preservatives, and disinfectants; all have the capacity to kill or suppress the growth of microorganisms. Antimicrobial agents are essential components of the practice of medicine. They are used to treat, prevent, and control bacterial pathogens. The term antibiotic has been traditionally reserved for compounds that are naturally produced by living microorganisms, such as bacteria and fungi. The term has come to be more widely applied to any natural, semisynthetic, or synthetic molecule used to treat or prevent disease. Antibiotics Mode of Action: Antibiotics target anabolic cellular processes: تتمثل إحدى الوظائف األساسية لمختبر األحياء الدقيقة السريرية في تحديد حساسية مضادات الميكروبات للعزالت ، العوامل المضادة للميكروبات هي عوامل عالجية مضادة للميكروبات غير سامة.البكتيرية الهامة التي تتطلب العالج بما في ذلك المطهرات والمضادات الحيوية والمواد الحافظة والمطهرات ؛ جميعها لديها القدرة على قتل أو قمع نمو يتم استخدامها لعالج مسببات. العوامل المضادة للميكروبات هي مكونات أساسية لممارسة الطب.الكائنات الحية الدقيقة مصطلح المضادات الحيوية يستخدم تقليديا للمركبات التي تنتج بشكل طبيعي.األمراض البكتيرية والوقاية منها ومكافحتها أصبح المصطلح مطبقًا على نطاق واسع على أي جزيء. مثل البكتيريا والفطريات، عن طريق الكائنات الحية الدقيقة تستهدف: طريقة عمل المضادات الحيوية.طبيعي أو شبه اصطناعي أو اصطناعي يستخدم لعالج المرض أو الوقاية منه المضادات الحيوية العمليات الخلوية االبتنائية 1. Cell wall synthesis. تركيب جدار الخلية 2. Cell membrane synthesis تركيب غشاء الخلية 3. DNA replication. تكرار الحمض النووي 4. RNA transcription. نسخ الحمض النووي الريبي 5. Protein synthesis تخليق البروتين 1 Antibiotic susceptibility testing is performed on bacteria isolated from clinical specimens to determine which antimicrobial agents might be effective in treating infections caused by the bacteria which presumed to be the etiological agent of the infection. يتم إجراء اختبار الحساسية للمضادات الحيوية على البكتيريا المعزولة من العينات السريرية لتحديد العوامل المضادة.للميكروبات التي قد تكون فعالة في عالج العدوى التي تسببها البكتيريا التي يُفترض أنها العامل المسبب للمرض The main purpose of routine in vitro susceptibility testing in the clinical microbiology laboratory is to guide physicians in selecting antimicrobial therapy for treatment of individual patients. Testing bacteria that are not involved in the infection would be misleading to the physician and could lead to a more serious infection with development of antimicrobial resistance. الغرض الرئيسي من اختبار الحساسية الروتيني في المختبر في مختبر األحياء الدقيقة السريرية هو توجيه األطباء في ً مضلال قد يكون اختبار البكتيريا غير المتورطة في العدوى.اختيار العالج المضاد للميكروبات لعالج المرضى الفرديين للطبيب ويمكن أن يؤدي إلى عدوى أكثر خطورة مع تطور مقاومة مضادات الميكروبات One of the major challenges in clinical microbiology is the identification of the bacterium that caused infections. Often these bacteria need to be distinguished from normal flora that may be present in at the site of the infection normally, although in some situations the microbial flora that reside at the site of infection may be contributing to the infection. Therefore, thought needs to go into determining which bacteria from a specimen will be tested for susceptibility to antimicrobials. Most microbiology laboratories have guidelines for determining when and on which bacteria susceptibility testing will be done. When in doubt (uncertainty) about the significance of a bacteria from a specimen, it is best to discuss the situation with the attending physician. غالبًا ما تحتاج هذه البكتيريا.أحد التحديات الرئيسية في علم األحياء الدقيقة السريرية هو تحديد البكتيريا المسببة للعدوى على الرغم من أنه في بعض الحاالت، للتمييز عن النباتات الطبيعية التي قد تكون موجودة في موقع اإلصابة بشكل طبيعي يجب التفكير في تحديد البكتيريا من العينة، لذلك. قد تساهم النباتات الميكروبية الموجودة في موقع اإلصابة في اإلصابة، تحتوي معظم مختبرات األحياء الدقيقة على مبادئ توجيهية.التي سيتم اختبارها للتأكد من قابليتها لمضادات الميكروبات في حالة الشك (عدم اليقين) بشأن أهمية بكتيريا من.لتحديد متى سيتم إجراء اختبار الحساسية للبكتيريا وفي أي منها. فمن األفضل مناقشة الوضع مع الطبيب المعالج، عينة In clinical laboratories, susceptibility testing is usually performed by a disk diffusion or and minimal inhibitory concentration [MIC] methods. Standards that describe these methods are published and frequently updated by the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), formerly the National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS). عادة ما يتم إجراء اختبار الحساسية عن طريق انتشار القرص أو طرق التركيز المثبط األدنى، في المختبرات السريرية يتم نشر المعايير التي تصف هذه األساليب وتحديثها بشكل متكرر من قبل معهد المعايير السريرية والمخبرية.] MIC[.)NCCLS( سابقًا اللجنة الوطنية لمعايير المختبرات السريرية، )CLSI( 2 After a pathogen is cultured, its sensitivity to specific antibiotics serves as a guide in choosing antimicrobial therapy. Some pathogens, such as Streptococcus pyogenes & Neisseria meningitidis, usually have predictable sensitivity patterns to certain antibiotics. In contrast, most gram-negative bacilli, enterococci, and Staphylococcal species show unpredictable sensitivity patterns to various antibiotics and require susceptibility testing to determine an appropriate antimicrobial therapy. عادة. تعمل حساسيته لمضادات حيوية معينة كدليل في اختيار العالج المضاد للميكروبات، بعد زراعة العا مل الممرض أنماط، Streptococcus pyogenes & Neisseria meningitidis مثل، ما يكون لبعض مسببات األمراض فإن معظم أنواع العصيات والمكورات المعوية، على النقيض من ذلك.حساسية يمكن التنبؤ بها لمضادات حيوية معينة والمكورات العنقودية سالبة الجرام تظهر أنماط حساسية غير متوقعة للمضادات الحيوية المختلفة وتتطلب اختبار.الحساسية لتحديد العالج المناسب بمضادات الميكروبات There are many methods for detecting this bacterial susceptibility pattern like: هناك العديد من الطرق الكتشاف نمط الحساسية البكتيرية مثل 1- Disk diffusion(Kirby-Bauer) method The classic qualitative method to test susceptibility to antibiotics has been the Kirby-Bauer disk-diffusion method, in which disks with exact amounts of different antimicrobial agents are placed on Mueller-Hinton agar culture medium dishes inoculated with the microorganism to be tested. The micro-organism's growth (resistance to the drug) or lack of growth (sensitivity to the drug) is then monitored. ) الطريقة النوعية الكالسيكية الختبار القابلية للمضادات الحيوية هي طريقة نشرKirby-Bauer( طريقة نشر األقراص حيث توضع األقراص التي تحتوي على كميات محددة من العوامل المختلفة المضادة، Kirby-Bauer القرص يتم بعد ذلك. تلقيح الكائنات الحية الدقيقة المراد اختبارها.هينتون-للميكروبات على أطباق متوسطة لزراعة أجار مولر.)مراقبة نمو الكائن الدقيق (مقاومة الدواء) أو نقص النمو (الحساسية للدواء 3 After a defined period of incubation, the zone of no growth around each disc is measured and interpreted based on published interpretive criteria, which have been developed by comparison with MIC methods. In addition, the size of the zone of growth inhibition is influenced by the concentration and rate of diffusion of the antibiotic on the disk. The disk - diffusion method is useful when susceptibility to an unusual antibiotic, not available in automated systems, is to be determined. ، يتم قياس منطقة عدم النمو حول كل قرص وتفسيرها بنا ًء على المعايير التفسيرية المنشورة، بعد فترة حضانة محددة يتأثر حجم منطقة تثبيط النمو بتركيز ومعدل، باإلضافة إلى ذلك.MIC والتي تم تطويرها من خالل المقارنة مع طرق تعتبر طريقة االنتشار القرصي مفيدة عند تحديد قابلية التعرض لمضاد حيوي غير.انتشار المضاد الحيوي على القرص غير متوفر في األنظمة اآللية، عادي 2- Minimal inhibitory concentration (MIC) التركيز المثبط األدنى Quantitative testing uses a dilution technique in which tubes containing serial dilutions of an antibiotic are inoculated with the organism whose sensitivity to that antibiotic is to be tested. The tubes are incubated and later observed to determine the minimal inhibitory concentration (MIC) of the antibiotic necessary to prevent bacterial growth. يستخدم االختبار الكمي تقنية تخفيف يتم فيها تلقيح األنابيب التي تحتوي على تخفيفات متسلسلة لمضاد حيوي بالكائن يتم تحضين األنابيب ويتم مالحظتها الحقًا لتحديد الحد األدنى من التركيز.الذي سيتم اختبار حساسيته لهذا المضاد الحيوي ) للمضاد الحيوي الضروري لمنع نمو البكتيرياMIC( المثبط Determination of minimal inhibitory concentration (MIC) of an antibiotic. ) للمضاد الحيويMIC( تحديد الحد األدنى للتركيز المثبط [Note: MICs are now automated and often done simultaneously with automated biochemical identifications.]. تلقائيًا وغالبًا ما يتم إجراؤه في وقت واحد باستخدام عمليات تحديد كيميائية حيوية آليةMIC يتم اآلن تشغيل:مالحظة 4 To provide effective antimicrobial therapy, the clinically obtainable antibiotic concentration in body fluids should be greater than the MIC. Quantitative susceptibility testing may be necessary for patients who either fail to respond to antimicrobial therapy or who relapse (decline) during therapy. In some clinical cases, the minimal bactericidal concentration may need to be determined. This is the lowest concentration of antibiotic that kills 100 percent of the bacteria, rather than simply inhibiting growth. يجب أن يكون تركيز المضاد الحيوي الذي يمكن الحصول عليه سريريًا في، لتوفير عالج فعال بمضادات الميكروبات قد يكون اختبار الحساسية الكمي ضروريًا للمرضى الذين يفشلون في االستجابة للعالج.MIC سوائل الجسم أكبر من قد يلزم تحديد الحد، في بعض الحاالت السريرية.بمضادات الميكروبات أو الذين ينتكسون (ينخفضون) أثناء العالج بدالً من تثبيط، في المائة من البكتيريا100 هذا هو أقل تركيز للمضاد الحيوي الذي يقتل.األدنى من تركيز مبيد الجراثيم.النمو ببساطة Bacteriostatic versus bactericidal drugs Antimicrobial drugs are classified as either bacteriostatic or bactericidal. Bacteriostatic drugs arrest the growth & replication of bacteria at serum (or urine) levels achievable in the patient, thereby limiting the spread of infection while the body's immune system attacks, immobilizes (stops), and eliminates the pathogens. If the drug is removed before the immune system has scavenged (get out) the microorganisms; enough viable organisms may remain to begin a second cycle of infection. األدوية المثبطة للجراثيم مقابل األدوية المبيدة للجراثيم تعمل األدوية الكابحة للبكتيريا على إيقاف نمو.تصنف األدوية المضادة للميكروبات إما على أنها جراثيم أو مبيد للجراثيم مما يحد من انتشار العدوى بينما يهاجم، وتكاثر البكتيريا في مستويات المصل (أو البول) التي يمكن تحقيقها في المريض إذا تمت إزالة الدواء قبل أن يقوم الجهاز المناعي بكسح.الجهاز المناعي للجسم ويثبته (يتوقف) ويزيل مسببات األمراض.(إخراج) الكائنات الحية الدقيقة ؛ قد تبقى كائنات حية كافية لبدء دورة ثانية من العدوى Figure below shows a laboratory experiment in which the growth of bacteria is arrested by the addition of a bacteriostatic agent. Note that viable organisms remain even in the presence of the bacteriostatic drug. By contrast, addition of a bactericidal agent kills bacteria, and the total number of viable microorganisms’ decreases. Although practical, this classification may be too simplistic because it is possible for an antibiotic to be bacteriostatic for one organism and bactericidal for another (for example, chloramphenicol is bacteriostatic against gram-negative rods and bactericidal against pneumococci) الحظ أن الكائنات الحية.يوضح الشكل أدناه تجربة معملية يتم فيها إيقاف نمو البكتيريا عن طريق إضافة عامل جراثيم ويقل العدد، فإن إضافة عامل مبيد للجراثيم يقتل البكتيريا، على النقيض من ذلك.تبقى حتى في وجود عقار الجراثيم ً إال أنه قد يكون مبس، على الرغم من أن هذا التصنيف عملي.اإلجمالي للكائنات الحية الدقيقة القابلة للحياة طا للغاية ألنه ، من الممكن أن يكون المضاد الحيوي مضادًا للجراثيم لكائن حي ومبيد للجراثيم لكائن آخر (على سبيل المثال )الكلورامفينيكول مضاد للجراثيم ضد قضبان سالبة الجرام ومبيد للجراثيم ضد المكورات الرئوية 5 Laboratory strategies for antimicrobial susceptibility testing The clinical microbiology laboratory is responsible for maximizing the positive results that susceptibility testing information can have on the use of antimicrobial agents to therapeutically manage infectious diseases. However, meeting this responsibility is difficult because of demands (need) for more efficient use of laboratory resources, the increasing complexities of important bacterial resistance profiles, and the continued expectations for high quality results. To ensure quality in the midst of dwindling resources and expanding antimicrobial resistance, strategies for antimicrobial susceptibility testing must be carefully developed. These strategies should target accuracy and communication as their goals. االستراتيجيات المعملية الختبار الحساسية لمضادات الميكروبات يعتبر مختبر علم األحياء الدقيقة اإلكلينيكي مسؤوالً عن تعظيم النتائج اإليجابية التي يمكن أن تكون لمعلومات اختبار الحساسية حول استخدام العوامل المضادة للميكروبات إلدارة فإن الوفاء بهذه المسؤولية أمر صعب بسبب المطالب (الحاجة) الستخدام أكثر كفاءة، ومع ذلك.ًاألمراض المعدية عالجيا. والتوقعات المستمرة لنتائج عالية الجودة، والتعقيدات المتزايدة لملفات المقاومة البكتيرية المهمة، لموارد المختبرات يجب وضع استراتيجيات الختبار، لضمان الجودة في خضم الموا رد المتضائلة وتوسيع مقاومة مضادات الميكروبات. يجب أن تستهدف هذه االستراتيجيات الدقة والتواصل كأهدافها.الحساسية لمضادات الميكروبات بعناية 6 Based on the assumption that the organism is clinically significant. Table (1) only includes those bacteria to which standardized testing procedures are available as outlined and recommended by the National Committee for Clinical Laboratory Standards. Testing only needed an antimicrobial to which the organisms are frequently resistant is considered for use such as penicillin for Neisseria gonorrhoeae. Antimicrobial susceptibility testing should only be performed when there is sufficient potential for providing clinically useful and reliable information regarding those antimicrobial agents that are appropriate for the bacterial isolates. ) فقط تلك البكتيريا التي تتوفر لها إجراءات اختبار1( يشمل الجدول.بنا ًء على افتراض أن الكائن الحي مهم سريريًا يحتاج االختبار فقط لمضادات.موحدة على النحو المبين والموصى به من قبل اللجنة الوطنية لمعايير المختبرات اإلكلينيكية يجب إجراء اختبار الحساسية.الميكروبات التي تقاوم الكائنات ال حية بشكل متكرر استخدامها مثل البنسلين للنيسرية البنية لمضادات الميكروبات فقط عندما تكون هناك إمكانية كافية لتوفير معلومات مفيدة وموثوقة سريريًا بشأن تلك العوامل المضادة للميكروبات المناسبة للعزالت البكتيرية Automated Antimicrobial Susceptibility Test Systems..أنظمة اختبار حساسية مضادات الميكروبات اآللية The automated antimicrobial susceptibility test systems available for use include the Vitek Legacy system and Vitek 2 Systems. These different systems vary with respect to the extent which inoculum preparation and inoculation are automated, the methods used to detect growth, and the procedures used to interpret and assign MIC values and categorical (i.e., susceptible, intermediate, resistant) findings. Vitek وأنظمةVitek Legacy تشمل أنظمة اختبار الحساسية التلقائية لمضادات الميكروبات المتاحة لالستخدام نظام ، والطرق المستخدمة الكتشاف النمو، تختلف هذه األنظمة المختلفة فيما يتعلق بمدى أتمتة تحضير اللقاح والتلقيح.2.) والمقاومة، والمتوسطة، والنتائج الفئوية (أي الحساسةMIC واإلجراءات المستخدمة لتفسير وتعيين قيم In summary, this system facilitates standardized susceptibility testing in a closed environment with validated results and recognition of an organism's antimicrobial resistance mechanism in 6 to 8 hours for most clinically related bacteria. يسهل هذا النظام اختبار الحساسية المعياري في بيئة مغلقة مع نتائج مثبتة والتعرف على آلية مقاومة مضادات، باختصار. ساعات لمعظم البكتيريا ذات الصلة سريريًا8 إلى6 الميكروبات للكائن الحي في Microbiologists must be aware of the strengths and weaknesses of their primary susceptibility testing methods (disk diffusion, commercial broth micro dilution, automation) for detecting relevant resistance patterns and know when assistant or supplemental testing is necessary يجب أن يكون علماء األحياء الدقيقة على دراية بنقاط القوة والضعف في طرق اختبار الحساسية األولية لديهم (نشر واألتمتة) الكتشاف أنماط المقاومة ذات الصلة ومعرفة متى يكون االختبار، والتخفيف الدقيق للمرق التجاري، القرص المساعد أو التكميلي ضروريًا 7 8 Bloodstream infections التهابات مجرى الدم Which is primarily concerned with the presence of bacteria in the blood. There are various routes that organisms take to reach the blood. Pneumococcus colonizing the upper airways could be aspirated into the lungs during sleep and go on to cause lobar pneumonia; from here it can enter the blood. The presence of bacteria in the blood requires the identification of the likely source. يمكن. هناك طرق مختلفة تسلكها الكائنات الحية للوصول إلى الدم.والتي تهتم بشكل أساسي بوجود البكتيريا في الدم.استنشاق المكورات الرئوية التي تستعمر الشعب الهوائية العلوية إلى الرئتين أثناء النوم وتسبب االلتهاب الرئوي الفصي. يتطلب وجود البكتيريا في الدم تحديد المصدر المحتمل.من هنا يمكن أن يدخل الدم There is an obvious association between Escherichia coli in blood and an ascending urinary tract infection (UTI). When native valve endocarditis is identified it can be straightforward to determine the likely source of the organism. The patient with endocarditis caused by a Streptococcus of the mouth flora, such as Streptococcus sanguinis, can have poor dentition (Poor oral health), and this needs to be addressed as part of the patient’s management, usually involving the maxilla-facial surgical team and also called periodontal organisms of dental infections. عندما يتم التعرف على.)UTI( هناك عالقة واضحة بين اإلشريكية القولونية في الدم والتهاب المسالك البولية الصاعد يمكن أن يعاني المريض. يمكن أن يكون من السهل تحديد المصدر المحتمل للكائن الحي، التهاب شغاف القلب األصلي Streptococcus مثل، Streptococcus of the mouth flora المصاب بالتهاب الشغاف الناجم عن بكتريا وعادة ما، وهذا يحتاج إلى معالجة كجزء من إدارة المريض، ) من ضعف األسنان (ضعف صحة الفم، sanguinis.يشمل الفريق الجراحي للوجه والفكين و وتسمى أيضًا بكائنات اللثة من التهابات األسنان More unusual situations occur, and one is the identification of Streptococcus gallolyticus in blood culture. This organism is a minor member of the normal flora of the colon. However, it is recognized that there is an association that can develop between it and a large bowel malignancy, likely due to a specific interaction between the organism and these malignant cells. The Streptococcus gains a selective growth advantage, from where it accesses the blood. Once in the blood it has the potential to initiate infective endocarditis. The finding of Streptococcus gallolyticus in blood culture, often in the setting of endocarditis, is an alert to investigate this malignancy; if found this is removed before any valve surgery. هذا الكائن الحي هو عضو. في ثقافة الدمStreptococcus gallolyticus أحدها هو تحديد، تحدث حاالت أكثر غرابة طا يمكن أن يتطور بينه وبين ورم خبيث في ً فمن المعروف أن هناك ارتبا، ومع ذلك.ثانوي من الفلورا الطبيعية للقولون تكتسب. ويرجع ذلك على األرجح إلى تفاعل محدد بين الكائن الحي وهذه الخاليا الخبيثة، األمعاء الغليظة مرة واحدة في الدم لديها القدرة على بدء التهاب الشغاف. حيث تصل إلى الدم، ميزة نمو انتقائيStreptococcus هو تنبيه، غالبًا في حالة التهاب الشغاف، في مزرعة الدمStreptococcus gallolyticus إن اكتشاف.المعدي إذا وجد هذا يتم إزالته قبل أي جراحة صمام.للتحقيق في هذا الورم الخبيث Bacteremia defines the presence of bacteria as detected by the culture of blood. يعرف تجرثم الدم وجود البكتيريا كما تم الكشف عنها بواسطة مزرعة الدم Septicemia also defines the presence of bacteria in the blood, but it signals a sense of urgency in the management of the patient.. لكنه يشير إلى الشعور باإللحاح في إدارة المريض، يحدد تسمم الدم أيضًا وجود البكتيريا في الدم 1 The terms sepsis and septic shock are also used and, with clinical parameters such as fever, hypotension, tachycardia, multi-organ failure and leukocytosis, alert the clinician to the severity of the situation, and the need for immediate action in the management of the patient. ومع المعلمات السريرية مثل الحمى وانخفاض ضغط الدم وعدم، ت ُستخدم أيضًا مصطلحات اإلنتان والصدمة اإلنتانية ينبه الطبيب إلى خطورة الحالة والحاجة إلى اتخاذ، انتظام دقات القلب والفشل متعدد األعضاء وكثرة الكريات البيض. مريض.إجراءات فورية في تدبير المرض Bacteremia can be defined as transient (a single episode lasting less than 30 minutes or so), intermittent or continuous. These definitions are important concepts in terms of the site from which they may arise. Transient bacteremia can arise from pneumococcal pneumonia (caused by Streptococcus pneumonia), or pyelonephritis caused by Escherichia coli. Intermittent bacteremia implies (indicates) manipulation (guidance) of an extravascular site, such as a Staphylococcus aureus abscess, where bacteria enter the lymphatics at irregular intervals, and from there, the blood. Continuous bacteremia implies an intravascular source, & endocarditis is the most important example. هذه. متقطع أو مستمر، ) دقيقة أو نحو ذلك30 يمكن تعريف تجرثم الدم على أنه عابر (حلقة واحدة تدوم أقل من يمكن أن تنشأ تجرثم الدم العابر من االلتهاب الرئوي.التعريفات هي مفاهيم مهمة من حيث الموقع الذي قد تنشأ منه أو التهاب الحويضة والكلية الناجم عن اإلشريكية، )بالمكورات الرئوية (التي تسببها المكورات العقدية ذات الرئة مثل خراج، يشير تجرثم الدم المتقطع إلى (يشير) إلى التالعب (التوجيه) في موقع خارج األوعية الدموية.القولونية. الدم، ومن هناك، حيث تدخل البكتيريا إلى األوعية اللمفاوية على فترات غير منتظمة، المكورات العنقودية الذهبية. والتهاب الشغاف هو المثال األكثر أهمية، تجرثم الدم المستمر يشير إلى مصدر داخل األوعية الدموية Once bacteria enter the blood, they have the potential to settle (become down) in other sites of the body, and set up another focus of infection. A Staphylococcus aureus bacteremia arising from an infected peripheral venous cannula (PVC) site can result in bacteria attaching to a heart valve to initiate endocarditis, or settling in the spine and causing an abscess there. The bacteria can cross the synovial membrane of a joint to initiate septic arthritis. These examples underline the critical importance of full clinical assessment of the septic or bacteremic patient. وتكوين بؤرة، يكون لديها القدرة على االستقرار (الهبوط) في مواقع أخرى من الجسم، بمجرد دخول البكتيريا إلى الدم )PVC( التي تنشأ من موقع قنية وريدية محيطيةStaphylococcus aureus يمكن أن تؤدي بكتيريا.أخرى للعدوى. أو االستقرار في العمود الفقري والتسبب في حدوث خراج هناك، إلى إصابة البكتيريا بصمام القلب لبدء التهاب الشغاف تؤكد هذه األمثلة على األهمية الحاسمة للتقييم.يمكن للبكتيريا عبور الغشاء الزليلي للمفصل لبدء التهاب المفاصل اإلنتاني السريري الكامل لمريض اإلنتان أو الجراثيم 2 3 Diagnosis of microbial infections of bloodstream تشخيص االلتهابات الجرثومية لمجرى الدم Blood stream infections (BSI) refer to the presence of organisms in the blood which are a threat to every organ in the body. It causes shock, multiple organ failure and disseminated intravascular coagulation (DIC). The presence of bacteria in blood is called Bacteremia. يسبب الصدمة وفشل. ) إلى وجود كائنات حية في الدم تشكل تهديدًا لكل عضو في الجسمBSI( تشير عدوى مجرى الدم. يسمى وجود البكتيريا في الدم تجرثم الدم.)DIC( العديد من األعضاء والتخثر المنتشر داخل األوعية The bacteria circulate and actively multiply in the blood stream is called Septicemia. The presence of a virus in the blood is called Viremia. The presence of parasites in blood is called Parasitemia. The presence of fungi in the blood is called Fungemia. يسمى.Viremia يسمى وجود فيروس في الدم.تسمى البكتيريا التي تنتشر وتتكاثر بنشاط في مجرى الدم تسمم الدم يسمى وجود الفطريات في الدم الفطريات.وجود الطفيليات في الدم طفيليات الدم Etiological agents: العوامل المسببة 1. Bacteria like S. aureus, S. pneumonia and E. coli 2. Fungi such as Candida albicans الفطريات مثل المبيضات البيض 3. Parasites like Toxoplasma gondii, and Plasmodium malariae الطفيليات مثل 4. Viruses such as Epstein Barr Virus, Cytomegalovirus, SARS, SARS CoV2(Novel corona virus), HIV, Hepatitis. ) (فيروس كورونا المستجدCoV2 السارس، السارس، الفيروس المضخم للخاليا، فيروسات مثل فيروس ابشتاين بار التهاب الكبد، فيروس نقص المناعة البشرية، TYPES OF BACTEREMIA أنواع البكتيريا 1. Transient bacteremia is the sudden destruction of the tissue. It occurs during brushing teeth, chewing food, manipulation of infected tissues, devices inserted through the contaminated mucosal surface, and surgery in non-sterile sites. والتالعب باألنسجة المصابة، ومضغ الطعام، يحدث أثناء تنظيف األسنان.تجرثم الدم العابر هو التدمير المفاجئ لل نسجة. والجراحة في المواقع غير المعقمة، واألجهزة التي يتم إدخالها من خالل سطح الغشاء المخاطي الملوث، 2. Continuous bacteremia so, when the organism is released into the bloodstream at a fairly constant rate. It occurs in the early stages of certain infections such as typhoid fever, brucellosis and leptospirosis. يحدث في المراحل المبكرة. عندما يتم إطالق الكائن الحي في مجرى الدم بمعدل ثابت إلى حد ما، تجرثم الدم المستمر لذلك من بعض أنواع العدوى مثل حمى التيفود وداء البروسيالت وداء البريميات 3. Intermittent bacteremia that here the organism released into the bloodstream at various time intervals & it is found in patients with undrained abscess, which occurs in the early stages of meningitis, pneumonia, pyrogenic arthritis, and osteomyelitis. تجرثم الدم المتقطع الذي يطلق هنا الكائن الحي في مجرى الدم على فترات زمنية مختلفة ويوجد في المرضى الذين يعانون من خراج غير مصحوب يحدث في المراحل المبكرة من التهاب السحايا وااللتهاب الرئوي والتهاب المفاصل الحمى.والتهاب العظم والنقي 4 LABORATORY DIAGNOSIS: Specimen collection: جمع العينات The blood should be collected before antimicrobial therapy. The skin is wiped with 70% isopropyl alcohol. Using a sterile disposable syringe the blood is collected aseptically by vein- puncture. The blood volume is around 10-20 ml for adults and 1- 5 ml for infants. The collected blood was transported to the laboratory in an anticoagulant contain tube. Heparin and EDTA are not used, because it inhibits the growth of organisms. Hence, Sodium polyanethol sulphonate (SPS) is a coagulant for blood culture. باستخدام حقنة معقمة. من كحول األيزوبروبيل٪70 يُمسح الجلد بنسبة.يجب جمع الدم قبل العالج بمضادات الميكروبات 5-1 مل للبالغين و20-10 حجم الدم حوالي. يتم جمع الدم بطريقة معقمة عن طريق ثقب الوريد، يمكن التخلص منها ال يتم استخدام الهيبارين و. تم نقل الدم الذي تم جمعه إلى المختبر في أنبوب يحتوي على مضاد للتخثر.مل للرض ع.) هو مادة تخثر لثقافة الدمSPS( فإن سلفونات الصوديوم بوليانيثول، ومن ثم. ألنه يمنع نمو الكائنات الحية، EDTA Blood culture media: It consists of nutrient broth & anticoagulant. It includes Trypticase soy broth, Brain heart infusion broth, Columbia or Brucella broth. Biphasic medium is used as a conventional culture medium. In countries where brucellosis is prevalent, the use of a diphasic blood-culture bottle, with a broth phase and a solid-slant phase on one of the flat surfaces of the bottle (Castaneda bottle), is recommended for the cultivation of Brucella spp. The presence of carbon dioxide is needed for the isolation of most strains of Brucella abortus. مرق كولومبيا أو، مرق ضخ قلب الدماغ، وتشمل مرق الصويا تريبتيسيز.يتكون من مرق مغذي ومضاد للتخثر يوصى، في البلدان التي ينتشر فيها داء البروسيالت. يستخدم الوسط ثنائي الطور كوسيط استزراع تقليدي.البروسيال مع طور مرق ومرحلة مائلة صلبة على أحد األسطح المسطحة للزجاجة، باستخدام زجاجة استنبات دم ثنائية الطور. إن وجود ثاني أكسيد الكربون ضروري لعزل معظم سالالت البروسيال المجهضة. لزراعة البروسيال، )(زجاجة كاستانيدا 5 Subcultures are performed by streaking a loopful on appropriate media: for Gramnegative Rods: MacConkey agar, Kligler iron agar, motility indole– urease (MIU) Medium, Simmons citrate agar. For small Gram-negative rods: blood agar. أجار، MacConkey أجار: للقضبان النحوية:يتم إجراء الثقافات الفرعية عن طريق وضع خط على وسط مناسب أجار: للقضبان الصغيرة سالبة الجرام. أجار سترات سيمونز، ) المتوسطMIU( أجار اإلندول الحركي، كليجلر الحديدي.الدم For Staphylococci: blood agar, mannitol salt agar. For Streptococci: blood agar with Optochin, bacitracin, and tellurite discs. For routine examinations, it is not necessary To incubate blood cultures beyond 7 days. In some cases, incubation may be Prolonged for an additional 7 days, for example, if Brucella or other fastidious Organisms are suspected, in cases of endocarditis, or if the patient has received Antimicrobials. bacitracin وOptochin أجار الدم مع أقراص: للمكورات العقدية. أجار ملح مانيتول، أجار الدم:للمكورات العنقودية في بعض. أيام7 ليس من الضروري احتضان مزارع الدم ألكثر من، بالنسبة للفحوصات الروتينية.Tellurite و في حالة االشتباه في وجود البروسيال أو، على سبيل المثال، أيام إضافية7 قد تطول فترة الحضانة لمدة، الحاالت. أو إذا كان المريض قد تلقى مضادات الميكروبات، في حاالت التهاب الشغاف، الكائنات الدقيقة األخرى Instrument based systems like BACTEC System األنظمة القائمة على األدوات مثل نظام BACTEC is a fully automated machine that consists of an incubator, shaker and Blood bottles. عبارة عن آلة مؤتمتة بالكامل تتكون من حاضنة وشاكر وزجاجات دمBACTEC Identification: The isolated organism is identified from blood culture by colony morphology, gram staining, biochemical reactions and serological tests. The Antibiotic sensitivity test is essential for effective therapy وتلطيخ الجرام، يتم التعرف على الكائن الحي المعزول من مزرعة الدم عن طريق مورفولوجيا المستعمرة:تحديد الهوية يعد اختبار حساسية المضادات الحيوية ضروريًا للعالج الفعال. والتفاعالت البيوكيميائية واالختبارات المصلية، 6 7 Meningitis and other infections of the central nervous system التهاب السحايا والتهابات الجهاز العصبي المركزي األخرى Diagnosis of bacterial brain abscess and anaerobic infections: تشخيص خراج الدماغ الجرثومي وااللتهابات الالهوائية Brain abscess is a serious and deadly clinical case. Pyogenic infection of brain parenchyma begins with a localized area of inflammatory change referred to as cerebritis. This early stage of infection has characterized by increased blood vessel permeability without angiogenesis. When unrecognized, this process will progress to an immature capsular stage and then to brain abscess, a condition defined by an area of parenchymal infections containing pus encapsulated by a vascularized membrane. Anaerobic and microaerophilic cocci, gram-negative and gram- positive anaerobic bacilli were the predominating bacterial isolates. تبدأ العدوى القيحية لحمة الدماغ بمنطقة موضعية من التغير االلتهابي.يعتبر خراج الدماغ حالة سريرية خطيرة ومميتة.تكون األوعية ّ تتميز هذه المرحلة المبكرة من العدوى بزيادة نفاذية األوعية الدموية دون.يشار إليها باسم التهاب الدماغ وهي حالة، ست تطور هذه العملية إلى مرحلة المحفظة غير الناضجة ثم إلى خراج الدماغ، عندما ال يتم التعرف عليها ، كانت المعزوالت الالهوائية والميكروية.تحددها منطقة من العدوى المتني تحتوي على صديد مغلف بغشاء وعائي والعصيات الالهوائية سالبة الجرام وموجبة الجرام هي العزالت البكتيرية السائدة Many brain abscesses have mixed bacterial infections. The predominant organisms include: Staphylococcus aureus, aerobic and anaerobic streptococci (especially Streptococcus intermedius), Bacteroides, and Fusobacterium species, Enterobacteriaceae, Pseudomonas species and other anaerobes. Less common organisms include; Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, and Neisseria meningitides. Also bacterial abscess caused by Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Salmonella spp., Proteus spp., Enterobacter spp., Bacteroides spp. and Propionibacterium spp. ، المكورات العنقودية الذهبية: تشمل الكائنات الحية السائدة.العديد من خراجات الدماغ لها عدوى بكتيرية مختلطة ، وأنواع البكتيريا المغزلية، والبكتيرويد، )والمكورات العقدية الهوائية والالهوائية (خاصة المكورات العقدية الوسيطة العقدية الرئوية، تشمل الكائنات الحية األقل شيوعًا ؛ المستدمية النزلية. وأنواع الزائفة وغيرها من الالهوائية، والمعوية أيضا الخراج البكتيري الناجم عن. النيسرية السحائية، Bacterial Diagnosis of Cerebrospinal Fluid التشخيص الجرثومي للسائل الدماغي النخاعي Cerebrospinal fluid (CSF) is a watery fluid, continuously produced and absorbed, which flows in the ventricles (cavities) within the brain and around the surface of the brain and spinal cord. ) ويتدفق في البطينين (التجاويف، يتم إنتاجه وامتصاصه باستمرار، ) هو سائل مائيCSF( السائل الدماغي النخاعي داخل الدماغ وحول سطح الدماغ والحبل الشوكي Functions of CSF: - Hydrolic shock absorber. ممتص هيدروليكي للصدمات - Regulation of intracranial pressure. تنظيم الضغط داخل الجمجمة - Impacts the hunger sensation and eating behaviors يؤثر على اإلحساس بالجوع وسلوكيات األكل 1 Bacterial infection of CSF cause meningitis, which ranks high among medical emergencies, and early, rapid, and exact diagnosis, is more essential. Diagnosis of meningitis depends on maintaining a high index of thought, obtaining adequate specimens properly, and examining the specimens quickly. Based on the host's response to the invading microorganism, meningitis is divided into two major categories: purulent bacterial meningitis and aseptic (sterile) meningitis. ، والذي يحتل مرتبة عالية بين حاالت الطوارئ الطبية، العدوى البكتيرية للسائل النخاعي تسبب التهاب السحايا يعتمد تشخيص التهاب السحايا على الحفاظ على مؤشر عالي. هو أكثر أهمية، والتشخيص المبكر والسريع والدقيق بنا ًء على استجابة المضيف للكائنات الحية. وفحص العينات بسرعة، والحصول على عينات مناسبة بشكل صحيح، للفكر التهاب السحايا الجرثومي القيحي والتهاب السحايا العقيم: ينقسم التهاب السحايا إلى فئتين رئيسيتين، الدقيقة الغازية - Purulent meningitis: A patient with purulent meningitis typically has a marked acute inflammatory exudate with large numbers of polymorphonuclear cells (PMNs). The immediate decision usually based on the cell count, the glucose concentration in CSF and in a blood, protein content of cerebrospinal fluid, the results of microscopic examination for microorganisms. In addition, the results of culture, serologic tests, nucleic acid amplification tests, and other laboratory procedures. عادةً ما يعاني المريض المصاب بالتهاب السحايا القيحي من إفرازات التهابية حادة مع أعداد:التهاب السحايا القيحي يعتمد القرار الفوري عادةً على عدد الخاليا وتركيز الجلوكوز في السائل.)PMNs( كبيرة من الخاليا متعددة األشكال.الدماغي النخاعي وفي الدم ومحتوى البروتين في السائل النخاعي ونتائج الفحص المجهري للكائنات الحية الدقيقة واإلجراءات المعملية األخرى، واختبارات تضخيم الحمض النووي، واالختبارات المصلية، باإلضافة إلى نتائج الزراعة - Aseptic meningitis: Aseptic meningitis is characterized by increases of lymphocytes and other mononuclear cells (pleocytosis) in the CSF (in contrast to purulent, the PMN response characteristic to bacterial meningitis) and negative bacterial and fungal cultures. Patients may have fever, headache, a stiff neck, and nausea and vomiting. Aseptic meningitis is commonly associated with viral infections and is usually a self-limiting infection. It is also a component of syphilis and some other spirochetal diseases. Stiff-neck and CSF pleocytosis may also be produced by various processes, such as malignancy, that are not CNS infections. يتميز التهاب السحايا العقيم بزيادة الخاليا الليمفاوية وغيرها من الخاليا أحادية النواة (كثرة:التهاب السحايا العقيم ) المميزة اللتهاب السحايا الجرثوميPMN استجابة، الخاليا) في السائل الدماغي النخاعي (على عكس الصديد القيحي عادة ما. قد يعاني المرضى من الحمى والصداع وتصلب الرقبة والغثيان والقيء.والثقافات البكتيرية والفطرية السلبية وهو أيضًا أحد مكونات مرض.يرتبط التهاب السحايا العقيم بالعدوى الفيروسية وعادة ما يكون عدوى ذاتية الشفاء قد ينتج أيضًا تيبس الرقبة وكثرة خاليا السائل النخاعي عن طريق عمليات.الزهري وبعض األمراض اللولبية األخرى التي ال تعتبر عدوى بالجهاز العصبي المركزي، مثل األورام الخبيثة، مختلفة The most common types of bacteria that cause meningitis are: أكثر أنواع البكتيريا المسببة اللتهاب السحايا شيوعًا هي Serogroup B Streptococci (Strep. agalactiae) cause infection to neonates to age 3 months of age. أشهر من3 تسبب العدوى للولدان حتى عمرB (Strep. Agalactiae) المكورات العقدية من المجموعة المصلية العمر Escherichia coli infect mainly neonates..اإلشريكية القولونية تصيب الولدان بشكل رئيسي 2 Listeria monocytogenes also infect neonates; elderly; immunocompromised children and adults. كبير؛ األطفال والبالغين الذين يعانون من نقص المناعة.كما تصيب الليستريا المستوحدة حديثي الوالدة Haemophilus influenzae infect children 6 months to 5 years سنوات5 أشهر إلى6 تصيب المستدمية النزلية األطفال من سن Neisseria meningitides infect all ages النيسرية السحائية تصيب جميع األعمار Streptococcus pneumoniae infect all ages; highest incidence in the young age أعلى نسبة في سن مبكرة.العقدية الرئوية تصيب جميع األعمار Specimens: As soon as infection of the central nervous system has suspected, blood samples has taken for culture and cerebrospinal fluid (CSF) has obtained. To obtain cerebrospinal fluid, perform lumbar puncture with strict technique. CSF is collected by aseptically inserting a needle into the subarachnoid space, usually at the level of the lumbar spine. CSF is usually collected in three to four portions of 2 – 5 ml each in sterile tubes, immediately labeled with the patient's name. CSF should be hand-delivered immediately to the laboratory. Specimens should never be refrigerated. Certain agents, such as Streptococcus pneumoniae, may not be detectable after an hour or longer unless antigen detection methods are used. If not rapidly processed, CSF should be incubated (35 °C) or left at room temperature. One exception to this rule involves CSF for viral studies. These specimens may be refrigerated for as long as 23 hours after collection or frozen at -70 °C if a longer delay is anticipated until they are inoculated. CSF for viral studies should never be frozen at temperatures above -70 °C. يتم أخذ عينات الدم للثقافة والحصول على السائل النخاعي، بمجرد االشتباه في إصابة ال جهاز العصبي المركزي:العينات يتم جمع السائل الدماغي النخاعي عن. قم بإجراء البزل القطني بتقنية صارمة، للحصول على السائل النخاعي.) CSF( عادة ما يتم جمع السائل. عادةً على مستوى العمود الفقري القطني، طريق إدخال إبرة معقمة في الفراغ تحت العنكبوتية. على الفور معنون باسم المريض، مل لكل منها في أنابيب معقمة5 – 2 الدماغي النخاعي في ثالثة إلى أربعة أجزاء من قد ال يمكن اكتشاف عوامل. ال ينبغي أبدًا تبريد العينات.يجب تسليم السائل الدماغي النخاعي باليد على الفور إلى المختبر إذا. بعد ساعة أو أكثر ما لم يتم استخدام طرق الكشف عن المستضد، Streptococcus pneumoniae مثل، معينة. درجة مئوية) أو تركه في درجة حرارة الغرفة35( يجب تحضين السائل الدماغي النخاعي، لم تتم معالجتها بسرعة ساعة بعد23 يمكن تبريد هذه العينات لمدة تصل إلى. للدراسات الفيروسيةCSF استثناء واحد لهذه القاعدة يتضمن ال ينبغي أبدًا تجميد. درجة مئوية إذا كان من المتوقع حدوث تأخير أطول حتى يتم تلقيحها70- جمعها أو تجميدها عند. درجة مئوية70- السائل الدماغي النخاعي للدراسات الفيروسية عند درجات حرارة أعلى من If bacterial meningitis has suspected, CSF is the best clinical specimen to use for isolation, identification, and characterization of the etiological agents. Suspected agents should include N. meningitides, S. pneumoniae, and H. influenzae and other pathogens in some cases. فإن السائل الدماغي النخاعي هو أفضل عينة سريرية الستخدامها في عزل، إذا اشتبه في التهاب السحايا الجرثومي والعصبية الرئوية، يجب أن تشتمل العوامل المشتبه فيها على المبيدات السحائية.العوامل المسببة وتحديدها وتوصيفها والمستدمية النزلية ومسببات األمراض األخرى في بعض الحاالت، 3 Microscopic Examination: Smears have made from all the sediment of centrifuged cerebrospinal fluid. False-positive smears have resulted from inadvertent use of contaminated slides. Using a cytospin centrifuge to prepare the slides for staining has also been found to be an excellent alternative procedure. Use of this method for preparing smears for staining concentrates cellular material and bacterial cells up to a 1000-fold. The presence or absence of bacteria, inflammatory cells, and erythrocytes should be reported following examination. نتجت اللطاخات اإليجابية الكاذبة عن. تم عمل مسحات من جميع رواسب السائل الدماغي النخاعي:الفحص المجهري كما وجد أن استخدام جهاز الطرد المركزي للسيتوسبين لتحضير الشرائح.االستخدام غير المقصود للشرائح الملوثة استخدام هذه الطريقة لتحضير مسحات لتلطيخ مركزات المواد الخلوية والخاليا البكتيرية حتى.للتلطيخ إجراء بديل ممتاز يجب اإلبالغ عن وجود أو عدم وجود البكتيريا والخاليا االلتهابية وكريات الدم الحمراء بعد الفحص. ضعف1000 Smears have stained with Gram stain. Study of stained smears under the oil immersion objective may reveal intracellular gram-negative diplococci (meningococci), extracellular lancet-shaped gram positive diplococci (pneumococci), or small gram-negative rods (Haemophilus influenzae or enteric gram-negative rods). قد تكشف دراسة المسحات الملطخة تحت هدف الغمر بالزيت عن مكورات ثنائية سالبة.المسحات ملطخة بصبغة جرام أو مكورات ثنائية إيجابية الجرام على شكل مشبك خارج الخلية (المكورات، )الجرام داخل الخاليا (المكورات السحائية.) أو قضبان صغيرة سالبة الجرام (المستدمية النزلية أو قضبان معوية سالبة الجرام، )الرئوية Culture: The culture methods used must help the growth of microorganisms most commonly encountered in meningitis. Sheep blood and chocolate agar together grow almost all bacteria that cause meningitis.. يجب أن تساعد طرق االستزراع المستخدمة في نمو الكائنات الحية الدقيقة األكثر شيوعًا في التهاب السحايا:الثقافة.ينمو دم األغنام وأجار الشوكوالتة معًا تقريبًا جميع البكتيريا المسببة اللتهاب السحايا 4 Follow-up Examination of Cerebrospinal Fluid فحص متابعة السائل الدماغي النخاعي The return of the cerebrospinal fluid glucose level and cell count toward normal is good evidence of adequate diagnosis and therapy. Neisseria meningitidis are gramnegative,coffee- bean shaped diplococci that may occur intracellularly or extracellularly in polymorphic nuclei (PMN) leukocytes. (PMNs or neutrophils are often more than 1000 WBCs/cu mm). Neisseria meningitidis is a fastidious organism, aerobic diplococci, which grows best at 35 – 37 °C with ~ 5% CO2 (or in a candle-jar). It can grow on both a blood agar plate (BAP) and a chocolate agar plate (CAP). Colonies of N. meningitidis are grey and unpigmented on a blood agar plate and appear round, smooth, moist, shiny, and convex, with a clearly defined edge. N. meningitidis appear as large, colorless - to - grey, opaque colonies on a chocolate agar plate. إن عودة مستوى الجلوكوز في السائل الدماغي النخاعي وعدد الخاليا إلى المستوى الطبيعي دليل جيد على التشخيص ا لنيسرية السحائية هي مكورات ثنائية النحوية على شكل حبة البن والتي قد تحدث داخل الخاليا أو.والعالج المناسبين WBCs 1000 أو العدالت أكثر منPMNs (غالبًا ما تكون.)PMN( خارجها في نوى الكريات البيض متعددة األشكال درجة37 – 35 تنمو بشكل أفضل عند، مكورات هوائية مزدوجة، النيسرية السحائية هي كائن حساس.) / cu mm )BAP( يمكن أن ينمو على كل من صفيحة أجار الدم.) من ثاني أكسيد الكربون (أو في وعاء شمعة٪ 5 مئوية مع حوالي مستعمرات النيسرية السحائية رمادية اللون وغير مصبوغة على صفيحة أجار الدم.)CAP( ولوحة أجار الشوكوالتة تظهر النيسرية السحائية على شكل مستعمرات. مع حافة محددة بوضوح، وتبدو مستديرة وناعمة ورطبة والمعة ومحدبة معتمة على طبق أجار الشوكوالتة، عديمة اللون – إلى – رمادية، كبيرة 5 Biochemical tests have recommended confirming the identity of cultures that morphologically appear to be N. meningitidis such as oxidase test (+) and carbohydrate utilization (acid production from glucose, maltose). If the oxidase test is positive, carbohydrate utilization testing should have performed. If the carbohydrate utilization test indicates that the isolate may be Neisseria meningitidis, serological tests to identify the serogroup should performed. Additional methods for identification and characterization of N. meningitidis using molecular tools like PCR technique. أوصت االختبارات الكيميائية الحيوية بتأكيد هوية الثقافات التي تبدو شكليًا أنها النيتروجين السحائي مثل اختبار أوكسيديز فيجب إجراء، إذا كان اختبار أوكسيديز إيجاب ًيا.)) واستخدام الكربوهيدرات (إنتاج الحمض من الجلوكوز والمالتوز+( Neisseria إذا كان اختبار استخدام الكربوهيدرات يشير إلى أن العزلة قد تكون.اختبار استخدام الكربوهيدرات طرق إضافية لتحديد وتوصيف النيسرية. فيجب إجراء االختبارات المصلية لتحديد المجموعة المصلية، meningitidis السحائية باستخدام أدوات جزيئية مثل تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل Streptococcus pneumoniae: may occur intracellularly or extracellularly as grampositive diplococci, but can also occur as single cocci or in short chains of cocci. S. pneumoniae is a fastidious bacterium, growing best at 35 – 37 °C with ~ 5% CO2 (or in a candle-jar). It is usually culturing on media that contain blood, but can also grow on a chocolate agar plate (CAP). On a blood agar plate (BAP), colonies of S. pneumoniae appear as small, grey, moist (sometimes mucoid), colonies & characteristically produce a zone of alpha-hemolysis (green). ولكن يمكن أن تحدث أيضًا على شكل، قد تحدث داخل الخاليا أو خارجها على شكل مكورات ثنائية النواة:العقدية الرئوية تنمو بشكل، هي بكتيريا شديدة الحساسيةS. Pneumoniae.مكورات مفردة أو في سالسل قصيرة من المكورات عادة ما يتم تربيته على.) من ثاني أكسيد الكربون (أو في وعاء شمعة٪5 درجة مئوية مع حوالي37 – 35 أفضل عند )BAP( على صفيحة آجار الدم.)CAP( ولكن يمكن أن ينمو أيضًا على طبق أجار الشوكوالتة، وسائط تحتوي على دم وتنتج، ) رطبة (في بعض األحيان مخاطية، رمادية، تظهر مستعمرات العقدية الرئوية على شكل مستعمرات صغيرة،.)بشكل مميز منطقة انحالل الدم ألفا (خضراء The alpha-hemolytic property differentiates this organism from many species, but not from the commensal alpha-hemolytic (Viridans) streptococci. Differentiating pneumococci from viridans streptococci is difficult as young pneumococcal colonies appear raised, similar to viridans streptococci. However, once the pneumococcal culture ages 24-48 hours, the colonies become flatten, & the central portion becomes depressed, which does not occur with viridans streptococci. ولكن ليس من العقديات االنحاللية ألفا المتعايشة، تميز خاصية انحالل الدم ألفا هذا الكائن الحي عن العديد من األنواع يصعب التمييز بين المكورات الرئوية والمكورات العقدية فيريدان حيث تظهر مستعمرات المكورات الرئوية.)Viridans( بمجرد أن تتراوح أعمار مزرعة المكورات الرئوية من، ومع ذلك. على غرار المكورات العقدية فيريدان، الشابة مرتفعة وهو ما ال يحدث مع المكورات العقدية، ويصبح الجزء المركزي مكتئبًا، تصبح الخاليا مسطحة، ساعة48 إلى24.فيريدان 6 identification and characterization procedures, it is essential to test alphahemolytic colonies that are less than a day old, typically grown overnight at 35 – 37 °C with ~ 5% CO2 (or in a candle-jar). The specialized tests have used to identify colonies on a blood agar that resemble pneumococci. Streptococcus pneumoniae can be identified using Gram stain, catalase (-), and optochin tests. وعادة ما، من الضروري اختبار المستعمرات الحالة للدم والتي يقل عمرها عن يوم واحد، إجراءات التحديد والتوصيف استخدمت.) من ثاني أكسيد الكربون (أو في وعاء شمعة٪ 5 درجة مئوية مع حوالي37 – 35 تنمو طوال الليل عند يمكن التعرف على.االختبارات المتخصصة لتحديد المستعمرات الموجودة على أجار الدم التي تشبه المكورات الرئوية optochin و، )-( الكاتالز، العقدية الرئوية باستخدام اختبارات صبغة جرام If these tests indicate that, the isolate is S. pneumoniae, then serological tests used to identify the serotype caught performed. Additional methods for identification and characterization of S. pneumoniae using molecular tools. Haemophilus influenzae are small, pleomorphic, gram- negative bacilli or Coccobacilli with random arrangements. H. influenzae is a fastidious organism, which grows at 35 – 37 °C with ~ 5% CO2 (or in a candle-jar) and requires haemin (X factor) and nicotinamideadenine-dinucleotide(NAD, also known as V factor) for growth. The standard medium used for growth of H. influenzae is a chocolate agar plate, which can be prepared with heat-lysed horse blood, a good source of both haemin and NAD, although sheep blood can also be used. H. influenzae appear as large, round, smooth, convex, colorless- to-grey, cloudy colonies on a CAP. يتم إجراء االختبارات المصلية المستخدمة لتحديد، S. Pneumoniae إذا كانت هذه االختبارات تشير إلى أن العزلة هي المستدمية. طرق إضافية لتحديد وتوصيف العقدية الرئوية باستخدام األدوات الجزيئية.النمط المصلي الذي تم اصطياده المستدمية. سالبة الجرام أو عصيات بكتيرية مع ترتيبات عشوائية، متعددة األشكال، النزلية عبارة عن عصيات صغيرة من ثاني أكسيد الكربون (أو في٪5 درجة مئوية مع حوالي37-35 النزلية من الكائنات الحية الدقيقة التي تنمو عند المعروف أيضًا باسم العامل، NAD( ثنائي النوكليوتيد-) والنيكوتيناميددينينX وعاء شمعة) وتتطلب الهيمين (العامل والتي يمكن، الوسيط القياسي المستخدم لنمو المستدمية النزلية هو صفيحة آجار الشوكوالتة.الخامس) من أجل نمو على الرغم من أنه يمكن أيضًا، NAD وهو مصدر جيد لكل من الهيمين و، تحضيرها بدم الحصان المتحلل بالحرارة عديمة اللون إلى، محدبة، ناعمة، مستديرة، تظهر المستدمية النزلية على شكل مستعمرات كبيرة.استخدام دم األغنام. غائمة على الغطاء النباتي، الرمادي 7 H. influenzae produce a sharp indole smell, plate should not be opened in order to smell the cultures. H. influenzae cannot grow on an unsupplemented blood agar plate (the blood used in chocolate agar is heated to inactivate nonspecific inhibitors of Haemophilus influenzae growth). ال يمكن أن تنمو المستدمية النزلية. وال ينبغي فتح الصفيحة لتشم المزروعات، تنتج المستدمية النزلية رائحة إندول حادة على صفيحة أجار الدم غير المكتملة (يتم تسخين الدم المستخدم في آجار الشوكوالتة لتعطيل مثبطات غير محددة لنمو المستدمية النزلية Biochemical tests have recommended confirming the identity of cultures that morphologically appear to be H. influenzae. H. influenzae caught identified using Kovac's oxidase test and determining the necessity of haemin and NAD as growth requirements. If the oxidase test is positive, haemin and NAD growth factor requirement testing should have performed. If the growth factor requirement test indicates that the isolate may be H. influenzae, serological tests to identify the serotype should have performed. Additional methods for identification and characterization of H. influenzae using molecular tools like PCR technique. تم التعرف على المستدمية.أوصت االختبارات البيوكيميائية بتأكيد هوية الثقافات التي يبدو شكليًا أنها المستدمية النزلية إذا كان اختبار. كمتطلبات للنموNAD وتحديد ضرورة الهيمين وKovac النزلية المصابة باستخدام اختبار أوكسيديز إذا كان اختبار متطلبات عامل النمو يشير.NAD فيجب إجراء اختبار متطلبات عامل النمو للهيمين و، أوكسيديز إيجابيًا طرق إضافية. فيجب إجراء االختبارات المصلية لتحديد النمط المصلي، إلى أن العزلة قد تكون من المستدمية النزلية.لتحديد وتوصيف المستدمية النزلية باستخدام األدوات الجزيئية مثل تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل 8 Bacterial infections of respiratory tract االلتهابات البكتيرية في الجهاز التنفسي The respiratory tract is the most common frequent site of infection by pathogens, because it comes in direct contact with the physical environment and is exposed to airborne microorganisms. A wide range of organisms can infect the respiratory tract, including viruses, bacteria, fungi and parasites. ألنه يتالمس بشكل مباشر مع البيئة المادية، الجهاز التنفسي هو الموقع األكثر شيوعًا لإلصابة بمسببات األمراض يمكن لمجموعة كبيرة من الكائنات الحية أن تصيب الجهاز التنفسي.ويتعرض للكائنات الحية الدقيقة المحمولة بالهواء. بما في ذلك الفيروسات والبكتيريا والفطريات والطفيليات، Nearly all of the surfaces of the respiratory tract (nasal and oral passages, nasopharynx, oropharynx, trachea, bronchi, bronchioles, and alveolar sacs) are colonized by the host microbiota. These organisms are inhabitants of the respiratory tract and rarely cause disease. والقصبة الهوائية، والبلعوم الفموي، والبلعوم األنفي، تقريبًا جميع أسطح الجهاز التنفسي (الممرات األنفية والفموية هذه الكائنات. واألكياس السنخية) مستعمرة من قبل الكائنات الحية الدقيقة المضيفة، والقصيبات، والشعب الهوائية،.ونادرا ما تسبب المرض ً تعيش في الجهاز التنفسي The microbiota of the respiratory tract has two main functions important in maintaining the healthy state of the host: للميكروبات في الجهاز التنفسي وظيفتان رئيسيتان مهمتان في الحفاظ على الحالة الصحية للمضيف 1. These organisms compete with pathogenic organisms for potential attachment sites, and و، تتنافس هذه الكائنات الحية مع الكائنات المسببة لألمراض على مواقع التعلق المحتملة 2. They can produce substances that are bactericidal and prevent infection by pathogens. يمكن أن تنتج مواد مبيدة للجراثيم وتمنع العدوى بمسببات األمراض Recent studies have shown that there are from 10-100 bacterial cells per 1000 lung cells. Many of the organisms in the lower respiratory tract microbiota do not grow on media commonly used to grow bacteria. Pathogenic organisms inhaled or aspirated into the lower respiratory tract are usually eliminated by alveolar macrophages. Alveolar macrophages are considered the most important means of eliminating pathogenic organisms that enter the lungs. ال تنمو العديد من الكائنات الحية. خلية رئوية1000 خلية بكتيرية لكل100-10 أظهرت الدراسات الحديثة أن هناك من عادة ما يتم.الدقيقة الموجودة في الجراثيم في الجهاز التنفسي السفلي على الوسائط التي يشيع استخدامها لنمو البكتيريا التخلص من الكائنات المسببة لألمراض التي يتم استنشاقها أو استنشاقها في الجهاز التنفسي السفلي بواسطة الضامة. تعتبر الضامة السنخية أهم وسيلة للقضاء على مسببات األمراض التي تدخل الرئتين.السنخية Respiratory system has divided into two major parts: ينقسم الجهاز التنفسي إلى قسمين رئيسيين - Upper respiratory tract includes (nose and pharynx) )الجهاز التنفسي العلوي ويشمل (األنف والبلعوم - Lower respiratory tract includes (larynx, trachea, bronchial tube and alveoli)..)الجهاز التنفسي السفلي يشمل (الحنجرة والقصبة الهوائية والقصبات الهوائية والحويصالت الهوائية 1 Each part of organ of this system has own resident microflora. Many factors play a vital role in challenging and limitation of number and type of microflora colonizing. Also each parts of respiratory tract having physical factors such as hair, mucus membrane lining the tract, cilia movement, sneezing, coughing besides oxygen tension in lung, which act all collectively as unbreakable defense line. In addition, innate immunity and circulating antibodies stabilize natural balance, which represents equilibrium state between host immunity and action of pathogens. Ear, eye and nose are all share common canal, so any infection of one of these parts may cause infection to others. Nasal cavity for example consider as a reservoir for genus Staphylococcus along with other gram-negative bacteria. Nasal cavity is the pathway for deeper parts of respiratory tract for example resident bacteria of nasal cavity may and will find its way to the system causing problems here location and to nervous system such as meningitis. دورا حيويًا في تحدي والحد من عدد ونوع ً تلعب العديد من العوامل.كل جزء من أعضاء هذا النظام له نباتات دقيقة مقيمة كما أن كل جزء من أجزاء الجهاز التنفسي له عوامل فيزيائية مثل الشعر والغشاء المخاطي المبطن.البكتيريا المستعمرة والتي تعمل مجتمعة كخط دفاع غير قابل، للقناة وحركة األهداب والعطس والسعال باإلضافة إلى توتر األكسجين في الرئة والذي، تعمل المناعة الفطرية واألجسام المضادة المنتشرة على استقرار التوازن الطبيعي، باإلضافة إلى ذلك.للكسر تشترك كل من األذن والعين واألنف في القناة المشتركة.يمثل حالة التوازن بين مناعة المضيف وعمل مسببات األمراض يعتبر تجويف األنف على سبيل المثال خزانًا للجنس. لذا فإن أي إصابة في أحد هذه األجزاء قد تسبب العدوى لآلخرين، تجويف األنف هو المسار ألجزاء أعمق من الجهاز. جنبًا إلى جنب مع البكتيريا األخرى سالبة الجرامStaphylococcus التنف سي على سبيل المثال قد تجد البكتيريا المقيمة في تجويف األنف طريقها إلى الجهاز مما يسبب مشاكل في الموقع.والجهاز العصبي مثل التهاب السحايا Ear infection, on other hand may be the way for enteric bacteria to reach to unlimited area in respiratory or nervous systems. E. coli meningitis is one example among many of such cases. قد تكون عدوى األذن هي السبيل لوصول البكتيريا المعوية إلى منطقة غير محدودة في الجهاز التنفسي، من ناحية أخرى. يعد التهاب السحايا باإلشريكية القولونية أحد األمثلة من بين العديد من هذه الحاالت.أو الجهاز العصبي Tonsils are the major front line of defense, yet, it is frequently had infected with so many species of bacteria, Gram-negative as well as Gram-positive bacteria. سالبة الجرام وكذلك البكتيريا، غال ًبا ما يكون مصا ًبا بالعديد من أنواع البكتيريا، ومع ذلك، اللوزتان هما خط الدفاع األول.موجبة الجرام 2 Infection of respiratory tract sometimes classified as adult or childhood infections in this regard, Bordetella pertussis the causative agents of whooping cough is the example of childhood infections. Respiratory infections may have classified as accidental or seasonal infections. The latter has associated with possible changes in the weather, from winter to summer and vice versa, bacterial infection may come second to viral infection in this aspect. Accidental infection is the infection that acquired during daily life. No limitation for the types of bacteria that may cause infection to respiratory system regardless the way that bacteria inter the system. ويعتبر بورديتيال السعال، تصنف عدوى الجهاز التنفسي أحيانًا على أنها عدوى لدى البالغين أو األطفال في هذا الصدد ً قد تصنف التهابات الجهاز التنفسي على أنها.مثاال على التهابات األطفال الديكي من العوامل المسببة للسعال الديكي من الشتاء إلى الصيف والعكس صحيح، وقد ارتبط هذا األخير بالتغيرات المحتملة في الطقس.عدوى عرضية أو موسمية العدوى العرضية هي العدوى التي. وقد تأتي العدوى البكتيرية في المرتبة الثانية بعد العدوى الفيروسية في هذا الجانب، ال توجد قيود على أنواع البكتيريا التي قد تسبب عدوى للجهاز التنفسي بغض النظر عن.تحدث خالل الحياة اليومية.الطريقة التي تتداخل بها البكتيريا مع الجهاز التنفسي Most of normal flora of upper respiratory tract plays an important role in causing opportunistic disease. Staphylococcus, Streptococcus, Haemophilus, Corynebacterium, Neisseria, Bacteroides, Fusobacterium, and Actinomyces, are typical examples for these bacteria. Nearly any type of gram-positive or negative bacteria pneumonia, Mycoplasma, and Chlamydia spp., can cause respiratory infection. On other hand may cause non-specific pneumonia, while Tuberculosis caused by Mycobacterium tuberculosis complex, both of these diseases involved lower respiratory tract. المكورات العنقودية.دورا مه ًما في التسبب في المرض االنتهازيً تلعب معظم الفلورا الطبيعية في الجهاز التنفسي العلوي. هي أمثلة نموذجية لهذه البكتيريا، واألكتينوميسيس، المغزلية، البكتيرويد، النيسرية، الوتدية، المستدمية، العقدية، ، والكالميديا، والميكوبالزما، يمكن أن يتسبب أي نوع من أنواع االلتهاب الرئوي البكتيري الموجب أو السالب الجرام في حين أن السل الذي تسببه، من ناحية أخرى قد يسبب االلتهاب الرئوي غير النوعي.في التهابات الجهاز التنفسي كال هذين المرضين يشمل الجهاز التنفسي السفلي، المتفطرة السلية المعقدة Sore throat is a common infection of upper respiratory tract caused specially by hemolytic streptococci, besides other gram-positive cocci or gram-negative bacilli (Haemophilus spp.). The middle and inner ear are normally sterile, while outer ear and auditory canal contain the normal flora of mouth and nose. إلى جانب، التهاب الحلق هو عدوى شائعة في الجهاز التنفسي العلوي ناتجة بشكل خاص عن العقديات الحالة للدم عادة ما تكون األذن الوسطى.).Haemophilus spp( العصيات األخرى إيجابية الجرام أو العصيات سلبية الغرام. بينما تحتوي األذن الخارجية والقناة السمعية على الفلورا الطبيعية للفم واألنف، والداخلية معقمة When a person cough, sneezes or blow the nose these microorganisms may reach middle or inner ear and causing infection. Tears in eyes decreases the number of microorganisms that may find its way to eye because it's content of lysozyme that destroys bacterial cells قد تصل هذه الكائنات الدقيقة إلى األذن الوسطى أو الداخلية وتسبب، عندما يسعل الشخص أو يعطس أو ينفث أنفه تقلل الدموع في العين من عدد الكائنات الحية الدقيقة التي قد تجد طريقها إلى العين ألن محتواها من الليزوزيم.العدوى الذي يدمر الخاليا البكتيرية 3 Bronchitis التهاب شعبي 1- Acute bronchitis: It is an acute inflammation of the tracheobronchial tree generally self- limited and the eventual (final) complete healing and return of function. Causative agent: Mycoplasma pneumonia; Bordetella pertussis. ) وهو التهاب حاد يصيب شجرة القصبة الهوائية بشكل عام ويؤدي إلى الشفاء التام (النهائي:التهاب الشعب الهوائية الحاد البورديتيلة السعال الديكي. االلتهاب الرئوي الميكوبالزما: العامل المسبب.والعودة للوظيفة Laboratory diagnosis: Specimen: sputum Procedure: Gram staining, Culture, Biochemical and Serological test for microbe identification. اختبار الكيمياء الحيوية والمصل لتحديد الميكروبات، الثقافة، تلطيخ الجرام: إجراء البلغم: العينة:التشخيص المختبري 2- Chronic bronchitis: It has defined as chronic productive cough for at least three months in each of two successive years. يعرف بأنه السعال المزمن المنتج لمدة ثالثة أشهر على األقل في كل عام من سنتين متتاليتين:التهاب القصبات المزمن Causative factors: Cigarette smoking; Air pollution; Exposure to harmful stimuli. تلوث الهواء؛ التعرض للمنبهات الضارة. تدخين السجائر:العوامل المسببة Bacteria that improve chronic bronchitis are: البكتيريا التي تحسن التهاب الشعب الهوائية المزمن هي - Streptococcus pneumonia - Haemophilus influenza - Mycoplasma pneumonia - Branhamella catarrhalis Laboratory diagnosis: Specimen: sputumالبلغم Procedure: Gram staining, Culture, Biochemical and Serological test for microbe identification. اختبار الكيمياء الحيوية والمصل لتحديد الجراثيم، الثقافة، تلطيخ الجرام:اإلجراء Pneumonia It is infection of the lung parenchyma. Causative agents: العوامل المسببة.االلتهاب الرئوي هو عدوى لحمة الرئة - Streptococcus pneumonia, االلتهاب الرئوي العقدية - Staphylococcus aureus, المكورات العنقودية الذهبية - Haemophilus influenzae المستدمية النزلية - Mycoplasma pneumonia..االلتهاب الرئوي الميكوبالزما Route of entry of microbes to the lung: طريق دخول الميكروبات الى الرئة - Aspiration of oral and gastric secretion شفط إفرازات الفم والمعدة - Haematogenous spread from distant foci انتشار الدم من بؤر بعيدة - Direct inoculation and local spread from surrounding tissue التلقيح المباشر واالنتشار الموضعي من األنسجة المحيطة - Inhalation استنشاق 4 Laboratory diagnosis: Specimen: Lower respiratory secretion which indicated by greater than 25 neutrophils and less than 10 squamous epithelial cells per high power field. Procedure: Gram staining, Culture, Biochemical and Serological test for microbe identification. خاليا ظهارية حرشفية10 من العدالت وأقل من25 إفراز الجهاز التنفسي السفلي والذي يشير إلى وجود أكثر من:العينة اختبار الكيمياء الحيوية والمصل لتحديد الجراثيم، الثقافة، تلطيخ الجرام: اإلجراء.لكل مجال عالي القدرة Bacterial Diagnosis of TB infection التشخيص الجرثومي لعدوى السل Tuberculosis مرض الدرن It is a disease caused by group of Mycobacterium spp., namely Mycobacterium tuberculosis complex. Mycobacterium tuberculosis is of human origin, M. bovis is of cattle origin, M. africanum is predominantly isolated in different parts of Africa cause TB in humans, M. microti causes TB mainly in small rodents like voles, and M. canetti can cause TB in humans. Mycobacterium tuberculosis. وهي معقد المتفطرة السلية، وهو مرض تسببه مجموعة من المتفطرة السلية معزول في الغالب في أجزاء مختلفة من إفريقياM. Africanum ، من أصل ماشيM. Bovis ، من أصل بشري ويمكن أن يسبب، يسبب السل بشكل رئيسي في القوارض الصغيرة مثل الفأرM. Microti ، يسبب السل في البشر. في البشر. السلM. Canetti 1- Their high resistance to environmental stress such as dryness..مقاومتها العالية لإلجهاد البيئي مثل الجفاف 2- Survive in dry sputum for months..البقاء على قيد الحياة في البلغم الجاف لعدة أشهر 3- Members of genus mycobacterium are very resistant to chemical and antibiotic treatment. أفراد المتفطرات الجنسية شديدة المقاومة للعالج الكيميائي والمضادات الحيوية All these features are because of their highly contents of cell wall of lipids. Cell wall lipid content makes these bacteria difficult to stain with ordinary stains. Therefore, special stain is required (Acid Fast Stain; AFS). محتوى دهون جدار الخلية يجعل من الصعب تلطيخ.كل هذه الميزات بسبب محتواها العالي من جدار الخلية من الدهون.)AFS ؛Acid Fast Stain( تلزم صبغة خاصة، لذلك.هذه البكتيريا بالبقع العادية AFS depends on penetration of carbolfuchsin dye to cell wall with aid of heat, once it is in there, a complex of stain and lipid of cell wall is formed this complex is not removed by normal decolorizing agent (alcohol), it resists even the decolorizing with acid alcohol from which it takes its name (Acid Fast Bacteria). يتم تكوين، بمجرد وجوده هناك، في جدار الخلية بمساعدة الحرارةcarbolfuchsin على تغلغل صبغةAFS يعتمد بل يقاوم، ) وال تتم إزالة هذا المركب بواسطة عامل إزالة اللون الطبيعي (الكحول، مجمع من البقع والدهون لجدار الخلية.)Acid Fast Bacteria( حتى إزالة اللون مع الكحول الحمضي الذي يأخذ منه اسمه 5 Air born droplets, milk, or even prolonged contact with sick peoples consist collectively the major pathways for transmission of disease, yet, air born route of entry, fine particles containing one or two TB. Cells travels from patient for a distance of one meter to another person (air born) will enough to cause a disease in susceptible individual; normally these bacteria are overcoming by host defense. تتكون القطيرات المحمولة بالهواء أو الحليب أو حتى االتصال المطول مع المرضى بشكل جماعي من المسارات الرئيسية والجسيمات الدقيقة التي تحتوي على واحد أو اثنين من، فإن طريق الدخول عبر الهواء، ومع ذلك، النتقال المرض تنتقل الخاليا من المريض لمساف ة متر واحد إلى شخص آخر (مولود في الهواء) مما يكفي إلحداث مرض في األفراد.السل المعرضين لإلصابة ؛ عادة يتم التغلب على هذه البكتيريا عن طريق دفاع المضيف If bacteria succeeded to penetrate host defense, then alveoli will the battlefield (area) of the disease. فإن الحويصالت الهوائية ستكون ساحة المعركة (منطقة) المرض، إذا نجحت البكتيريا في اختراق دفاع المضيف Bacilli are multiply in macrophages protect themselves against killing process, in a self- protection process host try to limit the drastic (severe) effect of the pathogen by forming a tubercle, which is a matrix tissues, exudates, WBCs, and other materials. Mycobacterium tuberculosis, tend to arrange in cord formation, which increase the immune response of host resulting in what is called hypersensitivity reaction which lead ultimately to issue damage. في عملية الحماية الذاتية يحاول المضيف الحد من التأثير، تتكاثر العصيات في البالعم تحمي نفسها من عملية القتل ، كرات دم بيضاء، إفرازات، وهي عبارة عن أنسجة مصفوفة، الحاد (الشديد) للعامل الممرض عن طريق تكوين درنة مما يزيد من االستجابة المناعية للمضيف مما يؤدي، تميل المتفطرة السلية إلى الترتيب في تكوين الحبل.ومواد أخرى.إلى ما يسمى تفاعل فرط الحساسية الذي يؤدي في النهاية إلى إحداث ضرر Laboratory diagnosis: Mycobacterium may come from a wide range of samples, these include; sputum, lung wash, urine, wound, CSF, lymph secretion, and gastro-intestinal. السائل، الجرح، البول، غسيل الرئة، وتشمل هذه ؛ البلغم، قد تأتي المتفطرة الفطرية من مجموعة واسعة من العينات والجهاز الهضمي، إفراز الليمفاوية، النخاعي The prime diagnostic parameter is culturing of materials (regardless the origin of it) on suitable culture medium, the medium commonly used as Lowenstein- Jensen medium (LJM), enriched media with high contents of nutrition to aid the long period of incubation.