Variaciones en la Estructura del ADN PDF

Tema 6. VARIACIONES A LA ESTRUCTURA DEL DNA No todo DNA está en el Beta Puede tomar diferentes formas Al tener interacción con otras proteínas su estructura va a cambiar las más comunes son la A y la Z( Son variaciones locales) La estándar es la beta Estas variaciones son importantes en rep...

Tema 6. VARIACIONES A LA ESTRUCTURA DEL DNA No todo DNA está en el Beta Puede tomar diferentes formas Al tener interacción con otras proteínas su estructura va a cambiar las más comunes son la A y la Z( Son variaciones locales) La estándar es la beta Estas variaciones son importantes en replicar la transcripción del DNA La estándar es la DNA B Habrá algunas partes que serán: DNA A que se da por deshidratación, resorte donde se va a comprimir (más chico pero más ancho). Características: más ancha, más corta, más numero de bases de por vuelta y eso modifica los surcos que son más estrechos. DNA Z resorte se va a estirar y va a quedar hebra más estrecha pero más larga. Los surcos “se pierden”, no tienen profundidad y por eso no se forman adecuadamente Importan: forma y tamaño A (deshidratada) - B (Watson-Crick) - Z (Rich-Dickerson) Ancha y corta - intermedia - estrecha y larga Sentido de la hélice: dextrógiro - dextrógiro - levógiro Pares de bases por vuelta: 11 - 10,4 - 12 A B Z deshidratada Watson-Crick Rich-Dickerson A B Z Ancha y corta Intermedia Estrecha y larga Dextrógiro dextrógiro levógiro 11 10,4 12 Curvaturas de la doble hélice Si se asocia o no con proteínas Palíndromos= aquellas regiones de un ADN cuya secuencia es la misma en ambas hebras En hebras opuestas. Si doy un giro de 180° queda la misma secuencia Misma secuencia en la 5´y en la 5´, por eso se lee igual ¿Para qué es importante es un palíndromo en mi DNA? Van a ser secuencias que las reconocen las proteínas identificadas y que dirán “aquí me pego”. Todas las interacciones con DNA es con secuencias Misma secuencia en hebras opuestas no en la misma y serían complementarias o se pueden doblar Palíndromo se lee igual, puede rotar Palíndromo interrumpido: pequeña secuencia separa las dos mitades de palíndromo y actúa por tanto como centro de simetría no puntual (secuencia aleatoria) S i m i p a l í n d ro m o d e h e b r a s e n c i l l a o d o b l e , q u e s o n complementarias porque se leían iguales se podrían doblar o interaccionar entre ellas Es una secuencia que si se dobla se complementa Para que me sirve esto? Porque si es complementaria va a formar lo que se llama una horquilla sencilla porque mi hebra es sencilla En DNA al ser una hebra doble, se forma una estructura cruciforme, es decir la de arriba y la de abajo se complementa ¿Qué pasa con palíndromos interrumpidos? Se complementan las hebras y lo que interrumpe se queda libre y se llama BUCLE Si fuese doble hebra.. tengo estructura cruciforme con bucle Son importantes porque cuando viene toda la maquinaria de la transcripción y se encuentra con una estructura de este tipo, la para Son secuencias estructurales importantes en otras estructuras como el RNA. Contribuyen a la terminación de la transcripción. En DNA dúplex actúa con sitios de reconocimiento al que se unen proteínas reguladoras. Hay otro tipo de DNA que le llamamos de triple hebra, triple hélice o DNA H (Hoogsten): Estructura poco habitual formada por tres hebras: una triple hélice Una que es muy rica en purinas, la de arriba muy rica en piridiminas Purinas se asocian por tres puentes de hidrógeno Atrae a hebra débil y deja desapareada a mi otra hebra Porque se hace por puentes que les llaman de Hoogsten, el DNA tiene que estar en doble hebra. Parte de la doble hélice se abre y la hebra rica en C y T se repliegue y se aparee con la otra hebra (rica en AG) mediante enlaces Hoogsten, quedando libres átomos electro negativos listos para aparearse con la hebra desapareada Estructuras del orden superior Asociarse en doble hebra Estructuras del orden superior Si vuelvo a enrollar doble hebra se llama superenrrollamiento Condensación - nivel estructural de orden superior DNA -> Superenrrollamiento Genoma humano 6,6 x 10´9 pb = 2,2 m longitud en forma de Superenrrollamiento “enrollar algo que ya esta enrollado Retorcimiento o giro sobre sí mismo de la doble hélice Cuando se enrolla va a ganar o perder vueltas 10,5 pb/vuelta Superenrollamiento negativo= perdió vueltas pero ganó pb Superenrrollamiento positivo = ganó vueltas pero perdió pb Dna en las células tiene superenrollamiento negativo Estructuras del orden superior en RNA RNA mensajero, carece de estructura tridimensional ni definida, va a depender de la secuencia que tenga, es el más sencillo RNA de transferencia: toma una estructura a través de palíndromos que le llaman brazos, importancia recae en que va a tener un brazo con el que tiene un aminoácido y otro brazo con el que va ir leyendo mi mensaje. Mediador entre mensaje del RNA y la proteína. Me da capacidad de interaccionar con aminoácido y de interaccionar con mi mensaje. Tengo una estructura definida con palíndromos RNA ribosomal: es el más flexible, el más largo, compuesto de N secuencias palindrómicas. Es el soporte estructural y componente principal de los ribosomas. Es el más complejo por hebras flexibles y es más grande. Hasta 75% del DNA total de una célula. Estos 3 RNAS están en proporciones diferentes. RNA Mensajero - 5% RNA Ribosomático - 75% necesita más porque está sintetizando proteínas rRNA 20% Subunidades 16s, 23s y 5s en procariotes (me da género y especie) 18s, 5,8s, en eucariotas Tengo fragmentos que van a codificar diferentes tamaños de DNa, éste dona se asocia a las proteínas con pequeñas y grandes subunidades. La S es un coeficiente de sedimentación Ribosoma se puede asociar o disociar Condensación - ir comprimiendo Se asocian con proteinas para que ocurra esto Histonas son altamente conservadas, proteínas básicas Histona H1, H2A, H2B, H3, H4 Car que tiene que tener proteína tiene que tener carga positiva y el DNA negativa y así se atraen HISTONAS : 2 H2A, A este conjunto se le llama octánero La h1 se cree que es de soporte A esto se le llama nucleosoma, compuesto de 8 proteínas de HISTONA se asocia con el DNA y va a formar un nucleosoma El nucleosoma es mi unidad básica de condensación Condensación 4 niveles: fibra 10 nm- DNA doble cadena se asocia con mi nucleosoma y a esto ese le llama de fibra de 10 nm n(primer nivel de condensación) si esto lo enrollo sería mi 2do nivel que se llama fibra de 30 nm o solenoide Si a esto a un asa eucromatina sería el nivel 3 de condensación Heterocromatina 4to nivel de condensación donde se vuelve a disponer se conoce como cromosoma metafase (ya no pueden tener interacciones Se descondensa y en eucromatina ya es legible y solo se desenrolla Nucleosoma 8 histomas