De l’ADN à la protéine Cours #7 PDF

De l’ADN à la protéine Cours #7 Oliver Hartley 7.10.24 De l’ADN à la protéine: cours #7 Le code génétique: codons L’ARNt – une molécule adaptatrice Les ARNt synthétases: charger les molécules adaptatrices La formation dirigée des liaisons peptidiques Trois cad...

De l’ADN à la protéine Cours #7 Oliver Hartley 7.10.24 De l’ADN à la protéine: cours #7 Le code génétique: codons L’ARNt – une molécule adaptatrice Les ARNt synthétases: charger les molécules adaptatrices La formation dirigée des liaisons peptidiques Trois cadres de lecture __________________________________________________________ La machine ribosomale Des cycles de synthèse protéique Le début et la fin de la traduction Pour vos questions pendant et après les cours https://web.speakup.info/room/join/18045 Rappel: cours de Martina Valentini ARNr ARNm ARNt Notre sujet d’aujourd’hui: la traduction ARNm région région non- codante codante queue poly(A) coiffe protéine La pierre de Rosette Les protéines: chaînes polypeptidiques Chaînes Squelette polypeptdique latérales Extrémité amine Extrémité carboxyle ou N-terminale ou C-terminale Liaisons peptidiques Liaison peptidique Chaînes latérales Codage: 4 bases pour 20 acides aminés carbone a groupe groupe amine carboxyle chaîne latérale Le code génétique Francis Crick & Sydney Brenner Robert Holley, Har Gobind Khorana & Marshall Nirenberg Théorie du code génétique Explication complète du code génétique, Prix Nobel publiée en 1961 (Médecine) 1968 Le code génétique: 64 codons (4 x 4 x 4) Acide aminé Codons (5’ à 3’) Ala A GCA GCC GCG GCU Arg R AGA AGG CGA CGC CGG CGU Asp D GAC GAU Asn N AAC AAU Cys C UGC UGU Glu E GAA GAG Gln Q CAA CAG Gly G GGA GGC GGG GGU His H CAC CAU Ile I AUA AUC AUU Leu L UUA UUG CUA CUC CUG CUU Lys K AAA AAG Met M AUG Phe F UUC UUU Pro P CCA CCC CCG CCU Ser S AGC AGU UCA UCC UCG UCU Thr T ACA ACC ACG ACU Trp W UGG Tyr Y UAC UAU Val V GUA GUC GUG GUU STOP UAA UAG UGA Rappel: cours de Martina Valentini L’ARNt: une molécule adaptatrice W Acide aminé ARNt 3’ A C C 5’ U G G 5’ 3’ ARNm  Les ARNt: des molécules adaptatrices W T K V 3’ A C C 5’ 3’ U G A 5’ 3’ U U C 5’ 3’ G A G 5’ U G G A C U A A G G U C 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’ Au moins 1 ARNt pour chaque codon (sauf les STOP)  Pour charger les molécules adaptatrices: les ARNt synthétases acide aminé (tryptophane) reconnaissance W moléculaire Liaison riche ARNt en énergie (ARNttrp) liaison de l’acide aminé à l’ARNt ARNt synthétase (tryptophanyl-ARNt synthétase) 20 ARNt synthétases: 1 pour chaque acide aminé  Formation dirigée des liaisons peptidiques V 1 2 3 4 Peptidyl-ARNt attaché au C-terminal de la chaîne polypeptydique Nouvelle molecule de peptidyl-ARNt attachée au C-terminal de la chaîne 5’ 3’ polypeptydique  Trois cadres de lecture 1: Ser-Leu-Ser-Arg V Ser Leu Ser Arg U C A G A U A G G U C U A G U C U A U C C A G A A G C 5’ 3’  Trois cadres de lecture 1: Ser-Leu-Ser-Arg V 2: Val-Tyr-Pro-Glu Val Tyr Pro Glu C A G A U A G G U C U U A G U C U A U C C A G A A G C 5’ 3’  Trois cadres de lecture 1: Ser-Leu-Ser-Arg V 2: Val-Tyr-Pro-Glu Ser Ile Gln Lys 3: Ser-Ile-Gln-Lys A G A U A G G U C U U C A G U C U A U C C A G A A G C 5’ 3’  Trois cadres de lecture 1: Ser-Leu-Ser-Arg V 2: Val-Tyr-Pro-Glu Ser Leu Ser Arg Ser 3: Ser-Ile-Gln-Lys 4: Ser-Leu-Ser-Arg-Ser U C A G A U A G G U C U U C G A G U C U A U C C A G A A G C 5’ 3’ Trois cadres de lecture 5’ C U C A G C G U A A U 3’ Pour lire (traduire) le message C U C A G C G U A A U (ARNm) correctement, la Leu Ser Val machine doit : C U C A G C G U A A U Identifier le bon point de depart Ser Ala STOP Coller les acides aminés C U C A G C G U A A U ensemble selon le bon cadre de Gln Arg Asn lecture PAUSE Rappel: cours de Martina Valentini Fonction Non-codant Composants des ribosomes (machinerie responsable de la synthèse des protéines) Structure Très compacte et organisée Synthèse Lieux de synthèse : nucléole ARN très abondants La structure du ribosome Site E Site P Site A Grande sous-unité ribosomale Petite sous-unité ribosomale Site de liaison à l’ARNm La machine ribosomale Site E Site P Site A Grande sous-unité ribosomale Petite sous- unité ribosomale Site de liaison à l’ARNm La machine ribosomale: des cycles de synthèse protéique Chaîne polypeptidique en croissance ETAPE 1 Nouvel aminoacyl- ARNt lié La machine ribosomale: des cycles de synthèse protéique ETAPE 2 La machine ribosomale: des cycles de synthèse protéique ETAPE 3 La machine ribosomale: des cycles de synthèse protéique ETAPE 4 ARNt éjecté du site E La machine ribosomale: des cycles de synthèse protéique ETAPE 1 Les facteurs Nouvel aminoacyl- d’élongation EF1 et ARNt lié EF2 font avancer la traduction à chaque cycle (hydrolyse du GTP en GDP) L’initiation de la traduction Site E Site P Site A eIF2 Grande sous-unité ARNt initiator ribosomale Petite Petite sous- sous-unité unité ribosomale ribosomale Site de liaison à l’ARNm Le complexe ARTt initiateur-méthionine est chargé sur la petite sous-unité ribosomale  Initiation de la traduction eIF4G ARNm eIF4E Coiffe 5’ La petite sous-unité ribosomale se fixe à l’éxtremité 5’ d’une molécule d’ARNm  Initiation de la traduction Le complexe se déplace le long de l’ARNm charchant le premier codon AUG  Initiation de la traduction La grande sous-unité ribosomale se lie  Initiation de la traduction Le deuxième aminoacyl-ARNt se fixe sur le site A du ribosome  Initiation de la traduction Formation de la première liaison peptidique… et ainsi de suite Les codons d’arrêt et la fin de la traduction Facteur de libération Forme moléculaire ressemble à celle d’un molécule d’ARNt Rappel: 3 codons « STOP » UAG UAA UGA  Les codons d’arrêt et la fin de la traduction Facteur de libération Forme moléculaire ressemble à celle d’un molécule d’ARNt Liaison du facteur de libération sur le site A  Les codons d’arrêt et la fin de la traduction Hydrolyse de la liaison entre la chaîne polypeptidique et le dernier ARNt  Les codons d’arrêt et la fin de la traduction Dissociation du ribosome en ses deux sous-unités Ce que vous avez vu aujourd’hui Le code génétique: codons L’ARNt – une molécule adaptatrice Les ARNt synthétases: pour charger les molécules adaptatrices La formation dirigée des liaisons peptidiques Trois cadres de lecture La machine ribosomale Des cycles de synthèse protéique Le début et la fin de la traduction FIN