Zinc Fingers in DNA Binding

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30 Questions

Quel est le rôle du zinc dans la structure des doigts de zinc ?

Il stabilise la structure

Quel est le nom du motif de liaison au calcium représenté sur la figure 34 ?

EF-Hand

Qu'est-ce qu'un domaine d'une protéine ?

Une partie de chaîne polypeptidique qui peut se replier de façon indépendante

Quel est le rôle des doigts de zinc ?

D'interagir avec l'ADN ou entre protéines

Quels sont les exemples de protéines à plusieurs domaines structuraux et fonctionnels ?

Toutes les options précédentes

Quel est le rôle du domaine d'attache à l'ADN dans les doigts de zinc ?

De lier l'ADN

Quel est le principal avantage de la prédiction de structure secondaire par rapport à la comparaison de séquences par alignement ?

Elle est utilisée lorsque les méthodes de comparaison de séquences ont atteint leurs limites

Qu'est-ce que les zones énergétiquement favorables sont représentées par ?

Des contours colorés

Quels sont les deux domaines principaux dans le diagramme de Ramachandran ?

La région de l'hélices α et la région du feuillet β

Qu'est-ce que représentent les croix sur le diagramme de Ramachandran ?

Les acides aminés glycine

Pourquoi la structure secondaire est-elle mieux préservée que les séquences ?

Parce que les structures 3D et 2D sont mieux préservées que les séquences

Qu'est-ce que permet de détecter des similitudes lointaines entre des séquences qui ne peuvent pas être détectées par alignement de séquences ?

La comparaison de structures 2D

Quelle est la méthode qui fournit des informations sur les positions relatives des atomes dans la molécule, y compris celles des atomes d'hydrogène?

La spectroscopie par résonance magnétique

Quel est le résultat de la détermination d'une structure par cristallographie?

Une carte de densité électronique

Quel est le rôle de l'environnement de l'atome dans la protéine lors de la mesure de RMN ?

Déterminer les propriétés de la radiation électromagnétique

Quel est le facteur qui influe sur la précision et l'exactitude avec lesquelles on peut déduire les coordonnées atomiques?

Plusieurs facteurs qui diffèrent dans ces deux méthodes

Quel est le résultat de la comparaison du signal émis avec un signal de référence en RMN ?

Un déplacement chimique

Quelle est la méthode qui utilise le nuage électronique des atomes autres que l'hydrogène pour déterminer les coordonnées atomiques?

La technique de diffraction des rayons X

Quel est l'objectif final de la mesure de RMN ?

Déterminer la structure de la protéine

Quelle est la méthode qui fournit des informations sur les positions relatives des atomes dans la molécule, sans inclure les atomes d'hydrogène?

La technique de diffraction des rayons X

Quel est le rôle du tétraméthylsilane (TMS) en RMN ?

Fournir une référence pour le déplacement chimique

Quel est le résultat de la perturbation du noyau des atomes en RMN ?

Une radiation électromagnétique

Quel est le résultat de la combinaison de la cristallographie au rayon X et de la RMN?

Des informations sur les positions relatives des atomes dans la molécule

Quel est le symbole utilisé pour noter le déplacement chimique en RMN ?

δ

Quel est le résultat de la combinaison de l’IEF avec l’électrophorèse?

Une technique de séparation extrêmement performante

Quel est le but de la migration des protéines sur gel?

De séparer les protéines

Quelle est la technique la plus couramment utilisée pour révéler les protéines sur le gel?

Le nitrate d’argent

Quel est le résultat de la coloration du gel et de la révélation?

La visualisation des protéines sous forme de taches

Quel est le but de l'excision des taches du gel?

D'identifier les protéines pures

Quel type d'information peut être obtenue à partir de la séparation des protéines par électrophorèse en 2D?

La présence de protéines différentes dans un échantillon

Learn about the role of zinc in stabilizing DNA structure, its presence in DNA-binding domains, and its interaction with proteins and DNA. Discover how zinc fingers are involved in transcription factors and more.

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