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Questions and Answers
Qu'est-ce qui définit un microremaniement récurrent?
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Quelle est la taille habituelle des duplications segmentaires?
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Quel impact négatif peuvent avoir les duplications segmentaires?
Quel impact négatif peuvent avoir les duplications segmentaires?
Quelle est la conséquence de l'appariement incorrect lors de la méiose?
Quelle est la conséquence de l'appariement incorrect lors de la méiose?
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Qu'est-ce que la recombinaison homologue non allélique (NAHR)?
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Dans quel cas un individu est considéré comme homozygote?
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Quel terme décrit un individu portant deux allèles différents sur les chromosomes homologues?
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Les duplications segmentaires sont souvent localisées près de quels éléments chromosomiques?
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Quel pourcentage du génome est constitué de zones non codantes dans la majorité des cas ?
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Quel est un exemple de translocation réciproque mentionnée ?
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Qu'est-ce qui se forme pour permettre l'appariement des quatre chromosomes au stade du pachytène ?
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Qu'est-ce que la ségrégation adjacente 1 entraîne pour le lot 1 ?
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Quel type de déséquilibre est observé en ségrégation 3/1 ?
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Comment les différentes couleurs sur l'arbre généalogique sont-elles interprétées ?
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Quel type de maladie peut être évoqué par des phénotypes différents dans une famille ?
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Quel est l'effet d'une translocation équilibrée sur le phénotype d'un individu ?
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Qu'est-ce qu'un hétérozygote composite?
Qu'est-ce qu'un hétérozygote composite?
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Quel est le mode d'hérédité pour qu'un individu soit malade dans le cas d'une maladie autosomique récessive?
Quel est le mode d'hérédité pour qu'un individu soit malade dans le cas d'une maladie autosomique récessive?
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Quel est un exemple typique d'une maladie autosomique récessive?
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Dans quel cas un individu est considéré comme hétérozygote double?
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Quelle probabilité a un individu homozygote atteint d'être malade dans une maladie autosomique récessive?
Quelle probabilité a un individu homozygote atteint d'être malade dans une maladie autosomique récessive?
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Quel est le lien entre l'hétérozygotie et le paludisme?
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Quel est le risque d'être malade pour une maladie autosomique dominante?
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Quels types de phénotypes peuvent entraîner des maladies autosomiques dominantes?
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Quelle est la définition de la pénétrance?
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Quelle est une caractéristique de la pénétrance incomplète?
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Dans le mode d’hérédité liée au chromosome X, qui transmet la mutation à son fils?
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Quelle méthode n'est pas utilisée pour dépister les femmes conductrices?
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Combien de copies d'ADN mitochondrial sont généralement présentes par mitochondrie?
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Quel est l'un des gènes codés par l'ADN mitochondrial?
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Quel complexe n'est pas un composant de la chaîne respiratoire?
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Quelle est la principale caractéristique des cytopathies mitochondriales?
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Quels organes sont principalement affectés par les cytopathies mitochondriales?
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Quel type d'étude est nécessaire pour connaître la présence d'une cytopathie mitochondriale?
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Qu'est-ce qu'un SNP?
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Quelle est la fréquence du variant majeur dans les SNP (MAF)?
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Quel est l'effet phénotypique des SNP?
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Quelles variations sont dues aux CNV?
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Quel est le modèle d'étude pour détecter un variant génomique par Whole Genome sequencing?
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Study Notes
Translocations
- Les translocations peuvent être équilibrées ou s'accompagner de remaniements infra-microscopiques au niveau des points de cassure.
- Dans la majorité des cas, les translocations surviennent dans des régions non codantes du génome.
- Elles peuvent cependant avoir des conséquences en pathologie constitutionnelle : un individu sur 500-600 sans phénotype de RM et de malformation congénitale est porteur d'une translocation équilibrée.
- Un exemple de translocation réciproque est t(10;17)(q26;p11.2), un "échange" entre un bout du chromosome 10 et 17.
- Lors de la méiose, les chromosomes impliqués dans une translocation forment une structure en "quadrivalent" pour maximiser l'alignement des zones homologues.
- Différentes possibilités de ségrégation existent : ségrégation alterne, ségrégation adjacente 1, ségrégation adjacente 2, ségrégation 3/1.
- Chaque type de ségrégation peut générer des gamètes avec des déséquilibres chromosomiques, menant à des phénotypes différents.
- Certaines maladies familiales avec des phénotypes différents peuvent être dues à des translocations réciproques avec des ségrégations particulières.
Microremaniements Récurrents
- Les microremaniements sont des anomalies chromosomiques de taille inférieure à 5 MB, invisibles au caryotype.
- Ils sont plus fréquents que ne le voudrait le hasard.
- Les microremaniements récurrents sont souvent associés à des séquences ou structures particulières de l'ADN, comme les translocations Robertsoniennes, les séquences palindromiques, et les duplications segmentaires.
Duplications Segmentaires
- Les duplications segmentaires mesurent de 1 à 400 kb et présentent 97% d'identité.
- Elles sont présentes dans les gènes, les clusters de gènes, les pseudo-gènes, les séquences rétrovirales, etc.
- Elles se situent près des centromères et des télomères.
- Les duplications segmentaires ont accompagné l'évolution humaine et contribuent à la diversité, mais peuvent avoir un impact négatif sur le phénotype.
- Le taux d'expression des gènes dans les duplications segmentaires peut varier pour les gènes situés dans les duplicons.
Conséquences des Duplications Segmentaires en Méiose
- En méiose, les duplications segmentaires peuvent entraîner des délétions et des duplications.
- L'appairage quasiment identique des séquences peut mener à une recombinaison homologue non allélique (NAHR).
- NAHR aboutit à une recombinaison non équilibrée, avec des différences dans le nombre d'allèles sur les chromatides.
- Un exemple de ce phénomène est le syndrome de DiGeorge, marqué par des délétions et des insertions.
Pathologies Génétiques
Définitions
- Homozygote: les individus portent sur les deux chromosomes homologues le même allèle.
- Hétérozygote: les individus portent sur les deux chromosomes homologues deux allèles différents.
- Hémizygote: pour les locus portés par le chromosome X, seuls les hommes sont hémizygotes, car ils n'ont qu'un seul chromosome X.
- Hétérozygote composite: individu qui porte à un locus donné deux allèles différents et différents de l'allèle "normal" ou "sauvage".
- Double hétérozygote: individu qui porte à deux locus différents deux allèles différents et différents de l'allèle "normal" ou "sauvage".
Mode d'Hérédité Autosomique Récessif
- Il faut avoir les deux copies du gène avec le même allèle pour être malade.
- Il y a trois possibilités : homozygote indemne (aucune allèle malade), hétérozygote indemne mais porteur (porte un allèle malade), homozygote atteint (malade).
- Exemple : la drépanocytose.
Mode d'Hérédité Autosomique Dominant
- Il suffit d'une seule copie du gène pour être malade.
- Le risque d'être malade est de 50%.
- Exemple : Neurofibromatose de type 1.
- Les maladies autosomiques dominantes peuvent entraîner des phénotypes différents avec une expression variable de la maladie.
- Les variabilités peuvent être inter-familiales, intra-familiales ou les deux.
Pénétrance
- La pénétrance est le rapport de probabilité du phénotype sur le génotype.
- Si la pénétrance est de 100%, l'individu sera malade.
- Si la pénétrance est plus faible, l'individu peut être sain malgré le fait qu'il porte l'allèle malade ou avoir une forme nuancée de la maladie.
- La pénétrance incomplète peut entraîner des sauts de génération de la maladie, puisqu'elle ne s'exprime pas toujours de manière visible et forte.
Mode d'Hérédité Liée au Chromosome X
- Exemple : la myopathie de Duchenne de Boulogne/Hémophilies.
- La mutation est portée par le chromosome X.
- La mère, non malade, peut transmettre la mutation à son fils qui sera malade car il n'a qu'un seul chromosome X.
- Dépistage des femmes conductrices : analyse de l'arbre généalogique, recherche de signes cliniques mineurs, recherche de signes biologiques mineurs, analyse de génétique moléculaire.
Pathologies du Génome Mitochondrial
- L'ADN mitochondrial mesure 16,5 kb.
- Il y a entre 5 et 10 copies d'ADN Mt par mitochondrie.
- On estime qu'il y a 5000 copies d'ADN Mt par cellule.
- L'ADN mitochondrial code pour 37 gènes, dont les 13 protéines de la chaîne respiratoire.
- Le code génétique pour l'ADN mitochondrial est légèrement différent de celui de l'ADN nucléaire et sa structure est simplifiée.
- Les cytopathies mitochondriales touchent les organes qui consomment beaucoup d'énergie, comme les muscles et le cerveau.
- Lors de la mitose, le nombre de mitochondries "malades" peut ne pas être séparé équitablement entre les cellules, pouvant mener à une hétéroplasmie.
Présentation Clinique des Cytopathies Mitochondriales
- Association inexpliquée de signes
- Début précoce
- Évolutivité progressive
- Implication d'organes apparemment dénués de liens embryologiques, anatomiques ou fonctionnels.
Investigation des Cytopathies Mitochondriales
- Investigation métabolique in vivo : lactate, pyruvate, corps cétoniques, rapport redox cytoplasmiques and mitochondriaux, enzymologie.
- Étude de l'ADN.
Stratégies d'Études Devant la Découverte d'un Variant Génomique
Variations Nucléotidiques : SNV
- Les SNP (Single Nucleotide Polymorphism) n'ont pas d'effet phénotypique et le MAF (Minor Allele Frequency) est supérieur à 1%.
- Chaque personne a environ 4 millions de SNPs par rapport à un génome de référence.
- Il existe une base de données ("https://gnomad.broadinstitute.org/") basée sur 15,708 génomes de témoins.
- Certaines fréquences alléliques peuvent être spécifiques des groupes ethniques.
Variations Structurales : SN
- Variations structurales dues aux CNV (Copy Number Variations).
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Description
Ce quiz explore les translocations chromosomiques, en mettant en lumière leur nature équilibrée et leurs conséquences. Apprenez comment ces phénomènes se produisent lors de la méiose et les différents types de ségrégation qui peuvent en découler. Testez vos connaissances sur les aspects pathologiques associés aux translocations.