Questions and Answers
Quelle est la propriété optique du tryptophane ?
Il est fluorescent
Quelle est la structure qui impose que la cystéine x soit liée avec la cystéine y plutôt qu'avec la cystéine z dans une protéine ?
La structure tertiaire
Quelle est l'utilité des réducteurs dans la manipulation des protéines contenant des ponts disulfures ?
Ils évitent la formation de ponts SS illégitimes
Qu'est-ce qui différencie un réducteur d'un dénaturant?
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Quels sont les types d'interactions non covalentes mentionnées dans le texte?
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Quelles sont les facteurs qui influencent l'énergie potentielle des interactions entre charges?
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Quelles sont les applications possibles de la modélisation des structures protéiques?
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Quels sont les acides aminés polaires non chargés mentionnés dans le texte ?
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Quels sont les acides aminés aliphatiques apolaires mentionnés dans le texte ?
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Quels sont les acides aminés aromatiques mentionnés dans le texte ?
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Quelle est la propriété optique du tryptophane mentionnée dans le texte ?
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Quelle est l'utilité des réducteurs dans la manipulation des protéines contenant des ponts disulfures ?
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Quels sont les réducteurs classiques mentionnés dans le texte?
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Quelle est la différence entre un réducteur et un dénaturant?
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Quels sont les facteurs qui influencent l'énergie potentielle des interactions entre charges?
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Qu'est-ce que l'effet hydrophobe?
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Quelles sont les applications possibles de la modélisation des structures protéiques?
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Qu'est-ce que l'énergie potentielle de l'interaction entre charges dépend?
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Quelles sont les forces responsables des interactions non covalentes?
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Quel est le rôle de l'eau dans les interactions non covalentes?
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Quels sont les problèmes à résoudre pour prédire la structure d'une protéine?
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Qu'est-ce qui rend la prédiction de la structure tertiaire d'une protéine difficile?
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Study Notes
Classification des acides aminés
- Les acides aminés peuvent être classés en fonction de la charge des chaînes latérales :
- 2 acides aminés chargés négativement (D et E)
- 2 acides aminés chargés positivement (H et K, R)
- 15 acides aminés non chargés
- Les acides aminés polaires non chargés sont : N, Q, S, T, C
- Les acides aminés apolaires aliphatiques sont : G, A, V, L, I, M, P
- Les acides aminés aromatiques sont : F, Y, W
Propriétés optiques des acides aminés
- Le tryptophane est fluorescent et cette fluorescence est très sensible à l'environnement des tryptophanes
- La fluorescence est utilisée pour étudier les protéines, comme la fluorescence de la Green Fluorescent Protein (GFP)
Ponts disulfures
- Les ponts disulfures sont formés par la liaison de deux cystéines
- Les protéines qui restent dans le cytosol n'ont en général pas de ponts disulfures
- Les protéines secrétées peuvent comporter des ponts disulfures, mais pas systématiquement
- Les ponts disulfures sont importants pour la stabilité des protéines qui les contiennent
- Les réducteurs peuvent être utilisés pour réduire les ponts disulfures et conserver les protéines
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