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Questions and Answers
Quale tra queste affermazioni sulla forma A del DNA è corretta?
Quale tra queste affermazioni sulla forma A del DNA è corretta?
- La forma A è sinistrorsa e ha un diametro maggiore rispetto alla forma B.
- La forma A è destrorsa e ha 10 coppie di basi per giro di elica.
- La forma A è la forma più comune di DNA nelle cellule.
- La forma A può essere trovata anche in vivo, ad esempio in duplex di RNA o DNA-RNA. (correct)
Quale caratteristica distingue la forma Z del DNA dalle altre forme?
Quale caratteristica distingue la forma Z del DNA dalle altre forme?
- È un'elica sinistrorsa. (correct)
- È un'elica destrorsa.
- È composta da tre filamenti di DNA.
- Ha un diametro maggiore rispetto alla forma B.
La forma B del DNA è la forma dominante all'interno delle cellule. Quale caratteristica la rende adatta a questa funzione?
La forma B del DNA è la forma dominante all'interno delle cellule. Quale caratteristica la rende adatta a questa funzione?
- La forma B ha il diametro più grande, il che la rende più resistente alla degradazione.
- La forma B è la più stabile in condizioni di umidità elevate. (correct)
- La forma B è la più compatta e facilmente impacchettata.
- La forma B ha un passo più corto, il che facilita la replicazione e la trascrizione.
Cosa rende la forma Z del DNA notevolmente diversa dalle forme A e B?
Cosa rende la forma Z del DNA notevolmente diversa dalle forme A e B?
Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo alle strutture a tripla elica del DNA?
Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo alle strutture a tripla elica del DNA?
Quale delle seguenti condizioni favorisce la formazione della forma A del DNA?
Quale delle seguenti condizioni favorisce la formazione della forma A del DNA?
Quale delle seguenti affermazioni non è corretta riguardo alla forma Z del DNA?
Quale delle seguenti affermazioni non è corretta riguardo alla forma Z del DNA?
La struttura a tripla elica del DNA è caratterizzata da:
La struttura a tripla elica del DNA è caratterizzata da:
Quale delle seguenti strutture NON è considerata un motivo strutturale comune nei tRNA?
Quale delle seguenti strutture NON è considerata un motivo strutturale comune nei tRNA?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo all'appaiamento tra basi nell'RNA è CORRETTA?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo all'appaiamento tra basi nell'RNA è CORRETTA?
Quale dei seguenti elementi NON è coinvolto nella formazione di una struttura a tripla elica nell'RNA?
Quale dei seguenti elementi NON è coinvolto nella formazione di una struttura a tripla elica nell'RNA?
Quale delle seguenti affermazioni sulle anse nei tRNA è CORRETTA?
Quale delle seguenti affermazioni sulle anse nei tRNA è CORRETTA?
Quale delle seguenti strutture è responsabile dell'interazione tra il braccio accettore e il braccio T-Φ-C nel tRNA?
Quale delle seguenti strutture è responsabile dell'interazione tra il braccio accettore e il braccio T-Φ-C nel tRNA?
Che cosa si intende per 'motivo A-minore' nell'RNA?
Che cosa si intende per 'motivo A-minore' nell'RNA?
Quale delle seguenti strutture è responsabile dell'interazione tra il braccio dell'anticodone e il braccio D nel tRNA?
Quale delle seguenti strutture è responsabile dell'interazione tra il braccio dell'anticodone e il braccio D nel tRNA?
Quale delle seguenti affermazioni sui tRNA è CORRETTA?
Quale delle seguenti affermazioni sui tRNA è CORRETTA?
Quale affermazione sul DNA è corretta?
Quale affermazione sul DNA è corretta?
Qual è la principale differenza tra DNA e RNA?
Qual è la principale differenza tra DNA e RNA?
Cosa possono causare le variazioni strutturali nel DNA?
Cosa possono causare le variazioni strutturali nel DNA?
Cosa causa il superavvolgimento del DNA?
Cosa causa il superavvolgimento del DNA?
Cosa è necessario per controllare il grado di superavvolgimento del DNA?
Cosa è necessario per controllare il grado di superavvolgimento del DNA?
Quali coppie di basi tendono a curvare il DNA verso il solco minore?
Quali coppie di basi tendono a curvare il DNA verso il solco minore?
Cosa viene influenzato dalla presenza di sequenze consecutive di basi nel DNA?
Cosa viene influenzato dalla presenza di sequenze consecutive di basi nel DNA?
Quale struttura è caratterizzata da filamenti di DNA avvolti in una doppia elica?
Quale struttura è caratterizzata da filamenti di DNA avvolti in una doppia elica?
Qual è il tipo di legame che si forma tra le purine e le pirimidine nella catena polipirimidinica?
Qual è il tipo di legame che si forma tra le purine e le pirimidine nella catena polipirimidinica?
Cosa sono gli appaiamenti di Hoogsteen?
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Qual è la caratteristica principale dei quartetti di G intramolecolari?
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Cosa caratterizza una struttura cruciforme nel DNA?
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Quale affermazione riguardo alla struttura a forcina è corretta?
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Cosa determina l'orientamento dei filamenti in un quadruplex?
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Qual è uno degli aspetti interessanti delle sequenze palindromiche nel DNA?
Qual è uno degli aspetti interessanti delle sequenze palindromiche nel DNA?
Quali condizioni sono necessarie per la formazione di quartetti di G intermolecolari?
Quali condizioni sono necessarie per la formazione di quartetti di G intermolecolari?
Qual è la funzione principale delle DNA topoisomerasi?
Qual è la funzione principale delle DNA topoisomerasi?
Cosa comporta la transizione da forma B a forma Z del DNA?
Cosa comporta la transizione da forma B a forma Z del DNA?
Qual è il meccanismo di rottura controllata utilizzato dalle topoisomerasi di tipo I?
Qual è il meccanismo di rottura controllata utilizzato dalle topoisomerasi di tipo I?
Quale affermazione è vera riguardo al ruolo dell'energia libera nel processo delle DNA topoisomerasi?
Quale affermazione è vera riguardo al ruolo dell'energia libera nel processo delle DNA topoisomerasi?
Cosa permette la tecnica di 'strand passage' nella topoisomerasi?
Cosa permette la tecnica di 'strand passage' nella topoisomerasi?
Qual è una caratteristica distintiva della topoisomerasi IB?
Qual è una caratteristica distintiva della topoisomerasi IB?
Quale effetto ha la topoisomerasi di tipo I sulla struttura del DNA?
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Qual è il risultato della reazione di transesterificazione nella funzione delle topoisomerasi?
Qual è il risultato della reazione di transesterificazione nella funzione delle topoisomerasi?
Quale delle seguenti affermazioni riguardanti le basi azotate è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni riguardanti le basi azotate è corretta?
Quali sono le 3 possibili superfici di interazione di un singolo nucleotide?
Quali sono le 3 possibili superfici di interazione di un singolo nucleotide?
Cosa determina la stabilità complessiva di una struttura secondaria dell'RNA?
Cosa determina la stabilità complessiva di una struttura secondaria dell'RNA?
Come si può determinare la probabilità di formazione di una specifica struttura secondaria dell'RNA?
Come si può determinare la probabilità di formazione di una specifica struttura secondaria dell'RNA?
Cosa determina la stabilità di un tetraloop in una struttura secondaria dell'RNA?
Cosa determina la stabilità di un tetraloop in una struttura secondaria dell'RNA?
Quale dei seguenti fattori NON contribuisce alla stabilità complessiva di una struttura secondaria dell'RNA?
Quale dei seguenti fattori NON contribuisce alla stabilità complessiva di una struttura secondaria dell'RNA?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo all'energia libera, G , è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo all'energia libera, G , è corretta?
Quale dei seguenti fattori NON è direttamente correlato all'energia libera di una struttura secondaria dell'RNA?
Quale dei seguenti fattori NON è direttamente correlato all'energia libera di una struttura secondaria dell'RNA?
Flashcards
Doppia elica
Doppia elica
Struttura proposta da Crick e Watson per il DNA, stabilita da diffrazione raggi X.
Forma A
Forma A
Variante del DNA con bassa umidità, destrorsa, con 11 coppie di basi per giro.
Forma B
Forma B
Forma prevalente del DNA, stabilita in condizioni di alta umidità.
Forma Z
Forma Z
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Tripla elica
Tripla elica
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Coppie di basi
Coppie di basi
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Conformazione 'syn'
Conformazione 'syn'
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Proteine leganti DNA Z
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Catena polipirimidinica
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Appaiamenti di Hoogsteen
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Quartetti di G
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Struttura a quadruplex
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Ripetizioni invertite
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Sequenza palindromica
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Struttura cruciforme
Struttura cruciforme
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Struttura a forcina
Struttura a forcina
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RNA
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Forcine RNA
Forcine RNA
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Curvatura del DNA
Curvatura del DNA
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Superavvolgimenti
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DNA topoisomerasi
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Tilt nel DNA
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Roll nel DNA
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Filamenti di DNA
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Appaiamenti delle basi
Appaiamenti delle basi
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Energia libera
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Reazione esoergonica
Reazione esoergonica
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Reazione endoergonica
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Stabilità di una struttura
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Appaiamento Hoogsteen
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Impilamento delle basi
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Tetraloop stabile
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Pseudonodi
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Motivo A-minore
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Struttura a trifoglio del tRNA
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Ansa D
Ansa D
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Braccio accettore tRNA
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Interazioni coassiali
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Strutture terziarie dell'RNA
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Funzionalità RNA non energeticamente vantaggiosa
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Topoisomerasi
Topoisomerasi
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Rottura singola
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Rilegazione
Rilegazione
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Passaggio del filamento
Passaggio del filamento
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Transesterificazione
Transesterificazione
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Rotazione controllata
Rotazione controllata
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Study Notes
Strutture alternative degli acidi nucleici
- Il DNA, in condizioni di alta umidità, assume la forma B, struttura a doppia elica scoperta da Crick e Watson tramite diffrazione a raggi X.
- La forma A è una struttura destrorsa, simile alla forma B ma con diverse caratteristiche: maggiore angolatura delle coppie di basi rispetto al piano dell'elica, 11 coppie di basi per ogni giro, passo di 25 Å e diametro di 23 Å. Trova applicazione in vivo in duplex di RNA o DNA-RNA.
- La forma Z ha struttura sinistrorsa, diametro di 18 Å e passo di 46 Å. È caratterizzata da un'alternanza di nucleotidi in conformazione syn e anti. Si trova in piccole percentuali nelle cellule.
Tripla elica
- In alcuni casi particolari, il DNA può formare regioni a tripla elica.
- Nonostante non si sia dimostrato un ruolo biologico nell'organismo, queste strutture potrebbero essere utilizzate per sviluppare inibitori di geni.
- Queste regioni a tripla elica coinvolgono un filamento a doppia elica e un ulteriore filamento a singolo filamento, formato da sole pirimidine e complementari alla sequenza di purine del filamento della doppia elica.
Strutture cruciformi e a forcina
- Le sequenze palindromiche e le ripetizioni invertite presenti nel DNA possono formare strutture cruciformi.
- In queste strutture, le regioni complementari del DNA si appaiano a formare "steli" mentre le regioni non complementari creano "anse".
- Una struttura a forcina è simile, ma con uno stelo e un'ansa. Questo tipo di struttura è importante nell'RNA.
DNA curvo
- L'interazione di impilamento lungo la molecola del DNA può provocare variazioni strutturali locali e angoli tra le paia di basi.
- Un accumulo di questi angoli fa assumere una curvatura all'asse della molecola di DNA.
- Le sequenze di basi influenzano la struttura della doppia elica.
Topologia del DNA e DNA topoisomerasi
- Il DNA, per svolgere processi di espressione dei geni, duplicazione e segregazione cromosomica, deve poter modificarsi.
- L'avvolgimento e l'attraversamento su sé stesso del DNA porta a superavvolgimenti.
- Gli organismi utilizzano le DNA topoisomerasi per regolare il superavvolgimento del DNA. Queste enzimi tagliano temporaneamente un o entrambi i filamenti del DNA e poi li risaldano.
Struttura dell'RNA
- L'RNA è simile al DNA, ma utilizza lo zucchero ribosio anziché desossiribosio, e presenta l'uracile al posto della timina.
- L'RNA è spesso a singolo filamento.
- Può assumere varie strutture secondarie e terziarie, rilevanti per la sua funzione, grazie alla presenza di anse, forcine, e gemme.
- Queste strutture sono stabilizzate da appaiamenti di basi, interazioni idrofobiche, e ioni come il Mg²⁺.
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