Struttura delle Proteine e Legami Peptidici

L'enzima lisozima è presente nel corpo umano ed è fondamentale per la difesa dalle infezioni batteriche. Rompe la parete cellulare dei batteri, contribuendo così al loro eliminazione.

I legami intramolecolari sono forze che tengono uniti gli atomi all'interno di una singola molecola.

I legami covalenti sono forti e stabili, responsabili del mantenimento della struttura delle molecole organiche.

I legami ionici sono interazioni forti tra due atomi con cariche opposte. Sono responsabili della formazione di sali come il cloruro di sodio (NaCl).

Il sale da cucina (NaCl) si dissolve in acqua grazie all'interazione tra gli ioni Na+ e Cl- con le molecole d'acqua. Questo processo è fondamentale per il nostro corpo, ricco di acqua.

Le interazioni tra cariche e la forma delle molecole permettono l'incontro tra enzimi e substrati, consentendo reazioni biochimiche specifiche.

I legami intermolecolari sono forze deboli che si verificano tra molecole differenti. I legami a idrogeno sono i più importanti nel contesto biologico.

I legami a idrogeno sono interazioni deboli ma fondamentali per il mantenimento della struttura delle molecole biologiche come il DNA e le proteine.

Un legame covalente che si forma tra il gruppo carbossilico di un amminoacido e il gruppo amminico di un altro amminoacido.

Un'unità di base delle proteine, composta da un gruppo amminico, un gruppo carbossilico e una catena laterale variabile.

Il livello di struttura proteica che descrive la sequenza lineare degli amminoacidi.

La struttura risultante dal ripiegamento locale della catena polipeptidica in alfa eliche o beta foglietti.

La struttura tridimensionale completa di una proteina, derivante dall'interazione tra le catene laterali degli amminoacidi.

La struttura risultante dall'associazione di più catene polipeptidiche per formare un complesso proteico.

Il gruppo amminico all'estremità di una catena peptidica, chiamato anche 'N-terminale'.

Il gruppo carbossilico all'estremità di una catena peptidica, chiamato anche 'C-terminale'.

Una molecola a doppia elica che contiene informazioni genetiche.

Le basi azotate del DNA sono Adenina, Timina, Citosina e Guanina.

L'unità di base del DNA, formato da una base azotata, uno zucchero (desossiribosio) e un gruppo fosfato.

I due filamenti di DNA hanno polarità opposta: uno va in direzione 5'-3' e l'altro in direzione 3'-5'.

La struttura del DNA presenta una struttura a doppia elica con due solchi: un solco maggiore (major groove) e un solco minore (minor groove).

Il legame tra le basi azotate del DNA è un legame idrogeno.

Un'unità di base del DNA, formato da una base azotata, uno zucchero e un gruppo fosfato.

Il DNA è un'acido nucleico composto da un doppio filamento di nucleotidi.

La struttura secondaria di una proteina descrive il ripiegamento locale di aminoacidi adiacenti, come le alfa-eliche e i foglietti beta.

I foglietti beta sono strutture planari formate da catene polipeptidiche allineate. Possono essere disposte in modo parallelo o antiparallelo.

L'arrangiamento dei foglietti beta, paralleli o antiparalleli, influenza la stabilità e la resistenza della proteina.

La struttura terziaria è influenzata da interazioni tra i residui amminoacidici, come legami idrogeno, forze ioniche e ponti disolfuro.

Le regioni idrofile di una proteina tendono a esporsi al solvente acquoso, mentre le regioni idrofobiche si nascondono all'interno della struttura.

Le anse sono regioni irregolari della struttura terziaria, con conformazioni variabili rispetto alle alfa-eliche e ai foglietti beta.

La Green Fluorescent Protein (GFP) è una proteina che emette fluorescenza spontanea ed è utilizzata come strumento di ricerca per marcare proteine e organelli.

Le basi azotate sono molecole organiche presenti nel DNA e nell'RNA, responsabili del codice genetico. Ci sono cinque basi azotate principali: adenina (A), guanina (G), citosina (C), timina (T) e uracile (U).

Le purine sono un tipo di base azotata con una struttura a doppio anello. Le purine sono adenina (A) e guanina (G).

Le pirimidine sono un tipo di base azotata con una struttura a singolo anello. Le pirimidine sono citosina (C), timina (T) e uracile (U).

La timina (T) è una base azotata presente nel DNA, mentre l'uracile (U) è presente nell'RNA. La timina contiene un gruppo metilico in più rispetto all'uracile.

L'appaiamento delle basi azotate in DNA e RNA segue il principio di complementarità: adenina si appaia con timina (nel DNA) o uracile (nell'RNA) e guanina si appaia con citosina. Questo appaiamento è possibile grazie alla formazione di legami a idrogeno tra le basi.

La deaminazione della citosina è un processo che può portare alla trasformazione della citosina in uracile. Questo fenomeno può essere causato da radiazioni o dall'esposizione a sostanze chimiche.

La deaminazione della citosina è importante perché può causare mutazioni nel DNA. Se la citosina viene trasformata in uracile, il processo di replicazione del DNA potrebbe inserire una timina al posto dell'uracile, creando una mutazione puntiforme.

L'Uracile non può essere trasformato in Timina tramite la perdita del gruppo metilico, perché le due molecole hanno strutture differenti.

Il desossiribosio è lo zucchero presente nel DNA. Manca l'ossigeno in posizione 2, rendendolo più resistente alla degradazione.

Il ribosio è lo zucchero che si trova nell'RNA. Ha un gruppo ossidrile (-OH) in posizione 2, rendendolo più reattivo e meno stabile del desossiribosio.

La differenza chiave tra DNA e RNA è lo zucchero: il DNA contiene desossiribosio, l'RNA contiene ribosio. Questa differenza influenza la stabilità delle due molecole.

Il DNA è molto più resistente all'idrolisi e alla degradazione rispetto all'RNA grazie alla presenza del desossiribosio. Ciò gli consente di conservare le informazioni genetiche per lunghi periodi.

Tra i principali componenti del DNA vi sono le basi azotate, che si uniscono ad uno zucchero e ad un gruppo fosfato, formando i nucleotidi.

L'Uracile è una base azotata che si trova nell'RNA, mentre la Timina è presente nel DNA.

Il DNA è una doppia elica formata da due filamenti antiparalleli, che si avvolgono a spirale. La struttura è mantenuta da legami idrogeno tra le basi azotate.

Il diametro del DNA è costante e misura circa 20 Armstrong (2 nm).