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Questions and Answers
Quale delle seguenti affermazioni sul codice genetico è corretta?
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Quale componente svolge un ruolo fondamentale nel caricamento degli amminoacidi sul tRNA?
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Durante la traduzione, quale sito del ribosoma è occupato dal tRNA caricato con la metionina al momento dell'inizio della sintesi proteica?
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Qual è la funzione dell'enzima peptidil-transferasi durante la sintesi proteica?
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Quale affermazione sui fattori di inizio, di allungamento e di terminazione della sintesi proteica è vera?
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Cosa accade quando un codone di stop entra nel sito A durante la traduzione?
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Quale funzione ha il tRNA nella traduzione?
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Quale meccanismo epigenetico silenzia i geni tramite la metilazione del DNA?
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Qual è il principale costituente dei ribosomi?
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Cosa rappresenta un corpo di Barr nelle donne?
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Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo alla spiralizzazione del DNA?
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Cosa si determina se si sostituisce il nono nucleotide guanina con adenina in una sequenza codificante?
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Qual è l'unità fondamentale della cromatina?
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Quale meccanismo è coinvolto nel rilascio del tRNA dalla subunità ribosomiale?
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Quale struttura si presenta visibilmente come una macchia basofila nei nuclei eucromatici?
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Che tipo di RNA è coinvolto nello splicing?
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Cosa comporterebbe una mutazione che crea una tripletta di stop?
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Quale affermazione descrive correttamente il fenomeno dell'imprinting genomico?
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Quale componente non è coinvolto nella sintesi delle proteine?
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Quale affermazione è vera sui corpi di Barr in caso di aneuploidia?
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Cosa provoca la metilazione degli istoni?
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Quale affermazione riguardo alla struttura del DNA è corretta?
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Cosa determina il modello di Watson e Crick?
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Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo alla regola di Chargaff?
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Quale forma fisica del DNA è associata ai mitocondri?
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Qual è la differenza principale tra eucromatina ed eterocromatina?
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Quale affermazione sulla stabilità del DNA è corretta?
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Quale delle seguenti proprietà del DNA consente la variazione genetica?
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Durante quale fase del ciclo cellulare la cromatina eucromatica è attiva?
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Qual è il risultato dello splicing alternativo?
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Quale affermazione sui promotori è corretta?
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Quale dei seguenti enunciati sui silenziatori è vero?
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Qual è la sequenza corretta dell'mRNA trascritto dal filamento coding 5’ - AGTTACGTACTTAGCTAATCGTCA - 3’?
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In quale processo si prevede la conversione dell'mRNA in una sequenza di amminoacidi?
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Cosa sono gli enhancers in relazione alla trascrizione?
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Qual è la funzione principale degli introni durante lo splicing?
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Qual è la corretta definizione di sequenze consenso?
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Qual è la principale differenza tra il ciclo litico e il ciclo lisogeno dei virus?
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Cosa succede all’operone lac in assenza di lattosio?
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Quale dei seguenti elementi caratterizza un provocatore nel ciclo lisogeno?
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Cosa rappresenta un allele?
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Quale affermazione è corretta riguardo ai cromosomi omologhi?
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Cosa distingue un organismo omozigote da uno eterozigote?
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Qual è la funzione principale dell'RNA polimerasi nell'operone lac?
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Cosa caratterizza il fenotipo di un organismo?
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Cosa indica il concetto di locus in riferimento ai geni?
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Quale di queste affermazioni non è vera riguardo alla riproduzione sessuata?
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Study Notes
Fondamenti di Genetica
- La genetica studia i meccanismi dell'ereditarietà.
- Il DNA è una macromolecola, molto stabile, che rappresenta l'1% delle molecole in una cellula procariotica.
- Il DNA è capace di replicarsi fedelmente e codificare RNA e proteine.
- Subisce mutazioni, che determinano la variabilità genetica e l'evoluzione degli organismi.
Struttura del DNA
- L'acido desossiribonucleico (DNA) è un polimero di nucleotidi.
- I filamenti di DNA sono antiparalleli, ovvero il senso di un filamento è opposto a quello del filamento complementare.
- Ogni catena presenta un'estremità 5' con un gruppo fosfato e un'estremità 3' con un gruppo ossidrile.
- L'estremità 5' di un filamento corrisponde all'estremità 3' dell'altro filamento.
- Il DNA ha una struttura a doppia elica, con andamento destrorso.
- Le due catene sono unite da legami idrogeno tra le basi azotate.
Modelli di Watson e Crick (1953)
- Il modello di Watson e Crick descrive la struttura del DNA come una doppia elica.
- Ogni molecola di DNA è composta da due filamenti avvolti.
- Le due catene hanno andamento antiparallelo.
- I due filamenti sono uniti da legami idrogeno fra le basi azotate.
Forme fisiche del DNA naturale
- Il DNA può essere lineare a catena singola o circolare a catena singola.
- Può essere anche lineare o circolare a doppia elica.
Regola di Chargaff
- In una singola molecola di DNA a doppio filamento, il rapporto tra basi puriniche (A+G) e pirimidiniche (T+C) è 1:1.
- La percentuale di adenina è uguale a quella di timina e la percentuale di guanina è uguale a quella di citosina (A=T e G=C).
Cromatina
- La cromatina è un complesso di DNA, RNA e proteine basiche (ad esempio, istoni), neutre e acide.
- È complessivamente basofila.
- Presenta diversi livelli di superavvolgimento, come eucromatina (cromatina attiva) ed eterocromatina (cromatina inattiva).
Eucromatina
- Appare chiara al TEM e al MO.
- La cromatina è decondensata.
- Il DNA può essere trascritto in mRNA (interfase del ciclo cellulare).
- Cellule che producono proteine (neuroni, epatociti, ghiandole).
Eterocromatina
- Appare scura al TEM e al MO.
- La cromatina è condensata.
- Il DNA non viene trascritto (fase M del ciclo cellulare).
- Cellule che producono poche proteine (osteociti, spermatozoi).
Epigenetica
- L'epigenetica è una branca della genetica che studia i cambiamenti fenotipici ereditabili senza variazioni nel genotipo.
- I meccanismi epigenetici includono la metilazione del DNA e la modificazione covalente degli istoni.
- L'imprinting genomico è un fenomeno epigenetico che si basa sulla metilazione del DNA e determina l'espressione di alcuni geni a seconda del genitore da cui vengono ereditati.
Corpi di Barr
- Cromosoma X inattivato nelle donne.
- Ben visibile nei nuclei eucromatici, si presenta come una macchia basofila.
- In ogni cellula viene inattivato uno dei due cromosomi X.
- Se i cromosomi X sono più di due (aneuploidia), vengono inattivati tutti tranne uno.
- n° corpi di Barr = n° cromosomi X - 1
Avvolgimenti del DNA
- I diversi livelli di avvolgimento del DNA impattano sull'accessibilità del DNA e sull'espressione genica.
- Molecola di DNA, Nucleosomi, Collana di perle, Fibra cromatinica di 30nm, Cromosoma attivo, Cromosoma metafasico.
Replicazione del DNA
- Il DNA si replica in modo semiconservativo.
- Ogni elica madre fa da stampo per un'elica figlia.
- Durante la divisione cellulare, le due copie di doppie eliche seminuove prodotte finiscono in una cellula figlia.
- L'inizio della replicazione prevede l'intervento di topoisomerasi, elicasi, single-strand binding protein (SSB) e primasi (per sintetizzare brevi inneschi di RNA).
- L'allungamento della replicazione prevede DNA polimerasi, lavorando in direzione 5' --> 3'.
- Ci sono due filamenti di replicazione (leading e lagging), dove il lagging crea frammenti di Okazaki.
- La DNA ligasi congiunge i frammenti di Okazaki.
- Il replisoma è il complesso proteico formato dagli enzimi della replicazione.
Procarioti vs Eucarioti
- I procarioti hanno DNA circolare, mentre gli eucarioti hanno DNA lineare.
- Una sola forcella di replicazione nei procarioti, più forcelle nelle cellule eucariotiche.
Enzimi coinvolti nella replicazione del DNA
- DNA polimerasi
- Topoisomerasi
- Elicasi
Espansione di informazioni
- Il dogma centrale della biologia illustra il flusso di informazioni dal DNA all'RNA alle proteine.
- Solo una piccola parte del DNA (geni) viene trascritta in RNA complementare. Negli eucarioti, gli RNA codificanti vengono modificati prima della traduzione. Un singolo mRNA procariotico è policistronico, mentre i mRNA eucariotici sono monocistronici.
Promotore
- Sequenza segnale di DNA prossima al gene che contiene la TATA box.
- Interagisce con fattori di trascrizione per posizionare l'RNA polimerasi e iniziare la trascrizione.
Sequenze regolatrici
- Enhancers: regioni anche distanti dal gene e favoriscono la trascrizione.
- Silencers: regioni che inibiscono l'attività trascrizionale e attraggono repressori.
Trascrizione
- Viene trascritto solo uno dei due filamenti del DNA.
- L'RNA polimerasi sintetizza l'mRNA in direzione 5' --> 3'.
- L'mRNA è una copia complementare dell'antisenso di un gene.
- Alla timina viene sostituito l'uracile.
- La terminazione si verifica quando la RNA polimerasi incontra il segnale di terminazione.
Maturazione dell'mRNA
- L'mRNA viene modificato post-trascrizionalmente con capping all'estremità 5' e poliadenilazione all'estremità 3', in aggiunta al splicing.
- Capping: aggiunta di una guanosina modificata all'estremità 5'.
- Poliadenilazione: aggiunta di una sequenza di adenosine (coda poli-A) all'estremità 3'.
- Splicing: rimozione delle regioni introniche e giunzione degli esoni, contenenti amminoacidi.
Splicing alternativo
- Meccanismo di splicing in cui possono essere ottenuti mRNA differenti a partire dal medesimo pre-mRNA, portando alla sintesi di proteine diverse (isoforme proteiche).
Regolazione pre-trascrizionale
- I promotori, enhancers, silencers, sono sequenze regolatrici.
- I geni vengono riconosciuti dall'RNA polimerasi e i processi post trascrizionali ne influenzano la sintesi.
Traduzione
- Processo che converte l'mRNA in una sequenza di amminoacidi.
- Esso prevede l'intervento di ribosomi, tRNA (molecole adattatrici), amminoacil-tRNA sintetasi (enzimi che caricano gli amminoacidi sui tRNA), e diversi fattori di inizio, allungamento e terminazione.
Codice genetico
- È degenerato: più triplette possono codificare per lo stesso amminoacido.
- Ogni tripletta codifica per al più un amminoacido.
- È universale: è valido per tutte le forme di vita conosciute.
- Ci sono delle eccezioni al codice genetico universale, in particolare nei mitocondri.
Ribosomi e tRNA
- I ribosomi sono le macchine cellulari che leggono le sequenze di mRNA.
- I tRNA trasportano gli amminoacidi e li posizionano nel ribosoma per la sintesi proteica.
Traduzione: inizio, allungamento e terminazione
- Inizio: Il ribosoma si lega all'mRNA, e il primo tRNA caricato con metionina si lega al codone d'inizio AUG, formando il complesso di inizio.
- Allungamento: Il ribosoma si muove lungo l'mRNA, aggiungendo amminoacidi al polipeptide in crescita secondo l'informazione di sequenza dell'mRNA per ogni codone. Il tRNA caricato con il secondo amminoacido si lega al sito A e l'enzima peptidil-transferasi catalizza il legame peptidico. Il tRNA legato al polipeptide si sposta al sito P, e il ribosoma si sposta al codone successivo dell'mRNA.
- Terminazione: Un fattore di rilascio si lega al codone di stop sull'mRNA, causando la separazione del polipeptide completamento dalla macchina di sintesi proteica, e le subunità ribosomiali si separano.
Eccezioni al codice genetico (Selenocisteina e Pirrolisina)
- Sono amminoacidi extra rispetto al codice genetico standard.
- Sono codificati da codoni di stop (UGA e UAG), ma sequenze di mRNA particolari influenzano la traduzione.
Cariotipo
- Rappresentazione visiva dei cromosomi di una cellula.
- Mostra il numero e la forma dei cromosomi per una diagnosi di malattie genetiche.
- Il cariotipo normale negli esseri umani è costituito da 46 cromosomi (22 paia di autosomi e una di eterosomi o cromosomi sessuali).
Cromosomi sessuali
- Tutte le cellule umane hanno 22 paia di cromosomi autosomici e una coppia di cromosomi sessuali.
- Ci sono due tipi di cromosomi sessuali: X e Y.
- Le femmine hanno una coppia di cromosomi X e i maschi hanno un cromosoma X e uno Y.
Alberi genealogici
- Sono utili per tracciare la trasmissione di malattie genetiche nelle famiglie.
- Aiuta a identificare se un carattere è dominante o recessivo e se è legato all'autosomi, ai cromosomi sessuali o ai mitocondri.
Malattie genetiche
- Autosomica recessiva
- Autosomica dominante
- X-linked recessiva
- X-linked dominante
- Mitocondriale
Mutazioni genomiche
- Delezioni, Duplicazioni, Inserzioni, Traslocazioni.
- Aneuploidie: Numero anormale di cromosomi. (es: Trisomia 21 - sindrome di Down)
- Monosomie: Assenza di un cromosoma. (es: Sindrome di Turner: mancanza di un cromosoma X in una femmina)
- Trisomie: Presenza di un cromosoma extra. (es: Sindrome di Down: presenza di un cromosoma 21 extra)
Mutazioni
- Geniche: mutazioni a livello di singoli geni (es: mutazioni puntiformi, frame-shift).
- Genomiche: mutazioni a livello dell'intero corredo cromosomico.
- Cromosomiche: mutazioni nella struttura dei cromosomi (es: delezioni, duplicazioni, inversione, traslocazioni).
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