29 Questions
Che cosa si può studiare grazie alle piattaforme di nuova generazione?
Le modificazioni epigenetiche sull'RNA
Quale tecnica molecolare è stata una delle prime applicazioni per studiare l'espressione genica?
Il Northern blot
Che cosa vengono utilizzati per rilevare il prodotto di amplificazione nella PCR real-time?
Sonde marcate con fluorocromi
Come vengono studiate le differenze nell'espressione genica tra cellule diverse?
Confrontando l'espressione di geni in cellule trattate con farmaci rispetto alle cellule di controllo
Che cosa possono essere utilizzati per studiare le isoforme di espressione delle proteine?
Le piattaforme di nuova generazione
Che cosa si possono studiare grazie alle piattaforme di nuova generazione per esprimere i geni di fusione?
I geni di fusione
Perché le grandi piattaforme di terza e quarta generazione hanno un'accuratezza inferiore rispetto alle piattaforme di sequenziamento di ultima generazione?
Perché il segnale che si accumula è troppo intenso per discriminare a quante basi uguali è associato
Cosa avviene nella fase di preparazione dei campioni per la sequenziamento?
La miscela di frammenti da sequenziare si carica nel capillare
Cosa rappresenta la ione sphere particle?
Le biglie ricoperte che si generano durante la PCR ad emulsione
Che cosa avviene durante la fase di incorporazione del nucleotide terminatore?
Si forma il segnale che si accumula
Che cosa permette la fase successiva dopo la PCR ad emulsione?
La selezione delle biglie che sono ricoperte dallo stesso frammento di DNA
Che cosa fa il Pirosequenziatore?
L'amplificazione clonale mediante la PCR ad emulsione
In cosa consiste il segnale rilevato nella piattaforma Ion Torrent?
Una variazione di pH
Come avviene l'amplificazione clonale nella piattaforma Illumina?
Con la PCR a ponte
Perché il costo e la manutenzione delle piattaforme Illumina è più elevato?
Perché hanno bisogno di laser capaci di rilevare la fluorescenza
Cosa significa l'acronimo SMRT nella piattaforma PACBIO?
Single Molecule Real Time
Qual è la caratteristica principale della piattaforma SMRT di PACBIO?
Consente di sequenziare le singole molecole in maniera diretta e immediata
Quale è la principale differenza tra la piattaforma Ion Torrent e la piattaforma Illumina?
La piattaforma Ion Torrent utilizza una variazione di pH come segnale, mentre la piattaforma Illumina utilizza un segnale fluorescente
Che cosa determina il colore dell'emissione fluorescente?
La differenza nell'espressione del gene tra cellula normale e cellula tumorale
Che cosa viene aggiunto ai frammenti generati dal materiale di partenza?
Adattatori
Perché è utile avere sequenze paired end?
Per aumentare la qualità del dato
Cos'è l'obiettivo finale del processo di sequenziamento?
Raggiungere la quantizzazione dell'espressione dei geni
Che cosa viene utilizzato per allineare le sequenze generate?
I trascritti di riferimento
Che cosa accade alla procedura sperimentale con le piattaforme di nuova generazione?
Cambia, perché si deve passare attraverso una trascrizione inversa
Perché l'estrazione sequenziale del DNA non è considerata unvero replicato biologico?
Perché non è più rappresentativa dello stato iniziale dopo un giorno
Quale tipo di replicato è più facile da ottenere nei pazienti?
Replicato tecnico
Perché è importante avere un gruppo numeroso di pazienti per valutare la significatività di un risultato?
Perché alcuni pazienti possono non rispondere come previsto
Cosa si ottiene attraverso l'estrazione del DNA da una biopsia o un campione di sangue?
Un campione di DNA
Quale è il problema principale dell'estrazione sequenziale del DNA?
Non rappresenta più lo stato iniziale del campione
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