Sequenziamento del DNA

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Questions and Answers

Che cosa si può studiare grazie alle piattaforme di nuova generazione?

  • Le isoforme di espressione dei geni
  • Le modificazioni epigenetiche sull'RNA (correct)
  • Le proteine esprimibili
  • La struttura del DNA

Quale tecnica molecolare è stata una delle prime applicazioni per studiare l'espressione genica?

  • La tecnica di sequenziamento
  • La PCR real-time
  • La trasformazione genica
  • Il Northern blot (correct)

Che cosa vengono utilizzati per rilevare il prodotto di amplificazione nella PCR real-time?

  • Anticorpi monoclonali
  • Marcatrici radioattive
  • Sonde marcate con fluorocromi (correct)
  • Enzimi di restrizione

Come vengono studiate le differenze nell'espressione genica tra cellule diverse?

<p>Confrontando l'espressione di geni in cellule trattate con farmaci rispetto alle cellule di controllo (A)</p> Signup and view all the answers

Che cosa possono essere utilizzati per studiare le isoforme di espressione delle proteine?

<p>Le piattaforme di nuova generazione (C)</p> Signup and view all the answers

Che cosa si possono studiare grazie alle piattaforme di nuova generazione per esprimere i geni di fusione?

<p>I geni di fusione (A)</p> Signup and view all the answers

Perché le grandi piattaforme di terza e quarta generazione hanno un'accuratezza inferiore rispetto alle piattaforme di sequenziamento di ultima generazione?

<p>Perché il segnale che si accumula è troppo intenso per discriminare a quante basi uguali è associato (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa avviene nella fase di preparazione dei campioni per la sequenziamento?

<p>La miscela di frammenti da sequenziare si carica nel capillare (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa rappresenta la ione sphere particle?

<p>Le biglie ricoperte che si generano durante la PCR ad emulsione (A)</p> Signup and view all the answers

Che cosa avviene durante la fase di incorporazione del nucleotide terminatore?

<p>Si forma il segnale che si accumula (B)</p> Signup and view all the answers

Che cosa permette la fase successiva dopo la PCR ad emulsione?

<p>La selezione delle biglie che sono ricoperte dallo stesso frammento di DNA (A)</p> Signup and view all the answers

Che cosa fa il Pirosequenziatore?

<p>L'amplificazione clonale mediante la PCR ad emulsione (D)</p> Signup and view all the answers

In cosa consiste il segnale rilevato nella piattaforma Ion Torrent?

<p>Una variazione di pH (A)</p> Signup and view all the answers

Come avviene l'amplificazione clonale nella piattaforma Illumina?

<p>Con la PCR a ponte (D)</p> Signup and view all the answers

Perché il costo e la manutenzione delle piattaforme Illumina è più elevato?

<p>Perché hanno bisogno di laser capaci di rilevare la fluorescenza (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa significa l'acronimo SMRT nella piattaforma PACBIO?

<p>Single Molecule Real Time (B)</p> Signup and view all the answers

Qual è la caratteristica principale della piattaforma SMRT di PACBIO?

<p>Consente di sequenziare le singole molecole in maniera diretta e immediata (D)</p> Signup and view all the answers

Quale è la principale differenza tra la piattaforma Ion Torrent e la piattaforma Illumina?

<p>La piattaforma Ion Torrent utilizza una variazione di pH come segnale, mentre la piattaforma Illumina utilizza un segnale fluorescente (A)</p> Signup and view all the answers

Che cosa determina il colore dell'emissione fluorescente?

<p>La differenza nell'espressione del gene tra cellula normale e cellula tumorale (C)</p> Signup and view all the answers

Che cosa viene aggiunto ai frammenti generati dal materiale di partenza?

<p>Adattatori (C)</p> Signup and view all the answers

Perché è utile avere sequenze paired end?

<p>Per aumentare la qualità del dato (C)</p> Signup and view all the answers

Cos'è l'obiettivo finale del processo di sequenziamento?

<p>Raggiungere la quantizzazione dell'espressione dei geni (A)</p> Signup and view all the answers

Che cosa viene utilizzato per allineare le sequenze generate?

<p>I trascritti di riferimento (A)</p> Signup and view all the answers

Che cosa accade alla procedura sperimentale con le piattaforme di nuova generazione?

<p>Cambia, perché si deve passare attraverso una trascrizione inversa (B)</p> Signup and view all the answers

Perché l'estrazione sequenziale del DNA non è considerata unvero replicato biologico?

<p>Perché non è più rappresentativa dello stato iniziale dopo un giorno (D)</p> Signup and view all the answers

Quale tipo di replicato è più facile da ottenere nei pazienti?

<p>Replicato tecnico (B)</p> Signup and view all the answers

Perché è importante avere un gruppo numeroso di pazienti per valutare la significatività di un risultato?

<p>Perché alcuni pazienti possono non rispondere come previsto (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa si ottiene attraverso l'estrazione del DNA da una biopsia o un campione di sangue?

<p>Un campione di DNA (B)</p> Signup and view all the answers

Quale è il problema principale dell'estrazione sequenziale del DNA?

<p>Non rappresenta più lo stato iniziale del campione (B)</p> Signup and view all the answers

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