Replicazione del DNA

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Questions and Answers

Quale delle seguenti affermazioni descrive correttamente il modello di replicazione del DNA semiconservativo?

  • Frammenti casuali di DNA parentale vengono utilizzati come modelli per creare nuove molecole di DNA, risultando in due nuove molecole di DNA con filamenti parentali e nuovi mischiati in modo casuale.
  • Un solo filamento di DNA parentale viene utilizzato come modello per creare una nuova molecola di DNA, mentre l'altro filamento viene scartato.
  • Ogni filamento di DNA parentale viene utilizzato come modello per creare un nuovo filamento, risultando in due nuove molecole di DNA, ciascuna contenente un filamento originale e uno nuovo. (correct)
  • Entrambi i filamenti di DNA parentale vengono utilizzati come modelli per creare due nuove molecole di DNA completamente nuove.

Quale dei seguenti enzimi è responsabile della sintesi di un primer durante la replicazione del DNA?

  • DNA elicasi
  • Primasi (correct)
  • DNA polimerasi 𝛃
  • DNA ligasi

Quale delle seguenti affermazioni descrive correttamente il ruolo dell'origine di replicazione (ori) nel processo di replicazione del DNA?

  • L'origine di replicazione è il punto in cui viene prodotto il primer di RNA.
  • L'origine di replicazione è il sito in cui i nuovi nucleotidi vengono aggiunti al nuovo filamento di DNA.
  • L'origine di replicazione è la regione in cui la doppia elica del DNA viene separata per formare due filamenti stampo. (correct)
  • L'origine di replicazione è il punto in cui la DNA polimerasi si lega al DNA per iniziare la replicazione.

Qual è il ruolo della DNA elicasi durante la replicazione del DNA?

<p>La DNA elicasi separa i due filamenti di DNA parentale. (B)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo alla replicazione del DNA in E.coli?

<p>La replicazione del DNA in E.coli richiede circa 40 minuti. (D)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni descrive correttamente il processo di appaiamento delle basi durante la replicazione del DNA?

<p>Ogni nucleotide si lega al suo nucleotide complementare sul filamento stampo attraverso legami idrogeno. (C)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo alla replicazione del DNA negli eucarioti?

<p>Gli eucarioti hanno più origini di replicazione sui loro cromosomi. (A)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti opzioni è la struttura primaria del DNA?

<p>Sequenza di nucleotidi. (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la temperatura utilizzata per la denaturazione dei filamenti di DNA nella PCR?

<p>95 °C (A)</p> Signup and view all the answers

Quale componente della miscela PCR è essenziale per mantenere il pH neutro?

<p>Sali (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo dei primer nella PCR?

<p>Appaiarsi ai filamenti stampo (C)</p> Signup and view all the answers

Quanti cicli di amplificazione vengono generalmente eseguiti in una reazione PCR?

<p>25-30 cicli (C)</p> Signup and view all the answers

Da quale batterio viene estratta la DNA polimerasi utilizzata nella PCR?

<p>Thermus aquaticus (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo principale della telomerasi nelle cellule che si dividono continuamente?

<p>Aggiunge sequenze telomeriche perse (A)</p> Signup and view all the answers

Perché il problema della replicazione alla fine dei cromosomi non esiste nei procarioti?

<p>Perché il DNA procariotico è circolare (A)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni sul processo di correzione di bozze è corretta?

<p>Rimuove nucleotidi erroneamente appaiati durante la sintesi (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è il compito della DNA polimerasi 𝛼 nella sintesi del filamento ritardato?

<p>Sintetizzare il primer (D)</p> Signup and view all the answers

Quale meccanismo di riparazione del DNA rimuove direttamente le basi danneggiate?

<p>Riparazione per escissione (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa avviene se il sistema di riparazione degli appaiamenti errati fallisce?

<p>Il DNA rimane incorretto e potrebbe causare mutazioni (A)</p> Signup and view all the answers

Quale affermazione riguarda il DNA telomerico?

<p>È una sequenza di DNA alla fine di un cromosoma che non codifica per proteine (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è il principale fattore di rischio che può danneggiare il DNA?

<p>Radiazioni UV (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è la caratteristica fondamentale della struttura del DNA?

<p>E' un'elica a doppio filamento (A), E' destrorsa e antiparallela (C)</p> Signup and view all the answers

Quale affermazione descrive correttamente l'appaiamento delle basi?

<p>Una purina si appaia con una pirimidina (B)</p> Signup and view all the answers

In quale direzione cresce una catena di acidi nucleici?

<p>Da 5' a 3' (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa tengono insieme le due catene di DNA?

<p>Legami a idrogeno tra le basi (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è la funzione dei gruppi fosfato nel DNA?

<p>Collegano il carbonio 3′ di uno zucchero col carbonio 5′ di un altro zucchero (D)</p> Signup and view all the answers

Quale di queste affermazioni sui solchi della doppia elica è corretta?

<p>I bordi esterni delle coppie di basi sono esposti nei solchi (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa distingue il solco maggiore dal solco minore nella doppia elica del DNA?

<p>Hanno diverse larghezze e profondità (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è l'estremità iniziale della catena di DNA?

<p>Estremità 5' con gruppo fosfato (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la direzione in cui un filamento di DNA può essere sempre sintetizzato?

<p>5’-3’ (C)</p> Signup and view all the answers

Quale DNA polimerasi è considerata l'enzima principale della replicazione nei procarioti?

<p>DNA polimerasi III (B)</p> Signup and view all the answers

Quale funzione ha il DNA primasi nel processo di replicazione del DNA?

<p>Sintetizzare il primer (A)</p> Signup and view all the answers

Che cosa impediscono i telomeri ai cromosomi eucariotici?

<p>Essere accorpati da riparazione (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la caratteristica principale delle DNA polimerasi?

<p>Sono processive (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa succede ai cromosomi ad ogni replicazione a causa dell'azione dei telomeri?

<p>Diventano più corti (A)</p> Signup and view all the answers

Quale di queste affermazioni è vera riguardo ai filamenti di DNA?

<p>I filamenti decorrono con polarità opposte (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la funzione della pinza scorrevole nel complesso DNA polimerasi-DNA?

<p>Stabilizzare il complesso (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa costituisce un nucleotide?

<p>Uno zucchero pentoso, una base azotata e un gruppo fosfato (B)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni riguarda la relazione tra purine e pirimidine nel DNA?

<p>La quantità di purine è uguale alla quantità di pirimidine (C)</p> Signup and view all the answers

Che tipo di legame si forma tra la base e lo zucchero in un nucleoside?

<p>Legame covalente (C)</p> Signup and view all the answers

Quale dei seguenti metodi ha fornito evidenze sulla struttura del DNA?

<p>Diffrazione dei raggi X (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è il diametro di un filamento di DNA?

<p>2.0 nm (B)</p> Signup and view all the answers

Chi sono i due scienziati che hanno proposto il modello della doppia elica del DNA?

<p>Watson e Crick (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la direzione dei due filamenti di DNA?

<p>Sono antiparalleli (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è la composizione percentuale delle basi azotate nel DNA umano?

<p>A = T = 30%; G = C = 20% (D)</p> Signup and view all the answers

Flashcards

Reazione a catena della polimerasi (PCR)

Una tecnica di laboratorio usata per amplificare (creare copie multiple) di un segmento specifico di DNA.

Denaturazione del DNA

La fase iniziale della PCR in cui i filamenti di DNA vengono separati per riscaldamento.

Annealing

La fase della PCR in cui i primer si legano al DNA stampo.

Allungamento

La fase della PCR in cui la DNA polimerasi sintetizza nuovi filamenti di DNA.

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Long Products

I frammenti di DNA delimitati solo dal lato in cui i primer si ibridano.

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DNA ligasi

Un enzima che lega insieme i frammenti di DNA, creando il legame fosfodiestere finale.

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Filamento ritardato

Il filamento di DNA sintetizzato in modo discontinuo durante la replicazione, in direzione opposta al filamento guida.

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Primer

Un breve tratto di RNA necessario per iniziare la replicazione del DNA. Viene sintetizzato dalla DNA primasi.

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DNA polimerasi

L'enzima principale che aggiunge nucleotidi all'estremità 3' di un filamento di DNA durante la replicazione.

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Filamento guida

Il filamento di DNA che viene sintetizzato in modo continuo durante la replicazione.

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Direzionalità del DNA

La direzione in cui viene sintetizzato il DNA, sempre da 5' a 3'.

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Processività

La capacità di un enzima di legarsi a un substrato e catalizzare molte reazioni in successione senza disaccoppiarsi.

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Telomeri

Sequenze ripetitive di DNA all'estremità dei cromosomi eucariotici che proteggono i cromosomi dalla degradazione.

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Doppia elica del DNA

Il DNA è costituito da due filamenti avvolti a spirale intorno a un asse centrale, formando una struttura a doppia elica.

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Direzione del DNA

La direzione di un filamento di DNA è determinata dalla posizione dei suoi gruppi fosfato, da 5' a 3', in base al numero del carbonio dello zucchero al quale il gruppo fosfato è legato.

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Filamenti antiparalleli

I due filamenti di DNA corrono in direzioni opposte, con un'estremità 5' di un filamento che si appaia all'estremità 3' dell'altro filamento.

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Appaiamento delle basi

Le basi azotate, adenina (A), guanina (G), citosina (C) e timina (T), si legano tra loro in coppie specifiche (A-T e G-C), formando legami a idrogeno.

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Stabilità della struttura

Le due catene di DNA sono tenute insieme da legami a idrogeno tra le basi, nonché da forze di Van der Waals tra le basi adiacenti sullo stesso filamento.

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Solchi maggiori e minori

Le coppie di basi esposte nei solchi maggiori e minori possono interagire con proteine ​​e altre molecole, creando siti di legame specifici.

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Elica destrorsa

L'elica del DNA è destrorsa, il che significa che gira verso destra quando osservata dall'alto.

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Regola di Chargaff

Nella struttura del DNA, una purina (A o G) si appaia sempre con una pirimidina (T o C), garantendo un'ampiezza uniforme dell'elica.

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Il DNA memorizza informazioni genetiche

Il DNA memorizza le informazioni genetiche sotto forma di sequenze di basi azotate. Milioni di nucleotidi formano sequenze che contengono un'enorme quantità di informazioni.

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Il DNA è suscettibile alle mutazioni

Le sequenze di basi azotate nel DNA possono subire delle modifiche, chiamate mutazioni. Queste modifiche possono avere un impatto sulle informazioni genetiche e sulle proteine che vengono prodotte.

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Replicazione del DNA

Durante la divisione cellulare, il DNA viene copiato con grande precisione. Il processo di replicazione si basa sul principio di appaiamento complementare delle basi: ogni base del filamento originale trova la sua base complementare sul nuovo filamento.

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Espressione genica

L'informazione genetica codificata nel DNA viene espressa in un fenotipo, ovvero nelle caratteristiche fisiche e biologiche che un organismo manifesta.

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Replicazione semiconservativa

La replicazione semiconservativa del DNA prevede che ogni filamento parentale serva da stampo per la creazione di un nuovo filamento. Ogni nuova molecola di DNA avrà un filamento vecchio e uno nuovo.

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Origine di replicazione (ori)

La replicazione del DNA inizia quando un complesso proteico si lega ad una regione specifica del DNA chiamata origine di replicazione (ori). Questo complesso svolge la doppia elica, dando inizio alla duplicazione.

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Sintesi del nuovo filamento di DNA

I nuovi nucleotidi vengono aggiunti al nuovo filamento di DNA all'estremità 3'. Il legame tra i nucleotidi avviene grazie a una reazione di condensazione che libera energia.

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Primasi e primer

La primasi è un enzima che sintetizza un breve filamento di RNA chiamato primer. Questo primer serve come punto di partenza per la DNA polimerasi, che inizia la replicazione del nuovo filamento di DNA.

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Cos'è il DNA?

Il DNA è un polimero costituito da subunità chiamate nucleotidi. Ogni nucleotide è composto da tre parti: uno zucchero pentoso (desossiribosio nel DNA), una base azotata e un gruppo fosfato.

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Quali sono le basi azotate del DNA e come si appaiano?

Le basi azotate del DNA sono adenina (A), guanina (G), citosina (C) e timina (T). Le adenine si legano alle timine (A-T) e le guanine si legano alle citosine (G-C) attraverso legami idrogeno.

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Che differenza c'è tra un nucleoside e un nucleotide?

Un nucleoside è composto da uno zucchero pentoso e una base azotata. Un nucleotide è un nucleoside legato a un gruppo fosfato.

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Descrivi la struttura del DNA.

La struttura del DNA è una doppia elica a spirale. Le due catene di DNA sono antiparallele, cioè corrono in direzioni opposte. Lo scheletro del DNA è formato da gruppi zucchero-fosfato, mentre le basi azotate sono rivolte verso l'interno della doppia elica.

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Quali sono le regole di Chargaff?

Le regole di Chargaff indicano che la quantità di adenina (A) è uguale a quella di timina (T), e la quantità di guanina (G) è uguale a quella di citosina (C). Questo perché le basi azotate si appaiano in modo specifico (A-T e G-C).

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Come è stata determinata la struttura del DNA?

La diffrazione dei raggi X è stata una tecnica fondamentale per determinare la struttura del DNA. Rosalind Franklin ha utilizzato questa tecnica per ottenere immagini che hanno mostrato la forma a doppia elica del DNA.

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Perché la struttura del DNA è così importante?

La struttura del DNA è altamente conservata negli organismi viventi. Questo significa che la disposizione delle basi azotate è molto simile in tutte le specie, anche se il numero totale di basi può variare.

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Qual è la funzione del DNA?

Il DNA è il materiale genetico che contiene le informazioni per costruire e mantenere un organismo. Il DNA viene replicato per creare copie di sé stesso, permettendo la trasmissione delle informazioni genetiche alle cellule figlie.

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Telomeri e loro importanza nella replicazione

Le estremità dei cromosomi sono chiamate telomeri. Durante la replicazione del DNA, una parte di questi telomeri si perde ad ogni ciclo di replicazione, il che può portare alla perdita di informazioni genetiche e alla morte cellulare.

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La telomerasi: un 'salvatore' dei telomeri

La telomerasi è un enzima che aggiunge sequenze telomeriche alle estremità dei cromosomi, compensando la perdita che si verifica durante la replicazione del DNA. È particolarmente importante nelle cellule che si dividono continuamente, come le cellule staminali.

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La replicazione del DNA nei procarioti: un processo diverso

Negli organismi procarioti, il DNA è circolare, quindi la replicazione non comporta la perdita di sequenze alle estremità. Non affrontano il problema della perdita dei telomeri che si verifica negli eucarioti.

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Il filamento ritardato e i frammenti di Okazaki: la complessità della replicazione

Durante la replicazione del DNA, il filamento ritardato viene sintetizzato in modo discontinuo, con brevi frammenti chiamati frammenti di Okazaki. Questi frammenti devono essere uniti, il che richiede la rimozione del primer di RNA e la sua sostituzione con DNA.

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Errori durante la replicazione del DNA e i sistemi di riparazione

La DNA polimerasi può commettere errori durante la replicazione e il DNA può essere danneggiato da vari fattori. Le cellule dispongono di sistemi di riparazione per correggere questi errori e danni.

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Correzione di bozze: un controllo di qualità durante la replicazione

La correzione di bozze è un processo che avviene durante la replicazione del DNA, in cui la DNA polimerasi verifica l'appaiamento dei nucleotidi e corregge gli errori in tempo reale.

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Riparazione di appaiamenti errati: una rete di sicurezza

Questo sistema di riparazione identifica e corregge gli errori di appaiamento tra i nucleotidi che non sono stati corretti durante la replicazione. Si basa su una serie di proteine che riconoscono e correggono gli appaiamenti errati.

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Riparazione per escissione: rimuovere e sostituire

In questo processo, le basi danneggiate del DNA vengono rimosse dagli enzimi ed è una delle principali vie di riparazione del danno del DNA.

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Study Notes

Replicazione del DNA

  • Il DNA è un acido nucleico polimerico formato da nucleotidi.
  • I nucleotidi sono composti da:
    • uno zucchero pentoso (5 atomi di carbonio)
    • una base azotata: purine o pirimidine
    • un gruppo fosfato (-H₂PO₄)
  • Un nucleoside è formato da uno zucchero pentoso e una base azotata.
  • Le basi azotate possono essere pirimidine o purine.
  • Le pirimidine sono citosina (C) e timina (T).
  • Le purine sono adenina (A) e guanina (G).
  • Il gruppo fosfato si lega al carbonio 5' dello zucchero e la base azotata al carbonio 1'.
  • Il legame tra i nucleotidi è un legame fosfodiesterico, tra il carbonio 3' di uno zucchero e il carbonio 5' dello zucchero successivo.
  • La direzione della catena di DNA è 5'→3'.
  • Le basi azotate appaiate sono A con T e G con C (appaiamento complementare).
  • Il DNA è una doppia elica con le basi all'interno e lo scheletro zucchero-fosfato all'esterno.
  • I due filamenti di DNA sono antiparalleli.
  • La struttura del DNA è tenuta unita dai legami a idrogeno tra le basi appaiate e le forze di Van der Waals.
  • I telomeri sono sequenze ripetitive alle estremità dei cromosomi eucariotici.
  • La sequenza dei telomeri negli esseri umani è TTAGGG (ripetuta circa 2500 volte).
  • I telomeri proteggono i cromosomi dalla degradazione o dalla fusione con altri cromosomi.
  • Nei cromosomi eucariotici, la replicazione inizia in più punti o origini di replicazione.
  • I cromosomi procariotici hanno un'unica origine di replicazione.

Modelli di replicazione del DNA

  • Semiconservativa: ogni filamento parentale serve come stampo per un nuovo filamento.
    • Le nuove molecole di DNA hanno un filamento vecchio e uno nuovo.
  • Conservativa: la molecola di DNA originale rimane invariata, e viene costruita una molecola completamente nuova.
  • Dispersiva: i filamenti di DNA nuovi e vecchi sono frammentati e mescolati.

Fasi della replicazione del DNA

  • Inizio: inizia con un complesso proteico al sito ori (origine di replicazione).
    • Il DNA si apre formando una forcella di replicazione.
  • Allungamento: le DNA polimerasi aggiungono nucleotidi al filamento in crescita.
  • Terminazione: la copia del DNA si completa.

DNA polimerasi

  • Le DNA polimerasi catalizzano la sintesi del DNA.
  • Vengono aggiunti nucleotidi all'estremità 3' del nuovo filamento di DNA.
  • Possono anche rimuovere un nucleotide se non è appaiato in modo corretto.
  • La DNA polimerasi I può rimuovere primer di RNA sui frammenti di Okazaki e sostituirli con DNA.

Filamento guida e filamento lento

  • Filamento guida (leading strand): la sintesi del filamento avviene in modo continuo, dalla forcella di replicazione all'estremità 3'.
  • Filamento lento (lagging strand): la sintesi del filamento avviene in modo discontinuo, in frammenti di Okazaki, in direzione 5'→3'.

Enzimi aggiuntivi in replicazione

  • DNA elicasi: apre la doppia elica del DNA.
  • Proteine leganti il singolo filamento (SSB): stabilizzano i filamenti di DNA singoli evitando il riappaiamento.
  • Primer/Primasi: una corta sequenza RNA necessaria per l'inizio della sintesi di nuovi filamenti di DNA.
  • DNA ligasi: lega i frammenti di Okazaki durante la sintesi del filamento lento.

PCR (Polymerase Chain Reaction)

  • La reazione a catena della polimerasi (PCR) è una tecnica di amplificazione del DNA.
  • Le fasi sono denaturazione (95°C), annealing (55°C) ed estensione/elongazione (72°C).
  • Le fasi vengono ripetute per moltiplicare le copie del DNA.
  • Il processo usa DNA polimerasi termo-stabili e primer specifici.

Riparazione del DNA

  • Correzione di bozze: gli errori nell'aggiunta di nucleotidi possono essere corretti immediatamente.
  • Riparazione degli appaiamenti errati: i nucleotidi errati accoppiati nel DNA vengono identificati e modificati.
  • Riparazione per escissione: le basi danneggiate nel DNA vengono rimosse e sostituite.

Telomeri

  • Le estremità di ogni cromosoma sono chiamate telomeri.
  • La funzione dei telomeri è quella di prevenire la fusione dei cromosomi e la perdita di informazioni genetiche durante la divisione.
  • La telomerasi è un enzima in grado di aggiungere sequenze telomeriche per prevenire l'accorciamento dei cromosomi.

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