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Questions and Answers
Quale delle seguenti affermazioni sui geni housekeeping è vera?
Quale delle seguenti affermazioni sui geni housekeeping è vera?
- Le CpG islands sono assenti nei geni housekeeping.
- I promotori dei geni housekeeping possono essere metilati.
- I geni housekeeping sono legati al fattore di trascrizione Sp1. (correct)
- I geni housekeeping sono espressi solo in condizioni particolari.
Qual è l'agenzia principale responsabile della repressione dell'attività trascrizionale tramite metilazione?
Qual è l'agenzia principale responsabile della repressione dell'attività trascrizionale tramite metilazione?
- Fattori di trascrizione Sp1
- Metiltransferasi de novo
- Metilasi di mantenimento (correct)
- Fattore nucleare κB
In che fase dello sviluppo embrionale viene espressa l'epsilon globina?
In che fase dello sviluppo embrionale viene espressa l'epsilon globina?
- Solo dopo la nascita
- In qualsiasi fase dello sviluppo postnatale
- Durante le ultime fasi di sviluppo intrauterino
- Durante le prime fasi dello sviluppo embrionale (correct)
Quale delle seguenti isoforme di globina ha la massima espressione durante la vita adulta?
Quale delle seguenti isoforme di globina ha la massima espressione durante la vita adulta?
Qual è la funzione principale delle metiltransferasi de novo nel contesto dell'espressione genica?
Qual è la funzione principale delle metiltransferasi de novo nel contesto dell'espressione genica?
Cosa impedisce che i promotori dei geni housekeeping vengano metilati?
Cosa impedisce che i promotori dei geni housekeeping vengano metilati?
Qual è il primo passo necessario per passare dalla globina fetale a quella adulta?
Qual è il primo passo necessario per passare dalla globina fetale a quella adulta?
Quale dei seguenti meccanismi è associato alla demetilazione attiva?
Quale dei seguenti meccanismi è associato alla demetilazione attiva?
Che ruolo giocano le citosine carbossiliche nel processo di demetilazione?
Che ruolo giocano le citosine carbossiliche nel processo di demetilazione?
In che anno è stato pubblicato l'articolo che ha chiarito le modalità di demetilazione nelle cellule dei vertebrati?
In che anno è stato pubblicato l'articolo che ha chiarito le modalità di demetilazione nelle cellule dei vertebrati?
Quale enzimatico processo è stato al centro delle critiche, causando l'etichetta di 'grande falso' nella letteratura scientifica?
Quale enzimatico processo è stato al centro delle critiche, causando l'etichetta di 'grande falso' nella letteratura scientifica?
Cosa implica la reversibilità della metilazione nel contesto della trascrizione genica?
Cosa implica la reversibilità della metilazione nel contesto della trascrizione genica?
Quale processo è coinvolto nella demetilazione passiva?
Quale processo è coinvolto nella demetilazione passiva?
Qual è il prodotto finale del processo di demetilazione secondo le modalità chiarite nel 2012?
Qual è il prodotto finale del processo di demetilazione secondo le modalità chiarite nel 2012?
Che tipo di nucleotidi vengono coinvolti nel meccanismo di riparazione delle mutazioni puntiformi?
Che tipo di nucleotidi vengono coinvolti nel meccanismo di riparazione delle mutazioni puntiformi?
Quale delle seguenti affermazioni sui geni housekeeping è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni sui geni housekeeping è corretta?
Qual è il ruolo principale delle metilasi di tipo 1?
Qual è il ruolo principale delle metilasi di tipo 1?
Cosa accade durante la demetilazione del DNA?
Cosa accade durante la demetilazione del DNA?
Qual è la funzione principale delle proteine MeCP2?
Qual è la funzione principale delle proteine MeCP2?
Qual è la relazione tra metilazione del DNA e modulazione dell'espressione genica?
Qual è la relazione tra metilazione del DNA e modulazione dell'espressione genica?
Cosa distingue le metilasi de novo dalle metilasi di mantenimento?
Cosa distingue le metilasi de novo dalle metilasi di mantenimento?
Quale affermazione sull'emimetilazione è vera?
Quale affermazione sull'emimetilazione è vera?
Quale è il principale risultato della metilazione sui nucleosomi?
Quale è il principale risultato della metilazione sui nucleosomi?
Qual è l'impatto della metilazione differenziale su isoforme geniche?
Qual è l'impatto della metilazione differenziale su isoforme geniche?
Come si può descrivere la reversibilità della metilazione?
Come si può descrivere la reversibilità della metilazione?
Flashcards
Demetilazione
Demetilazione
Processo di rimozione dei gruppi metilici dalle citosine del DNA.
Demetilazione attiva
Demetilazione attiva
Processo di demetilazione in cui un enzima (demetilasi) rimuove direttamente i gruppi metilici dalle citosine.
Demetilazione passiva
Demetilazione passiva
Processo di demetilazione in cui si inibisce l'enzima metilasi, portando alla perdita di metilazione durante la replicazione del DNA.
Metilazione
Metilazione
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Reversibilità della metilazione
Reversibilità della metilazione
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Promotore
Promotore
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Metilasi di mantenimento
Metilasi di mantenimento
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Riparazione BER
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Carbossi-citosina/Formil-citosina
Carbossi-citosina/Formil-citosina
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Metiltransferasi di tipo 1
Metiltransferasi di tipo 1
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Metiltransferasi di classe 3 o de novo
Metiltransferasi di classe 3 o de novo
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Geni housekeeping
Geni housekeeping
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Mantenimento del profilo di metilazione
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Isolotti CpG
Isolotti CpG
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Complesso DNA polimerasico
Complesso DNA polimerasico
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Fattore di trascrizione Sp1
Fattore di trascrizione Sp1
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Metilazione del DNA
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Profilo epigenetico
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Modificazioni istoniche
Modificazioni istoniche
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Globina
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Proteine MeCP2
Proteine MeCP2
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Isoforme della globina
Isoforme della globina
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Repressione dell'espressione genica
Repressione dell'espressione genica
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Geni Housekeeping
Geni Housekeeping
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Study Notes
Metilazione e Demetilazione
- Due classi di metil-transferasi sono essenziali per la vita e lo sviluppo dei vertebrati: metilasi di tipo 1 (di mantenimento) e metilasi di classe 3 (de novo).
- Le metilasi di tipo 1 mantengono l'identità di una cellula a livello molecolare, contribuendo all'espressione genica.
- Le metilasi di classe 3 sono cruciali per le ondate morfogenetiche dello sviluppo embrionale.
Mantenimento del Profilo di Metilazione
- La metilasi di mantenimento trasferisce il profilo di metilazione della cellula parentale al filamento neosintetizzato, subito dopo la replicazione.
- Questo processo è parte del complesso della DNA polimerasi, per garantire che la cellula figlia mantenga la sua identità.
- La metilazione è cruciale per mantenere il profilo epigenetico di una cellula, attraverso le modificazione degli istoni e il DNA stesso.
- Il complesso di duplicazione comprende non solo la DNA polimerasi, ma anche altre proteine, come le metil-transferasi e le proteine MeCP2, per ottimizzare la replicazione.
- Queste proteine sigillano il profilo di metilazione una volta stabilita l'espressione genica, per evitare attivazione aberranti.
I Geni Housekeeping
- I geni housekeeping sono espressi costantemente nelle cellule multicellulari.
- Non hanno una tata box, ma hanno isole CpG (ricche di citosine-guanine).
- Sono regolati dal fattore di trascrizione Sp1.
- La metilazione delle citosine, molto abbondanti in questi geni, li mantiene attivi a livelli elevati.
- I promotori dei geni housekeeping non vengono metilati, quindi l'evitare la metilazione di queste regioni è fondamentale.
La Globina
- La globina è un esempio di regolazione dell'espressione genica mediata dalla metilazione.
- Esistono tre isoforme di globina (epsilon, delta e beta) con livelli di espressione che variano durante lo sviluppo.
- I cambiamenti nell'espressione delle isoforme di globina sono dovuti a modificazioni di metilazione che influenzano l'espressione dei promotori.
- Questo esempio evidenzia la flessibilità e la reversibilità dei meccanismi legati alla metilazione per permetter la regolazione dell'espressione genica.
Reversibilità della Metilazione
- Due ipotesi spiegano il processo di demetilazione:
- Demetilazione attiva: enzimi demetilasi rimuovono i gruppi metili dalla citosina.
- Demetilazione passiva: l'inibizione della metil-transferasi di mantenimento porta a una diminuzione delle citosine metilate durante le successive divisioni cellulari.
- La demetilazione è un processo fondamentale per regolare l'espressione genica durante lo sviluppo embrionale.
Processo di Demetilazione
- Il processo di demetilazione coinvolge l'ossidazione della 5-metilcitosina (5mC) catalizzata dalle proteine TET.
- L'ossidazione porta alla formazione di intermedi come 5-idrossimetilcitosina (5hmC), 5-formilcitosina (5fC), e 5-carbossi-citosina (5caC).
- Queste citosine ossidate vengono rimosse dal meccanismo di riparazione del DNA.
- Quindi l'attività di riparazione riconosce queste citosine come danni e le rimuove.
- Inoltre, le proteine TET giocano un ruolo chiave nella demetilazione durante lo sviluppo embrionale.
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Description
Questo quiz esplora le due classi di metil-transferasi fondamentali per i vertebrati: le metilasi di tipo 1 e di classe 3. Esaminerai il loro ruolo nel mantenimento del profilo di metilazione, fondamentale per l'identità cellulare e lo sviluppo embrionale. Scoprirai anche come la metilazione influisce sull'espressione genica.
