Podcast
Questions and Answers
Qui a fait la première description d'une cellule biologique en 1665?
Qui a fait la première description d'une cellule biologique en 1665?
- Ernst Haeckel
- Louis Joblot
- Robert Hooke (correct)
- Antoni van Leeuwenhoek
Quel scientifique a découvert la lithotrophie et la nitrification au XIXe siècle?
Quel scientifique a découvert la lithotrophie et la nitrification au XIXe siècle?
- Jacques Monod
- Louis Pasteur
- Alexander Fleming
- Sergueï Vinogradski (correct)
Qui a opposé le concept de génération spontanée?
Qui a opposé le concept de génération spontanée?
- Ernst Haeckel
- Louis Joblot
- Antoni van Leeuwenhoek (correct)
- Sergueï Vinogradski
Qui a découvert le mode d’organisation en biofilms?
Qui a découvert le mode d’organisation en biofilms?
Quel scientifique a découvert l'interaction entre organismes (antibiotiques)?
Quel scientifique a découvert l'interaction entre organismes (antibiotiques)?
Qui a défini l’écologie et le règne des protistes?
Qui a défini l’écologie et le règne des protistes?
Qui a découvert la fermentation, la stérilisation et la vaccination?
Qui a découvert la fermentation, la stérilisation et la vaccination?
Qui a découvert le cycle du bacille du charbon en 1887?
Qui a découvert le cycle du bacille du charbon en 1887?
Quel scientifique a mis en évidence les virus?
Quel scientifique a mis en évidence les virus?
Qui a dit : « Everything is everywhere, the environment selects »?
Qui a dit : « Everything is everywhere, the environment selects »?
Qu'est-ce que l'écologie microbienne étudie principalement?
Qu'est-ce que l'écologie microbienne étudie principalement?
Quels domaines sont concernés par l'écologie microbienne?
Quels domaines sont concernés par l'écologie microbienne?
Qu'est-ce que la microbiologie environnementale étudie principalement?
Qu'est-ce que la microbiologie environnementale étudie principalement?
Quel est l'un des objectifs de l'étude du monde microbien?
Quel est l'un des objectifs de l'étude du monde microbien?
Quels éléments sont inclus dans l'UE Introduction à l’écologie microbienne?
Quels éléments sont inclus dans l'UE Introduction à l’écologie microbienne?
Quel est le focus particulier d'étude en écologie microbienne?
Quel est le focus particulier d'étude en écologie microbienne?
Qu'est-ce que l'écologie microbienne étudie principalement?
Qu'est-ce que l'écologie microbienne étudie principalement?
Quels domaines sont concernés par l'écologie microbienne?
Quels domaines sont concernés par l'écologie microbienne?
Quel est le focus particulier d'étude en écologie microbienne?
Quel est le focus particulier d'étude en écologie microbienne?
Pourquoi étudier le monde microbien?
Pourquoi étudier le monde microbien?
Qu'est ce que l’écologie microbienne?
Qu'est ce que l’écologie microbienne?
Quelle est l'une des méthodes d’étude en écologie microbienne?
Quelle est l'une des méthodes d’étude en écologie microbienne?
Quel scientifique a fait la première description de microorganismes en 1718?
Quel scientifique a fait la première description de microorganismes en 1718?
Quel scientifique a découvert la lithotrophie et la nitrification au XIXe siècle?
Quel scientifique a découvert la lithotrophie et la nitrification au XIXe siècle?
Qui a dit : « Everything is everywhere, the environment selects »?
Qui a dit : « Everything is everywhere, the environment selects »?
Quel scientifique a découvert le mode d’organisation en biofilms?
Quel scientifique a découvert le mode d’organisation en biofilms?
Qui a découvert le cycle du bacille du charbon en 1887?
Qui a découvert le cycle du bacille du charbon en 1887?
Quel scientifique a opposé le concept de génération spontanée?
Quel scientifique a opposé le concept de génération spontanée?
Qui a défini l’écologie et le règne des protistes?
Qui a défini l’écologie et le règne des protistes?
Quel scientifique a découvert la fermentation, la stérilisation et la vaccination?
Quel scientifique a découvert la fermentation, la stérilisation et la vaccination?
Qui a fait la première description d'une cellule biologique en 1665?
Qui a fait la première description d'une cellule biologique en 1665?
Quel scientifique a découvert l’interaction entre organismes (antibiotiques)?
Quel scientifique a découvert l’interaction entre organismes (antibiotiques)?
Qu'est-ce que LUCA?
Qu'est-ce que LUCA?
Quelle est la principale différence entre les bactéries et les archées selon les études récentes?
Quelle est la principale différence entre les bactéries et les archées selon les études récentes?
Qu'est-ce qui a été découvert en 1887 dans le domaine de la microbiologie?
Qu'est-ce qui a été découvert en 1887 dans le domaine de la microbiologie?
Quel a été le rôle des archées selon Baker et al. en 2020?
Quel a été le rôle des archées selon Baker et al. en 2020?
D'où provient l'origine des eucaryotes selon les dernières recherches?
D'où provient l'origine des eucaryotes selon les dernières recherches?
Quel est l'objet d'étude principal de l'UE Introduction à l’écologie microbienne?
Quel est l'objet d'étude principal de l'UE Introduction à l’écologie microbienne?
Quelle est la définition de la sélection naturelle selon Darwin?
Quelle est la définition de la sélection naturelle selon Darwin?
Quelles sont les conditions nécessaires pour induire l'évolution d'un trait biologique dans une population sous l'effet de la sélection naturelle?
Quelles sont les conditions nécessaires pour induire l'évolution d'un trait biologique dans une population sous l'effet de la sélection naturelle?
Quelle est la fonction principale de la pression de sélection dans la sélection naturelle?
Quelle est la fonction principale de la pression de sélection dans la sélection naturelle?
Pourquoi Darwin pensait-il que les ressources devaient être limitées pour qu'il y ait sélection naturelle?
Pourquoi Darwin pensait-il que les ressources devaient être limitées pour qu'il y ait sélection naturelle?
Quel est le principal facteur déterminant la pression de sélection dans la nature?
Quel est le principal facteur déterminant la pression de sélection dans la nature?
Quelle est une condition nécessaire pour que la sélection naturelle induise l'évolution d'un trait biologique?
Quelle est une condition nécessaire pour que la sélection naturelle induise l'évolution d'un trait biologique?
Quel est le rôle principal de la sélection naturelle dans l'évolution des populations?
Quel est le rôle principal de la sélection naturelle dans l'évolution des populations?
Quel est le principal critère pour qu'un trait biologique puisse être influencé par la sélection naturelle?
Quel est le principal critère pour qu'un trait biologique puisse être influencé par la sélection naturelle?
Qu'est-ce qu'un microbiote?
Qu'est-ce qu'un microbiote?
Qu'est-ce que l'évolution du taux de mutation d'une culture bactérienne d'Escherichia coli a montré?
Qu'est-ce que l'évolution du taux de mutation d'une culture bactérienne d'Escherichia coli a montré?
Comment est décrit le transfert horizontal de gènes?
Comment est décrit le transfert horizontal de gènes?
Qu'est-ce qui est nécessaire pour analyser la diversité microbienne?
Qu'est-ce qui est nécessaire pour analyser la diversité microbienne?
Quels sont les indices de diversité abordés dans le texte?
Quels sont les indices de diversité abordés dans le texte?
Qu'est-ce que le microbiote selon le texte?
Qu'est-ce que le microbiote selon le texte?
Qu'est-ce que l'espace et le temps ont à voir avec l'étude de la diversité microbienne?
Qu'est-ce que l'espace et le temps ont à voir avec l'étude de la diversité microbienne?
Qu'est-ce qui est comparé dans le texte en ce qui concerne les caractéristiques des bactériens, champignons, archées et viruses?
Qu'est-ce qui est comparé dans le texte en ce qui concerne les caractéristiques des bactériens, champignons, archées et viruses?
Quels sont les processus abordés en ce qui concerne les mutations dans l'ADN?
Quels sont les processus abordés en ce qui concerne les mutations dans l'ADN?
Qu'est-ce que l'adhésion entraîne pour les microorganismes?
Qu'est-ce que l'adhésion entraîne pour les microorganismes?
Quel phénomène permet la structuration synchronisée du biofilm bactérien?
Quel phénomène permet la structuration synchronisée du biofilm bactérien?
Qui a découvert le rôle des microorganismes dans le 'microbial cloud' humain?
Qui a découvert le rôle des microorganismes dans le 'microbial cloud' humain?
Quel terme décrit la relation entre les plantes et les microorganismes?
Quel terme décrit la relation entre les plantes et les microorganismes?
Quel est le principal habitat microbien discuté dans le texte?
Quel est le principal habitat microbien discuté dans le texte?
Qu'est-ce que la microbiologie environnementale étudie principalement?
Qu'est-ce que la microbiologie environnementale étudie principalement?
Quel phénomène est associé à la communication intercellulaire dans les biofilms bactériens?
Quel phénomène est associé à la communication intercellulaire dans les biofilms bactériens?
'Humans differ in their personal microbial cloud.' Quelle étude a fait cette découverte?
'Humans differ in their personal microbial cloud.' Quelle étude a fait cette découverte?
Qu'est-ce que LUCA selon les dernières recherches?
Qu'est-ce que LUCA selon les dernières recherches?
Quelle est l'une des caractéristiques de la biomasse microbienne dans le sol selon le texte?
Quelle est l'une des caractéristiques de la biomasse microbienne dans le sol selon le texte?
Quel est le principal constat concernant la diversité microbienne qui dépend du milieu?
Quel est le principal constat concernant la diversité microbienne qui dépend du milieu?
Quel rôle les microorganismes jouent-ils dans le cycle de l'eau selon le texte?
Quel rôle les microorganismes jouent-ils dans le cycle de l'eau selon le texte?
Quelle est la principale caractéristique des microorganismes présents dans les environnements extrêmes?
Quelle est la principale caractéristique des microorganismes présents dans les environnements extrêmes?
Quel est l'impact de l'anthropocène sur la perturbation naturelle des sols?
Quel est l'impact de l'anthropocène sur la perturbation naturelle des sols?
Quel est le nombre approximatif d'espèces inconnues présentes dans 1 g de sol selon le texte?
Quel est le nombre approximatif d'espèces inconnues présentes dans 1 g de sol selon le texte?
Quelle est la principale caractéristique de la biomasse microbienne dans le sol selon le texte?
Quelle est la principale caractéristique de la biomasse microbienne dans le sol selon le texte?
Quel est le principal impact de l'anthropocène sur la perturbation naturelle des sols?
Quel est le principal impact de l'anthropocène sur la perturbation naturelle des sols?
Quelle est la principale caractéristique des microorganismes dans les nuages selon le texte?
Quelle est la principale caractéristique des microorganismes dans les nuages selon le texte?
Quelle est la principale caractéristique des microorganismes dans les nuages selon le texte?
Quelle est la principale caractéristique des microorganismes dans les nuages selon le texte?
Qu'est-ce qui détermine principalement la diversité microbienne selon le texte?
Qu'est-ce qui détermine principalement la diversité microbienne selon le texte?
Quel est le principal facteur de la diversité microbienne selon le texte?
Quel est le principal facteur de la diversité microbienne selon le texte?
Quelle est la caractéristique principale de la rhizosphère selon le texte?
Quelle est la caractéristique principale de la rhizosphère selon le texte?
Quelle est la fonction principale des microorganismes dans les sols selon le texte?
Quelle est la fonction principale des microorganismes dans les sols selon le texte?
Quel est l'objet principal d'étude de l'écologie microbienne selon le texte?
Quel est l'objet principal d'étude de l'écologie microbienne selon le texte?
Quel phénomène entraîne une perte de mobilité mais rend plus disponible certains cations, substrats?
Quel phénomène entraîne une perte de mobilité mais rend plus disponible certains cations, substrats?
Quel terme décrit la multiplication rapide avec production d'exopolymères et la modification de l'état de surface?
Quel terme décrit la multiplication rapide avec production d'exopolymères et la modification de l'état de surface?
Qu'est-ce qui est discuté dans le texte en relation avec les relations entre organismes?
Qu'est-ce qui est discuté dans le texte en relation avec les relations entre organismes?
Qui a découvert la différence des humains dans leur nuage microbien personnel?
Qui a découvert la différence des humains dans leur nuage microbien personnel?
Quel scientifique a mis en évidence les virus dans le texte?
Quel scientifique a mis en évidence les virus dans le texte?
Qu'est-ce que LUCA selon les dernières recherches?
Qu'est-ce que LUCA selon les dernières recherches?
Quel est l'objet d'étude principal de l'UE Introduction à l’écologie microbienne?
Quel est l'objet d'étude principal de l'UE Introduction à l’écologie microbienne?
Quel est le principal facteur déterminant la pression de sélection dans la nature selon le texte?
Quel est le principal facteur déterminant la pression de sélection dans la nature selon le texte?
Quel terme désigne l'étude de l'ADN environnemental dans le domaine de l'écologie microbienne?
Quel terme désigne l'étude de l'ADN environnemental dans le domaine de l'écologie microbienne?
Quelle méthode est principalement utilisée pour l'isolement des microorganismes sur milieux de culture?
Quelle méthode est principalement utilisée pour l'isolement des microorganismes sur milieux de culture?
Quelle technique est utilisée pour étudier la diversité génétique en relation avec la fonction des microorganismes?
Quelle technique est utilisée pour étudier la diversité génétique en relation avec la fonction des microorganismes?
Quelle méthode est utilisée pour étudier les protéines environnementales dans le domaine de l'écologie microbienne?
Quelle méthode est utilisée pour étudier les protéines environnementales dans le domaine de l'écologie microbienne?
Quelle méthode est utilisée pour l'étude de l'ARN environnemental dans le domaine de l'écologie microbienne?
Quelle méthode est utilisée pour l'étude de l'ARN environnemental dans le domaine de l'écologie microbienne?
Quel domaine est principalement concerné par l'étude de l'ADN environnemental et de l'ARN environnemental?
Quel domaine est principalement concerné par l'étude de l'ADN environnemental et de l'ARN environnemental?
Quelle méthode est utilisée pour étudier l'ensemble des gènes présents dans un échantillon environnemental?
Quelle méthode est utilisée pour étudier l'ensemble des gènes présents dans un échantillon environnemental?
Quelle méthode est principalement utilisée pour étudier les activités métaboliques des microorganismes dans leur environnement?
Quelle méthode est principalement utilisée pour étudier les activités métaboliques des microorganismes dans leur environnement?
Quelle méthode est utilisée pour étudier la diversité génétique et fonctionnelle des virus dans un échantillon environnemental?
Quelle méthode est utilisée pour étudier la diversité génétique et fonctionnelle des virus dans un échantillon environnemental?
Quelle technique est principalement utilisée pour visualiser la structure tridimensionnelle d'échantillons biologiques dans le domaine de l'écologie microbienne?
Quelle technique est principalement utilisée pour visualiser la structure tridimensionnelle d'échantillons biologiques dans le domaine de l'écologie microbienne?
Quel type de microscopie est utilisé pour l'étalement sur lame d’un échantillon de sol et le comptage au microscope?
Quel type de microscopie est utilisé pour l'étalement sur lame d’un échantillon de sol et le comptage au microscope?
Quelle méthode est utilisée pour mesurer la minéralisation d’un substrat apporté, telle que le carbone ou l'azote?
Quelle méthode est utilisée pour mesurer la minéralisation d’un substrat apporté, telle que le carbone ou l'azote?
Quelle technique est utilisée pour l'analyse des acides nucléiques à partir d'échantillons de sol?
Quelle technique est utilisée pour l'analyse des acides nucléiques à partir d'échantillons de sol?
Quel type d'électrophorèse est utilisé pour étudier l'impact des HAP sur la structure des communautés microbiennes?
Quel type d'électrophorèse est utilisé pour étudier l'impact des HAP sur la structure des communautés microbiennes?
Quel type de mesure permet de connaître la source de carbone utilisée par les microorganismes?
Quel type de mesure permet de connaître la source de carbone utilisée par les microorganismes?
Quelle méthode est utilisée pour mesurer le supplément de carbone ou d'azote minéralisé ou extractible dans un traitement fumigé par rapport au traitement témoin?
Quelle méthode est utilisée pour mesurer le supplément de carbone ou d'azote minéralisé ou extractible dans un traitement fumigé par rapport au traitement témoin?
Quel type de mesure permet d'estimer la biodiversité et la biomasse microbienne dans un échantillon de sol?
Quel type de mesure permet d'estimer la biodiversité et la biomasse microbienne dans un échantillon de sol?
Quelle technique est utilisée pour l'analyse in situ des biomarqueurs lipidiques, fournissant des informations sur la physiologie et la biodiversité des microorganismes?
Quelle technique est utilisée pour l'analyse in situ des biomarqueurs lipidiques, fournissant des informations sur la physiologie et la biodiversité des microorganismes?
Quelle méthode est utilisée pour quantifier un gène ciblé dans le sol?
Quelle méthode est utilisée pour quantifier un gène ciblé dans le sol?
Quelle technique est utilisée pour l'identification in situ des microorganismes?
Quelle technique est utilisée pour l'identification in situ des microorganismes?
Quelle méthode est utilisée pour relier diversité et fonction par approche SIP (Stable-Isotope Probing) selon le texte?
Quelle méthode est utilisée pour relier diversité et fonction par approche SIP (Stable-Isotope Probing) selon le texte?
Quelle technique est utilisée pour l'extraction de l'ADN du sol marqué avec fluorochromes et ciblant les mycorrhizes?
Quelle technique est utilisée pour l'extraction de l'ADN du sol marqué avec fluorochromes et ciblant les mycorrhizes?
Quelle méthode est utilisée pour l'analyse de la structure des communautés microbiennes?
Quelle méthode est utilisée pour l'analyse de la structure des communautés microbiennes?
Quelle est la profondeur moyenne du milieu marin selon le texte?
Quelle est la profondeur moyenne du milieu marin selon le texte?
Quel pourcentage de la surface de la terre est occupé par le milieu marin?
Quel pourcentage de la surface de la terre est occupé par le milieu marin?
Combien d'espèces marines diverses sont vérifiées sur la planète terre?
Combien d'espèces marines diverses sont vérifiées sur la planète terre?
Quel type d'organismes domine principalement les paysages marins en termes de biomasse?
Quel type d'organismes domine principalement les paysages marins en termes de biomasse?
Quelle est la diversité spécifique du milieu marin par rapport au milieu terrestre?
Quelle est la diversité spécifique du milieu marin par rapport au milieu terrestre?
Quel est le principal habitat des micro-organismes évoqué dans le texte?
Quel est le principal habitat des micro-organismes évoqué dans le texte?
Quel est le pourcentage de la surface de la terre occupé par la profondeur moyenne du milieu marin?
Quel est le pourcentage de la surface de la terre occupé par la profondeur moyenne du milieu marin?
Quel est le rôle important de l'éclairement en profondeur dans le milieu marin?
Quel est le rôle important de l'éclairement en profondeur dans le milieu marin?
Qu'est-ce qui renfermerait des groupes nouveaux ou peu connus selon le texte?
Qu'est-ce qui renfermerait des groupes nouveaux ou peu connus selon le texte?
Qui sont relativement bien répertoriés sur les vertébrés marins selon le texte?
Qui sont relativement bien répertoriés sur les vertébrés marins selon le texte?
Quel pourcentage des gélifiants et épaississants du marché sont constitués par les polysaccharides de la phase matricielle de la paroi?
Quel pourcentage des gélifiants et épaississants du marché sont constitués par les polysaccharides de la phase matricielle de la paroi?
Quels sont les principaux monosaccharides constitutifs des polysaccharides de la paroi des végétaux?
Quels sont les principaux monosaccharides constitutifs des polysaccharides de la paroi des végétaux?
Quelle algue est associée à des applications telles que la stabilisation de produits surgelés, la protection des films alimentaires et la clarification des huiles, du vin, du vinaigre et de la bière?
Quelle algue est associée à des applications telles que la stabilisation de produits surgelés, la protection des films alimentaires et la clarification des huiles, du vin, du vinaigre et de la bière?
Quel additif alimentaire est associé au contrôle de la formation de cristaux au moment de la congélation, à la révélation de goûts et à une texture fine, onctueuse et unie dans les glaces, crèmes glacées et sorbets?
Quel additif alimentaire est associé au contrôle de la formation de cristaux au moment de la congélation, à la révélation de goûts et à une texture fine, onctueuse et unie dans les glaces, crèmes glacées et sorbets?
Quel pourcentage des applications des agars se situe dans le domaine alimentaire?
Quel pourcentage des applications des agars se situe dans le domaine alimentaire?
Quel type de métabolisme nécessite à la fois la lumière et le carbone inorganique (CO2)?
Quel type de métabolisme nécessite à la fois la lumière et le carbone inorganique (CO2)?
Quel est le principal défi biotechnologique majeur associé aux microalgues selon le texte?
Quel est le principal défi biotechnologique majeur associé aux microalgues selon le texte?
Quel pourcentage de lipides les microalgues peuvent-elles contenir?
Quel pourcentage de lipides les microalgues peuvent-elles contenir?
Quel type d'algues est associé à l'autoassemblage tridimensionnel très complexe de composants microscopiques, modelant pour la fabrication d'appareils miniatures dans l'industrie des composants électroniques?
Quel type d'algues est associé à l'autoassemblage tridimensionnel très complexe de composants microscopiques, modelant pour la fabrication d'appareils miniatures dans l'industrie des composants électroniques?
Quelle est l'origine des eucaryotes selon les dernières recherches?
Quelle est l'origine des eucaryotes selon les dernières recherches?
Quelle algue est associée à l'alimentation en eau saumâtre et à la production possible sur des terres non arables?
Quelle algue est associée à l'alimentation en eau saumâtre et à la production possible sur des terres non arables?
Quelle application est associée aux algues rouges carraghénanes selon le texte?
Quelle application est associée aux algues rouges carraghénanes selon le texte?
Quelle est la fonction principale des récifs coralliens selon le texte?
Quelle est la fonction principale des récifs coralliens selon le texte?
Qu'est-ce que les zooxanthelles apportent au polype dans la relation symbiotique?
Qu'est-ce que les zooxanthelles apportent au polype dans la relation symbiotique?
Quel est le principal usage des macroalgues selon le texte?
Quel est le principal usage des macroalgues selon le texte?
Quelle est la principale caractéristique des algues brunes selon le texte?
Quelle est la principale caractéristique des algues brunes selon le texte?
Quel est le pourcentage de la production de macroalgue destiné à un usage alimentaire à l'échelle mondiale selon le texte?
Quel est le pourcentage de la production de macroalgue destiné à un usage alimentaire à l'échelle mondiale selon le texte?
Quels sont les phycocolloïdes issus des algues mentionnés dans le texte?
Quels sont les phycocolloïdes issus des algues mentionnés dans le texte?
Quel est le principal pays producteur de macroalgue à l'échelle mondiale selon le texte?
Quel est le principal pays producteur de macroalgue à l'échelle mondiale selon le texte?
Quel est l'objectif principal de la culture et de la collecte de macroalgues et végétaux aquatiques selon le texte?
Quel est l'objectif principal de la culture et de la collecte de macroalgues et végétaux aquatiques selon le texte?
Study Notes
-
Le texte traite de l'analyse de la diversité virale sur Terre, avec une présentation d'un graphe de réseau montrant les groupes viraux détectés dans différents environnements et leurs connexions.
-
Les caractéristiques des bactériens, champignons, archées et viruses sont comparées, avec une attention particulière sur leur taille, matériau génétique, mode de réplication et présence d'organites.
-
Pour analyser la diversité microbienne, il est nécessaire de définir l'espace et le temps de l'étude.
-
Un microbiote est une communauté de micro-organismes vivant dans un même environnement.
-
Les indices de diversité et les facteurs qui la modifient sont abordés, avec une mention de la présence de processus multi-échelle.
-
Les mutations dans l'ADN sont décrites, avec une distinction entre l'insertion/délétion et la substitution, et leur effet sur la séquence de l'ARNm.
-
L'évolution du taux de mutation d'une culture bactérienne d'Escherichia coli est présentée, montrant qu'elle a été cultivée depuis 1988 et a atteint 55 000 générations.
-
Le transfert horizontal de gènes est discuté, avec une mention de la conjugaison, la transduction et la transformation bactérienne et leurs conséquences sur la diversité des souches d'Escherichia coli et d'autres bactéries.
-
Extraction de l'ADN du sol utilisant des marqueurs PCR ciblant Mycobacterium (Cheung et al, 2005)
-
Analyse de la structure des communautés microbiennes par TRFLP et RFLP (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Extraction de l'ADN du sol PCR marquée avec fluorochromes et ciblant les mycorrhizes (Johnson et al, 2003)
-
RISA analysis extraction ADN PCR ciblant l'ITS (espace intergénique entre 16S et 23S) et séparation sur gel (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Impact des vers de terre sur la structure des communautés microbiennes (Kersanté et al, 2006)
-
Clonage, séquençage, analyses phylogénétiques avec plasmide (vecteur), transformation dans bactérie compétente et ADNr 16s (PCR) ligation (Lerch - IEES Paris Séquençage de l'insert)
-
Criblage et étalement sur un milieu de culture particulier (M1 STAEE parcours OMICS)
-
Quantification des microorganismes par PCR quantitative (qPCR) et cette dernière utilisé pour quantifier un gène ciblé (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Les microorganismes peuvent être actifs, dormants, morts ou extracellulaires, l'ADN est présent dans les bactéries actives, dormantes, mortes et extracellulaires, l'ARN uniquement synthétisé par les bactéries actives dans le sol (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Reverse transcription ADN complémentaire (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Techniques PCR/qPCR utilisées pour cibler un gène fonctionnel avec des marqueurs spécifiques (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Séquençage d'exemple : expression des gènes de dégradation de l'atrazine chez Pseudomonas sp. (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Identification in situ par FISH (Eickhorst and Tippkötter, 2008)
-
Nouvel enjeu : relier diversité et fonction par approche SIP (Stable-Isotope Probing) (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Exemple : bactéries dégradant l'atrazine 13C dans des galeries de vers de terre avec αProteobacteria, γ-Proteobacteria et β-Proteobacteria (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
NGS (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Banque de clones : l’ancêtre (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Applications des NGS avec ARN et ADN, génome entier, ADN codant, génome de novo, ADN immunoprécipité, ADN méthylé, ARN immunoprécipité, ARN non codant, ARNm, mutations/SNP, RNASeq, ExomeSeq, miARN, Small RNASeq, ClipSeq, Séquençage de novo, Reséquençage, Séquençage d'ARN, MeDIPSeq, BisulfiteSeq, Interactions ARN/protéines, Interactions ADN/protéines, Méthylation de l'ADN (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Pour quels questions : Metabarcoding, RNA seq, Whole genome shotgun, Microarray (Lerch - IEES Paris M1 STAEE parcours OMICS)
-
Comparaison entre méthodes : caractérisation de communautés microbiennes d'un sol agricole soumis à différents types de fertilisation, long terme experimental site de Uppsala, Suède, A, B, C, F, H, J, O, L, I, Sol nu, Sol cultivé, Nitrate de calcium, Paille, Engrais vert, Fumier, Boues (STEP), Sciure de bois, Tourbe (Lerch, 2010)
-
Propriétés physico-chimiques des sols avec soils treatments, code, Total C, Total N, C/N, pH, Bare fallow, Unfertilised, Ca(NO3)2, Straw, Straw+ Ca(NO3)2, Green manure, Farmyard manure, Sewage sludge (Lerch, 2010).
Studying That Suits You
Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.
Related Documents
Description
Test your knowledge of the historical elements, structure, physiology, metabolism, taxonomy, phylogeny, microbial diversity, microbial habitat, abiotic factors, niches, adaptation, and biotic interactions in microbial ecology.