Infections endogènes et leurs caractéristiques

Cours de Microbiologie Infectieuse et Santé

• Le master est en Microbiologie et contrôle de la qualité, semestre 1.
• Le cours porte sur la microbiologie infectieuse et la santé.
• La chargée de cours est la Dr. GHALOUNI.E.
• L'université est Ahmed ZABANA-Relizane.
• La faculté est celle des Sciences de la nature et de la vie.
• Le département est celui de Biologie.

Sommaire des Cours

• Introduction: Les maladies infectieuses constituent un problème majeur de santé publique. Elles représentent environ 26% de la mortalité globale dans le monde.
• Infectiologie:
  • Notions fondamentales (QI-Q): causes, modes de transmission, mécanismes de l'infection, typologie des agents infectieux
  • Agents infectieux et leurs modes de détection: bactéries, virus, champignons, parasites, prions
  • Les mécanismes de défense (système immunitaire), le dysfonctionnement du système immunitaire et son réglage des défaillances (vaccination, sérothérapie, interférons)

Introduction

• Les maladies infectieuses sont un problème majeur de santé publique, représentant environ 26% de la mortalité globale dans le monde.
• Ces maladies sont causées par un ou plusieurs agents infectieux.
• La microbiologie joue un rôle essentiel dans la détection, l'identification de ces agents et le diagnostic des maladies infectieuses.

Infectiologie: Notions Fondamentales

• Une infection (maladie infectieuse) est une maladie due à la prolifération de germes et à des réactions immunologiques ou des signes cliniques.
• Les agents infectieux sont des micro-organismes (bactéries, virus, champignons, parasites) ou tout autre agent (prions).
  • La pathogénicité: capacité de l'agent infectieux pour causer une infection.
  • La virulence: capacité de l'agent infectieux pour causer une maladie grave.
  • La dose infectieuse: quantité minimale d'agent infectieux pour provoquer une infection.

Le Mode de Transmission

• La transmission peut se faire de différentes façons, par exemple, des gouttelettes respiratoires projetées sur une surface ouverte peuvent entraîner la transmission d'un agent infectieux (ex : streptocoque), mais pas d'un autre (grippe).
• La capacité de survie des agents infectieux dans l'environnement varie selon l'agent et les conditions (température, humidité) et est corrélative au traitement.

Le Réservoir et le Vecteur

• Le réservoir: le lieu ou le site d'habitat naturel de l'agent infectieux (humain ou animal).
• Le vecteur : site de relais ou d'attente entre une espèce (réservoir) et l'homme (récepteur).

Une Colonisation

• La colonisation est la présence de germes sans réaction immunologique ou signes cliniques.
• Tout malade est colonisé avant d'être infecté.
• Une colonisation ne signifie pas toujours une infection.
• Une personne colonisée peut être porteuse sans être malade.

Une Maladie Contagieuse

• Une maladie infectieuse dont l'agent est spontanément transmissible d'un sujet à un autre.

Infectiologie

• Endogène (auto-infection): infection par les propres germes du patient.
• Exogène (infection croisée): infection par des germes provenant d'un environnement contaminé. (ex. infection hospitalière, Maladies nosocomiales).

Sensibilité à une Infection Nosocomiale

• Certains patients sont plus à risque de contracter une infection nosocomiale en raison d'un déséquilibre du corps.
• Facteurs de risque: âges extrêmes, états extrêmes de poids (obèses ou dénutris), diabète, insuffisance rénale, insuffisance hépatique ou immunodépression (ex. leucémie, cancer, SIDA).
• Acquisition de sensibilité: interventions chirurgicales, certains traitements (corticothérapie prolongée, radiothérapie, chimiothérapie anti-cancéreuse), antibiothérapie aveugle, nombre de personnes en contact avec le malade et manque de formation ou d'hygiène.

Modes de Transmission de l'Infection

• Contact direct: contact physique (main, relation sexuelle)
• Contact indirect: contact avec un objet contaminé
• Aéroporté: contact avec des gouttelettes lors de la parole, de la toux ou de l'éternuement
• Transmission par les voies respiratoires: contamination par les spores de champignons (candidoses, aspergilloses..)
• Transmission par les voies digestives: ingestion de germes infectieux contenus dans les aliments ou l'eau souillée (vibrio cholerae) ou de toxines (ex: Botulisme).
• Transmission par morsures ou piqûres animales: rôle de l'animal comme vecteur (ex: peste, rage, leishmanioses).

Mécanisme de l'Infection

• Les étapes sont:
• Contamination: contact avec l'agent infectieux.
• Colonisation: multiplication de l'agent infectieux sans signes cliniques ni réponse immunitaire.
• Infection: apparition de signes cliniques et/ou réponse immunitaire.
• Le mécanisme peut s'arrêter à n'importe quelle étape.

La Production de Toxines et d'Enzymes

• Les toxines sont des substances chimiques qui nuisent aux êtres vivants.
• Par exemple, la bactérie Clostridium tetani produit une toxine responsable du tétanos.
• Certaines maladies sont causées par des toxines produites par des micro-organismes en dehors de l'hôte, même si les micro-organismes eux-mêmes ont été détruits.

Les Enzymes

• Certaines bactéries produisent des enzymes qui détruisent les tissus, facilitant la propagation de l'infection.

Le Développement d'une Résistance aux Antibiotiques

• L'utilisation excessive d'antibiotiques a conduit au développement d'une résistance chez certaines bactéries, y compris la bactérie Staphylococcus aureus par exemple.
• Certaines bactéries développent une enzyme qui rend les antibiotiques inefficaces.

Blocage des Défenses de l'Organisme

• Les bactéries produisent des dispositifs qui bloquent les défenses immunitaires. Les défenses immunitaires sont bloquées au niveau de la production d'anticorps ou de lymphocytes T.
• La formation de capsules empêche l'ingestion des bactéries par les globules blancs.
• Une résistance à la lyse (destruction) par des substances circulantes dans le sang.

Qualité du Fonctionnement du Système Immunitaire

• Les personnes ayant un système immunitaire affaibli (immunodépression) sont plus sensibles aux infections.
• Les raisons d'un mauvais fonctionnement du système immunitaire peuvent être innées (anomalie héréditaire) ou acquises (ex., SIDA ou cancer).
• Certains médicaments (ex., corticoïdes) peuvent affaiblir le système immunitaire.

Le Développement de l'Infection

• L'infection peut rester locale (limitée à la peau ou aux muqueuses) et être caractérisée par une réaction inflammatoire.
• Une infection peut devenir locorégionale si les germes atteignent les ganglions lymphatiques.
• L'infection peut se généraliser et devenir une septicémie (envahissement du corps par les germes).

Typologie des Infections

• Virulente: due au pouvoir virulent du germe (ex: streptocoque).
• Spécifique: due à l'effet d'une toxine libérée par le germe (ex: tétanos).
• Mixte: à la fois virulente et toxigène (ex: gangrène gazeuse).

La Toxi-infection

• Une infection (souvent alimentaire) où les bactéries libèrent des toxines dans la lumière intestinale, conduisant à des symptômes d'intoxication.
• Exemple: dysenterie bacillaire (causée par Shigella dysenteriae).

Les Agents Infectieux

• Les principaux types d'agents infectieux sont : bactéries, virus, parasites, champignons et les prions.

L'Infection Bactérienne

• Caractéristiques:

  • Micro-organismes unicellulaires procaryotes.
  • Se distinguent par leur forme (coques, bacilles, spirales), la composition de leur paroi (Gram + ou Gram -) et leurs besoins en oxygène (aérobie, anaérobie, facultative).

• Exemple de bactéries et d'infections: Escherichia coli (infections urinaires), Staphylococcus aureus (infections cutanées), Mycobacterium tuberculosis (tuberculose), Salmonella typhi (fièvre typhoïde), Treponema pallidum (syphilis).

• Différentes formes: coques, bacilles, vibrions, spirilles, forme fusiformes.

• Plusieurs groupes de classification selon composition de la paroi, (Gram + et Gram-).

• Besoins en oxygène: aérobies, anaérobies, aero-anaérobies facultatives, micro-aérophiles.

Flores Bactériennes

• Résidente/commensale: non pathogène, réside en bonne entente sur la peau et les muqueuses.
• Saprophyte: inoffensive pour l'Homme, vit dans l'environnement extérieur.
• Transitoire: non pathogène en transit, passe dans l'organisme avant d'aller ailleurs.
• Pathogène: capables de provoquer des maladies dont la gravité varie selon la nature et la quantité agent infectieux, ainsi que le sujet.

Détection Directe de l'Infection Bactérienne

• Prélèvements: urines (ECBU), prélèvements ORL, crachats (ECBC), selles (coproculture), liquide céphalo-rachidien (LCR), sang (hémoculture).
• Techniques d'analyse macroscopique: culture et isolement (ex: milieux de Chapman, gélose au chocolat).
• Techniques d'analyse microscopique: coloration de Gram, coloration de Ziehl-Neelsen.
• Tests d'identification: tests rapides (API), propriétés biochimiques, métabolisme respiratoire, glucidique, enzymatique,
• Détermination de la sensibilité des bactéries aux antibiotiques (antibiogramme).
• Mode d'action des antibiotiques: blocage d'acide folique, destruction de la membrane cytoplasmique, inhibition de la synthèse de l'ADN ou des protéines ou de la paroi bactérienne.
• La résistance des bactéries vis-à-vis des ATB peut être naturelle ou acquise (via mutation ou acquisition de matériel génétique).

Les Virus

• Caractéristiques: acaryotes, structure biologique défective (icosaédrique, hélicoïdale), unicellulaires, nécessitant une cellule hôte pour se dupliquer.

• Composition: acide nucléique (ADN ou ARN), capside protéique protecteur. Il en existe des virus nus, et des virus enveloppés.

• Cycle de reproduction: liaison au récepteur cellulaire, pénétration dans la cellule, synthèse des composants viraux, assemblage et libération de nouveaux virus.

• Exemples d'infections virales: hépatite, infections gastro-intestinales, infections respiratoires (grippe, covid-19), infections du système nerveux (rage), SIDA, herpès.

• Diagnostic: dosage des antigènes ou des anticorps, vue la difficulté de culture de la plupart des virus.

• Traitement: antiviraux, interférons, vaccination.

• Evolutions possibles:

  • aiguës: résolution avec immunité acquise
  • chroniques: persistance du virus

L'Infection Fongique (mycoses)

• Champignons: organismes eucaryotes, hétérotrophes, immobiles, se reproduisent par spores.

• Classification: levure (cellules unicellulaires) et filamenteux (moisissures, cellules pluricellulaires).

• Les mycoses: due à l'ingestion ou à l'inhalation de spores ou la contamination directe par des champignons.

• Flores fongiques: saprophytes (se nourrissant de matières organiques décomposées) et commensales (vivant à l'intérieur des êtres vivants sans causer de troubles).

• Mycoses opportunistes: se développent chez des individus affaiblis.

• Exemples de mycoses: aspergilloses broncho-pulmonaires, candidoses (muguet oral/buccal).

• Diagnostic: examen microscopique et culture sur milieux spécifiques (ex: Sabouraud).

• Traitement: antifongiques (ex: fluconazole, voriconazole, micafungine).

L'Infection Parasitaire

• Parasites: organismes vivants se développant au dépend de l'hôte, se nourrissant de tissus ou du sang.
• Classification: Protozoaires unicellulaires (ex: amibes, giardia, plasmodium), helminthes pluricellulaires (vers plats, vers ronds), et acariens multicellulaires (tiques, acariens cutanés).
• Exemples: Amibes (dysenterie amibienne), Giardia lamblia (giardiase), Plasmodium (paludisme), helminthes (ex. Taenia).
• Diagnostic: macro et microscopique (selles, sang). Dosage des anticorps (sérologique), examen de sang (FNS).
• Traitement: médicamenteux.

Les Prions (ATNC)

• Prions: protéines infectieuses qui transmettent leur information génétique sans ADN ni ARN.
• Elles ont une forme anormale qui affecte le système nerveux conduisant à la dégénérescence neuronale et la mort des cellules.
• Exemple: maladie de la vache folle, encéphalopathies spongiformes transmissibles (ESPT).
• Diagnostic: électroencéphalogramme (EEG), imagerie par résonance magnétique (IRM).

Mécanismes de Défense

• Protection externe: barrières physiques (peau, muqueuses, poils, cils) et chimiques (mucus, sécrétions, enzymes).
• Système immunitaire: réaction non spécifique (réponse immédiate identique à toute agression) et réaction spécifique (Réponse ciblée et adaptative).
• Défaillances: déficit immunitaire, maladies héréditaires, âges extrêmes, maladies chroniques ou traitement par certains médicaments.
• Réglage des défaillances: vaccination, sérothérapie, interférons.

Sérothérapie

• Immunisation artificielle par injection de sérum contenant des anticorps spécifiques.
• Court durée de l'efficacité, (2 à 3 semaines).
• Utilisé pour des situations d'urgence.
• Exemples: sérums anti-toxines (botulique, tétanique), anti-venimeux .

Détection des Agents Infectieux

• Méthodes directes: à partir du produit biologique (examen microscopique et culture).
• Méthodes indirectes: PCR, Immunofluorescence indirecte, Western blot ou ELISA.

Les Interférons (IFN)

• Glycoprotéines appartenant à la famille des cytokines.
• Jouent un rôle dans la réponse immunitaire anti-virale
• Types I, II et III (IFNα, IFNβ, IFNγ).
• Utilisation dans certains traitements (hépatites,etc..).
• Production d'interférons recombinants pour lutter contre les virus et les certains cancer..

Ce quiz explore le concept d'infections endogènes et les différents types d'infections. Il aborde les germes qui peuvent provoquer des infections à partir des propres microorganismes du patient. Testez vos connaissances sur les mécanismes et les classifications des infections endogènes.