Filogeneza i Metody Filogenetyczne

Jakie rodzaje markerów genetycznych zawierają różne allele z odmienną liczbą jednostek powtórzeniowych?

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących SNP jest poprawne?

Jakie markery są złożone z jednostek powtarzających się z kilkudziesięciu nukleotydów od 10 do 100 par zasad?

Które markery mogą być stosowane do ustalania pochodzenia za pomocą mitochondrialnego DNA?

Które z poniższych zastosowań markerów genetycznych obejmuje identyfikację sprawców przestępstw?

Jakie elementy są określane jako markery molekularne?

Jakie mechanizmy wpływają na zmienność w populacjach według filogenetyki molekularnej?

Czym charakteryzują się markery mikrosatelitarne?

Jakie sekwencje są najczęściej stosowane jako markery?

Co jest głównym źródłem zmienności genetycznej w filogenezie?

Jakie trudności mogą wystąpić przy ustalaniu pierwotnego allelu?

Jakie typy sekwencji są wysoce zmienne w populacjach?

Jakie jest znaczenie sekwencji konserwatywnych rewolucyjnie?

Metody filogenetyczne

Konstruowanie drzew filogenetycznych ocenia dystanse genetyczne na podstawie analizy sekwencji DNA.
Umożliwiają badanie historii populacji i jej pochodzenia.

Filogenetyka molekularna

Zajmuje się rekonstrukcją związków filogenezy między populacjami opartą na sekwencjach DNA.
Proces ewolucji jest rozumiany jako zmiany w sekwencjach DNA, będące wynikiem mutacji i rearanżacji.

Zmienność genetyczna

Główne mechanizmy kształtujące zmienność to dobór naturalny i dryf genetyczny, które wpływają na utrwalanie nowych wariantów w populacji.
W populacjach ludzkich połowa genomu składa się z sekwencji powtarzających się.

Markery molekularne

Markery to sekwencje nukleotydowe, których zmienność pozwala ocenić różnorodność genetyczną.
Markery molekularne są głównie polimorfizmami mitochondrialnego DNA i sekwencjami retro-elementów.

Polimorfizmy markerowe

Zwykle mają charakter zmian selekcyjnie obojętnych.
Około 1/4 polimorfizmów nie utrwala się w populacji.

Markery mikrosatelitarne

Obejmują powtórzenia krótkich motywów sekwencji (2-6 par zasad) powstających przez poślizg polimerazy.
Szybsza mutacja w porównaniu do mutacji punktowych trudni ustalenie pierwotnych alleli.

Rodzaje markerów genetycznych

Mikrosatelitarne: Loci zawierające 10-30 do maksymalnie 50 powtórzeń.
SNP (Single Nucleotide Polymorphism): Mutacje punktowe, ich ogromna liczba w genomie (kilka milionów) ułatwia analizy.
SSLP (Simple Sequence Length Polymorphism): Różne allele o zmienności wynikającej z delecji lub insercji (indeli).
Minisatellity (VNTR): Złożone z jednostek powtarzających się, od 10 do 100 par zasad.
Mitochondrialne DNA: Umożliwia badanie haplotypów linii żeńskich i męskich genealogii.

Quiz dotyczący metod filogenetycznych i ich zastosowań w badaniu historii populacji. Zawiera pytania na temat konstrukcji drzew filogenetycznych oraz analizy sekwencji DNA. Sprawdź swoją wiedzę na temat filogenezy molekularnej!