Ερωτήσεις Υπολογιστικής

Διακριτικότητα και Κρυσταλλογραφία

• Η διακριτικότητα είναι η ελάχιστη απόσταση προσέγγισης 2 ορατών σημείων ενός ειδώλου πριν αυτά ενωθούν σε ένα.
• Η μονάδα μετρήσεων της διακριτικότητας είναι 1 Amstrong, η οποία ισούται με 10^(-10)m.
• Η βιολογική δράση των μακρομορίων είναι αποτέλεσμα της δυναμικής τους.

Κρύσταλλοι και Σκέδαση

• Ο κρύσταλλος είναι στερεό σώμα στο οποίο τα μόρια είναι περιοδικά διευθετημένα στον τρισδιάστατο χώρο.
• Σκέδαση είναι η επαναφορά της ακτινοβολίας από ένα αντικείμενο, και μπορεί να είναι περιοδική ή μη περιοδική.

Σκέδαση Ακτίνων Χ

• Η σκέδαση των ακτίνων Χ είναι μια από τις πιο σημαντικές αντιδράσεις στη φυσική και τη χημεία.
• Οι ακτίνες Χ cóνταuyen από ηλεκτρόνια που προσκρούουν πάνω σε ένα στόχο (χαλκό ή μολυβδαίνιο).
• Η δράση του φακού είναι αναλυτικά προσομοιώσιμη.
• Τα αποτελέσματα μιας κρυσταλλογραφικής μελέτης είναι ο χάρτης ηλεκτρονικής πυκνότητας.

Μετασχηματισμός Fourier

• Ο μετασχηματισμός Fourier είναι μια μαθηματική περιγραφή ενός περιθλώμενου κύματος ως συνάρτηση της κατανομής των ηλεκτρονίων του κρυστάλλου.
• Ο μετασχηματισμός Fourier χρησιμοποιείται για να αναλύσει τη σκέδαση των ακτίνων Χ.
• Η σκέδαση ακτινοβολίας από ένα αυθαίρετο αντικείμενο είναι ο μετασχηματισμός Fourier του αντικειμένου.

Μοναδικότητα και Σύνθεση Fourier

• Οι ακέραιοι αριθμοί (h,k,l) είναι δείκτες οι οποίοι προσδιορίζουν τη θέση ενός σημείου στο αντίστροφο πλέγμα.
• Ο μετασχηματισμός Fourier ενός πλέγματος είναι επίσης ένα πλέγμα, το λεγόμενο αντίστροφο πλέγμα.
• Η σύνθεση Fourier των τετραγώνων των πλατών παραγόντων δομής είναι ίση με την συνέλιξη της συνάρτησης ηλεκτρονικής πυκνότητας κρυστάλλου με ένα κεντροσυμμετρικό είδωλό.

MIR, MAD, MR

• MIR (Multiple Isomorphous Replacement) είναι μια μέθοδος που χρησιμοποιείται για να προσδιοριστεί η δομή ενός κρυστάλλου.
• MAD (Multiple Wavelength Anomalous Dispersion) είναι μια μέθοδος που χρησιμοποιείται για να προσδιοριστεί η δομή ενός κρυστάλλου με τη χρήση πολλαπλών μελών.
• MR (Molecular Replacement) είναι μια μέθοδος που χρησιμοποιείται για να προσδιοριστεί η δομή ενός κρυστάλλου με τη χρήση ενός αρχείου pdb με παρόμοιο μακρομόριο.

Ηλεκτρονική Μικροσκοπία

• Η αρχή λειτουργίας του ηλεκτρονικού μικροσκοπίου βρίσκεται στην θεωρία του de Broglie για την κυματική φύση ταχέως κινούμενων σωματιδίων.
• Το ηλεκτρονικό μικροσκόπιο είναι δομικά ανάλογο με ένα οπτικό μικροσκόπιο με την διαφορά ότι χρησιμοποιεί ταχέως κινούμενα ηλεκτρόνια вместо ακτινοβολίας.
• Το φάσμα περίθλασης των ηλεκτρονίων του αντικειμένου μπορεί να ανακτηθεί με τον εξοπλισμό του μικροσκοπίου.