29 Questions
Perché le reazioni di sequenza e di incorporazione del nucleotide terminatore avvengono in vitro?
Perché richiedono la presenza di enzimi e reazioni chimiche specifiche
Cosa rappresenta l'ione sphere particle?
Un biglia ricoperta da tante copie del frammento di interesse
Quale è il resultado della separazione dei frammenti da sequenziare?
La separazione dei frammenti da sequenziare
Perché non si forma l'ione sphere particle se non c'è la biglia?
Perché la biglia non è ricoperta da frammenti di DNA
Cosa avviene dopo la rilevazione del segnale?
Il blocco e il fluorocromo vengono allontanati
Cosa si ottiene dopo la fase successiva?
L'arricchimento di particelle ricoperte dallo stesso frammento o da due frammenti diversi di DNA
Come vengono fissate le molecole circolari SMRT BELL?
Sul fondo del pozzetto del chip
Che tipo di sequenze vengono definite HiFi?
Sequenze ad alta fedeltà
Qual è il vantaggio delle molecole circolari?
Permettono alla polimerasi di girare più volte
Che cosa succede alle sequenze adattatrici durante il metodo bioinformatico?
Vengono completamente eliminate
Cosa accade quando il gruppo OH del nucleotide già attaccato reagisce col gruppo fosfato?
Il legame fosfodiesterico si forma e il pirofosfato si allontana
Che cosa rappresentano le sequenze HiFi?
Sequenze ad alta fedeltà
Cosa porta con sé il pirofosfato quando si allontana?
Il fluorocromo
Quale è la differenza principale tra le piattaforme di nuova generazione?
La capacità di dati che possono generare
Quale è il limite principale delle prime piattaforme di sequenziamento?
Lunghezza delle sequenze limitata
Cosa può essere sequenziato con questa piattaforma?
Il genoma, l'RNA, sequenze mirate o sequenze di microrganismi
Cosa si può fare con le sequenze ottenute con questa piattaforma?
Fare la metagenomica o analizzare sequenze mirate
Cos'è un microarray a oligonucleotidi ad alta densità?
Un tipo di microarray in cui vengono sintetizzati direttamente oligonucleotidi sul supporto solido
Come funziona la sintesi fotolitografica?
Attraverso l'uso di raggi UV per rimuovere i blocchi fotolabili
Cosa sono i linker sulla superficie solida dell'array?
I gruppi che legano il blocchi fotolabili ai nucleotidi
Quale è il vantaggio dell'uso di oligonucleotidi ad alta densità?
Permette di studiare più geni contemporaneamente
Cosa rappresenta la maschera fotolitografica?
La strumentazione utilizzata per indirizzare la luce sulla superficie solida dell'array
Quanti geni possono essere studiati contemporaneamente con gli oligonucleotidi ad alta densità?
Centinaia di geni
Perché può rimanere una contaminazione delle sequenze intergeniche?
Perché non si può rimuovere completamente il genomico con il trattamento con la DNasi
Cosa accade arricchendo in poly-A?
Si perde il genomico e si concentra sui geni espressi
Qual è il principio della cattura a cDNA?
Utilizzare delle sonde specifiche per i geni d'interesse
Quale è il limite della cattura a cDNA?
Non riuscire a sequenziare tutto quello che c'è nella cellula
Qual è il primo passo nella procedura di arricchimento?
Estrae l'RNA dalle cellule
Che cosa si utilizza per la cattura a cDNA?
Sonde specifiche per i geni d'interesse
Learn about the advanced techniques used in DNA sequencing, including the differences between third and fourth generation sequencing platforms. Understand how sequencing reactions and nucleotide incorporation occur in vitro and how fragments are loaded into capillaries.
Make Your Own Quizzes and Flashcards
Convert your notes into interactive study material.
Get started for free
