Podcast
Questions and Answers
מהו ה-linking number של מולקולה המבצעת סיבוב אחד שמאלה?
מהו ה-linking number של מולקולה המבצעת סיבוב אחד שמאלה?
- -1 (correct)
- 0
- +1
- תלוי במבנה המולקולה
מהו מצב הסופר-סלילה (supercoiling) האופייני לדנ"א של E. coli בתנאים רגילים?
מהו מצב הסופר-סלילה (supercoiling) האופייני לדנ"א של E. coli בתנאים רגילים?
- סופר-סלילה חיובית
- סופר-סלילה שלילית (correct)
- ללא סופר-סלילה
- סופר-סלילה ניטרלית
כיצד ישפיע הכנסת linking number חיובי למולקולת דנ"א עם סופר-סלילה שלילית?
כיצד ישפיע הכנסת linking number חיובי למולקולת דנ"א עם סופר-סלילה שלילית?
- לא יהיה שינוי במולקולת הדנ"א.
- המולקולה תהפוך לסופר-סלילה שלילית יותר.
- המולקולה תירגע (פחות סופר-סלילה). (correct)
- המולקולה תהפוך לסופר-סלילה חיובית יותר.
איזה מהבאים יגרום ל-linking number חיובי?
איזה מהבאים יגרום ל-linking number חיובי?
איזה מהבאים יקטין את linking number?
איזה מהבאים יקטין את linking number?
איזה מהבאים מתאר בצורה הטובה ביותר את הפעולה של טופואיזומראז מסוג 1?
איזה מהבאים מתאר בצורה הטובה ביותר את הפעולה של טופואיזומראז מסוג 1?
מהו ה linking number שמכניס טופואיזומראז מסוג 1?
מהו ה linking number שמכניס טופואיזומראז מסוג 1?
מה יקרה אם תא יכיל טופואיזומראז מסוג 1 שאינו פעיל?
מה יקרה אם תא יכיל טופואיזומראז מסוג 1 שאינו פעיל?
איזו פעולה מזרז טופואיזומראז מסוג 1?
איזו פעולה מזרז טופואיזומראז מסוג 1?
איזה סוג של סופר-סלילים נוצרים כתוצאה מפעילות של טופואיזומראז מסוג 1?
איזה סוג של סופר-סלילים נוצרים כתוצאה מפעילות של טופואיזומראז מסוג 1?
מה התפקיד של טופואיזומראז בשכפול DNA מעגלי?
מה התפקיד של טופואיזומראז בשכפול DNA מעגלי?
איזו בעיה עלולה להיווצר במהלך שכפול DNA מעגלי אם לא יוסרו סופר-סלילים חיוביים?
איזו בעיה עלולה להיווצר במהלך שכפול DNA מעגלי אם לא יוסרו סופר-סלילים חיוביים?
מה מאפיין את מבנה ה-DNA המעגלי במהלך שכפול?
מה מאפיין את מבנה ה-DNA המעגלי במהלך שכפול?
מדוע חשובה ההפרדה של שרשראות ה-DNA במהלך שכפול?
מדוע חשובה ההפרדה של שרשראות ה-DNA במהלך שכפול?
מה יקרה אם האנזים טופואיזומראז לא יפעל כראוי במהלך הכפלת DNA מעגלי?
מה יקרה אם האנזים טופואיזומראז לא יפעל כראוי במהלך הכפלת DNA מעגלי?
בתנאים שבהם חלבון מסוים דורש אתר קישור יחיד בכיוון אחיד כדי להיקשר, אילו רצפים יהיו יעילים לקישור חלבון זה?
בתנאים שבהם חלבון מסוים דורש אתר קישור יחיד בכיוון אחיד כדי להיקשר, אילו רצפים יהיו יעילים לקישור חלבון זה?
איזה מהתנאים הבאים חייב להתקיים כדי שחלבון ייקשר לרצפים צהובים וכחולים בו זמנית?
איזה מהתנאים הבאים חייב להתקיים כדי שחלבון ייקשר לרצפים צהובים וכחולים בו זמנית?
איזו השפעה צפויה שתהיה למוטציה ההופכת את כל הרצפים הכחולים ל-tandem?
איזו השפעה צפויה שתהיה למוטציה ההופכת את כל הרצפים הכחולים ל-tandem?
אם הרצפים הצהובים עוברים מוטציה כך שהם כבר לא ב-tandem, איזו השפעה תהיה לכך על הקישור של חלבונים לאתרים אלה?
אם הרצפים הצהובים עוברים מוטציה כך שהם כבר לא ב-tandem, איזו השפעה תהיה לכך על הקישור של חלבונים לאתרים אלה?
חוקר מצא רצף חדש שחוזר על עצמו 5 פעמים, כאשר שני הרצפים הראשונים ב-tandem ושלושת הרצפים הנותרים בכיוונים מנוגדים. אילו חלבונים ייקשרו הכי סביר לרצף הזה?
חוקר מצא רצף חדש שחוזר על עצמו 5 פעמים, כאשר שני הרצפים הראשונים ב-tandem ושלושת הרצפים הנותרים בכיוונים מנוגדים. אילו חלבונים ייקשרו הכי סביר לרצף הזה?
מה תפקידו העיקרי של חלבון הדנ"א C בתהליך שכפול הדנ"א?
מה תפקידו העיקרי של חלבון הדנ"א C בתהליך שכפול הדנ"א?
מה המאפיין המבני של חלבון דנ"א B (הליקז)?
מה המאפיין המבני של חלבון דנ"א B (הליקז)?
מה ההבדל העיקרי בתפקיד בין חלבוני דנ"א B (הליקזות) לחלבוני דנ"א C בשכפול הדנ"א?
מה ההבדל העיקרי בתפקיד בין חלבוני דנ"א B (הליקזות) לחלבוני דנ"א C בשכפול הדנ"א?
כיצד פעולתם של חלבוני דנ"א B (הליקזות) תורמת לתהליך השכפול?
כיצד פעולתם של חלבוני דנ"א B (הליקזות) תורמת לתהליך השכפול?
מה תפקידו העיקרי של חלבון ה-dnaC בתחילת תהליך השכפול?
מה תפקידו העיקרי של חלבון ה-dnaC בתחילת תהליך השכפול?
מהו הצעד החשוב ביותר שצריך להתרחש לפני ש-dnaB יכול להתחיל לפתוח את גדילי ה-DNA?
מהו הצעד החשוב ביותר שצריך להתרחש לפני ש-dnaB יכול להתחיל לפתוח את גדילי ה-DNA?
מה יקרה אם תהיה מוטציה בחלבון דנ"א C שתגרום לאיבוד היכולת שלו לגייס את חלבוני דנ"א B?
מה יקרה אם תהיה מוטציה בחלבון דנ"א C שתגרום לאיבוד היכולת שלו לגייס את חלבוני דנ"א B?
איזו פעולה מבטיחה שהשכפול לא יתחיל מוקדם מדי וללא בקרה?
איזו פעולה מבטיחה שהשכפול לא יתחיל מוקדם מדי וללא בקרה?
מה יקרה אם dnaC לא יעכב את dnaB לאחר גיוסו לאתר השכפול?
מה יקרה אם dnaC לא יעכב את dnaB לאחר גיוסו לאתר השכפול?
איזה חלבון אחראי לגיוס dnaB לאתר השכפול?
איזה חלבון אחראי לגיוס dnaB לאתר השכפול?
Flashcards
Linking number
Linking number
מספר המייצג את סיבובי ה-DNA סביב עצמו.
Negative supercoiling
Negative supercoiling
מבנה בו הדנ״א מתפתל בצורה שלילית, כמו סליל.
E. coli
E. coli
בתרבית חיידקים נפוצה, לרוב משמשת במחקר.
Positive supercoiling
Positive supercoiling
Signup and view all the flashcards
-1 Linking number
-1 Linking number
Signup and view all the flashcards
שכפול דנ״א מעגלי
שכפול דנ״א מעגלי
Signup and view all the flashcards
מזלג בשכפול
מזלג בשכפול
Signup and view all the flashcards
חץ חיובי
חץ חיובי
Signup and view all the flashcards
negative supercoil
negative supercoil
Signup and view all the flashcards
לחץ במבנה דנ״א
לחץ במבנה דנ״א
Signup and view all the flashcards
שובר קשר פוספודיאסטרי
שובר קשר פוספודיאסטרי
Signup and view all the flashcards
שחרור negative supercoil
שחרור negative supercoil
Signup and view all the flashcards
יצירת positive supercoil
יצירת positive supercoil
Signup and view all the flashcards
linking number +1
linking number +1
Signup and view all the flashcards
הגדיל השני ב-DNA
הגדיל השני ב-DNA
Signup and view all the flashcards
רצפים צהובים
רצפים צהובים
Signup and view all the flashcards
רצפים כחולים
רצפים כחולים
Signup and view all the flashcards
תנאי קישור חלבונים
תנאי קישור חלבונים
Signup and view all the flashcards
כיוונים מנוגדים
כיוונים מנוגדים
Signup and view all the flashcards
רצפים ב-tandem
רצפים ב-tandem
Signup and view all the flashcards
dnaC
dnaC
Signup and view all the flashcards
dnaB
dnaB
Signup and view all the flashcards
תחילת רפליקציה
תחילת רפליקציה
Signup and view all the flashcards
מעכבות דנ״א
מעכבות דנ״א
Signup and view all the flashcards
תהליך רפליקציה
תהליך רפליקציה
Signup and view all the flashcards
חלבוני דנא B
חלבוני דנא B
Signup and view all the flashcards
הקסמר
הקסמר
Signup and view all the flashcards
הליקזות
הליקזות
Signup and view all the flashcards
דנא bBOX
דנא bBOX
Signup and view all the flashcards
Study Notes
מבנה וסופרקול של DNA
- DNA יכול ליצור סופרקול, בנוסף לסיבוב הרגיל של ההליקס, בדומה לשפרפרת מסתבכת.
- ניתן למדוד את מספר הסיבובים (Linking Number) ואת כיוונם (חיובי או שלילי).
- DNA רגיל מכיל כ-10.4 בסיסים לכל סיבוב.
- סופרקול חיובי נוצר כאשר מספר הסיבובים גדול מזה הרגיל, וסופרקול שלילי כאשר קטן.
- ב-E.coli מקרים מסוימים של linking number כוללים סיבוב אחד ימינה ופלוס 1 ( +1 ). סיבוב אחד שמאלה ופחות 1 ( -1 ).
פונקציות סופרקול
- סופרקול חיובי יכולים להופיע במהלך תהליכי שכפול DNA, אבל יכולים גם להיווצר במצבים רגילים
- סופרקול שלילי נחוץ לשכפול DNA כדי למנוע לחץ.
- טופואיזומרזות הן אנזימים שמבקרים את רמת הסופרקול של DNA.
סוגים של טופואיזומרזות
- סוג 1: שוברים קשר פוספודיאסטרי בשרשרת DNA אחת ועוברים אותה דרך השרשרת השנייה. זה משחרר לחץ ויוצר סופרקול שלילי.
- סוג 2: שוברים את שני גדיל ה DNA ומעבירים גדיל אחד דרך השני. זה יעיל בהפיכת סופרקול חיובי לשלילי.
מקור הרפליקציה (oriC) של E.coli
- oriC (מקור הרפליקציה) של E.coli הוא רצף של 245 זוגות בסיסים.
- יש רצפים מיוחדים בשם box A ו- box B.
- הרצפים של box B חוזרים על עצמם שלוש פעמים, ורצפים של box A חוזרים על עצמם ארבע פעמים.
- רצפי box B נמצאים באותו כיוון, בעוד רצפי box A בכיוונים מנוגדים, עובדה שדורשת קיפול DNA.
- חלבון dnaA נקשר ל- box A.
- חלבון dnaB נקשר ל- box B, ומאפשר פתיחת ה-helicase.
- חלבון dnaC עוזר לגייס dnaB.
- ל-dnaB יש 6 תתי יחידות, ולכן dnaC צריך 6 תתי יחידות לשם גיוס.
- זהו תהליך של פתיחת וסגר של DNA, שמנוהל על ידי dnaB, הוא ה-principle helicase של חיידקים.
Studying That Suits You
Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.
Related Documents
Description
השיעור מתאר סופרקול של DNA, כולל מדידת מספר הסיבובים וכיוונם. הוא מכסה את הפונקציות של סופרקול חיובי ושלילי, ואת תפקידם של טופואיזומרזות בבקרת רמת הסופרקול. לבסוף, השיעור כולל דיון במקור השכפול (oriC) של E.coli.