Biologie Moléculaire: Structure de l'ADN
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Questions and Answers

Quel facteur ne participe pas à la liaison du Pol II au promoteur?

  • TFIIF
  • TFIIE (correct)
  • TFIIA
  • TFIIB

    • Quel est le rôle principal de TFIIH dans le complexe TBP-TATA?

  • Formation de la double hélice
  • Hydrolyse de l'ATP (correct)
  • Activation du Pol II
  • Phosphorylation du CTD (correct)

    • Combien de fois la séquence répétée se trouve-t-elle chez l'homme?

  • 60
  • 52 (correct)
  • 27
  • 45

    • Quel élément est essentiel pour le démarrage de l'élongation du Pol II?

    <p>TFIIH</p> Signup and view all the answers

    Quel domaine est associé à la queue du Pol II?

    <p>Domaine carboxy terminal</p> Signup and view all the answers

    Quel facteur se fixe sur le promoteur en premier lieu?

    <p>TFIIA</p> Signup and view all the answers

    Quel acide aminé est présent dans le motif répétitif du CTD?

    <p>Tyrosine</p> Signup and view all the answers

    Quel facteur accompagne le Pol II dès qu'il se fixe sur le promoteur?

    <p>TFIIF</p> Signup and view all the answers

    Quel est l'élément qui maintient la structure en double hélice de l'ADN?

    <p>Interactions hydrophobes et liaisons hydrogène</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la principale caractéristique de l'ADN à pH physiologique?

    <p>Il est négatif</p> Signup and view all the answers

    Qu'est-ce qui se forme lorsque l'ADN est mélangé avec de l'éthanol?

    <p>Des fibres agglomérées</p> Signup and view all the answers

    Quel processus permet de séparer les molécules d'ADN en utilisant leur densité?

    <p>Ultracentrifugation</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la proportion de l'énergie nécessaire pour séparer les brins de l'ADN?

    <p>Faible</p> Signup and view all the answers

    Qu'est-ce qui est responsable de la solubilité de l'ADN dans l'eau?

    <p>Les sels de sodium</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la taille moyenne de l'ADN décrite dans une hélice?

    <p>10.5 paires de bases par tour</p> Signup and view all the answers

    Quel type de structure de l'ADN est illustré comme la forme principale?

    <p>Forme B</p> Signup and view all the answers

    Quelle enzyme est considérée comme l'enzyme majeure pour la synthèse de l'ADN chez E. Coli ?

    <p>ADN polymérase III</p> Signup and view all the answers

    Quelle est l'activité unique de l'ADN polymérase I par rapport à l'ADN polymérase III ?

    <p>Activité exonucléasique 5'-3'</p> Signup and view all the answers

    Quel est le rôle principal des primases dans la réplication de l'ADN ?

    <p>Synthétiser les amorces d'ARN</p> Signup and view all the answers

    Quelle structure est formée par les primases et l'hélicase chez E. Coli ?

    <p>Primosome</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la fonction de l'ADN polymérase III en termes de correction ?

    <p>Correction exonucléasique 3'-5'</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la composition de l'origine de réplication chez E. Coli (oriC) ?

    <p>Environ 245 paires de bases</p> Signup and view all the answers

    Quels types de liaisons les séquences répétées riches en A et T favorisent-elles lors de l'initiation de la réplication ?

    <p>Liaisons hydrogène</p> Signup and view all the answers

    Dans quel sens se fait la synthèse de l'amorce d'ARN par les primases ?

    <p>5' - 3'</p> Signup and view all the answers

    Quels facteurs influencent la Tm des oligonucléotides ?

    <p>La concentration de l'ADN</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la formule de Wallace pour estimer la Tm des petits oligonucléotides ?

    <p>Tm = 4(C+G) + 2(A+T)</p> Signup and view all the answers

    Quel est le principal objectif de l'hybridation des acides nucléiques ?

    <p>Détecter la présence d'un acide nucléique spécifique</p> Signup and view all the answers

    Quelle formule est utilisée pour les oligonucléotides contenant moins de 100 nucléotides ?

    <p>Tm = 16.6log[Na+] + 0.41(%(C+G))</p> Signup and view all the answers

    Qu'est-ce qui n'influence pas directement la Tm des acides nucléiques ?

    <p>La durée du stockage</p> Signup and view all the answers

    Quelles conditions sont essentielles pour une hybridation efficace ?

    <p>La force ionique et la complexité des séquences</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la première étape de la procédure de Southern blot?

    <p>Extraction de l'ADN</p> Signup and view all the answers

    Quelle méthode d'hybridation inclut l'immobilisation sur une membrane ?

    <p>Hybridation sur support solide</p> Signup and view all the answers

    Qu'est-ce que l'hybridation in situ permet d'étudier?

    <p>L'expression des gènes</p> Signup and view all the answers

    La formule globale pour calculer la Tm inclut quels paramètres ?

    <p>Concentration de l'ADN et force ionique</p> Signup and view all the answers

    Quelle technique est similaire au Southern blot et au Northern blot?

    <p>L'hybridation in situ</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la signification de FISH dans le contexte de l'hybridation?

    <p>Fluorescence In Situ Hybridization</p> Signup and view all the answers

    Quel type de produit est utilisé pour la révélations dans le processus de Southern blot?

    <p>Des sondes d'acides nucléiques marquées</p> Signup and view all the answers

    Pourquoi la région à étudier doit-elle être légèrement dénaturée lors de la FISH?

    <p>Pour éliminer les protéines associées</p> Signup and view all the answers

    Quel type de membranes est utilisé dans le Southern blot?

    <p>Membrane en nylon ou en PVDF</p> Signup and view all the answers

    Quelles séquences d'acides nucléiques peuvent être révélées par Northern blot?

    <p>Les séquences d'ARN</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    Structure de l'ADN

    • La double hélice de l'ADN de forme B comporte environ 10.5 paires de bases par tour d'hélice (34 Å).
    • Le squelette de chaque brin est constitué de sucre et de phosphate, tandis que les bases azotées sont orientées vers l'intérieur.

    Propriétés physico-chimiques de l'ADN

    • Les liaisons hydrogène et interactions hydrophobes maintiennent la structure en double hélice, permettant la dénaturation avec peu d'énergie.
    • L'ADN est un polyanion soluble dans l'eau, formant des solutions à haute viscosité en présence de sels de sodium.
    • L'éthanol provoque la précipitation de l'ADN sous forme de fibres.
    • La densité de l'ADN permet sa séparation par ultracentrifugation dans des gradients de densité, comme avec le chlorure de césium.
    • À pH physiologique, l'ADN porte une charge négative proportionnelle à sa longueur due aux groupements phosphates.

    Enzymes de la réplication de l'ADN chez E. Coli

    • Trois ADN polymérases : I, II, et III; avec la polymérase III comme enzyme principale pour la synthèse d'ADN.
    • L'ADN polymérase I possède une activité exonucléasique (5'-3') pour dégrader les amorces d'ARN.
    • La polymérase III a une activité ADN polymérasique dans le sens 5'-3' et correction exonucléasique dans le sens 3'-5'.
    • Les primases, ADN polymérases dépendantes de l'ADN, synthétisent des amorces d'ARN de 4 à 12 ribonucléotides.

    Mécanisme de réplication

    • Initiation de la réplication chez E. Coli à partir d'une seule origine (oriC) riche en A et T, avec une longueur d'environ 245 pb.
    • Des protéines d'amorçage se fixent à l'oriC pour ouvrir localement la double hélice d'ADN.
    • La répétition de séquences du domaine carboxy-terminal (CTD) de la polymérase II influence la régulation de la transcription.

    Hybridation des acides nucléiques

    • La température de fusion (Tm) de l'ADN dépend de la longueur du fragment, du contenu en C+G, et de l'appariement.
    • La formule de Wallace pour déduire la Tm : Tm = 4(C+G) + 2(A+T).
    • Divers facteurs influencent l'hybridation, incluant la concentration d'ADN, la température, et la complexité des séquences.

    Types d'hybridation

    • Southern blot : Technique pour détecter des séquences spécifiques d'ADN sur membrane.
    • Hybridation in situ (HIS) : Utilise des sondes pour localiser des séquences dans des cellules ou tissus.
    • FISH (Fluorescence in Situ Hybridization) : Utilise des sondes complémentaires pour identifier des régions spécifiques sur les chromosomes.

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    Description

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