Biologie Moléculaire: Quiz sur l'ADN et la PCR
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Questions and Answers

Quel brin d'ADN est considéré comme le brin codant ?

  • Brin 3'-5'
  • Brin 5'-3' (correct)
  • Brin de réplication
  • Brin ancien
  • L'ADN polymérase peut lire un brin d'ADN de 5' à 3'.

    False

    Quel est le rôle de la primase ?

    Créer une amorce complémentaire.

    La ____ est responsable de coller les fragments d'Okazaki.

    <p>ligase</p> Signup and view all the answers

    Associez les éléments suivants avec leur rôle :

    <p>Coiffe méthylée = Protection contre la dégradation Queue poly-AAAA = Transport vers le cytoplasme Epissage = Enlèvement des introns Fragments d'Okazaki = Syntétisés sur le brin lagging</p> Signup and view all the answers

    Quels éléments sont nécessaires pour que l'ARNm soit mature ?

    <p>Tous les éléments ci-dessus</p> Signup and view all the answers

    L'ARN pré-messager peut sortir du noyau sans être mature.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quels signaux spécifient les introns pour l'épissage ?

    <p>Sites GU et AG.</p> Signup and view all the answers

    Quels types de contrôle négatif existent selon la méthode PCR?

    <p>Contrôle au niveau des locaux</p> Signup and view all the answers

    Quelle sonde TaqMan est spécifique au Toxocara canis?

    <p>Sonde FAM</p> Signup and view all the answers

    Les amorces consensus non dégénérées peuvent se lier à des régions d'ADN qui sont 100% identiques.

    <p>True</p> Signup and view all the answers

    Quel gène est utilisé pour rechercher les Staphylocoques?

    <p>femA</p> Signup and view all the answers

    La qPCR Triplex utilise deux sondes TaqMan pour la détection des contaminations.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    La technique PCR qui amplifie en deux étapes est appelée la ______.

    <p>Nested PCR</p> Signup and view all the answers

    Quels sont les signaux positifs indiquant une contamination par T.cati?

    <p>Cyr5 et Red610</p> Signup and view all the answers

    Quel est un problème potentiel lors de l'utilisation de la PCR multiplex?

    <p>Dimères d'amorces</p> Signup and view all the answers

    Le pathogène identifié comme étant ___ est le Trichophyton rubrum.

    <p>mycose</p> Signup and view all the answers

    Associez les sondes aux résultats qu'elles représentent :

    <p>FAM = Homozygote muté VIC = Homozygote normal Mixte = Hétérozygote Red610 = Contamination par les Ascaridiacae</p> Signup and view all the answers

    Associez les types d'amorces à leurs caractéristiques :

    <p>Amorces consensus dégénérées = Ciblent différentes séquences Amorces spécifiques = Permettent de différencier des espèces Amorces consensus non dégénérées = Se lient à des régions identiques Amorces spécifiques pour mecA = Détectent la résistance à la Méthicilline</p> Signup and view all the answers

    La PCR multiplex amplifie une seule région de l'ADN.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quel est le but de la technique d'hybridation moléculaire?

    <p>Analyser l'ADN et l'ARN pour des lésions et l'expression</p> Signup and view all the answers

    Les techniques modernes telles que le NGS ont remplacé l'hybridation moléculaire.

    <p>True</p> Signup and view all the answers

    Quel gène permet de déterminer si les bactéries sont résistantes à la Méticilline?

    <p>mecA</p> Signup and view all the answers

    La séquence d'ADN pour détecter une mutation ponctuelle est l'objet d'une étude de ____.

    <p>drépanocytose</p> Signup and view all the answers

    Quelles sont les bases purines du code génétique?

    <p>Adénine et Guanine</p> Signup and view all the answers

    Le codon start est UAA.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Combien de codons stop existe-t-il?

    <p>3</p> Signup and view all the answers

    L'ADN est composé de deux chaînes polynucléiques ________ et ________.

    <p>antiparallèle, complémentaire</p> Signup and view all the answers

    Associez les types de nucléotides avec leur composition:

    <p>Nucléoside = Base + Sucre Nucléotide = Base + Sucre + Phosphate Désoxynucléotide = Base + Désoxyribose + Phosphate Nucléotide d'ARN = Base + Ribose + Phosphate</p> Signup and view all the answers

    Quelle caractéristique du code génétique signifie qu'un acide aminé peut être codé par plusieurs codons?

    <p>Dégénéré</p> Signup and view all the answers

    L'ADN mitochondrial est transmis par le père.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la structure de base des nucléosomes?

    <p>Histones et ADN</p> Signup and view all the answers

    Quelle méthode est utilisée pour étudier l'ARN?

    <p>Northern blot</p> Signup and view all the answers

    La qPCR peut détecter une seule copie de génome de M.pneumoniae.

    <p>True</p> Signup and view all the answers

    Quel est le poids moyen d'un nucléotide en daltons?

    <p>327</p> Signup and view all the answers

    Le processus d'hybridation nécessite l'ajout d'une sonde ______.

    <p>marquée</p> Signup and view all the answers

    Associez les étapes du Southern blot avec leur description appropriée:

    <p>Fragmentation = Utilisation d'enzymes de restriction Dénaturation = Formation de fragments monobrins Transfert sur membrane = Utilisation de tampons spécifiques Hybridation = Ajout d'une sonde marquée</p> Signup and view all the answers

    Quelle est l'efficacité normale de PCR par cycle?

    <p>100%</p> Signup and view all the answers

    Le seuil de détection (LOD) est défini par une dilution sériée d'ADN.

    <p>True</p> Signup and view all the answers

    Quel est le rapport de conversion entre 1 fg d’ADN de M.pneumoniae et le nombre de copies du génome?

    <p>1,129</p> Signup and view all the answers

    Quel facteur peut rendre la PCR moins efficace?

    <p>Une surconsommation des réactifs</p> Signup and view all the answers

    La quantification absolue permet de comparer l'expression d'un gène cible dans différents échantillons.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Qu'est-ce qu'une droite d'étalonnage dans la quantification absolue?

    <p>C'est un graphique qui représente la relation entre le nombre de copies d'ADN et le Ct à partir de dilutions sériées.</p> Signup and view all the answers

    La relation entre le nombre de copies et le Ct est de type ______.

    <p>logarithmique</p> Signup and view all the answers

    Associez les termes suivants avec leur description:

    <p>Ct = Cycle threshold HKG = Gène exprimé de manière constante ΔCt = Différence entre le Ct du gène cible et du gène de ménage ΔΔCt = Différence entre deux ΔCt</p> Signup and view all the answers

    Quelle méthode est utilisée pour surveiller la charge virale des personnes atteints de VIH?

    <p>Quantification absolue</p> Signup and view all the answers

    Les dimères d’amorces améliorent l’efficacité de la PCR.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Comment la quantification relative est-elle effectuée?

    <p>Elle compare l'expression d'un gène cible par rapport à un gène de ménage dans différents échantillons.</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    Biologie Moléculaire

    • Le code génétique est composé de 4 bases : purines (adénine et guanine) et pyrimidines (cytosine, uracile et thymine).
    • Un codon est une séquence de 3 bases qui code pour un acide aminé. Il y a 64 codons possibles, codant pour 20 acides aminés.
    • Les bases s'attachent à un sucre (ribose pour l'ARN et désoxyribose pour l'ADN).
    • Le nucléoside est formé de la base et du sucre.
    • Le nucléotide est formé de la base, du sucre et d'un groupe phosphate.
    • L'ADN est composé de deux chaînes de nucléotides antiparallèles et complémentaires.
    • Les histones sont des protéines autour desquelles l'ADN est enroulé dans le noyau.
    • L'ADN mitochondrial est hérité uniquement de la mère.
    • Le génome humain et le génome des porcs/souris sont utilisés pour la recherche en maladies génomiques.
    • La transcription se déroule dans le noyau où l'ADN est copié en ARN messager (ARNm).
    • La traduction se déroule dans le cytoplasme où l'ARNm est utilisé pour synthétiser des protéines.
    • L'ADN est chargé négativement.
    • Les différentes formes d'ARN comprennent l'ARN messager (ARNm), le transfert d'ARN (ARNt) et l'ARNr (ARN ribosomal).
    • L'ARNm contient l'information génétique pour synthétiser une protéine.
    • L'ARNt transporte les acides aminés aux ribosomes.
    • L'ARNr forme les ribosomes, le site de la traduction.
    • La coiffe 5' et la queue poly-A 3' sont ajoutées à l'ARNm pour sa stabilité et son transport.
    • L'épissage est le processus d'enlèvement des introns de l'ARNm avant la traduction.
    • Il y a 3 codons stop (UAA, UAG, UGA) pour arrêter la traduction.
    • Les différentes types d'ARN sont les hnRNA, snRNA, ARNt et ARNr.
    • La transcription se déroule dans le noyau où l'ADN est transcrit en ARN pré-ARN messager (pré-ARNm)
    • L'ajout de la queue poly-A assure la protection de l'ARNm pendant la traduction.
    • L'ARN pré-messager subit des transformations avant la traduction.
    • Le processus de traduction associe les acides aminés comme déterminé par le code génétique en ARN afin de former des protéines.
    • La structure du gène eucaryote est composée d'exons (séquences codantes) et d'introns (séquences non codantes).
    • Le promoteur est une région en amont du gène, qui assure l'initiation de la transcription par l'ARN polymérase.
    • Les différentes modifications du gène peuvent aboutir à différentes protéines selon le moment de la transcription.
    • La transcription se déroule dans le noyau et la traduction dans le cytoplasme.

    Extraction ADN/ARN -> PCR

    • Extraction des acides nucléiques (ADN ou ARN) des échantillons.
    • La PCR est une technique d'amplification de l'ADN pour détecter une séquence cible.
    • Les contrôles positif et négatif permettent de valider la fiabilité de la PCR.
    • La PCR multiplex permet d'amplifier plusieurs régions d'ADN dans une seule réaction.
    • Les amorces spécifiques permettent de cibler une région précise de l'ADN.
    • La Nested PCR améliore la sensibilité et la spécificité de la détection par multiplications de l'ADN par étapes.
    • La RT-PCR est une méthode pour créer un ADN complémentaire à partir d'ARN.
    • La technologie de séquençage à haut débit (NGE) peut séquencer une grande quantité de séquences d'ADN(ou ARN) rapidement.
    • La RPA et LAMP sont des méthodes rapides de détection.

    Real-time PCR (qPCR)

    • La qPCR permet la mesure de la fluorescence pendant l'amplification de l'ADN.
    • Différentes molécules fluorescentes sont utilisées telles que le SybrGreen ou les sondes Taqman.
    • Le cycle Threshold (Ct) est le cycle où la fluorescence dépasse un seuil prédéfini.
    • Le Ct est proportionnel à la quantité d'ADN.
    • Les sondes Taqman sont composées d'un rapporteur et d'un quencheur et la séparation de ces deux produits une émission de lumière.
    • Le ROX est une molécule de référence permettant la normalisation.
    • On mesure la fluorescence qui rend l'analyse plus rapide et simple.

    Polymérases

    • Les polymérases sont des enzymes qui copient l'ADN ou l'ARN.
    • Les polymérases ADN-dépendantes copient l'ADN à partir d'une matrice d'ADN.
    • Les polymérases ARN-dépendantes copient l'ARN à partir d'une matrice d'ARN ou ADN.

    Restriction enzymes (RFLP)

    • Les enzymes de restriction coupent l'ADN à des séquences spécifiques.
    • La RFLP analyse la taille des fragments d'ADN après la digestion avec des enzymes de restriction et détecte les variations génétiques.

    Clonage

    • Le clonage moléculaire permet de créer de multiples copies d'une séquence d'ADN cible.
    • Les plasmides sont des vecteurs utilisés pour cloner l'ADN.
    • On utilise des enzymes de restriction et une ADN ligase pour insérer l'ADN cible dans le plasmide.
    • La technique du clonage nécessite différentes étapes: préparation du fragment d'ADN, préparation du plasmide, excision du site de restriction.

    CRISPR-Cas

    • CRISPR-Cas est un système de défense immunitaire adaptative bactérienne contre les virus.
    • Ce système peut être utilisé pour modifier le génome de manière précise.
    • Un guide ARN(gRNA) est associé à une protéine Cas(ex: Cas9) pour localiser la séquence cible.
    • Le gRNA est conçu pour guider la Cas9 à l'emplacement spécifique par hybridation.
    • Le complexe Cas9-gRNA coupe le brin d'ADN à l'emplacement cible.

    Séquençage Sanger et Pyroséquençage

    • Le séquençage Sanger utilise des didésoxyribonucléotides (ddNTP) pour arrêter la polymérisation à des positions spécifiques.
    • Le séquençage par pyroséquençage mesure la libération du pyrophosphate lorsqu'un nucléotide est ajouté.
    • Le séquençage Sanger est coûteux et lent.
    • Le pyroséquençage est plus rapide et rentable.

    Autres aspects

    • L'hybridation moléculaire est utilisé pour détecter l'ARN ou l'ADN.
    • Les analyses de biologie moléculaire ont contribué à la recherche médicale, la recherche sur les maladies, aux analyses médicales, biotechnologie, génomique, etc.
    • Ce sont des outils puissants pour comprendre et manipuler le matériel génétique.

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    Description

    Testez vos connaissances en biologie moléculaire avec ce quiz centré sur l'ADN, la PCR et les processus associés. Découvrez des questions sur les brins codants, l'épissage, ainsi que la détection des contaminations. Attendez-vous à des questions variées qui couvrent l'ADN polymérase, les fragments d'Okazaki et bien plus encore.

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