Biologia Molecolare: Istoni e DNA

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Questions and Answers

Qual è la funzione principale del DNA linker nel contesto del nucleosoma?

  • Rende il DNA più stabile.
  • Riduce lo spazio occupato dal DNA. (correct)
  • Facilita la duplicazione del DNA.
  • Aumenta l'interazione con gli istoni.

Quale dei seguenti istoni è considerato il regolatore principale del nucleosoma?

  • Istona H1 (correct)
  • Istona H3
  • Istona H2A
  • Istona H4

Cosa accade all'istone H1 durante il processo di acetilazione?

  • Diventa più stabile nel nucleosoma.
  • Aumenta il legame con gli altri istoni.
  • Si distacca dal nucleosoma. (correct)
  • Si attacca permanentemente al DNA.

Quale ruolo ha l'istoneacetil-transferasi?

<p>Acetila l'istone H1 per regolare l'apertura del DNA. (A)</p> Signup and view all the answers

Quale affermazione riguardo agli amminoacidi negli istoni è vera?

<p>Le lisine sono più abbondanti rispetto alle arginine. (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa permette di fare lo srotolamento del DNA attorno al nucleosoma?

<p>Leggere il codice genetico. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è il principale effetto dell'acetilazione sul DNA?

<p>Consente una lettura efficiente del DNA. (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è il numero totale di amminoacidi in un ottamero di istoni?

<p>213 (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è la funzione principale della DNA polimerasi?

<p>Riparare il DNA sostituendo i nucleotidi danneggiati (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa diventa il nitrito nello stomaco?

<p>Acido nitroso (A)</p> Signup and view all the answers

Quale molecola viene prodotta dalla deaminazione della citosina?

<p>Uracile (D)</p> Signup and view all the answers

Quale è un ruolo dell'RNA messaggero?

<p>Codificare le informazioni necessarie per la sintesi proteica (D)</p> Signup and view all the answers

Perché l'uracile non si trova nel DNA?

<p>Perché causerebbe la lettura errata del codice genetico (B)</p> Signup and view all the answers

Come il DNA affronta il problema dell'uracile derivato dalla degradazione?

<p>Metilando l'uracile in timina (C)</p> Signup and view all the answers

Come differisce la trascrizione dalla replicazione del DNA?

<p>La trascrizione coinvolge solo porzioni specifiche del DNA (B)</p> Signup and view all the answers

Qual è il principale motivo per cui l'RNA può contenere uracile e non timina?

<p>L'RNA ha una vita breve e non subisce deaminazione (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo dell'RNA ribosomiale nella sintesi proteica?

<p>Costituisce la struttura dei ribosomi (A)</p> Signup and view all the answers

Cosa comporterebbe la presenza di uracile nel DNA?

<p>Rappresenterebbe una mutazione permanente (A)</p> Signup and view all the answers

Perché le banane hanno lo stesso genoma?

<p>Sono cloni dello stesso ceppo. (B)</p> Signup and view all the answers

Qual è la conseguenza di rimuovere entrambi i nucleotidi durante la riparazione del DNA?

<p>Porta a una mutazione indiretta (A)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni riguarda i nitriti?

<p>Conservano i cibi mantenendo il colore rosso (D)</p> Signup and view all the answers

Quale elemento aiuta a mantenere l'integrità del DNA escludendo l'acqua nel centro della doppia elica?

<p>La stabilità dei nucleotidi (D)</p> Signup and view all the answers

Quale mutazione ha portato alla creazione del pomodoro rosso?

<p>Una mutazione dell'enzima che sintetizza il licopene. (A)</p> Signup and view all the answers

Cosa ha fatto l'uomo con le mutazioni delle piante?

<p>Ha usato le mutazioni a suo vantaggio. (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è la velocità della reazione di deaminazione nel DNA?

<p>Circa tre anni (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è il meccanismo d'azione dell'acido nitroso?

<p>Agisce come un crosslinker legandosi a parti diverse (A)</p> Signup and view all the answers

In che modo l'acqua influisce sulla stabilità dei nucleotidi nel DNA?

<p>Catalizza reazioni chimiche di idrolisi (B)</p> Signup and view all the answers

Perché la farina usata oggi è diversa da quella di 700 anni fa?

<p>Perché aveva un contenuto proteico insufficiente. (A)</p> Signup and view all the answers

Che cosa è una mutazione da invecchiamento del DNA?

<p>Un danno al DNA causato dal tempo. (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa comporta la deaminazione della citosina?

<p>La sostituzione del NH2 con C=O. (D)</p> Signup and view all the answers

Come influisce l'intervento umano sulla biologia delle piante?

<p>Avviene una selezione dei ceppi con mutazioni favorevoli. (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è una delle origini dei danni sul DNA?

<p>L'invecchiamento. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è il principale problema identificato quando si cerca di correggere un errore in presenza di un filamento con energia sul nucleotide?

<p>Non c'è energia sufficiente per formare un legame (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è la composizione principale delle sequenze telomeriche?

<p>Sequenze non codificanti (B)</p> Signup and view all the answers

Che funzione ha la forma G-quadruplex nei telomeri?

<p>Protegge il DNA dagli enzimi nucleasici (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è la principale funzione dei telomeri negli eucarioti?

<p>Evitare la degradazione del DNA (C)</p> Signup and view all the answers

Perché i telomeri sono considerati un'invenzione dell'eucariogenesi?

<p>Perché non esistevano prima delle cellule eucariotiche (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è il fenomeno attraverso il quale un batterio trasferisce il proprio DNA ad un altro organismo?

<p>Trasferimento genico orizzontale (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa significa che l'uomo presenta un fenomeno di diploidia?

<p>Ha due copie di ogni cromosoma non identiche (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è un problema associato alla replicazione del DNA che i telomeri aiutano a prevenire?

<p>Problema di end replication (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa raccolgono gli eventi di fusione tra cromosomi?

<p>Possono portare a scambi di doppie eliche (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la forma che assume un cromosoma durante la replicazione e la duplicazione cellulare?

<p>A X o Y (B)</p> Signup and view all the answers

Qual è un effetto della mancanza di telomeri nei cromosomi?

<p>Rende il DNA più suscettibile alla degradazione (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa accade al corredo cromosomico durante la mitosi?

<p>Deve essere raddoppiato (D)</p> Signup and view all the answers

Che cosa sono i cromosomi fratelli?

<p>Cromosomi identici (B)</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo della replicazione del DNA nella divisione cellulare?

<p>Raddoppiare il corredo cromosomico (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa si intende per orizzontale in 'trasferimento genico orizzontale'?

<p>Il trasferimento si riferisce all'interscambio spesso casuale di informazioni genetiche (B)</p> Signup and view all the answers

Quali sono le coppie di cromosomi non identici in un organismo diploide?

<p>Cromosomi omologhi (D)</p> Signup and view all the answers

Flashcards

Agricoltura

La creazione di nuove varietà di piante e animali attraverso l'intervento umano nella selezione di mutazioni favorevoli.

Cloni di banane

Le banane sono cloni dello stesso ceppo, il che significa che hanno lo stesso genoma. Questo li rende vulnerabili alle variazioni ambientali, poiché non possono adattarsi facilmente.

Mutazione

Un cambiamento nel DNA che può portare a nuove caratteristiche o tratti in un organismo.

Enzima licopene

L'enzima responsabile della produzione di licopene, un pigmento che conferisce al pomodoro il suo colore rosso.

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Sostituzione di basi

La sostituzione di una base azotata nell'acido nucleico con un'altra.

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Danno da invecchiamento

Un tipo di danno al DNA causato da fattori come l'invecchiamento, che può portare a cambiamenti nella sequenza del DNA.

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Deaminazione della citosina

La conversione della citosina, una base azotata nel DNA, in uracile.

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Danni al DNA

Un danno al DNA che può verificarsi durante l'invecchiamento, causando il deterioramento e la modifica delle informazioni genetiche.

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Idrolisi del DNA

L'acqua può promuovere la reazione di idrolisi del DNA, rompendo i legami tra i nucleotidi.

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Deaminazione

La deaminazione è la conversione di una citosina in uracile a causa della perdita di un gruppo amminico.

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Assenza di uracile nel DNA

L'uracile non è presente nel DNA perché potrebbe essere scambiato per una citosina deaminata, portando a errori nella sequenza genetica.

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Timina vs Uracile

La timina è un uracile metilato. La presenza di timina invece di uracile nel DNA aiuta a distinguere tra citosina e uracile.

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Uracile nell'RNA

L'RNA ha l'uracile invece della timina perché gli RNA hanno una durata di vita più breve e la reazione di deaminazione è lenta.

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Cinetica della deaminazione

La deaminazione è un processo lento che si verifica nel DNA con una cinetica di circa 3 anni.

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Uracile come errore nel DNA

L'uracile legato al deossiribosio nel DNA è un errore e deve essere rimosso tramite i meccanismi di riparazione del DNA.

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Conseguenze della deaminazione

La deaminazione del DNA può cambiare la sequenza genetica e può portare a mutazioni geniche.

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Direzione di accrescimento del DNA

L'aggiunta di nucleotidi alla catena di DNA avviene solo in direzione 5'->3'.

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Problema della replicazione terminale

Il problema della replicazione terminale si riferisce all'incapacità della DNA polimerasi di replicare completamente le estremità 3' dei cromosomi lineari.

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Telomeri

I telomeri sono sequenze ripetute di DNA non codificanti situate alle estremità dei cromosomi.

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G-quadruplex

Il G-quadruplex è una struttura secondaria del DNA formata da quattro guanina sullo stesso filamento, comune nei telomeri.

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Protezione dai danni del DNA

I telomeri proteggono i cromosomi dalla degradazione da parte delle nucleasi (enzimi che degradano il DNA).

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Prevenzione della fusione cromosomica

I telomeri impediscono la fusione dei cromosomi, che potrebbe causare instabilità genomica.

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Risoluzione del problema della replicazione terminale

I telomeri aiutano a risolvere il problema della replicazione terminale, rallentando l'accorciamento delle estremità cromosomiche durante la replicazione.

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Importanza dei telomeri

I telomeri sono strutture importanti per la stabilità e l'integrità del genoma nelle cellule eucariotiche.

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Trasferimento Genico Orizzontale (HGT)

Il trasferimento genico orizzontale (HGT) è il processo in cui un organismo trasferisce materiale genetico ad un altro organismo che non è il suo discendente.

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Resistenza agli Antibiotici e HGT

La resistenza agli antibiotici si sviluppa attraverso il trasferimento genico orizzontale. Un batterio resistente trasferisce il gene della resistenza ad altri batteri sensibili.

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Trasferimento Genico Orizzontale in Eucarioti

Il processo per cui un organello cellulare (come un cloroplasto o un mitocondrio) trasferisce parte del suo DNA al nucleo della cellula ospite. Questo processo è alla base della diversità del genoma negli eucarioti.

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Diploidia

La presenza di due copie di ciascun cromosoma nelle cellule somatiche. Le due copie sono simili, ma non identiche.

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Cromosomi Omologhi

Cromosomi uguali che contengono informazioni genetiche simili. Si trovano nelle cellule somatiche.

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Cromosomi Fratelli (Sister Chromosomes)

Due cromosomi identici che vengono figli di un cromosoma solo dopo la replicazione. Spesso si trovano uniti durante la mitosi.

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Forma del Cromosoma

La forma del cromosoma a X o Y si riferisce al cromosoma duplicato. Durante la mitosi, ogni cromosoma viene replicato, creando due copie identiche che si appaiano.

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Replicazione del DNA

La replicazione del DNA duplica il corredo cromosomico prima della divisione cellulare. Questo processo assicura che ogni nuova cellula riceva una copia completa del DNA.

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La riparazione del DNA con la DNA polimerasi

La DNA polimerasi è un enzima che può riparare i danni al DNA rompendo i legami fosfato e sostituendo i nucleotidi. Tuttavia, questo processo può causare mutazioni indirette se la DNA polimerasi rimuove l'informazione sulla complementarietà dei nucleotidi.

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L'acido nitroso e le mutazioni

L'acido nitroso è un agente chimico che può causare mutazioni nel DNA. Viene utilizzato come conservante nei salumi, ma nel nostro stomaco si trasforma in acido nitroso, che può legarsi a due parti del DNA e causare danni.

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Cos'è la trascrizione?

La trascrizione è il processo in cui il DNA viene utilizzato per creare RNA messaggero (mRNA). Questo processo è detto eterocatalitico perché produce un acido nucleico diverso dal DNA.

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Tipi di RNA

Esistono tre tipi principali di RNA: ribosomiale (rRNA), transfer (tRNA) e messaggero (mRNA). Tutti sono coinvolti nella sintesi proteica.

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RNA ribosomiale (rRNA)

L'RNA ribosomiale (rRNA) forma i ribosomi, che sono le macchine molecolari che producono le proteine.

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RNA transfer (tRNA)

L'RNA transfer (tRNA) trasporta gli amminoacidi al sito di assemblaggio della proteina.

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RNA messaggero (mRNA)

L'RNA messaggero (mRNA) contiene il codice genetico che dirige la sintesi proteica.

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La trascrizione è specifica

La trascrizione avviene solo su una parte del genoma che codifica per la proteina specifica che deve essere sintetizzata.

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Nucleosoma

Il DNA è avvolto attorno a proteine chiamate istoni, formando una struttura chiamata nucleosoma. Ogni nucleosoma è composto da otto istoni (2 molecole di H2A, H2B, H3 e H4), attorno al quale il DNA si avvolge due volte.

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DNA linker

Il DNA che non è avvolto attorno al nucleosoma è chiamato DNA linker. Questo DNA si trova tra due nucleosomi successivi ed è molto più corto del DNA avvolto.

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Superavvolgimento del DNA

Il processo di compattamento del DNA attorno ai nucleosomi, che porta a una riduzione dello spazio occupato.

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Istone H1

L'istone H1 è un istone aggiuntivo che si lega al nucleosoma e aiuta a stabilizzare la sua struttura. L'istone H1 svolge un ruolo importante nella regolazione dell'espressione genica poiché il suo legame al nucleosoma può bloccare l'accesso al DNA per gli enzimi di trascrizione.

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Acetilazione dell'istone H1

Il processo di acetilazione dell'istone H1 prevede l'aggiunta di un gruppo acetile all'istone H1. Questo processo può portare al rilascio dell'H1 dal nucleosoma, consentendo l'accesso agli enzimi di trascrizione al DNA.

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Istoneacetil-transferasi

Gli enzimi che catalizzano l'acetilazione degli istoni.

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Lisina negli istoni

La lisina è un amminoacido presente negli istoni in quantità elevata. L'acetilazione della lisina inibisce l'interazione degli istoni con il DNA, aprendo l'accesso agli enzimi di trascrizione.

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Ruolo del nucleosoma nella regolazione genica

L'avvolgimento del DNA attorno al nucleosoma svolge un ruolo importante nella regolazione dell'espressione genica. Il legame dell'istone H1 al nucleosoma inibisce la trascrizione, mentre la sua rimozione tramite acetilazione consente l'accesso al DNA per gli enzimi di trascrizione.

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Study Notes

Flusso dell'informazione genetica

  • L'informazione genetica contenuta nel nucleo (e in cloroplasti e mitocondri) si traduce nella formazione di proteine.
  • La replicazione del DNA è la funzione autocatalitica, necessaria per la trasmissione dell'informazione genetica alle cellule figlie.
  • La funzione eterocatalitica comporta la produzione di RNA (RNA transfer, ribosomiale e messaggero) dallo stampo di DNA.
  • La sintesi proteica (traduzione) trasforma l'informazione dell'RNA messaggero in proteina.
  • La biologia genomica studia il DNA, la transcrittomica l'RNA, la proteomica le proteine e la metabolomica i metaboliti di una cellula.
  • Gene: il più piccolo segmento di DNA che determina un carattere fenotipico, che può essere visibile o biochimico.

Acidi nucleici

  • Gli acidi nucleici sono di due tipi: DNA e RNA.
  • I monomeri degli acidi nucleici sono i nucleotidi, composti da una base azotata e uno zucchero.
  • Le basi azotate possono essere di due tipi: purine (adenina e guanina) e pirimidine (citosina, timina e uracile).
  • Nel DNA lo zucchero è il 2'-deossiribosio, mentre nell'RNA è il ribosio.
  • I nucleotidi sono uniti tra loro da legami fosfodiesterici.

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