Biofilm e Meccanismi Batterici

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Questions and Answers

Descrivere il meccanismo mediante il quale i batteri si staccano da un biofilm vecchio.

I batteri nel biofilm possiedono flagelli che usano per staccarsi quando il biofilm muore. I flagelli permettono loro di diventare nuovamente monocellulari e colonizzare un nuovo sito.

Quali sono le cellule che si trovano nella parte più interna di un biofilm e qual è la loro funzione?

Le cellule più interne del biofilm sono le 'sacrificial cells', batteri anaerobi che producono caspasi. Queste caspasi inducono l'apoptosi o morte programmata delle cellule, rilasciando materiale biologico a beneficio della comunità batterica.

Spiegare il ruolo delle 'persisters' nella formazione del biofilm.

Le 'persisters' sono batteri aerobi o anaerobi facoltativi che rimangono in una fase stazionaria permanente. Sono responsabili della rigenerazione del biofilm dopo la fase di dispersione.

Cos'è il quorum sensing e in che modo regola la formazione del biofilm?

<p>Il quorum sensing è un sistema di comunicazione tra batteri che utilizza segnali chimici. Quando la concentrazione di questi segnali (peptidi o acil omoserina lattoni) supera una certa soglia, attiva l'espressione di geni specifici che regolano la formazione del biofilm, la produzione di fattori di virulenza, antibiotici e il trasferimento di materiale genetico.</p> Signup and view all the answers

Quali sono le molecole di segnalazione utilizzate nel quorum sensing dei batteri Gram-positivi e Gram-negativi?

<p>I batteri Gram-positivi comunicano attraverso peptidi o aminoacidi, mentre i batteri Gram-negativi utilizzano acil omoserina lattoni, derivati da acidi grassi.</p> Signup and view all the answers

Spiegare il meccanismo di quorum quenching e il suo impatto sulla comunicazione batterica.

<p>Il quorum quenching è un meccanismo che interferisce con la comunicazione cellula-cellula tra batteri. Si verifica quando disinfettanti o antibiotici bloccano o interrompono i segnali chimici del quorum sensing, rendendo inefficaci i batteri resistenti.</p> Signup and view all the answers

Qual è il meccanismo di trasferimento del materiale genetico chiamato coniugazione?

<p>La coniugazione è un meccanismo di ricombinazione genetica in cui i batteri scambiano plasmidi, piccole molecole di DNA circolare.</p> Signup and view all the answers

Descrivere come i batteri si adattano all'ambiente circostante durante la formazione del biofilm.

<p>I batteri utilizzano il quorum sensing e la ricombinazione genetica per adattarsi all'ambiente circostante. Attraverso il quorum sensing, regolano l'espressione di geni specifici per la formazione del biofilm, la produzione di fattori di virulenza e di antibiotici. La ricombinazione genetica, come la coniugazione, permette loro di acquisire nuovi geni e di adattarsi a nuove condizioni ambientali.</p> Signup and view all the answers

Quali sono le tre principali categorie di enzimi immobilizzati in base al metodo di legame?

<p>Gli enzimi immobilizzati possono essere classificati in tre categorie: enzimi adsorbiti, enzimi legati covalentemente ed enzimi intrappolati.</p> Signup and view all the answers

Perché è importante proteggere il sito catalitico di un enzima durante il processo di immobilizzazione?

<p>Proteggere il sito catalitico è essenziale per mantenere l'attività dell'enzima. Il legame con il supporto potrebbe avvenire a livello del sito catalitico, rendendolo inaccessibile al substrato e inattivando l'enzima.</p> Signup and view all the answers

Quali sono i vantaggi e gli svantaggi dell'adsorbimento come metodo di immobilizzazione degli enzimi?

<p>L'adsorbimento è un metodo semplice, veloce ed economico, ma il legame debole può portare all'eluizione dell'enzima dal supporto. Questo significa una perdita di attività enzimatica nel tempo.</p> Signup and view all the answers

In che modo i metalli di transizione possono migliorare l'immobilizzazione degli enzimi per adsorbimento?

<p>I metalli di transizione possono agire da chelanti tra l'enzima e il supporto, creando legami dativi più forti rispetto ai legami ionici.</p> Signup and view all the answers

Come si immobilizzano le glicoproteine mediante adsorbimento?

<p>Le glicoproteine possono essere immobilizzate con l'aiuto di lectine, proteine specifiche per determinati zuccheri, che si legano alla parte glucidica della proteina.</p> Signup and view all the answers

Quali sono i vantaggi dell'immobilizzazione delle lipoproteine mediante interazioni idrofobiche?

<p>L'immobilizzazione delle lipoproteine mediante interazioni idrofobiche offre alte rese, stabilità di pH e stabilità di concentrazione.</p> Signup and view all the answers

Come si può separare l'enzima dal supporto dopo l'immobilizzazione mediante adsorbimento?

<p>L'enzima può essere separato dal supporto mediante detergenti come SDS o Triton, ma con concentrazioni moderate per evitare la denaturazione della proteina.</p> Signup and view all the answers

Spiega il meccanismo di immobilizzazione degli enzimi mediante reagenti bifunzionali come la glutaraldeide.

<p>La glutaraldeide si lega covalentemente all'enzima sugli ammino gruppi e alle ammine primarie del supporto, creando un legame stabile tra enzima e supporto.</p> Signup and view all the answers

Spiega perché la presenza di grandi quantità di zuccheri nel mosto può portare alla produzione di glicerolo da parte dei lieviti.

<p>In presenza di grandi quantità di zuccheri, la pressione osmotica all'interno delle cellule di lievito aumenta. Per contrastare questo effetto, i lieviti producono glicerolo, una molecola osmo-protettiva, a partire dal diidrossiacetone fosfato, con consumo di NADH.</p> Signup and view all the answers

Quali sono le due principali conseguenze della produzione di glicerolo da parte dei lieviti durante la fermentazione alcolica?

<p>La produzione di glicerolo riduce la gradazione alcolica del vino perché il diidrossiacetone fosfato non viene convertito in gliceraldeide 3-fosfato e quindi solo la gliceraldeide 3-fosfato viene convertita in piruvato e va in fermentazione alcolica. Inoltre, la produzione di glicerolo porta alla diminuzione della gradazione alcolica e all'aumento dell'acidità perché una parte di etanolo viene convertita in acetaldeide e successivamente in acido acetico per rigenerare il NADH.</p> Signup and view all the answers

Spiega perché è importante raffreddare la miscela durante la fermentazione alcolica.

<p>Il raffreddamento della miscela è importante per evitare la morte dei lieviti, che sono sensibili a temperature troppo elevate.</p> Signup and view all the answers

Perché è fondamentale eseguire i travasi durante la fermentazione alcolica?

<p>I travasi servono a rimuovere i lieviti morti e le loro componenti cellulari. Questi elementi possono rendere il vino ospitale per batteri e lieviti inquinanti che potrebbero alterare il gusto e la qualità del vino.</p> Signup and view all the answers

Quali sono i due parametri principali che caratterizzano il vino al termine della fermentazione alcolica?

<p>Il vino al termine della fermentazione alcolica presenta un pH di 2-3 e una concentrazione alcolica tra gli 11-14 gradi.</p> Signup and view all the answers

Descrivi gli effetti degli alcol superiori sul vino.

<p>Gli alcoli superiori, come butanolo, isobutanolo, propanolo, alcol isoamlico e 2-feniletiletanolo, possono contribuire all'aroma del vino in concentrazioni inferiori ai 300 mg/L. Tuttavia, in concentrazioni superiori a 400 mg/L, questi alcoli possono dare al vino un gusto amaro e sgradevole, rendendolo potenzialmente tossico.</p> Signup and view all the answers

Elenca e descrivi brevemente i metodi per ridurre la quantità di alcoli superiori prodotti durante la fermentazione alcolica.

<p>Si possono ridurre gli alcoli superiori attraverso diverse strategie: mutazione di Saccharomyces cerevisiae utilizzando raggi UV o etilmetano sulfonato per inibire la fermentazione alcolica, riduzione della percentuale di azoto nel mosto, manipolazione genetica dei lieviti per ridurre la produzione di alcoli superiori derivanti da aminoacidi a catena ramificata e utilizzo di enzimi immobilizzati su alginato di sodio estratti dal Geothricum per migliorare la stabilità enzimatica e ridurre la produzione di alcoli superiori.</p> Signup and view all the answers

Oltre ai composti che si formano durante la fermentazione, cosa influenza il profilo aromatico del vino?

<p>Oltre ai 800 composti presenti nel vino, il profilo aromatico è influenzato anche dal legno della botte in cui viene conservato il vino.</p> Signup and view all the answers

Qual è la differenza principale tra le proteine integrali e le proteine periferiche nella membrana cellulare?

<p>Le proteine integrali attraversano completamente la membrana, mentre le proteine periferiche sono attaccate alla superficie della membrana.</p> Signup and view all the answers

Cosa caratterizza il trasporto passivo attraverso la membrane cellulare?

<p>Il trasporto passivo permette a molecole lipidiche e acqua di attraversare la membrana senza dispendio di energia.</p> Signup and view all the answers

In cosa consiste il trasporto contro gradiente e quali risorse energetiche richiede?

<p>Il trasporto contro gradiente sposta molecole in direzione opposta al gradiente e richiede energia, spesso sotto forma di ATP.</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo dell'RNA nella sintesi proteica?

<p>L'RNA messe insieme, come l'mRNA, fornisce il modello per la sintesi di proteine assemblando amminoacidi.</p> Signup and view all the answers

Qual è il principale vantaggio del trasporto facilitato rispetto al trasporto passivo?

<p>Il trasporto facilitato utilizza canali specifici che permettono il passaggio di molecole polari anche contro il gradiente, sebbene in maniera meno efficiente.</p> Signup and view all the answers

Come il DNA e le proteine interagiscono nella replicazione cellulare?

<p>Il DNA si replica per dare origine a nuove cellule, ma questo processo richiede anche la presenza di proteine.</p> Signup and view all the answers

Quale tipo di trasporto permette a molecole piccole di passare liberamente attraverso la membrana plasmatica?

<p>Il trasporto passivo consente a piccole molecole come lipidi e gas di attraversare liberamente la membrana plasmatica.</p> Signup and view all the answers

Che tipo di metabolismo avevano inizialmente i microrganismi e quali erano i suoi limiti energetici?

<p>I microrganismi avevano un metabolismo fermentativo che generava poca energia, producendo solo 2 moli di ATP.</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo del pilo F nei batteri Gram-?

<p>Il pilo F serve per il trasferimento del plasmide dal batterio donatore a quello ricevente.</p> Signup and view all the answers

Come avviene la trasduzione nei batteri?

<p>La trasduzione avviene quando un fago infetta un batterio, seguendo il ciclo litico o il ciclo lisogenico.</p> Signup and view all the answers

Cosa sono le vescicole nei batteri e qual è la loro funzione?

<p>Le vescicole sono strutture rilasciate dai batteri che fungono da trasportatori per diverse molecole.</p> Signup and view all the answers

Qual è la differenza tra esclusione e competizione in un contesto di antagonismo batterico?

<p>L'esclusione riguarda la colonizzazione di uno spazio da parte di un batterio, mentre la competizione si verifica quando due specie cercano di colonizzare lo stesso sito.</p> Signup and view all the answers

In che modo i batteri possono utilizzare la coaggregazione come strategia antagonistica?

<p>Attraverso la coaggregazione, alcuni batteri circondano i batteri patogeni, impedendone l'adesione o inattivandoli.</p> Signup and view all the answers

Cosa si intende per spiazzamento in microbiologia?

<p>Lo spiazzamento si verifica quando una nuova popolazione batterica soppianta una popolazione residente in un ambiente.</p> Signup and view all the answers

Che ruolo gioca la competizione nutrizionale tra le specie batteriche?

<p>Nella competizione nutrizionale, le specie che hanno esigenze simili si contendono le risorse, favorendo quella che si riproduce più rapidamente.</p> Signup and view all the answers

Qual è il risultato finale della trasduzione batterica nel contesto della resistenza?

<p>La trasduzione può portare a batteri riceventi che acquisiscono nuovi geni, inclusi quelli relativi alla resistenza agli antibiotici.</p> Signup and view all the answers

Qual è il principale vantaggio dell'immobilizzazione covalente degli enzimi?

<p>L'immobilizzazione covalente è costosa ma altamente efficace, poiché garantisce che l'enzima rimanga attivo nella sua forma immobilizzata.</p> Signup and view all the answers

Che ruolo ha il bromuro di cianogeno nell'attivazione dell'agarosio?

<p>Il bromuro di cianogeno attiva l'agarosio reagendo con i gruppi ossidrili, formando cianuri reattivi che interagiscono con gli ammino gruppi delle proteine.</p> Signup and view all the answers

Perché è importante mantenere un pH costante durante l'attivazione dell'agarosio?

<p>Mantenere un pH costante previene la denaturazione della proteina immobilizzata, assicurando la sua funzionalità.</p> Signup and view all the answers

Quali gruppi amminoacidici possono essere coinvolti nell'immobilizzazione covalente?

<p>I gruppi amminoacidici coinvolti includono il glutammato, asparagina, lisina, istidina e cisteina.</p> Signup and view all the answers

Qual è la differenza principale tra il metodo sequenziale e il metodo simultaneo di immobilizzazione?

<p>Il metodo sequenziale prevede il trattamento con un acido forte seguito da una base forte, mentre nel metodo simultaneo si combinano supporto, enzima e carbodiimmide contemporaneamente.</p> Signup and view all the answers

Quali sono gli effetti dell'aggiunta di bracci spaziatori all'agarosio?

<p>I bracci spaziatori consentono alla proteina immobilizzata di muoversi liberamente, evitando legami diretti al supporto.</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo della carbodiimmide nell'immobilizzazione degli enzimi?

<p>La carbodiimmide attiva i gruppi carbossilici reattivi dei bracci spaziatori per permettere il legame con la proteina da immobilizzare.</p> Signup and view all the answers

In che modo il toluene è utilizzato durante il processo di immobilizzazione?

<p>Il toluene funge da precipitante liquido attraverso il quale passa l'emulsione per raccogliere le fibre formate.</p> Signup and view all the answers

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Flashcards

Effetto degli zuccheri sul lievito

Un eccesso di zuccheri nel mosto causa un aumento della pressione osmotica, portando i lieviti a produrre glicerolo come molecola osmo-protettiva.

Effetti della produzione di glicerolo sul processo di fermentazione

La produzione di glicerolo dal diidrossiacetone fosfato sottrae NADH, che è necessario per la conversione del diidrossiacetone fosfato in gliceraldeide 3-fosfato. Questo processo riduce la quantità di gliceraldeide 3-fosfato disponibile per la fermentazione alcolica, portando a vini meno alcolici.

Rigenerazione del NADH e acidità

La produzione di glicerolo sottrae NADH, che deve essere rigenerato. Questo processo di rigenerazione comporta la conversione di una parte dell'etanolo in acetaldeide e poi in acido acetico, diminuendo ulteriormente la gradazione alcolica e aumentando l'acidità del vino.

Alcoli superiori nel vino

Gli alcoli superiori sono prodotti secondari della fermentazione e possono influenzare il gusto del vino, conferendogli un sapore amaro o persino essere tossici in quantità eccessive.

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Controllo della produzione di alcoli superiori

Per mitigare la formazione di alcoli superiori, possono essere impiegate diverse strategie, tra cui la manipolazione genetica del lievito, la riduzione dell'azoto nel mosto e l'utilizzo di enzimi immobilizzati per contrastare la loro produzione.

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Fasi finali della produzione del vino

Dopo la fermentazione, il vino deve essere sottoposto a processi di chiarificazione, stabilizzazione e invecchiamento per garantire la sua qualità e armonia.

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Importanza del legno nella produzione del vino

Il legno della botte in cui invecchia il vino contribuisce al suo profilo aromatico, oltre ai circa 800 composti già presenti.

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Rischio di contaminazione durante la fermentazione

La fermentazione, se non controllata, può portare alla morte dei lieviti, rilasciando componenti cellulari che rendono il vino suscettibile a contaminazioni da batteri e altri lieviti.

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Quorum sensing

La capacità dei batteri di comunicare tra loro attraverso l'emissione di segnali chimici.

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Formazione del biofilm

Il processo in cui i batteri si aggregano e formano una comunità complessa, aderendo alle superfici.

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Sacrificial cells

Cellule batteriche che si trovano all'interno del biofilm e sono responsabili della sua formazione.

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Cellule persisters

Bacteria aerobi o anaerobi facoltativi che rimangono in uno stato di quiescenza all'interno del biofilm e possono rigenerarlo.

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Segnali di trasduzione del Quorum Sensing

Molecole chimiche prodotte dai batteri per la comunicazione nel quorum sensing. Nei batteri Gram-positivi sono peptidi o aminoacidi, mentre nei batteri Gram-negativi sono acil-omoserina-lattoni.

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Coniugazione batterica

Il meccanismo attraverso cui i batteri scambiano il materiale genetico, in particolare i plasmidi.

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Geni regolati dal quorum sensing

L'insieme dei geni responsabili della formazione del biofilm, della virulenza, della produzione di antibiotici e del trasferimento genetico.

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Quorum quenching

Un processo che ostacola la comunicazione cellula-cellula tra batteri, ad esempio attraverso l'utilizzo di disinfettanti o antibiotici.

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Pilo F

I batteri Gram-negativi utilizzano questo organello per trasferire il plasmide a un altro batterio.

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Trasduzione

Il trasferimento di materiale genetico da un batterio a un altro tramite un virus.

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Ciclo litico

Un ciclo virale in cui il virus si replica all'interno del batterio, causando la sua lisi (rottura).

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Ciclo lisogenico

Un ciclo virale in cui il DNA virale si integra nel DNA batterico, replicandosi insieme a esso.

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Vescicole

I batteri possono rilasciare queste vescicole per trasportare piccole molecole ad altre cellule.

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Esclusione

Una forma di competizione tra batteri in cui un batterio impedisce agli altri di colonizzare un determinato spazio.

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Competizione

Quando due specie batteriche competono per le risorse, quella che si riproduce più velocemente prenderà il sopravvento.

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Coaggregazione

Alcuni batteri avvolgono i batteri patogeni, impedendone l'adesione o inattivandoli.

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Immobilizzazione di un enzima: perché è importante?

L'immobilizzazione di un enzima prevede l'ancoraggio dell'enzima a un supporto solido. Questo processo è importante per aumentare la stabilità dell'enzima e permettere la sua rimozione e riutilizzo.

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Protezione del sito catalitico durante l'immobilizzazione

Durante l'immobilizzazione, il sito catalitico dell'enzima è fondamentale per la sua attività. Per proteggerlo durante il processo, si possono aggiungere analoghi del substrato o un'abbondanza del substrato naturale.

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Tipi di enzimi immobilizzati

Gli enzimi immobilizzati vengono classificati in base al metodo di legame al supporto. Tre tipi principali sono gli enzimi adsorbiti, gli enzimi legati covalentemente e gli enzimi intrappolati.

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Immobilizzazione per adsorbimento

L'adsorbimento è un metodo semplice e veloce per immobilizzare gli enzimi, ma il legame è debole e l'enzima potrebbe essere eluito.

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Utilizzo di metalli di transizione nell'immobilizzazione

I metalli di transizione possono migliorare il legame tra l'enzima e il supporto, creando legami dativi che sono più forti dei legami ionici.

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Utilizzo delle lectine nell'immobilizzazione

Le lectine sono proteine che si legano agli zuccheri. Se l'enzima è una glicoproteina, la parte glucidica può legarsi al supporto attraverso le lectine, creando un legame più forte rispetto all'assorbimento semplice.

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Immobilizzazione di lipoproteine

Le lipoproteine hanno una parte lipidica. Questa parte può interagire con il dominio idrofobico del supporto, formando un legame idrofobico.

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Utilizzo della glutaraldeide nell'immobilizzazione

La glutaraldeide è un reagente bifunzionale che può legarsi covalentemente all'enzima e al supporto, creando un legame forte e stabile.

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Immobilizzazione covalente di enzimi

L'immobilizzazione covalente è un metodo per legare un enzima a un supporto solido mediante legami covalenti. Questo tipo di immobilizzazione è la più stabile e resistente alle condizioni di reazione, ma anche la più costosa.

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C-terminale e N-terminale nell'immobilizzazione

Il C-terminale e l'N-terminale sono i gruppi terminali della catena polipeptidica degli enzimi. Possono essere utilizzati come punti di attacco per l'immobilizzazione covalente.

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Attivazione dell'agarosio con bromuro di cianogeno

L'attivazione dell'agarosio mediante il bromuro di cianogeno è uno dei metodi più comuni per immobilizzare covalentemente gli enzimi. Il bromuro di cianogeno reagisce con i gruppi ossidrili dell'agarosio formando cianuri, strutture molto reattive che interagiscono con i gruppi amminici delle proteine, formando un derivato dell'isourea.

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Attivazione dell'agarosio con acili e carbodiimmidi

L'attivazione dell'agarosio con acili e carbodiimmidi prevede l'aggiunta di bracci spaziatori all'agarosio per creare più spazio tra l'enzima e il supporto, migliorando la mobilità dell'enzima.

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Bracci spaziatori

I bracci spaziatori sono catene idrocarburiche che vengono aggiunte all'agarosio per separare l'enzima dal supporto. Questi bracci favoriscono la mobilità dell'enzima e consentono una maggiore attività catalitica.

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Ruolo della Carbodiimmide

La carbodiimmide è un reagente chimico utilizzato per attivare i gruppi carbossilici dei bracci spaziatori sull'agarosio. Questo processo consente ai gruppi carbossilici di legarsi alla proteina da immobilizzare.

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Metodi sequenziale e simultaneo

Il metodo sequenziale prevede il trattamento dell'agarosio con un acido forte seguito da un trattamento con una base forte. Il metodo simultaneo prevede la miscelazione simultanea dell'agarosio, dell'enzima e della carbodiimmide.

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Reazione a pH 4.8

A pH 4.8, la carbodiimmide reagisce con il carbossile del braccio spaziatore, creando un legame covalente tra l'enzima e l'agarosio.

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Doppio strato fosfolipidico

Il doppio strato fosfolipidico è una struttura che forma la membrana cellulare, è responsabile della separazione tra l'ambiente interno ed esterno della cellula, creando una barriera semipermeabile.

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Proteine integrali

Le proteine integrali sono proteine che attraversano completamente la membrana cellulare, creando canali che consentono il passaggio di molecole. Sono ancorate alla membrana tramite interazioni idrofobiche e richiedono un trattamento con detergenti per essere estratte.

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Proteine periferiche

Le proteine periferiche sono legate alla superficie della membrana cellulare, sia interna che esterna. Sono collegate alle proteine integrali tramite legami idrogeno e interazioni elettrostatiche. Sono estratte mediante l'aumento della forza ionica.

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Trasporto passivo

Il trasporto passivo è un tipo di trasporto attraverso la membrana che non richiede energia. Le molecole lipidiche, l'acqua e i gas possono attraversare la membrana liberamente, senza l'aiuto di proteine.

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Trasporto contro gradiente

Il trasporto contro gradiente è un tipo di trasporto che richiede energia per muovere le molecole contro il loro gradiente di concentrazione. Richiede l'azione di una proteina trasportatrice associata a una proteina che scinde l'ATP.

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Trasporto facilitato

Il trasporto facilitato è un tipo di trasporto che si basa su canali che presentano gruppi carichi positivamente o negativamente, permettendo il passaggio di molecole polari. Il trasporto avviene secondo gradiente ma è poco efficiente.

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RNA e sintesi proteica

L'RNA è una molecola che svolge un ruolo cruciale nella sintesi proteica. L'mRNA funge da stampo per la produzione di proteine, mentre altri RNA assemblano gli amminoacidi per formare le proteine.

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Respirazione cellulare nei microrganismi

La respirazione cellulare è un processo che consente ai microrganismi di ottenere energia. Nei primi microrganismi, il metabolismo fermentativo era dominante, producendo poca energia (2 moli di ATP).

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