ccb03-UE2

La structure de l’ARN polymérase mitochondriale est très similaire à celles des ARN polymérases nucléaires.

L’ARN polymérase III est localisée dans le nucléole où elle synthétise le préARNr 45S.

Les gènes transcrits par l’ARN polymérase II sont les plus nombreux mais leurs transcrits sont les moins abondants.

Un domaine C-terminal, constitué de répétitions d’un heptapeptide, est retrouvé sur les grandes sous-unités des ARN polymérases I, II et III.

La sous-unité CDK7 du complexe TFIIH permet la phosphorylation du domaine C-terminal de la sous-unité RPB1 de l’ARN polymérase II et la méthylation des dinucléotides CpG.

Les ARN polymérases sont des enzymes processives, pouvant catalyser plusieurs réactions enzymatiques successives sans se dissocier de leur substrat.

Tous les promoteurs ont une boite TATA permettant le recrutement de la protéine TBP.

Les facteurs généraux de transcription TFIIF et TFFIIE restent associés à l’ARN polymérase lors de l’élongation de la transcription.

Lors de la réaction d’épissage, des réarrangements du spliceosome ont lieu pour permettre les deux réactions de transestérification.

Les snRNPs étant localisées aux pores nucléaires, la réaction d’épissage est couplée à l’export de l’ARNm.

Les mêmes protéines lient à la fois la coiffe et la séquence polyA, protégeant ainsi l’ARNm de la dégradation par des exonucléases.

L’épissage alternatif permet d’obtenir de nombreux variants des ARNr 28S et 18S.

Le domaine histone fold de l’histone H2A permet sa dimérisation avec un domaine histone fold de H2B, H3 ou H4.

Les protéines histones peuvent être modifiées par des complexes coactivateurs.

Les liaisons faibles entre protéines histones et ADN rendent la structure du nucléosome extrêmement lâche et dynamique.

Les protéines histones s’associent préférentiellement aux séquences cis régulatrices

TFIID est le premier facteur général recruté en amont du site d’initiation de la transcription.

Lors de l’élongation de la transcription, les facteurs généraux sont dissociés de l’ARN polymérase II.

Le promoteur minimum est flanqué par un site donneur et un site accepteur d’épissage.

Le promoteur minimum permet le recrutement d’activateurs transcriptionnels.

Les méthylations des sérines 5 sont mises en place par CDK7, une sous-unité du complexe TFIIH.

Les enzymes de formation de la coiffe sont recrutées par le CTD phosphorylé sur les sérines 5.

Au cours de la transcription, le CTD est tout d’abord méthylé sur les sérines 5 puis sur les sérines 2.

La kinase CDK9 catalyse l’ubiquitination du CTD provoquant la dégradation de Rpb1.

Un gène ayant deux exons et trois introns, a trois sites donneurs d’épissage.

Après la première réaction de transestérification la guanosine du site donneur d’épissage sera liée au 2’ OH de l’adénosine du site de branchement.

Tous les sites accepteurs d’épissage ont une séquence AG invariante à l’extrémité 3’ de l’intron.

Une snRNP est composée par l’assemblage d’une protéine avec 5 snRNA (snRNA U1, U2, U4, U5 et U6).

Un nucléosome contient 4 dimères d’histones (2 dimères H2A-H2B et 2 dimères H3-H4).

L’association aux protéines histones limite l’accessibilité de l’ADN pour les facteurs de transcription.

La triméthylation de la lysine 9 de l’histone H3 (H3K9me3) est très fortement enrichie aux promoteurs des gènes activement transcrits.

L’hétérochromatine contient de nombreuses régions déplétées en nucléosomes.

Chaque gène étant régulé par un facteur de transcription unique, il existe donc environ 22000 facteurs de transcription différents.

Les activateurs transcriptionnels induisent des modifications post traductionnelles de l’ARN polymérase II.

Dans toutes les cellules de l’organisme on retrouve une même combinaison d’activateurs transcriptionnels.

Un enhancer situé en aval et à distance d’un promoteur donné peut activer la transcription du gène correspondant par la formation d’une boucle de chromatine.

Les promoteurs, comme les enhancers, peuvent agir dans les deux orientations.

Un activateur transcriptionnel peut se fixer à de nombreux sites spécifiques dispersés sur le génome.

Un activateur transcriptionnel peut se fixer à de nombreux sites spécifiques dispersés sur le génome.

Un enhancer est une séquence régulatrice agissant en trans.

Des ADN méthyltransférases catalysent la méthylation de l’ADN et des protéines histones.

Les marques d’histones, une fois mises en place, vont persister pendant toute la vie de la cellule.

De nombreuses marques d’histones recrutent d’autres protéines qui affectent la transcription.

De nombreux activateurs transcriptionnels agissent en induisant des modifications post- traductionnelles des histones.

Toutes les ARN polymérases synthétisent des ARN double brin.

Toutes les protéines mitochondriales sont produites à partir des gènes du génome mitochondrial.

L’ARN synthétisé par une ARN polymérase reste entièrement apparié au brin non-matriciel de l’ADN double brin.

Il existe quatre ARN polymérases dans les cellules humaines.

Des ADN méthyltransférases catalysent la méthylation de l’ADN et des protéines histones.

Les marques d’histones, une fois mises en place, vont persister pendant toute la vie de la cellule.

De nombreuses marques d’histones recrutent d’autres protéines qui affectent la transcription.

De nombreux activateurs transcriptionnels agissent en induisant des modifications post- traductionnelles des histones.

Toutes les ARN polymérases synthétisent des ARN double brin.

Toutes les protéines mitochondriales sont produites à partir des gènes du génome mitochondrial.

L’ARN synthétisé par une ARN polymérase reste entièrement apparié au brin non-matriciel de l’ADN double brin.

Il existe quatre ARN polymérases dans les cellules humaines.

Les dinucléotides CpG sont sur-représentés dans le génome humain.

Les îlots CpG sont souvent retrouvés à l’extrémité 5’ des gènes de ménage.

Toutes les cytosines du génome peuvent être méthylées par des ADN méthyltransférases.

Les promoteurs minimum ayant une boite TATA sont le plus souvent contenus dans un îlot CpG.