ชีวสารสนเทศศาสตร์ บทนำ

กระบวนการเปรียบเทียบลำดับเบสหรือลำดับกรดอะมิโนของสองลำดับหรือมากกว่า เรียกอีกอย่างว่า Sequence Alignment

การจัดเรียงลำดับของสองลำดับเท่านั้น

โปรแกรมสำหรับการจัดเรียงคู่

การจัดเรียงลำดับของสามลำดับขึ้นไป

โปรแกรมสำหรับการจัดเรียงหลายลำดับ

โปรแกรมสำหรับ BioEdit ช่วยในการจัดเรียงลำดับ

การจัดเรียงลำดับโดยใช้ลำดับชั้น

เว็บไซต์สำหรับการจัดเรียงลำดับและสร้างโลโก้

การวิเคราะห์ขนาดของชิ้น DNA โดยการใช้เอนไซม์ตัดจําเพาะ (Restriction enzyme) เพื่อค้นหาจุดตัดบนสาย DNA

โปรแกรมเชิงพาณิชย์ที่ใช้ในการจัดเรียงลำดับ DNA

การรวมลำดับนิวคลีโอไทด์ของชิ้น DNA สั้นๆ เข้าด้วยกันเพื่อสร้างลำดับ DNA เต็ม

โครงการวิจัยขนาดใหญ่ที่มุ่งหมายในการทำแผนที่ยีน (gene mapping) ทั้งหมดของมนุษย์

ยีน CYS3 ในยีสต์ Saccharomyces cerevisiae ควบคุมการสร้างเอนไซม์ ไซสเตทไธโอนีน แกมมา-ไลเอส

เอนไซม์ที่ทำหน้าที่ตัดพันธะ γ ในโมเลกุลไซสเตทไธโอนีน

สายพันธุ์ Saccharomyces cerevisiae ที่ใช้ในการศึกษา

การทดลองเพื่อศึกษาคุณสมบัติทางเคมีและเอนไซม์ของโปรตีน

ข้อมูลที่ตีพิมพ์ในวารสารวิชาการ J. Bacteriol. ปี 1993

เป็นโปรแกรมฐานข้อมูลสำหรับข้อมูลโครงสร้าง 3 มิติของโปรตีนและกรดนิวคลีอิก สามารถเข้าถึงข้อมูลโครงสร้างของโปรตีนและกรดนิวคลีอิกทั่วโลก พร้อมข้อมูลการทำงานของโปรตีน

เป็นรูปแบบไฟล์ข้อความที่ใช้แทนข้อมูลลำดับเบสของนิวคลีโอไทด์หรือกรดอะมิโน มีสามส่วนหลัก: ชื่อข้อมูล, ลำดับข้อมูล, และเครื่องหมายสิ้นสุดข้อมูล (option)

เป็นส่วนแรกของไฟล์ Fasta format ซึ่งระบุแหล่งที่มาหรือชื่อของข้อมูล เช่น ชื่อยีน ชื่อโปรตีน

เป็นส่วนที่สองของไฟล์ Fasta format ซึ่งประกอบด้วยลำดับเบสของนิวคลีโอไทด์หรือกรดอะมิโน

เป็นส่วนที่สามของไฟล์ Fasta format ซึ่งเป็นเครื่องหมายสิ้นสุดข้อมูล

ขั้นตอนในการเตรียมไฟล์ Fasta format คือ

เป็นการวิเคราะห์ข้อมูลเบื้องต้นโดยใช้ไฟล์ Fasta format

การวิเคราะห์ข้อมูลเบื้องต้นสามารถทำได้โดยการ

การค้นหาข้อมูลเกี่ยวกับยีน โปรตีน หรือลำดับเบส

การเปรียบเทียบลำดับข้อมูลกับข้อมูลอื่นๆ เพื่อหาความคล้ายคลึงหรือความแตกต่าง

การนําเทคโนโลยีด้านสารสนเทศมาใช้ในการศึกษาทางชีววิทยา เช่น การวิเคราะห์ลําดับดีเอ็นเอ โปรตีน การสร้างแบบจําลองโครงสร้างโมเลกุล และการพัฒนาฐานข้อมูลทางชีวภาพ

ไฟล์ที่ใช้ในการบันทึกข้อมูลลําดับดีเอ็นเอ หรือโปรตีน โดยจะมีชื่อไฟล์ลงท้ายด้วย .fasta และมีโครงสร้างของไฟล์เป็น >ชื่อลําดับ
ลําดับดีเอ็นเอ หรือ โปรตีน

ฐานข้อมูลทางชีวภาพที่รวบรวมข้อมูลเกี่ยวกับยีน โปรตีน และสิ่งมีชีวิตต่างๆ

โปรแกรมหรือเว็บไซต์ที่ช่วยในการวิเคราะห์ข้อมูลทางชีวภาพ เช่น การค้นหาข้อมูล การเรียงลําดับ การสร้างแผนที่ยีน การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการ

เว็บไซต์ที่ให้ข้อมูลทางวิชาการเกี่ยวกับชีววิทยา เช่น บทความ การประชุมวิชาการ และการศึกษา

โปรแกรมที่ใช้ในการวิเคราะห์การตัดด้วยเอนไซม์จำเพาะ ซึ่งช่วยให้ทราบตำแหน่งของการตัดและสร้างชิ้นส่วน DNA

ไฟล์ที่บันทึกข้อมูลทางชีวภาพในรูปแบบของ GenBank โดยจะมีข้อมูลเกี่ยวกับลําดับดีเอ็นเอ โปรตีน และข้อมูลอื่นๆ ที่เกี่ยวข้อง

การใช้โปรแกรมหรือเว็บไซต์ในการวิเคราะห์ข้อมูลทางชีวภาพ เช่น การค้นหาข้อมูล การเรียงลําดับ การสร้างแผนที่ยีน การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการ

การตีความผลลัพธ์ของการวิเคราะห์ข้อมูล เพื่อให้ได้ข้อสรุปและความหมาย เช่น การหาสาเหตุของโรค การพัฒนาตัวยา และการออกแบบพันธุวิศวกรรม

เป็นยีนที่เกี่ยวข้องกับการเติบโตของเซลล์ประสาท โดยยีนนี้ถูกค้นพบในเซลล์ไฮบริดของมะเร็งต่อมน้ำเหลืองของหนู

เป็นเซลล์ไฮบริดที่เกิดจากการผสานเซลล์มะเร็งต่อมน้ำเหลืองของหนูกับเซลล์เนื้องอกสมองของหนู

เป็นฐานข้อมูลของลำดับนิวคลีโอไทด์ที่แสดงความสัมพันธ์ระหว่างลำดับนิวคลีโอไทด์กับฟังก์ชันการทำงานของยีน

เป็นลำดับของนิวคลีโอไทด์ที่แสดงถึงยีน TA20

เป็นลำดับของกรดอะมิโนที่สร้างจากการถอดรหัสลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน TA20

เป็นส่วนหนึ่งของลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ทำหน้าที่ควบคุมการแสดงออกของยีน

เป็นจุดเริ่มต้นของการสร้างโปรตีนจากลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน

เป็นสัญญาณที่บอกว่ายีนถูกถอดรหัสเป็นโปรตีนแล้ว

เป็นส่วนหนึ่งของลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ทำหน้าที่ควบคุมการแสดงออกของยีนโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่เกี่ยวข้องกับการสร้างโปรตีน

เป็นหน่วยพื้นฐานของรหัสพันธุกรรมที่ประกอบด้วยลำดับเบส 3 ตัว

เป็นเทคนิคที่ใช้ในการค้นหาและแยกยีน

เป็นการศึกษาเกี่ยวกับฟังก์ชันการทำงานของยีนและผลกระทบต่อเซลล์

เป็นกระบวนการที่เซลล์ใช้ในการปรับเปลี่ยนและรับส่งโปรตีนเพื่อให้ทำงานได้อย่างถูกต้อง

เป็นเซลล์ประสาทที่อยู่ในระหว่างการพัฒนา

เป็นกระบวนการที่เซลล์ประสาทสร้างเส้นใยประสาทที่ทำหน้าที่ส่งสัญญาณไปยังเซลล์ประสาทอื่น