ชีวสารสนเทศศาสตร์ บทนำ

Podcast

Play an AI-generated podcast conversation about this lesson

Questions and Answers

ยีน CYS3 มีหน้าที่อะไรใน Saccharomyces cerevisiae?

เข้าร่วมในกระบวนการสร้างสารในลำไส้

เข้าร่วมในกระบวนการสร้างกรดอะมิโน (correct)

เข้าร่วมในการสังเคราะห์โปรตีน

เข้าร่วมในกระบวนการหายใจ

Saccharomyces cerevisiae อยู่ในกลุ่มไหน?

Plantae

Fungi (correct)

Animalia

Bacteria

การศึกษานี้มีการวิจัยเกี่ยวกับอะไร?

การพัฒนาสายพันธุ์ใหม่

การแสดงออกของยีน CYS3 (correct)

การผลิตฮอร์โมน

การควบคุมเชื้อโรค

เอนไซม์ที่ถูกเข้ารหัสโดยยีน CYS3 มีลักษณะเฉพาะอย่างไร?

มีสมบัติทางฟิสิกส์และเคมีที่เฉพาะเจาะจง Signup and view all the answers

บทความนี้ตีพิมพ์ในปีไหน?

1993 Signup and view all the answers

การวิเคราะห์ด้วยเอนไซม์ตัดจาเพาะมีประโยชน์ในด้านใด?

การตัดต่อ DNA Signup and view all the answers

โปรแกรมที่ให้บริการในการวิเคราะห์และจัดการลำดับนิวคลิโอไทด์มีอะไรบ้าง?

VNTI และ Bioedit Signup and view all the answers

Restriction mapper เกี่ยวข้องกับอะไร?

การตัดจาเพาะเอนไซม์ Signup and view all the answers

Human Genome Project มีวัตถุประสงค์ใด?

การศึกษาลำดับดีเอ็นเอของมนุษย์ Signup and view all the answers

การ assemble ลำดับนิวคลีโอไทด์นำไปสู่อะไร?

การสร้าง full gene Signup and view all the answers

การเปรียบเทียบลำดับเบสหรือลำดับกรดอะมิโนของ sequences มากกว่า 2 ตัวเรียกว่าอะไร?

Multiple alignment Signup and view all the answers

โปรแกรมใดที่ใช้ในการทำ Pairwise alignment?

DIALIGN Signup and view all the answers

Clustal W ใช้สำหรับทำอะไร?

ทำ Multiple alignment Signup and view all the answers

โปรแกรมใดที่เหมาะสมสำหรับการสร้าง Alignment และสร้าง Logo?

WebLogo Signup and view all the answers

ลำดับกรดอะมิโนหรือเบสที่มีความยาวมาก ตัวไหนเหมาะสมสำหรับการใช้ในการทำ Alignment?

ข้อมูลเบสพันธุกรรม Signup and view all the answers

การจัดกลุ่มลำดับที่มีความคล้ายคลึงกันจะใช้เทคนิคใด?

Cluster analysis Signup and view all the answers

ซอฟต์แวร์ใดที่นิยมใช้ในการจัดการข้อมูล Alignment?

BioEdit Signup and view all the answers

สิ่งใดที่ไม่ใช่กรดอะมิโนในลำดับที่แสดง?

Thymine Signup and view all the answers

แหล่งข้อมูลไหนที่สามารถใช้ค้นหาระดับยีนหรือโปรตีนได้?

GenBank flash file Signup and view all the answers

การวิเคราะห์ข้อมูลเบื้องต้นในชีววิทยาจะใช้โปรแกรมไหนได้บ้าง?

Bioedit Signup and view all the answers

ไฟล์ประเภทใดที่มีการจัดเก็บข้อมูลยีน?

fasta file Signup and view all the answers

การใช้งาน bioinformatics มีจุดประสงค์หลักใด?

วิเคราะห์ข้อมูลทางชีววิทยา Signup and view all the answers

คำศัพท์ใดที่ไม่ถือเป็นศัพท์เฉพาะใน bioinformatics?

Software Signup and view all the answers

ข้อมูลลำดับนิวคลีโอไตด์อย่างง่ายสามารถวิเคราะห์ได้อย่างไร?

โดยใช้โปรแกรมเฉพาะ Signup and view all the answers

การใช้เทคโนโลยีสารสนเทศในชีววิทยามีวัตถุประสงค์อะไร?

ช่วยในการจัดการข้อมูล Signup and view all the answers

คำสั่งใดที่ไม่สามารถใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูลทางชีววิทยาได้?

ใช้โปรแกรม Word Signup and view all the answers

เพื่อการวิเคราะห์ข้อมูลอย่างถูกต้อง โปรแกรมใดที่ควรจะใช้?

Bioedit Signup and view all the answers

FASTA format มีส่วนประกอบหลักกี่ส่วน?

สามส่วน Signup and view all the answers

ในส่วนแรกของข้อมูล FASTA format ระบุข้อมูลอะไร?

ชื่อหรือแหล่งที่มาของข้อมูล Signup and view all the answers

จุดสิ้นสุดของข้อมูลใน FASTA format ถูกระบุโดยอักษรใด?

<ul> <li></li> </ul> Signup and view all the answers

PROTEIN DATA BASE (PDB) มีข้อมูลอะไรบ้าง?

ข้อมูลลำดับโปรตีนและโครงสร้าง 3D Signup and view all the answers

สาร TA20 มีหน้าที่ในการทำอะไรในเซลล์ประสาท?

ทำให้เกิดการยืดของใยประสาท Signup and view all the answers

การเตรียมไฟล์ FASTA ต้องมีการจัดรูปแบบข้อมูลอย่างไร?

ใช้เซคชั่นแยกต่างหากสำหรับแต่ละข้อมูล Signup and view all the answers

ลักษณะของเซลล์ที่ใช้ในการศึกษา TA20 เป็นอย่างไร?

เซลล์ที่ผสมระหว่างหนูกับกล้ามเนื้อ Signup and view all the answers

หลังจากลำดับกรดอะมิโนหรือเบสนิวคลีโอไทด์ใน FASTA format จะมีข้อมูลอะไรเพิ่มเติม?

ไม่มีข้อมูลเพิ่มเติม Signup and view all the answers

ข้อความที่บ่งบอกถึงแหล่งที่มาของข้อมูล FASTA format จะอยู่ในรูปแบบใด?

การรวมกันของตัวอักษรและตัวเลข Signup and view all the answers

การศึกษา TA20 ถูกส่งเพื่อเผยแพร่เมื่อใด?

18-พฤศจิกายน-1993 Signup and view all the answers

ลักษณะของความสัมพันธ์ระหว่าง TA20 และการเติบโตของเซลล์เป็นอย่างไร?

ทำให้เซลล์หยุดการเติบโต Signup and view all the answers

ส่วนใดของ FASTA format ไม่เกี่ยวข้องกับข้อมูลลำดับ?

ข้อมูลภาษา Signup and view all the answers

ไฟล์ในรูปแบบ FASTA สามารถใช้สำหรับการวิเคราะห์อะไรได้บ้าง?

การวิเคราะห์ลำดับโปรตีน Signup and view all the answers

แหล่งที่มาของลำดับ DNA ที่ใช้ในการศึกษา TA20 มีความเกี่ยวข้องกับสัตว์ประเภทใด?

สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม Signup and view all the answers

ลำดับของยีนที่ถูกศึกษา TA20 คือช่วงที่ไหนในลำดับของรหัส?

748..1311 Signup and view all the answers

ข้อมูลใน FASTA format เป็นข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับชนิดใด?

ข้อมูลชีวเคมี Signup and view all the answers

TA20 มีสัญญาณประเภทใดที่เกี่ยวข้องกับการควบคุมการแสดงออกของยีน?

TATA signal Signup and view all the answers

การค้นหาลำดับ TA20 สามารถใช้ในการศึกษาใด?

การสร้างเส้นใยประสาท Signup and view all the answers

อะไรคือประโยชน์หลักในการตรวจสอบลำดับรหัสโปรตีนของ TA20?

เข้าใจกลไกการเกิดโรค Signup and view all the answers

ความสำคัญของการจัดทำ cDNA คือต้องการมีข้อมูลเกี่ยวกับอะไร?

การแสดงออกของยีน Signup and view all the answers

TA20 มีผลต่อการยืดของใยประสาทอย่างไร?

เพิ่มความยืดหยุ่น Signup and view all the answers

ข้อมูลสรุปของ TA20 ระบุว่า TA20 มีสัญญาณบอกตำแหน่งไหน?

TATA_signal Signup and view all the answers

การตอบสนองของ TA20 ต่อเซลล์เป็นไปในทิศทางใด?

ยับยั้งการเจริญเติบโต Signup and view all the answers

Study Notes

บทนำเกี่ยวกับชีวสารสนเทศศาสตร์

ชีวสารสนเทศศาสตร์ คือ การนำเทคโนโลยีสารสนเทศมาใช้ในการศึกษาทางชีววิทยา
นักวิทยาศาสตร์ใช้ข้อมูลเพื่อทำความเข้าใจความแตกต่างของโรคและการรักษา
การพัฒนาการรักษาโรคที่ดีขึ้น และการทดสอบทางการแพทย์ใหม่ๆ

ผลการเรียนรู้ที่คาดหวัง

สามารถระบุแหล่งข้อมูลเพื่อค้นหาลำดับยีนหรือโปรตีนได้
สามารถอธิบายคำศัพท์เฉพาะและสัญลักษณ์สำคัญที่ระบุในไฟล์ข้อมูล เช่น ไฟล์ fasta และไฟล์ GenBank flash file
สามารถเลือกโปรแกรมหรือเว็บไซต์เพื่อวิเคราะห์ข้อมูลเบื้องต้น เช่น pubmed, Bioedit, และ web cutter
สามารถวิเคราะห์ข้อมูลอย่างง่าย อ่านผล และแปลผลการวิเคราะห์โดยใช้โปรแกรมต่างๆ ได้

ชีวสารสนเทศศาสตร์ (Bioinformatics)

เป็นการนำเทคโนโลยีสารสนเทศ (IT) มาใช้ในการศึกษาทางชีววิทยา
ใช้เพื่อศึกษาข้อมูลทางชีวภาพ เช่น ลำดับโปรตีน ลักษณะโครงสร้างของโปรตีน การจำแนกเชื้อ การวิเคราะห์ข้อมูลทางชีวเคมี และอื่นๆ
อาศัยการวิเคราะห์ข้อมูล และการจำลองแบบข้อมูลเพื่อทำความเข้าใจกระบวนการทางชีววิทยา
ช่วยให้เข้าใจโรคและการรักษาโรคได้ดียิ่งขึ้น รวมถึงการคิดค้นยาและการทดสอบทางการแพทย์ใหม่ๆ

ข้อมูลพื้นที่ชีวสารสนเทศศาสตร์ (Bioinformatics Information Space)

จำนวนจีโนมมนุษย์ที่ได้รับการจัดลำดับเพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็ว
มีการคาดการณ์ว่าจำนวนจีโนมมนุษย์ที่ได้รับการจัดลำดับจะเพิ่มขึ้นอย่างมากในอนาคต
อัตราการเติบโตต่อปี (CAGR) ของจำนวนจีโนมมนุษย์ที่ได้รับการจัดลำดับอยู่ที่ 200%

รายการรูปแบบไฟล์ข้อมูลลำดับเบสนิวคลีโอไทด์และลำดับกรดอะมิโน

GenBank sequence entry format
Fasta format
EMBL data library format
IG format
GCG format
Plain/ASCII.Staden sequence format
SwissProt sequence format
NBRF format or PIR format
ASN.1 format
GDE format

รูปแบบไฟล์ GenBank

ไฟล์ GenBank flash file เป็นไฟล์ข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ที่เก็บข้อมูลเกี่ยวกับยีน ชื่อยีน ขนาดยีน ลักษณะของยีน และหมายเลขยีนต่างๆ

ค้นหาข้อมูล

ใช้เครื่องมือค้นหาทางชีวภาพต่างๆ

- เช่น Google
- ใช้เว็บไซต์อย่าง NCBI เพื่อค้นหาข้อมูล
- การค้นหาข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์หรือโปรตีน เป็นสิ่งสำคัญ
- การเตรียมไฟล์เพื่อนำไปวิเคราะห์ เป็นส่วนสำคัญในการทำงาน

การวิเคราะห์ข้อมูลลำดับเบส

การจัดลำดับลำดับเบส (Sequence Alignment): กระบวนการเปรียบเทียบลำดับเบสหรือลำดับกรดอะมิโนเพื่อหาความคล้ายคลึงกัน
โปรแกรมที่ใช้ในการจัดลำดับเบส (Sequence Alignment) ได้แก่ DIALIGN และ Clustal W
โปรแกรม BioEdit สำหรับจัดลำดับเบสและเปรียบเทียบความคล้ายคลึงกัน
โปรแกรม Vector NTI สำหรับวิเคราะห์ ORF, การวิเคราะห์เอนไซม์ตัดจำเพาะ
การหา Open Reading Frame (ORF): การระบุตำแหน่งของยีนในลำดับเบสที่มี start codon และ stop codon
โปรแกรม ORF finder เพื่อหา ORF
การวิเคราะห์เอนไซม์ตัดจำเพาะ (Restriction enzymes): เพื่อหาตำแหน่งการตัดของเอนไซม์เหล่านั้น
โปรแกรม Restriction mapper และ NEBcutter
การประกอบลำดับ (Sequence Assembly): นำลำดับท่อนสั้น ๆ จากการจัดลำดับมาประกอบกันเป็นลำดับเต็ม
โปรแกรม (software) ต่างๆ เช่น Bioedit, Vector NTI

ฐานข้อมูลโปรตีน (PDB)

ฐานข้อมูลโปรตีน (PDB) ให้ข้อมูลลำดับโปรตีน ลักษณะโครงสร้าง 3 มิติ และหน้าที่ของโปรตีน

Studying That Suits You

Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.

Description

ชีวสารสนเทศศาสตร์คือการนำเทคโนโลยีสารสนเทศมาใช้ในการศึกษาทางชีววิทยา เพื่อทำความเข้าใจโรคและการรักษาได้ดีขึ้น Quiz นี้จะช่วยให้คุณสามารถระบุแหล่งข้อมูลและอธิบายคำศัพท์สำคัญในชีวสารสนเทศศาสตร์ได้.