ชีวสารสนเทศศาสตร์ บทนำ
50 Questions
2 Views

Choose a study mode

Play Quiz
Study Flashcards
Spaced Repetition
Chat to lesson

Podcast

Play an AI-generated podcast conversation about this lesson

Questions and Answers

ยีน CYS3 มีหน้าที่อะไรใน Saccharomyces cerevisiae?

  • เข้าร่วมในกระบวนการสร้างสารในลำไส้
  • เข้าร่วมในกระบวนการสร้างกรดอะมิโน (correct)
  • เข้าร่วมในการสังเคราะห์โปรตีน
  • เข้าร่วมในกระบวนการหายใจ

    • Saccharomyces cerevisiae อยู่ในกลุ่มไหน?

  • Plantae
  • Fungi (correct)
  • Animalia
  • Bacteria

    • การศึกษานี้มีการวิจัยเกี่ยวกับอะไร?

  • การพัฒนาสายพันธุ์ใหม่
  • การแสดงออกของยีน CYS3 (correct)
  • การผลิตฮอร์โมน
  • การควบคุมเชื้อโรค

    • เอนไซม์ที่ถูกเข้ารหัสโดยยีน CYS3 มีลักษณะเฉพาะอย่างไร?

    <p>มีสมบัติทางฟิสิกส์และเคมีที่เฉพาะเจาะจง</p> Signup and view all the answers

    บทความนี้ตีพิมพ์ในปีไหน?

    <p>1993</p> Signup and view all the answers

    การวิเคราะห์ด้วยเอนไซม์ตัดจาเพาะมีประโยชน์ในด้านใด?

    <p>การตัดต่อ DNA</p> Signup and view all the answers

    โปรแกรมที่ให้บริการในการวิเคราะห์และจัดการลำดับนิวคลิโอไทด์มีอะไรบ้าง?

    <p>VNTI และ Bioedit</p> Signup and view all the answers

    Restriction mapper เกี่ยวข้องกับอะไร?

    <p>การตัดจาเพาะเอนไซม์</p> Signup and view all the answers

    Human Genome Project มีวัตถุประสงค์ใด?

    <p>การศึกษาลำดับดีเอ็นเอของมนุษย์</p> Signup and view all the answers

    การ assemble ลำดับนิวคลีโอไทด์นำไปสู่อะไร?

    <p>การสร้าง full gene</p> Signup and view all the answers

    การเปรียบเทียบลำดับเบสหรือลำดับกรดอะมิโนของ sequences มากกว่า 2 ตัวเรียกว่าอะไร?

    <p>Multiple alignment</p> Signup and view all the answers

    โปรแกรมใดที่ใช้ในการทำ Pairwise alignment?

    <p>DIALIGN</p> Signup and view all the answers

    Clustal W ใช้สำหรับทำอะไร?

    <p>ทำ Multiple alignment</p> Signup and view all the answers

    โปรแกรมใดที่เหมาะสมสำหรับการสร้าง Alignment และสร้าง Logo?

    <p>WebLogo</p> Signup and view all the answers

    ลำดับกรดอะมิโนหรือเบสที่มีความยาวมาก ตัวไหนเหมาะสมสำหรับการใช้ในการทำ Alignment?

    <p>ข้อมูลเบสพันธุกรรม</p> Signup and view all the answers

    การจัดกลุ่มลำดับที่มีความคล้ายคลึงกันจะใช้เทคนิคใด?

    <p>Cluster analysis</p> Signup and view all the answers

    ซอฟต์แวร์ใดที่นิยมใช้ในการจัดการข้อมูล Alignment?

    <p>BioEdit</p> Signup and view all the answers

    สิ่งใดที่ไม่ใช่กรดอะมิโนในลำดับที่แสดง?

    <p>Thymine</p> Signup and view all the answers

    แหล่งข้อมูลไหนที่สามารถใช้ค้นหาระดับยีนหรือโปรตีนได้?

    <p>GenBank flash file</p> Signup and view all the answers

    การวิเคราะห์ข้อมูลเบื้องต้นในชีววิทยาจะใช้โปรแกรมไหนได้บ้าง?

    <p>Bioedit</p> Signup and view all the answers

    ไฟล์ประเภทใดที่มีการจัดเก็บข้อมูลยีน?

    <p>fasta file</p> Signup and view all the answers

    การใช้งาน bioinformatics มีจุดประสงค์หลักใด?

    <p>วิเคราะห์ข้อมูลทางชีววิทยา</p> Signup and view all the answers

    คำศัพท์ใดที่ไม่ถือเป็นศัพท์เฉพาะใน bioinformatics?

    <p>Software</p> Signup and view all the answers

    ข้อมูลลำดับนิวคลีโอไตด์อย่างง่ายสามารถวิเคราะห์ได้อย่างไร?

    <p>โดยใช้โปรแกรมเฉพาะ</p> Signup and view all the answers

    การใช้เทคโนโลยีสารสนเทศในชีววิทยามีวัตถุประสงค์อะไร?

    <p>ช่วยในการจัดการข้อมูล</p> Signup and view all the answers

    คำสั่งใดที่ไม่สามารถใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูลทางชีววิทยาได้?

    <p>ใช้โปรแกรม Word</p> Signup and view all the answers

    เพื่อการวิเคราะห์ข้อมูลอย่างถูกต้อง โปรแกรมใดที่ควรจะใช้?

    <p>Bioedit</p> Signup and view all the answers

    FASTA format มีส่วนประกอบหลักกี่ส่วน?

    <p>สามส่วน</p> Signup and view all the answers

    ในส่วนแรกของข้อมูล FASTA format ระบุข้อมูลอะไร?

    <p>ชื่อหรือแหล่งที่มาของข้อมูล</p> Signup and view all the answers

    จุดสิ้นสุดของข้อมูลใน FASTA format ถูกระบุโดยอักษรใด?

    <ul> <li></li> </ul> Signup and view all the answers

    PROTEIN DATA BASE (PDB) มีข้อมูลอะไรบ้าง?

    <p>ข้อมูลลำดับโปรตีนและโครงสร้าง 3D</p> Signup and view all the answers

    สาร TA20 มีหน้าที่ในการทำอะไรในเซลล์ประสาท?

    <p>ทำให้เกิดการยืดของใยประสาท</p> Signup and view all the answers

    การเตรียมไฟล์ FASTA ต้องมีการจัดรูปแบบข้อมูลอย่างไร?

    <p>ใช้เซคชั่นแยกต่างหากสำหรับแต่ละข้อมูล</p> Signup and view all the answers

    ลักษณะของเซลล์ที่ใช้ในการศึกษา TA20 เป็นอย่างไร?

    <p>เซลล์ที่ผสมระหว่างหนูกับกล้ามเนื้อ</p> Signup and view all the answers

    หลังจากลำดับกรดอะมิโนหรือเบสนิวคลีโอไทด์ใน FASTA format จะมีข้อมูลอะไรเพิ่มเติม?

    <p>ไม่มีข้อมูลเพิ่มเติม</p> Signup and view all the answers

    ข้อความที่บ่งบอกถึงแหล่งที่มาของข้อมูล FASTA format จะอยู่ในรูปแบบใด?

    <p>การรวมกันของตัวอักษรและตัวเลข</p> Signup and view all the answers

    การศึกษา TA20 ถูกส่งเพื่อเผยแพร่เมื่อใด?

    <p>18-พฤศจิกายน-1993</p> Signup and view all the answers

    ลักษณะของความสัมพันธ์ระหว่าง TA20 และการเติบโตของเซลล์เป็นอย่างไร?

    <p>ทำให้เซลล์หยุดการเติบโต</p> Signup and view all the answers

    ส่วนใดของ FASTA format ไม่เกี่ยวข้องกับข้อมูลลำดับ?

    <p>ข้อมูลภาษา</p> Signup and view all the answers

    ไฟล์ในรูปแบบ FASTA สามารถใช้สำหรับการวิเคราะห์อะไรได้บ้าง?

    <p>การวิเคราะห์ลำดับโปรตีน</p> Signup and view all the answers

    แหล่งที่มาของลำดับ DNA ที่ใช้ในการศึกษา TA20 มีความเกี่ยวข้องกับสัตว์ประเภทใด?

    <p>สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม</p> Signup and view all the answers

    ลำดับของยีนที่ถูกศึกษา TA20 คือช่วงที่ไหนในลำดับของรหัส?

    <p>748..1311</p> Signup and view all the answers

    ข้อมูลใน FASTA format เป็นข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับชนิดใด?

    <p>ข้อมูลชีวเคมี</p> Signup and view all the answers

    TA20 มีสัญญาณประเภทใดที่เกี่ยวข้องกับการควบคุมการแสดงออกของยีน?

    <p>TATA signal</p> Signup and view all the answers

    การค้นหาลำดับ TA20 สามารถใช้ในการศึกษาใด?

    <p>การสร้างเส้นใยประสาท</p> Signup and view all the answers

    อะไรคือประโยชน์หลักในการตรวจสอบลำดับรหัสโปรตีนของ TA20?

    <p>เข้าใจกลไกการเกิดโรค</p> Signup and view all the answers

    ความสำคัญของการจัดทำ cDNA คือต้องการมีข้อมูลเกี่ยวกับอะไร?

    <p>การแสดงออกของยีน</p> Signup and view all the answers

    TA20 มีผลต่อการยืดของใยประสาทอย่างไร?

    <p>เพิ่มความยืดหยุ่น</p> Signup and view all the answers

    ข้อมูลสรุปของ TA20 ระบุว่า TA20 มีสัญญาณบอกตำแหน่งไหน?

    <p>TATA_signal</p> Signup and view all the answers

    การตอบสนองของ TA20 ต่อเซลล์เป็นไปในทิศทางใด?

    <p>ยับยั้งการเจริญเติบโต</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    บทนำเกี่ยวกับชีวสารสนเทศศาสตร์

    • ชีวสารสนเทศศาสตร์ คือ การนำเทคโนโลยีสารสนเทศมาใช้ในการศึกษาทางชีววิทยา
    • นักวิทยาศาสตร์ใช้ข้อมูลเพื่อทำความเข้าใจความแตกต่างของโรคและการรักษา
    • การพัฒนาการรักษาโรคที่ดีขึ้น และการทดสอบทางการแพทย์ใหม่ๆ

    ผลการเรียนรู้ที่คาดหวัง

    • สามารถระบุแหล่งข้อมูลเพื่อค้นหาลำดับยีนหรือโปรตีนได้
    • สามารถอธิบายคำศัพท์เฉพาะและสัญลักษณ์สำคัญที่ระบุในไฟล์ข้อมูล เช่น ไฟล์ fasta และไฟล์ GenBank flash file
    • สามารถเลือกโปรแกรมหรือเว็บไซต์เพื่อวิเคราะห์ข้อมูลเบื้องต้น เช่น pubmed, Bioedit, และ web cutter
    • สามารถวิเคราะห์ข้อมูลอย่างง่าย อ่านผล และแปลผลการวิเคราะห์โดยใช้โปรแกรมต่างๆ ได้

    ชีวสารสนเทศศาสตร์ (Bioinformatics)

    • เป็นการนำเทคโนโลยีสารสนเทศ (IT) มาใช้ในการศึกษาทางชีววิทยา
    • ใช้เพื่อศึกษาข้อมูลทางชีวภาพ เช่น ลำดับโปรตีน ลักษณะโครงสร้างของโปรตีน การจำแนกเชื้อ การวิเคราะห์ข้อมูลทางชีวเคมี และอื่นๆ
    • อาศัยการวิเคราะห์ข้อมูล และการจำลองแบบข้อมูลเพื่อทำความเข้าใจกระบวนการทางชีววิทยา
    • ช่วยให้เข้าใจโรคและการรักษาโรคได้ดียิ่งขึ้น รวมถึงการคิดค้นยาและการทดสอบทางการแพทย์ใหม่ๆ

    ข้อมูลพื้นที่ชีวสารสนเทศศาสตร์ (Bioinformatics Information Space)

    • จำนวนจีโนมมนุษย์ที่ได้รับการจัดลำดับเพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็ว
    • มีการคาดการณ์ว่าจำนวนจีโนมมนุษย์ที่ได้รับการจัดลำดับจะเพิ่มขึ้นอย่างมากในอนาคต
    • อัตราการเติบโตต่อปี (CAGR) ของจำนวนจีโนมมนุษย์ที่ได้รับการจัดลำดับอยู่ที่ 200%

    รายการรูปแบบไฟล์ข้อมูลลำดับเบสนิวคลีโอไทด์และลำดับกรดอะมิโน

    • GenBank sequence entry format
    • Fasta format
    • EMBL data library format
    • IG format
    • GCG format
    • Plain/ASCII.Staden sequence format
    • SwissProt sequence format
    • NBRF format or PIR format
    • ASN.1 format
    • GDE format

    รูปแบบไฟล์ GenBank

    • ไฟล์ GenBank flash file เป็นไฟล์ข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ที่เก็บข้อมูลเกี่ยวกับยีน ชื่อยีน ขนาดยีน ลักษณะของยีน และหมายเลขยีนต่างๆ

    ค้นหาข้อมูล

    • ใช้เครื่องมือค้นหาทางชีวภาพต่างๆ
    - เช่น Google
- ใช้เว็บไซต์อย่าง NCBI เพื่อค้นหาข้อมูล
- การค้นหาข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์หรือโปรตีน เป็นสิ่งสำคัญ
- การเตรียมไฟล์เพื่อนำไปวิเคราะห์ เป็นส่วนสำคัญในการทำงาน

    การวิเคราะห์ข้อมูลลำดับเบส

    • การจัดลำดับลำดับเบส (Sequence Alignment): กระบวนการเปรียบเทียบลำดับเบสหรือลำดับกรดอะมิโนเพื่อหาความคล้ายคลึงกัน
    • โปรแกรมที่ใช้ในการจัดลำดับเบส (Sequence Alignment) ได้แก่ DIALIGN และ Clustal W
    • โปรแกรม BioEdit สำหรับจัดลำดับเบสและเปรียบเทียบความคล้ายคลึงกัน
    • โปรแกรม Vector NTI สำหรับวิเคราะห์ ORF, การวิเคราะห์เอนไซม์ตัดจำเพาะ
    • การหา Open Reading Frame (ORF): การระบุตำแหน่งของยีนในลำดับเบสที่มี start codon และ stop codon
    • โปรแกรม ORF finder เพื่อหา ORF
    • การวิเคราะห์เอนไซม์ตัดจำเพาะ (Restriction enzymes): เพื่อหาตำแหน่งการตัดของเอนไซม์เหล่านั้น
    • โปรแกรม Restriction mapper และ NEBcutter
    • การประกอบลำดับ (Sequence Assembly): นำลำดับท่อนสั้น ๆ จากการจัดลำดับมาประกอบกันเป็นลำดับเต็ม
    • โปรแกรม (software) ต่างๆ เช่น Bioedit, Vector NTI

    ฐานข้อมูลโปรตีน (PDB)

    • ฐานข้อมูลโปรตีน (PDB) ให้ข้อมูลลำดับโปรตีน ลักษณะโครงสร้าง 3 มิติ และหน้าที่ของโปรตีน

    Studying That Suits You

    Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.

    Quiz Team

    Related Documents

    Introduction to Bioinformatics PDF

    Description

    ชีวสารสนเทศศาสตร์คือการนำเทคโนโลยีสารสนเทศมาใช้ในการศึกษาทางชีววิทยา เพื่อทำความเข้าใจโรคและการรักษาได้ดีขึ้น Quiz นี้จะช่วยให้คุณสามารถระบุแหล่งข้อมูลและอธิบายคำศัพท์สำคัญในชีวสารสนเทศศาสตร์ได้.

    More Like This

    Use Quizgecko on...
    Browser
    Open
    Browser
    Browser