Mycoses des plantes PDF

Les maladies fongiques des plantes: les mycoses des plantes  Généralités Les maladies causées par les champignons sont appelées mycoses ou maladies cryptogamiques Dépourvus de chlorophylle, donc ne sont pas photosynthétiques Ne possèdent ni racine, ni feu...

Les maladies fongiques des plantes: les mycoses des plantes  Généralités Les maladies causées par les champignons sont appelées mycoses ou maladies cryptogamiques Dépourvus de chlorophylle, donc ne sont pas photosynthétiques Ne possèdent ni racine, ni feuille, ni fleure Constitués de MYCELIUM Sont plus complexes que les bactéries, parfois visibles à l’œil nu, mais plus souvent au microscope Plus fréquents et les plus dommageables Causent plus de 50 % des maladies Mode de vie Représentation d’un champignon parasite  Symptômes ou types de maladies Nanisme, Fonte de semis Jaunissement et flétrissement Taches diverses (feuilles et fruits), pustules, lésions Nécrotiques /chancreuses sur divers organes Pourritures variées sur feuilles, tiges, collet et fruits etc.  Grands groupes de champignon phytopathogènes Les champignons ne sont plus placés parmi les végétaux Ils constituent un règne autonome : Le règne fongique Grands groupes de champignon phytopathogènes ❑ Organismes fongiformes Oomycètes: fontes de semis, pourritures racinaires et au collet, mildious, rouilles blanches. En raison de leurs ressemblances, les Oomycètes ont été pendant longtemps classés chez les Champignons Analyses génétiques Les champignons partagent un ancêtre commun avec les animaux Les oomycètes sont plus proches des algues brunes Phytophtora, Pythium, Aphanomyces (pathogènes) Champignons mycorhiziens et pathogènes glymeromycete Champignons mycorhiziens  Oomycètes et Champignons se ressemblent Structure filamenteuse, formation de spores et colonisation de l’hôte par un appressorium Champignon Oomycète spore * Appressorium : Zone de contact avec l’hôte  Mais des différences existent : par exemple Oomycètes sont insensibles à la plupart des fongicides Oomycètes ne synthétisent pas d’ergostérol (composant principal de la membrane des champignons) mais à la place des lipides et de longues chaînes d’acides gras Les fongicides Azolés qui inhibent la synthèse de l’ergostérol sont inefficaces Oomycètes contiennent très peu de chitine (N-acetylglucosamine) (composant principal de la paroi des champignons) mais à la place des 1,3 et 1,4 glucanes Les fongicides (Polyoxin D ou Nokkomycin) qui inhibent la synthèse de la chitine sont inefficaces ❑ Champignons supérieurs Ascomycètes : - Taches foliaires (oïdiums, alternarioses, anthracnoses, septorioses, etc.), - Pourritures sur divers organes (aériens : Botrytis spp., Sclerotinia spp., Penicillium spp., Aspergillus spp., etc. ; racinaires : Pyrenochaeta spp., Thielaviopsis basicola, etc.), - Brunissements vasculaires et ou pourritures racinaires et du collet (Fusarium spp., Verticillium spp.) Basidiomycètes : Rouilles, charbons, pourritures racinaires, du collet et des fruits à Rhizoctonia solani et Sclero&um rolfsii, etc.  Parasitisme Deux formes: ❑ Forme végétative : Mycélium formé de filaments (hyphes) libres ou entrelacés cloisonnés ou non. Couvre les colonies de surface et sporule (reproduction asexuée) ❑ Formes de conservation : chlamydospores, sclérotes, oospores. ❑ Fixation aux plantes : appressorium qui sert aussi à pénétrer celle-ci.  Reproduction des champignons - Asexuée (forme imparfaite, mitotique, téléomorphe) - Sexuée (forme parfaite, méiotique, anamorphe)  Reproduction asexuée Production variée de spores asexuées (dissémination) - Conidie: spore formée par le bourgeonnement terminal d’hyphes spécialisées (Conidiophores) - Oïdies: spores résultant de la fragmentation du mycélium - Chlamydospores: spores à parois épaisses différenciées de cellules terminales ou intermédiaires de l’hyphe. - Zoospores: spores flagellées ❑ Pénétration dans les plantes : A travers la cuticule et la paroi des cellules végétales; Par des ouvertures naturelles (stomates); Par les blessures ou les tissus sénescents (les vieilles feuilles, les fleurs fanées, les plaies de taille, les cassures de poils épidermiques, les sites d’émission de racines adventives, des dégâts de nématodes...). ❑ Parasitisme : Spécificité vis-à-vis des tissus (jeunes ou sénescents) et des organes attaqués : champignons telluriques (racines, collet), vasculaires (vaisseaux), aériens (feuilles, tiges, fruits, fleurs).  Franchissement des barrières naturelles Champignons biotrophes 1 2 (1) Fixation des spores sur 3 la cuticule des cellules épidermiques grâce à un mucilage (glycoprotéines et polysaccharides). 4 (2) Germination des spores et production d’hyphes à la surface des cellules végétales. (3) Formation d’un appressorium (point végétatif d’appui pour la pénétration dans l’espace interne). Production de cutinases et dégradation de la cuticule, Développement des hyphes dans la paroi cellulaire végétale (production de pectinases, et cellulases) ou (4) Développement des hyphes dans l’espace interne en développant une zone de contact amplifiée avec la cellule hôte : haustorium. ❑Sporulation: Si les conditions climatiques sont favorables, formation des structures spécialisées: sporocystophores, conidiophores, pycnides, acervules, oospores, zygospores, cléistothèces, périthèces, apothécies. ❑Dissémination : Vent, air, poussières de sol, l’eau, à la suite de lessivages, Hommes et outils, et différents autres vecteurs : insectes, semences.  Conditions de développement ❑ Température : Pas le facteur le plus important, des températures minimales sont tout de même nécessaires pour qu’ils puissent se développer. Réduisent ou cessent leur développement durant l’hiver. Celui- ci est a lieu dans une plage de températures assez large, comprise entre quelques degrés et plus de 30°C. ❑ Humidité : Facteur important (pluie, irrigation, brouillard...). Indispensable à presque tous les stades de développement des champignons Sols gorgés d’eau sont très propices aux attaques des champignons telluriques.  Vent : contribue à la libération et à la dissémination des spores. Mais il peut parfois avoir un effet négatif sur le développement d’une mycose en réduisant l’hygrométrie ambiante. Lumière : influence réduite conduisant à l’étiolement des plantes, ce qui les rend plus sensibles. pH du sol et nutrition des plantes : conditionnent aussi plus ou moins le développement de certains champignons. Leurs effets ne sont pas toujours faciles à mettre en évidence.  Deux modes de reproduction des champignons La plupart des champignons possèdent deux modalités de reproduction : Reproduction sexuée, Reproduction asexuée (végétative), Cycle biologique type d'un champignon  Reproduction sexuée Tous les types de cycles biologiques existent chez les champignons : - Cycle monogénétique haplophasique (certains phycomycètes et zygomycètes, ex. Mucor mucedo) - Cycle digénétique (tous les groupes sauf les ascomycètes, ex. Coprinus comatus) - Cycle trigénétique à deux sporophytes (chez les ascomycètes et certains basidiomycètes)  Exemples de maladies fongiques Mildiou Nom générique d'une série de maladies cryptogamiques affectant de nombreuses espèces de plantes Maladies provoquées par des oomycètes, appartenant à différents genres ( Peronospora, Plasmopara, Bremia, Phytophtora...). Elle provoque l'apparition de taches vertes pâles à brunes qui s'étendent peu à peu. Les tissus finissent par se dessécher. Ces lésions de couleur brune affectent ensuite les pétioles des feuilles puis les tiges. Les plantes atteintes très tôt par le mildiou peuvent produire des fruits déformés avec des marbrures marron. Le mildiou est l'une des maladies les plus courantes du potager Phytophtora infestans Plasmopara Viticola Plasmopara helianthi Fueilles et Tubercule de pomme de terre Phytophtora infectans  Oïdium Champignon assez fréquent chez un grand nombre de plantes, légumes, arbres, arbustes et rosiers. Se caractérise par l’apparition de moisissure ou d’un léger duvet blanc (foutrage blanc) sur feuilles, tiges, et parfois fruits. Prolifère par temps chaud associé à une forte humidité ambiante. Sphaerotheca fuliginea Erysiphe cichoracearum  Rouille De nombreux végétaux peuvent être atteints par la rouille : arbres, arbustes, fleurs, légumes, fruitiers... Facile à repérer et à reconnaître: La face supérieure des feuilles présente des auréoles rougeâtres ou jaunâtres, Les feuilles assurent moins bien leur fonction synthétique, la chlorophylle détruite par endroit Rouille du poireau (Puccinia porri) Les champignons se développent mieux lorsque le temps est pluvieux, ou l'ambiance humide (serre). Arrosages répétés du feuillage en été Mauvaise circulation de l'air (lieu confiné, végétaux trop serrés les uns contre les autres, feuillage très dense...)  Rouille Puccinia recondita Phragmidium disciflorum  Fusariose : une maladie, plusieurs champignons Une petite vingtaine d’espèces responsables de la fusariose Plus souvent rencontrées sont Fusarium graminearum, F. culmorum, F. avanaceum, F. tricinctum, Microdochium nivale et majus. Visuellement il est très difficile de les distinguer au champ. Sur blé, les pertes de rendement peuvent atteindre 15 à 30 qx/ha. Affecte également la qualité sanitaire de la récolte, les Fusarium spp produisant des mycotoxines en quantité diverses. Pluie et températures fraîches, favorisent le développement de la fusariose Aux stades épiaison/floraison. la fusariose impacte prioritairement la qualité des grains, contrairement à la septoriose ou la rouille Fusariose des épis de l'orge Fusarium roseum Les contaminations de l'épi au moment de la floraison. Les symptômes : taches sur glume (taches décolorées cernées de brun), grains et/ou épillets échaudés (coloration rose), Echaudage total de l'épi dans le cas d'une attaque au col de l'épi.  Fusarioses de l'épi Fusarium spp, Microdochium spp Symptômes: Epillets échaudés roses-orangés par groupe pouvant aller jusqu’à échaudage complet de l’épi Différenciation difficile à l’œil nu, il faut réaliser une analyse microbiologique ou moléculaire.  Fusariose de l'épi - Maïs grain et fourrager Symptômes Feuille: sont accolées aux grains. Parfois aspect délavé, translucide et couverts de périthèces noirs. Épi : mycélium rose à rougeâtre débutant généralement à l’apex et progressant dans l’épi. Parfois au milieu ou à la base de l’épi.  Alternariose Alternaria solani, champignon ascomycète Famille des solanacées: tomate, pomme de terre, aubergine, pigment Symtômes : essentiellement sur feuilles, taches noires arrondies avec des cercles concentriques Feuille de tomate Tomate Feuille pomme de terre Alternaria solani Alternaria linariae  Verticilliose Verticillium dahliae Ascomycète, téllurique Affecte le système vasculaire (assure la circulation de la sève) des plantes Verticilliose ou Flétrissement verticillien Affecte plus de 300 espèces de plantes (herbacées, annuelles ou vivaces, ou ligneuses)  L’ergot des céréales Causé par un champignon ascomycète qui affecte les graminées cultivées ou adventices, sans spécificité d’hôte Toute céréale à paille peut être contaminée, mais il existe des différences de sensibilité entre espèces : Seigle > Triticale > Blé dur, Blé tendre, Orge, Avoine. (Claviceps purpurea) Ces sclérotes* contiennent des alcaloïdes toxiques (parmi lesquels l’acide lysergique*) dont l’absorption provoque des affections convulsives (le « feu sacré » ) ou gangreneuses (déformations et nécroses des membres) provoquant conduire à la mort des personnes ou des animaux intoxiqués  Charbon des inflorescences, ou charbon nu Blé L’infection par Ustilago nuda f.sp. Tritici Nu= Contamination par l’embryon Sont transmises par le biais des semences ou par le sol. Reste invisible tant que l’épi n’a pas émergé. Le premier signe d'infection est l’apparition d'un épi noirci. Au lieu d'un tissu normal, l’épi contient une masse de spores de couleur brun-olive. Les grains sont infectés durant la floraison et représentent la source primaire d’inoculum dans la prochaine culture. Le champignon survit à l'intérieur de la graine et, quand la graine germe, le mycélium du champignon se développe dans la plante, remontant jusqu’au primordium de l’inflorescence Charbon des inflorescences, ou charbon nu Blé Ustilago nuda f.sp. tritici (basidiomycète)  Charbon couvert de l’orge Contamination par les téguments (charbon couvert) Ustilago hordei Carie du blé  Charbon du maïs Les organes végétatifs du maïs (les tiges, les feuilles, les fleurs et les épis) atteints par Ustilago maydis, sont couverts de bosses boursouflées À l'intérieur de ces bosses se trouvent des masses de spores visqueuses, qui se transforment, par la suite, en poudre.  Pourriture grise Maladie cryptogamique due au champignon Botrytis cinerea (Botryotinia fuckeliana) Saprophyte qui peut se développer très rapidement et profiter de la moindre blessure pour s’installer. Feuilles: Les attaques apparaissent sous forme de taches brunes avec un feutrage grisâtre. Ces taches forment d’abord un triangle partant du bord du limbe puis ont tendance à s’accroître et à envahir tout le limbe.  Pourriture grise Grappes: Peuvent être touchées avant la floraison et se dessécher. Symptômes caractéristiques sont : Une coloration brune des baies sur cépages blancs Apparition d’un épais feutrage gris sur les baies Pourriture grise peut envahir la totalité des grappes. Pourriture grise de la vigne (Botrytis cinerea)  Piétin échaudage du blé Gaeumannomyces graminis tritici Champignon du sol qui contamine les racines Conduit à un échaudage des plantes atteintes. Spécifique des graminées Racines : nécroses noires de plusieurs cm. - Plantes : faible croissance, mauvais tallage. - Feuilles : jaunissement par la pointe. A l’épiaison : - Plantes : échaudage complet de toute la plante avec ses talles, couleur dominante blanc (paille sèche). - Racines : nécroses noires parfois étendues à toute la racine.  Pourriture blanche Sclérotiniose due aux champignons du genre Sclerotinia Premiers symptômes comprennent un jaunissement, un flétrissement et une chute des feuilles plus âgées. Au fur et à mesure que le champignon envahit le système racinaire et le plateau, il cause une pourriture Croissance mycélienne blanche épaisse Formation de sclérotes sur tissus malades Pourriture à Sclérotinia/Oignon Pourriture à Sclérotinia/Carotte  Exemple de maladies fongiques Rouille de la menthe (Puccinia menthae) Rouille brune du blé (Puccinia triticina) Rouille jaune du blé (Puccinia striiformis) Rouille noire (des tiges) du blé: Puccinia graminis f. sp. tritici Rouille du rosier (Phragmidium rosae) PENICILLIUM