Secuenciación del ADN PDF

Secuenciación del ADN Aidamalia Vargas L PhD. Agregue un pie de página TREY research 1  Función Decodificación de secuencias genómicas...

Secuenciación del ADN Aidamalia Vargas L PhD. Agregue un pie de página TREY research 1  Función Decodificación de secuencias genómicas o transcriptómicas Aidmalia Vargas L PhD. TREY research 2 Inventores Walter Gilbert y Frederick Sanger Agregue un pie de página TREY research 3 Secuenciación Tecnología de Secuenciación de Maxam- Gilbert & Sanger del ADN Publicado en 1977 Tecnología de Secuenciación de Sanger “Método de terminación de cadena” “Método dideoxinucleotido” “Método de secuenciación por síntesis” Automatizada en 1995 Applied Biosystem ABI 370 TREY research 4 Secuenciación: Método de Sanger H ADN TREY research 5 Secuenciación: Método de Sanger TREY research 6 Secuenciación: Método de Sanger TREY research 7 Secuenciación: Método de Sanger H H TREY research 8 Secuenciación: Método de Sanger ddG ddA ddT ddC TREY research 9 Secuenciación: Método de Sanger TREY research 10 Secuenciación: Método de Sanger TREY research 11 Secuenciación: Método de Sanger AT C A X TREY research 12 Secuenciación: Método de Sanger TREY research 13 Secuenciación: Método de Sanger TREY research 14 Secuenciación: Método de Sanger A AGC 200 a 400bp TREY research 15 Secuenciación: Método de Sanger TREY research 16 Secuenciación: Método de Sanger automatizado 2 millones bp por día TREY research 17  Secuenciación: Método de Sanger automatizado electroforesis capilar en gel Fragmentos de ADN terminadores con tintes fluorescente Los fluorocromos crean picos en el ordenador al ser detectados por el láser cromatograma A A C G T Secuencia recuperada TREY research 18  SecuenciacióndeÚltima Generación NGS Agregue un pie de página TREY research 19 NGS Generalidades Las moléculas de ADN que se Se han aislado millones de Las nuevas tecnologías, equipos y desean secuenciar se preparan en fragmentos individuales de ADN y software permiten detectar los reacciones “libres”, sin la secuenciado en paralelo durante productos de reacción resultantes necesidad de ser clonadas en cada ejecución o corrida. de la secuenciación a partir de huéspedes microbianos. volúmenes de reacción extremadamente pequeños. Agregue un pie de página TREY research 20 NGS Ventajas Generación de millones de “reads” Mayor velocidad durante el No se necesita realizar detección cortos en paralelo proceso y bajo costo con la técnica de electroforesis Agregue un pie de página TREY research 21 Costo de la secuenciación a través del tiempo Agregue un pie de página TREY research 22 NGS Métodos utilizados Millones a billones en simultaneo Pirosecuenciación y/o Secuenciación por síntesis Secuenciación por Ión Torrent La secuenciación SOLiD (del inglés Sequencing by Oligonucleotide Ligation and Detection) o Codificación con dos bases Secuenciación de moléculas individuales en tiempo real (SMRT) Agregue un pie de página TREY research 23 NGS Segunda generación: Secuenciación Illumina Etapas Agregue un pie de página TREY research 24 TREY research 25 TREY research  Secuenciación de cuarta generación Una célula de flujo MinION contiene 512 canales con 4 nanoporos en cada canal, para un total de 2.048 nanoporos utilizados para secuenciar ADN o ARN. Los pozos se insertan en una membrana de polímero resistente eléctricamente apoyada por un conjunto de micro andamios conectados a un chip sensor. Katara et al., 2024 Agregue un pie de página TREY research  Secuenciación de cuarta generación Es capaz de secuenciar una sola molécula sin amplificación (ADN o ARN), permitiendo la síntesis en tiempo real y la secuenciación sin repeticiones del ciclo. La tecnología de Oxford Nanopore (ONT) Precio de 900 dólares, puede decodificar casi mil millones de bases de ADN en un cuarto de día. Katara et al., 2024 Agregue un pie de página TREY research NGS Importancia a nivel social La capacidad de secuenciar genomas de forma rutinaria abre nuevas posibilidades en la investigación biológica y en aplicaciones biomédicas. Por ejemplo, la secuenciación de bajo costo es un paso hacia la medicina personalizada: un tratamiento médico a la medida de las necesidades de un individuo con base en las variantes génicas de su genoma. Agregue un pie de página TREY research 29  Aidamalia VARGAS LOWMAN [email protected] Universidad de Panamá Agregue un pie de página TREY research 30