Practical Bacterial Diagnosis PDF

Practical Bacterial Diagnosis First Laboratory  ‫ يكون لدى‬،‫في كثير من الحاالت‬ In many cases, the physician ‫الطبيب فكرة صحيحة...

Practical Bacterial Diagnosis First Laboratory  ‫ يكون لدى‬،‫في كثير من الحاالت‬ In many cases, the physician ‫الطبيب فكرة صحيحة عن‬ has a correct idea about the ‫التشخيص بعد أخذ التاريخ‬ diagnosis after taking a patient ‫املرضي للمريض وإجراء الفحص‬.‫البدني‬ history and performing a physical examination. ‫يتعرض الطبيب لضغوط‬ The physician is greatly In other cases, the diagnosis is ‫كبيرة لبدء العالج الفوري‬ pressured to begin immediate not clear, assistance comes ‫للمرضى الذين تظهر‬ treatment of symptomatic from laboratory or radiologic.‫عليهم األعراض‬ patients. studies. ‫ يكون‬،‫وفي حاالت أخرى‬ ‫ وتأتي‬،‫التشخيص غير واضح‬ ‫املساعدة من خالل الدراسات‬.‫املخبرية أو الشعاعية‬ With infectious diseases, the physician may has an idea of ‫ قد‬،‫في حالة األمراض املعدية‬ ‫يكون لدى الطبيب فكرة عن‬ the likely cause of symptom or ‫السبب املحتمل لألعراض أو قد‬ may not..‫ال يكون لديه فكرة‬ The diagnostic microbiology laboratory has the Specimens are collected and opportunity to respond to sent to the laboratory to the physician during the confirm the physician’s treatment decision making suspicions about the process or early in empirical patient’s illness or reject it. therapy. ‫يتم جمع العينات وإرسالها إلى املختبر‬ ‫يتمتع مختبر علم األحياء الدقيقة التشخيصي‬ ‫للتأكد من شكوك الطبيب حول مرض‬ ‫بفرصة الرد على الطبيب أثناء عملية اتخاذ قرار‬.‫املريض أو رفضها‬.‫العالج أو في وقت مبكر من العالج التجريبي‬ ‫استجابة املختبر يتم تغييرها في الوقت‬ ‫املناسب مع إبقاء النتائج على نوع العالج‬ ‫تصبح املشاهدة املباشرة ملسببات‬.‫أو تغييره‬ ‫مباشرا لتأكيد أو‬ ً ‫األمراض دليالً أوليًا أو‬.‫رفض التشخيص األولي للطبيب‬ The respond of the Direct viewing of pathogens laboratory is a timely becomes primary or direct changed with results would evidence to confirm or reject keep the type of treatment the physician’s initial or change it. diagnosis.  ‫يتم تحضير املسحات من املسحات عن طريق‬ ‫دحرجة املسحة ذهابًا وإيابًا على مناطق‬ Smears from Swabs ‫مسحات من املسحات‬ ‫متجاورة من الشريحة الزجاجية لترسيب طبقة‬ ‫رقيقة من العينة‬ two swabs must collected (one for microscopy and other for culture) ‫يجب جمع مسحتني )واحدة للفحص املجهري وغيرها من أجل الثقافة‬ Smears from swabs are prepared by rolling the swab back and forth over contiguous areas of the glass slide to deposit a thin layer of sample material. Smears from Thick Liquids or Semisolids ‫مسحات من السوائل السميكة أو املواد شبه الصلبة‬ Swabs also can be used as the tool for preparation of the smear from samples such as feces..‫أيضا استخدام املسحات كأداة لتحضير اللطاخة من عينات مثل البراز‬ ً ‫يمكن‬ The swab is immersed in the specimen for several seconds and used to prepare a thin spread of material on the glass slide for staining and viewing. Wooden stick may also used. ‫ يتم غمر املسحة في العينة لعدة ثوان‬ ً ‫يمكن استخدام عصا خشبية‬.‫أيضا‬ ‫واستخدامها لتحضير طبقة رقيقة من املادة على‬.‫الشريحة الزجاجية للتلوين والعرض‬.(‫ينتشر على شكل طبقة أحادية رقيقة من املادة )يجب أن يحتوي على مناطق سميكة ورقيقة‬ Smears from Thick, Granular, or Mucoid Materials ‫مسحات من مواد سميكة أو حبيبية أو مخاطية‬ Spread as thin monolayer of material (must have both thick and thin areas). Granules must be crushed (if Granules are too hard, it would nor represent infectious.(‫ فلن تكون معدية‬،‫يجب سحق الحبيبات )إذا كانت الحبيبات صلبة ج ًدا‬ Materials). 1. Place a portion of the sample on slide, and press a second slide onto the sample to flatten or crush the components..‫ ثم اضغط على شريحة ثانية على العينة لتسوية املكونات أو سحقها‬،‫ ضع جز ًءا من العينة على الشريحة‬.1 2. Rotate the two glass surfaces against each other so that the shear forces break up the material then separate the slides. ‫ قم بتدوير السطحني الزجاجيني مقابل بعضهما البعض بحيث تعمل قوى القص‬.2.‫على تفتيت املادة ومن ثم فصل الشرائح‬ Smears from Thin Fluids ‫مسحات من السوائل الرقيقة‬ “Thin” specimens of fluids such as urine, cerebrospinal fluid (CSF) and BAL should be dropped but not spread on the slide. ‫يجب إسقاط عينات رقيقة من السوائل مثل البول‬ ‫ ولكن ال يتم نشرها‬BAL‫( و‬CSF) ‫والسائل النخاعي‬ cytocentrifugation is preferred for this type of specimen..‫على الشريحة‬.‫يفضل استخدام الطرد املركزي الخلوي لهذا النوع من العينات‬  Smears from Thin Fluids, whole sample Smears from Thick, Granular, or Mucoid Materials Smears from Thin Fluids, cytocentrifuge  Microscopic identification of Bacteria ‫التحديد املجهري للبكتيريا‬ Cocci are spherical in shape..‫العصيات على شكل قضيب‬ Bacilli are rod-shaped..‫البكتيريا الحلزونية صلبة أو مرنة‬ Spiral bacteria are rigid or flexible. The Gram stain is a diagnostic staining procedure that can be done on body fluids, tissue biopsies, throat cultures, samples from abscesses when infection is suspected. ‫ وخزعات‬،‫صبغة جرام هي إجراء صبغ تشخيصي يمكن إجراؤه على سوائل الجسم‬.‫ وعينات من الخراجات عند االشتباه في اإلصابة‬،‫ ومزارع الحلق‬،‫األنسجة‬ Clinically important results are obtained much more rapidly from staining than from culturing the specimen. ‫يتم الحصول على نتائج مهمة سرير ًيا بسرعة أكبر من خالل الصبغ‬.‫مقارنة بزراعة العينة‬ ‫ستساعد نتائج صبغة‬ The results of the Gram stain will aid a clinical lab in ‫جرام املختبر السريري‬ ‫في تحديد االختبارات‬ determining which additional tests may be required ‫اإلضافية التي قد تكون‬ for identification of the bacterial strain. ‫مطلوبة لتحديد الساللة‬.‫البكتيرية‬  Acid-Fast Staining ‫تلطيخ حمض سريع‬ a few genera, particularly the members of the genus Mycobacterium, are visualized much ،‫ وخاصة أعضاء جنس املتفطرة‬،‫يتم تصور بعض األجناس‬ better by the acid-fast method..‫بشكل أفضل بكثير من خالل طريقة الحمض السريع‬ M. tuberculosis and M. leprae represent bacteria that are pathogenic to humans, the stain is of diagnostic value in identifying these organisms. ‫ وللصبغة‬،‫تمثل املتفطرة السلية واملفطورة الجذامية البكتيريا املسببة لألمراض لإلنسان‬.‫قيمة تشخيصية في التعرف على هذه الكائنات‬ What is the difference between Mycobacterium and other bacteria? ‫ما هو الفرق بني املتفطرة والبكتيريا األخرى؟‬ The cell walls of bacteria belonging to the genera Mycobacterium or Nocardia contain mycolic acid and give“false” gram-positive result in Gram stain. ‫تحتوي جدران خاليا البكتيريا التي تنتمي إلى أجناس املتفطرة أو النوكارديا على حمض‬.‫امليكوليك وتعطي نتيجة إيجابية جرام "خاطئة" في صبغة جرام‬ The medical importance of the acid-fast stain is for the diagnosis of the Mycobacterium species, which cause tuberculosis, leprosy, and other infections. ‫ التي تسبب مرض‬،‫تكمن األهمية الطبية للصبغة املقاومة للحمض في تشخيص بكتيريا املتفطرة‬.‫السل والجذام وغيرها من االلتهابات‬ The genus Nocardia, which is the causative agent for lung infections, will also be identified by the acid-fast staining method. ً ‫سيتم‬ ‫ وهو العامل املسبب اللتهابات‬،‫أيضا التعرف على جنس النوكارديا‬.‫ من خالل طريقة الصبغ السريع للحمض‬،‫الرئة‬  ‫أنماط النمو على أجار‬ Growth Patterns on Agar Recognizing different bacterial growth morphologies on agar plates is a useful and often crucial step in the ‫يعد التعرف على أشكال النمو البكتيري املختلفة على ألواح األجار‬ identification process..‫خطوة مفيدة وحاسمة في كثير من األحيان في عملية تحديد الهوية‬ A single clone of bacteria multiplying in the presence of nutrients to form a visible growth on the solid medium ‫ نسيلة واحدة من البكتيريا التي تتكاثر في وجود العناصر الغذائية‬ is called a bacterial colony..‫واضحا على الوسط الصلب تسمى مستعمرة بكتيرية‬ ً ‫لتشكل نم ًوا‬ Colony morphology is one among the various characters of bacteria. ‫مورفولوجية املستعمرة هي واحدة من الخصائص املختلفة‬.‫للبكتيريا‬ 1-Size of colony ‫حجم املستعمرة‬-1 Measuring the diameter of colony by millimeters ‫قياس قطر املستعمرة بامللليمتر‬ bacterial colonies classified according to the size to: : ‫ املستعمرات البكتيرية تصنف حسب حجمها إلى‬ a. Very small, about 1 mm or less (pin point)..(‫ مم أو أقل )نقطة الدبوس‬1 ‫ حوالي‬،‫ صغير ج ًدا‬.‫أ‬ b. Medium, about 1-2 mm in diameter..‫ ملم‬2-1 ‫ قطرها حوالي‬،‫ متوسطة الحجم‬.‫ب‬ c. Large, more than 3 mm in diameter..‫ مم‬3 ‫ قطرها أكثر من‬،‫ كبيرة الحجم‬.‫ج‬ 2-Edge / Margin of colony b. c. d. e. f. a. Entire. Undulate. Lobate. Rhizoid. Curled. Filamentous.  3-Color of colony ‫لون املستعمرة‬-3.(‫ البيوسيانني )األخضر املزرق‬.1 ‫تنتج العديد من‬ Many bacteria produce ‫البكتيريا أصبا ًغا‬ pigments which are of two.‫من نوعني‬ 1. pyocyanin types. (bluish green). ‫تنتج بعض البكتيريا أصباغ‬ ‫تفرز إلى خارج الخلية‬ a. Exopigment ‫البكتيرية مما يؤدي إلى تغيير‬.‫ على سبيل املثال‬،‫لون الوسط‬ Pseudomonas ‫ التي تنتج لونني‬aeruginosa 2. Some bacteria produce pigments which are fluorescein.(‫ الفلورسني )أصفر مخضر‬.2 excreted to the outside of the bacterial cell (greenish changing the color of the medium e.g. yellow). Pseudomonas aeruginosa which produce two colors  ‫ الصباغ الداخلي‬.‫ب‬ b. Endopigment ‫تنتج بعض البكتيريا أصباغ تبقى داخل الخلية‬ ‫ على سبيل املثال‬.‫البكتيرية‬ Some bacteria produce pigments which remain inside the bacterial cell. e.g. ‫ تنتجها‬:‫الصبغة الصفراء‬ Yellow pigment: Staphylococcus ‫بكتيريا‬.citrus produced by Staphylococcus citrus. White pigment: ‫ تنتجه‬:‫الصباغ األبيض‬ produced by ‫املكورات العنقودية‬ Golden pigment: produce.‫البيضاء‬ by Staphylococcus aureus. Staphylococcus albus. ‫ تنتجه املكورات‬:‫الصباغ الذهبي‬.‫العنقودية الذهبية‬ ‫ارتفاع املستعمرة‬-4 4-Elavation of colony a. Flat..‫ مستوي‬.‫أ‬.‫ نشأ‬.‫ب‬ b. Raised. ‫ محدب‬.‫ج‬.‫منخفض‬ c. Low convex. ‫ محدب أو‬.‫د‬.‫قبة‬ ‫أمبوناتي‬. d. Convex or dom..‫ حليمي‬.F e. Umbonate. f. Papillate.  5-Surface structure ‫ هيكل السطح‬-5 a. Smooth. a b.‫ سلس‬.‫أ‬.‫ خشن‬.‫ب‬ b. Rough..‫ حبيبي‬.‫ج‬.‫ حلق‬.‫د‬ c. Granular. c d.‫ حليمي‬.‫ه‬ d. Ringed. e. Papillate. e  6-. Shape ‫ شكل‬.-6 a. Circular..‫ دائري‬.‫أ‬ b. Irregular..‫ غير عادي‬.‫ب‬.‫ مشع‬.‫ج‬ c. Radiated..‫ ريزويد‬.‫د‬ d. Rhizoid..‫ خيطي‬.‫ه‬ e. Filamentous. 7-Blood hemolysis ‫ انحالل الدم‬-7 Some bacteria are able to lyse RBCs because they have hemolysin which is responsible of blood haemolysis..‫بعض البكتيريا قادرة على تحليل كرات الدم الحمراء ألنها تحتوي على الهيموليزين املسؤول عن انحالل الدم‬ ‫هناك ثالثة أنواع من انحالل الدم ألفا‬ There are three types of hemolysis alpha, beta, gamma..‫وبيتا وغاما‬ A. Alpha hemolysis ‫ انحالل الدم ألفا‬.‫ أ‬ Alpha hemolysis is a greenish color that surrounds a bacterial colony growing on the agar..‫انحالل الدم ألفا هو لون أخضر يحيط بمستعمرة بكتيرية تنمو على األجار‬ This type of hemolysis represents a partial hemoglobin of the red blood cells..‫يمثل هذا النوع من انحالل الدم الهيموجلوبني الجزئي لخاليا الدم الحمراء‬  B. Beta hemolysis ‫ انحالل الدم بيتا‬.‫ب‬ bacterial colony which leads to formation of Complete ‫انحالل بيتا هو‬ Beta hemolysis a blood hemolysis which appears as clear zone around the ‫انهيار كامل‬ complete breakdown ‫للهيموجلوبني في‬ colonies. of the hemoglobin of ‫خاليا الدم‬ the red blood cells. ‫مستعمرة بكتيرية مما يؤدي إلى تكوين انحالل الدم الكامل والذي يظهر‬.‫الحمراء‬.‫على شكل منطقة واضحة حول املستعمرات‬  C. Gamma ‫ انحالل الدم بأشعة غاما‬-‫ج‬ hemolysis ‫انحالل الدم غاما هو نقص انحالل الدم‬ ‫في املنطقة املحيطة بمستعمرة بكتيرية‬ ‫بسبب غياب الهيموليزين‬ Gamma hemolysis is a lack of hemolysis in the area around a bacterial colony because of absence of hemolysin.  nutrient gelatin media deep tubes used to demonstrate the Gelatin hydrolytic activity of gelatinase. ‫أنابيب عميقة من وسائط الجيالتني املغذية تستخدم إلظهار النشاط املائي‬ Hydrolysis.‫للجيالتيناز‬ The medium consists of nutrient broth supplemented with 12% gelatin..‫ جيالتني‬٪12 ‫يتكون الوسط من مرق مغذي مكمل بـ‬ 48 ‫بعد التلقيح بالطعن والحضانة ملدة‬ Following inoculation by stabbing and incubation for 48 ‫ يتم وضع الثقافات في الثالجة عند‬،‫ساعة‬ hours, the cultures are placed in a refrigerator at 4°C for ‫ دقيقة‬30 ‫ درجات مئوية ملدة‬4 30 minutes. ‫تنتج الثقافات التي تظل مسالة الجيالتيناز‬ Cultures that remain liquefied produce gelatinase and.‫وتظهر التحلل املائي السريع للجيالتني‬ demonstrate rapid gelatin hydrolysis. Re-incubate all solidified cultures for an additional 5 days..‫ أيام إضافية‬5 ‫إعادة احتضان جميع الثقافات املتصلبة ملدة‬ Refrigerate for 30 minutes and observe for liquefaction..‫ دقيقة والحظي التسييل‬30 ‫ضعيها في الثالجة ملدة‬ ‫تشير الثقافات التي تظل مسالة إلى‬ Cultures that remain liquefied are indicative of slow.‫بطء التحلل املائي للجيالتني‬ gelatin hydrolysis.