VIRUS 1 JOSE LUIS.docx

CM11: INTROUCCIÓN A LA VIROLOGÍA ================================ CARACTERÍSTICAS --------------- Aquellos que presenten la bicapa lipídica se denominan envueltos y los que no, desnudos. Esto va a ser muy relevante ya que está membrana lipídica es muy lábil, en el medio exterior puede verse fácilm...

CM11: INTROUCCIÓN A LA VIROLOGÍA ================================ CARACTERÍSTICAS --------------- Aquellos que presenten la bicapa lipídica se denominan envueltos y los que no, desnudos. Esto va a ser muy relevante ya que está membrana lipídica es muy lábil, en el medio exterior puede verse fácilmente afectada, y así determina la viabilidad del virus. Importante tener en cuenta de cara a la transmisión. **ENFERMEDAD DEL MOSAICO DEL TABACO** Durante el siglo XIX, cuando empezaba la microbiología, en la naturaleza algunas de las enfermedades, tanto de animales como de plantas se intuía que eran de naturaleza infecciosa. Pero como no se podían cultivar porque no crecían en los medios para bacterias no se podía establecer la causa, de hecho, fue a finales del siglo XIX que estudiando la enfermedad del mosaico del tabaco que se pudo demostrar que el agente causante de la enfermedad en la planta del tabaco era más pequeño que cualquiera de las bacterias: cogió́ hojas de las plantas infectadas, hizo un extracto y lo hizo pasar por unos filtros de porcelana con poros muy pequeños que bloqueaba el paso de las bacterias, de modo que lo que pasaba a través, no eran bacterias. Se vio que el filtrado seguía siendo infectivo, de modo que demostró́ que había unos agentes **mucho más pequeños que las bacterias** que eran capaces de causar esa enfermedad en el tabaco. Posteriormente se estableció́ que los causantes eran virus. Como vemos, pues, el tamaño de los virus es muy pequeño, a nivel de entre 200 y 300 nanómetros. Son tan pequeños que es imposible su observación en el microscopio óptico, están por debajo de la resolución óptica. Por ello, fue necesario el desarrollo de la microscopia electrónica para poder observarlos. Aunque esto no hay en la rutina clínica, por lo que estudiaremos los métodos que se utilizan. ESTUCTURA DEL VIRIÓN -------------------- El virión, como se ha dicho anteriormente, es la partícula del virus que se encuentra ya estructuralmente completa en su estadio extracelular. El virión está formado por una **molécula de ácido nucleico,** ya sea DNA o RNA, serán autoexcluyentes; es decir, o DNA o el RNA, nunca los dos. El RNA suele ser monocatenario y el DNA bicatenario, pero existen excepciones en ambos sentidos; es decir existen virus monocatenarios de DNA y al revés. Tenemos el genoma, los ácidos nucleicos, rodeados de una **envuelta proteica llamada cápside**. Además, hay más proteínas que suelen ser funcionales; tenemos la cápside, que son proteínas estructurales y, por otro lado, tenemos proteínas que suelen ser funcionales, como las **enzimas**. En algunos virus (aquellos con una envuelta externa de una membrana lipídica) tendremos esta envuelta que, además de la **membrana lipídica** tendrá́ diversas glicoproteínas. Podemos observar que los virus que no tienen más que el genoma (los ácidos nucleicos) y la cápside proteica se denominan virus sin envuelta o desnudos y los que tienen la membrana lipídica con glicoproteínas por fuera son virus envueltos. Esto es importante porque determina las características, no solo del tipo de infección, sino también de su transmisión. La , junto con el genoma es lo que denominamos nucleocápside. **OTRAS PROTEINAS** Además de las proteínas que formarán la cápside, tenemos proteínas que pueden incorporarse en el virión que, evidentemente, son esenciales para la **replicación** del virus; no se encuentran en la hospedadora y son imprescindible para la replicación. Por ejemplo, en el caso del HIV, el gen que codifica para la transcriptasa reversa, que va a permitir que el RNA del virus pase a DNA y, posteriormente, se puedan sintetizar las proteínas. Estas enzimas pueden ser diana de algunos antivirales. **GENOMA** Tenemos una molécula de **DNA o RNA**, que son excluyentes, y pueden ser mono o bicatenarios. Además, pueden ser en una orientación u otra; pueden denominarse positivo o negativo acorde con esto. Asimismo, el genoma puede ser lineal, circular y segmentado (como en el virus de la gripe), cosa que condiciona la variabilidad genética. Normalmente los viriones tienen una sola copia de las moléculas, aunque hay excepciones como en los retrovirus, que pueden tener dos copias del ácido nucleico. El tamaño del genoma también es variable y depende del número de genes que puede codificar; algunos virus pueden tener solo 3 genes y otros incluso 300 genes, de modo que hay una gran **diversidad** en cuanto al número de genes, dependiendo del no de proteínas que va a codificar.  **CAPSIDE** Viene del latín "capsam", que significa caja y hace referencia a la envuelta de los ácidos nucleicos para protegerlos sobre todo en la fase extracelular. Esta cápsida es una estructura que suele ser muy rígida hecha de proteínas que está normalmente formado por capsómeros que se van autoensamblado; son estas subunidades formadas a su vez por diversos polipéptidos. Es el autoensamblaje de esta cápside que forma la nucleocápside y finalmente el virión. La cápside, de hecho, puede tener diversas estructuras: helicoidal o icosaédrica formando distintos casos o compleja, como en el caso de los bacteriófagos. En los **desnudos**, los que no tienen envuelta, es la cápside la que contribuye a unirse a los receptores celulares de la célula hospedadora, y esto es importante para ver qué células infecta y qué células no. Es decir, cumplirá la función de adhesina, la que va a unirse a la mucosa y empezar la infección. Además, estas proteínas de la cápside son antigénicas, generarán una respuesta inmune por parte del hospedador y se pueden usar en el diagnóstico. **ENVOLTURA** Estos virus con envuelta sacan la membrana lipídica que los envuelve de las membranas de la célula hospedadora; de la membrana citoplasmática, nuclear o de sistemas como el retículo endotelial. Esto depende del sitio donde se replique el virus, que puede ser en el citoplasma o nivel del núcleo. En los virus envueltos tendremos la membrana lipídica que deriva de las membranas celulares del hospedador y también llevan sus propias proteínas codificadas por los genes del propio virus. Entre estas proteínas de los virus **envueltos** destacamos glucoproteínas,que son las que quedan expuestas en a la superficie a través de la membrana lipídica y son las adhesinas que se unen a las células hospedadoras, que tienen receptores específicos. Las glicoproteínas son antigénicas. Las adhesinas están codificadas por el virus, serán las que generarán la respuesta inmune, son inmunogénicas. Por ello, como se ha explicado antes, el hecho de tener o carecer la bicapa lipídica es relevante en la transmisión. Esa labilidad de los virus envueltos hace que necesite una transmisión más próxima o un contacto directo, secreciones, sangre, etc. No pueden permanecer mucho tiempo en el exterior: herpes, HIV... De lo contrario, los desnudos permanecerán mucho tiempo en el exterior, de manera que van a transmitirse algunos por vía fecal-oral, en las aguas, fómites, contacto directo mano a mano, por gotas, etc. Estos son más resistentes y, por ello, persisten mucho más en el medio ambiente, son más resistentes a la temperatura, al ácido gástrico y a la desecación: encontraríamos rotativos, que dan gastroenteritis, o el virus de la hepatitis A que es de transmisión fecaloral. Los virus **desnudos** pueden ser helicoidales o icosaédricos y en los **envueltos**, los virus helicoidales se van a plegar para quedar envueltos por la membrana posteriormente. Además, encontramos algunas estructuras que no encajan muy bien en estas definiciones y a los que denominamos virus **complejos**,como el de la viruela. El hecho de ser virus sin envuelta o con envuelta tiene mucha relevancia en muchos sentidos, de manera especial en su transmisión. **ESPECIFICIDAD** Pueden infectar células de animales, plantas personas, hongos y bacterias (en el caso de los fagos). Pero un virus en concreto solo infecta un estrecho rango de células, y esto es debido a que tienen una especificidad que se da por las adhesinas o las glicoproteínas de los virus envueltos que son reconocidas por receptores específicos de las células hospedadora. Esto hace que haya virus que solo infectan a una sola especie y, además, a unos tipos concretos de células, determinando así ́el tropismo del órgano que van a infectar. Es por ello, que el paso de virus de una especie a otra, como ha ocurrido con el coronavirus es difícil. Respecto al **reservorio**:la mayoría que causan infecciones humanas son de reservorio humano, pero algunos virus animales pueden llegar al hombre como puede ser el virus de la rabia. Algunos que llegan a humanos a través de artrópodos\... pero sobre todo los hay con reservorio animal que, si llegan al hombre por evolución, la infección es muchísimo más severa, porque este no está adaptado. Esto ha ocurrido con el coronavirus, el ébola, etc. CLASIFICACIÓN ------------- Existen varias clasificaciones, la más obvia y fácil de entender es a través de las características biológicas que hemos comentado: envuelto o desnudo, de genoma de DNA o RNA, cómo se replica, si es helicoidal, icosaédrico, pero también podemos agruparlos de acuerdo con la enfermedad que producen, dado que muchos virus muy distintos dan cuadros muy similares (los de la hepatitis agrupan virus muy distintos, desnudos como la A o envueltos como la B o la C) o según la transmisión y según el tipo de células que infecta, virus de plantas, de animales, bacteriófagos... La taxonomía de los virus no sigue la taxonomía binomial, es decir, los nombres no serán binomiales y en latín. **VIRUS SATELITE** Hay virus que por sí solos no pueden infectar y necesitan de una concepción con otro virus que es el "helper". Estos son **virus satélite:** le faltó algún gen para poder hacer todo el ciclo completo por ellos mismos. Por ejemplo, el virus de la hepatitis D o delta, que necesita la coinfección con el virus de la hepatitis B, ya que al de la hepatitis D le faltan los genes que codifican las glucoproteínas y de esto depende, ya que se lo proporciona el virus de la hepatitis B.  PARTICULAS QUE SON MÁS PEQUEÑAS QUE LOS VIRUS --------------------------------------------- **ADDENDUM, AUN MAS PEQUEÑOS** Los viroides son fragmentos más pequeños de RNA sin cápside ni ninguna otra envoltura que se disponen en una forma de horquilla y se encuentran en vegetales, y en algunos casos causan enfermedades en las plantas. Lo que hacen es causar una interferencia con el RNA del hospedador. ### CICLO BIOLÓGICO - Adhesión. - Entrada. - Descapsulamiento. - Síntesis. - Ensamblaje. - Liberación. La unión especifica entre la adhesina del virus y el receptor celular es el primer paso para que se de la infección. Una vez se ha producido la unión específica, en segundo lugar, el virus va a entrar en la célula para, en tercer lugar, desprenderse de la envuelta para liberar ácidos nucleicos en el citoplasma o en el núcleo. En cuarto lugar, se produce la replicación usando la maquinaria de la célula hospedadora, es decir, todo lo que necesite para la síntesis de las proteínas. Después, cuando tenga las proteínas virales sintetizadas y las moléculas, va a autoensamblarse juntos con la cápside y, por último, tendremos el virión que va a salir. Este sería el ciclo típico de replicación de un virus. Más en detalle: **1.- RECONOCIMIENTO Y ADHESION CELULAR** Determina el rango de hospedadores a los que puede infectar y a qué órganos puede atacar y a cuáles no. Además estas proteínas virales o adhesinas que le permiten ser reconocidas por las células hospedadora son también antigénicas, de modo que son reconocidas por anticuerpos que denominamos neutralizantes. Los anticuerpos se unen a la proteínas de superficie de la gripe para evitar así que se dé la infección, que se una al receptor de la célula hospedadora. Es decir, si hay inmunidad previa como anticuerpos vacunales o de una infección previa, se podrá producir esta neutralización que intentará evitar la infección. 3.- SINTESIS DE ACIDOS NUCELICOS Y PROTEINAS La síntesis molecular se da una vez tenemos los ácidos nucleicos liberados en el citoplasma o núcleo, se replica el genoma y se produce la síntesis de proteínas usando la maquinaria de la célula hospedadora. El proceso depende del tipo de virus, si es DNA o RNA, bi o monocatenario\... los virus de DNA de doble cadena es el caso que más se parece a un proceso celular normal: a partir del DNA se acaba teniendo un RNA mensajero que produce la proteína. En el caso de DNA monocatenario se duplica la cadena y luego tendremos el RNAm que podrá producir la proteína. En el caso de RNA tenemos situaciones ya más complejas; puede ser de cadena positiva o negativa, en el caso de ser negativa necesitará pasar a positiva para luego poder sintetizar las proteínas que necesitan. Se destaca el caso de los retrovirus, como el HIV; ellos llevan su retrotranscriptasa porque la enzima que necesitan para hacer el proceso no está en la célula hospedadora y el proceso es pasar el RNA a DNA monocatenario, luego bicatenario y luego a RNA que sintetizará la proteína. De modo que, la retrotranscriptasa que realiza el paso de RNA a DNA la incorporan los propios virus. Los virus pueden fácilmente mutar. Estas tienen consecuencias como generar diferencias en los receptores. Esto se ve especialmente en los virus de RNA.  La mayoría dan este tipo de ciclos de replicación, pero en algunos casos, una vez realizada la infección inicial puede establecer una latencia, como es el caso de la familia herpes y del HIV. Los dos tipos de latencia viral que se va a establecer en las células eucariotas pueden ser a través un **provirus**, que es cuando los ácidos nucleicos del virus se integran en el propio cromosoma de la célula hospedadora, de modo que puede permanecer de manera latente o seguir replicándose. Esto sería en el HIV. Hay otro modo que es el **episoma**: en los herpes, los ácidos nucleicos no se integran en el cromosoma de la hospedadora pero quedan circularizados dentro de la célula infectada pero sin integrarse en el cromosoma, quedan en el citoplasma. **CICLO DE LOS BACTERIOFAGOS**: Pueden establecer dos tipos de cilo; lisogénico o lítico. Cuando la bacteria se infecta, los ácidos nucleicos penetran en la bacteria y establecen este ciclo **lisogénico** si es un profago integrado en el cromosoma bacteriano y así puede transmitirse factores de virulencia a bacterias. Las toxinas están mediadas por fagos lisogénicos. También puede no integrarse en el cromosoma bacteriano, seguir la replicación, formar los fagos que acaban lisando la bacteria y liberándose al exterior para reiniciar el ciclo de infección en otras células, que sería el **ciclo lítico**. A veces, de un paso, puede pasar al otro ciclo por distintas circunstancias ambientales.  ### PATOGÉNESIS **VIROMA:** Respecto a los virus que podemos tener pueden ser muchos y muy variados; desde los fagos que van a infectar las bacterias que tengamos en nuestro microbioma hasta los virus que van a infectar nuestras propias células y que se van a quedar en nuestro cuerpo, y distintos elementos virales que se encuentran dentro, en nuestros cromosomas. Son muy variados y no ha sido hasta la secuenciación masiva que no se ha empezado a ver todo el espectro que forma el viroma. INFECCIONES VÍRICAS Y SÍNDROMES ------------------------------- TRANSMISIÓN ----------- Exposición: - A **virus exógenos**: la vía de exposición sobre todo a virus exógenos está condicionada por el tipo de estructura de los viriones. El ejemplo más claro y típico es la exposición o [transmisión fecal-oral]. Son básicamente virus desnudos porque permanecen en el ambiente durante tiempo; es el caso de rotavirus, norovirus o el virus de la hepatitis A. - La reactivación de **virus endógenos**: los virus latentes pueden reactivarse, y suelen hacerlo debido a ciertos estímulos, y esta reactivación da posteriormente la clínica. Por ejemplo, el HIV. **EXPOSICION RESPIRATORIA:** La exposición por la mucosa del tracto respiratorio puede ser la entrada de virus que no dan infección a nivel respiratorio. Encontramos, por un lado, los virus respiratorios,y, por otro lado, virus que dan infecciones sistémicas, pero tienen la orofaringe como puerta de entrada, como el sarampión, la rubéola, parotiditis\... La **transmisión** es por gotas de secreciones respiratorias que entran en contacto con las mucosas del tracto respiratorio (nasal, nasofaringe u orofaringe) o con la conjuntiva (conjuntivitis en personas susceptibles). Las gotas, que son de igual o más de 5 micras, pesan y no quedan es suspensión, por lo que quedan a distancias relativamente cortas y no van a más de metro, metro y medio. De manera intermediaria los fómites también representan un papel, se depositan en estas (superficies inertes donde pueden permanecer viables durante un tiempo, dependiendo del virus). En las transmisiones por gotas no solo incluiríamos el virus de la gripe, también el coronavirus, rinovirus, etc. También tenemos virus que van a transmitirse por gotas y que darán infecciones sistémicas, por ejemplo, el virus del sarampión, la rubéola, la parotiditis, etc. Si nos centramos en los virus respiratorios, que son los que dan infecciones a este nivel, debemos saber que hay muchísimos diferentes que pertenecen a familias muy distintas. De hecho, a lo largo del siglo pasado se fueron aislando, y todas las manifestaciones suelen ser bastante congruentes, similares entre sí. **VIRUS RESPIRATORIOS:** Son muy diversos, pertenecientes a muchas familias de virus, entre las que encontramos el virus de la gripe, rinovirus, el adenovirus, diversos coronavirus, etc. De hecho, en este siglo se ha obtenido conocimiento de diversos coronavirus. Algunos son desnudos, otros envueltos. Por ejemplo, el virus respiratorio sincitial, que es relevante en niños, genera bronquiolitis muy severa. **MUCOSA RESPIRATORIA ENTRADA DE ALGUNAS INFECCIONES SISTÉMICAS:** la mucosa respiratoria puede ser la entrada de infecciones sistémicas como en el caso del sarampión coma la parotiditis y la rubéola, involucrados en enfermedades exantemáticas. En el caso del sarampión la puerta de entrada son las secreciones respiratorias coma que llegan a la mucosa respiratoria, aquí se infectan las células epiteliales de la mucosa respiratoria y de ahí se va a designar primero a través de los ganglios linfáticos hasta dar la primera viremia que se va a diseminar a una serie de órganos distintos los que finalmente se producirá un rash en la piel, que es el responsable de este exantema y se produce de manera secundaria a una viremia, habitualmente esta respuesta celular o este rush es producido por los linfocitos T. La cara de una persona Descripción generada automáticamente con confianza baja. TRANSMISIÓN POR CONTACTO DIRECTO -------------------------------- De la misma manera que en el caso de la infección respiratoria, tenemos virus que nos van a dar la infección de las mucosas y de piel, u otros virus que tienen esta puerta de entrada, pero van a producir una clínica distinta. Los más frecuentemente relacionados con infecciones en la piel y mucosas son - El **papilomavirus**: formado por más de 100 serotipos, nos va a dar verrugas genitales que denominamos condilomas y afectación a nivel del tracto genital femenino a nivel de poder evolucionar hasta dar una neoplasia. De hecho, la infección por el papilomavirus es la infección por transmisión sexual más frecuente. - El del **molluscum**: virus de estructura un poco más compleja, con transmisión por contacto directo que puede ser sexual o no y contacto por toallas en de personas infectadas puede ser contacto indirecto. Las lesiones características del molluscum acaban desapareciendo, duran unos meses, pero es fácil que por autoinoculación,por rascado, podemos hacer que persistan más las lesiones. - Los **herpes simples 1 y 2** **y** en menor medida el **3**: el 1 y dos suele estar más relacionado con el herpes labial y el dos a nivel de tracto genital, aunque evidentemente por las prácticas sexuales podemos encontrar ambos en ambos lados. La familia de los virus herpes está formada por virus bastante distintos, pero todos ellos se caracterizan por establecer latencia y, en general, necesitan este contacto directo porque su transmisión es por contacto directo a través de las secreciones y nos dan clínicas muy distintas. Encontramos desde los simples 1 y 2, el 3 que es la varicela y el 4 que da mononucleosis infecciosa o enfermedad del beso y también el citomegalovirus. Aunque la transmisión es básicamente por secreciones,también encontramos que el virus de la varicela se puede transmitir desde gotas de secreciones respiratorias y, de hecho, en este virus en concreto las gotas son la vía de transmisión principal. ### PATOGÉNESIS VIRAL **IMPORTANTE**. Como ya hemos dicho, la interacción de la adhesina del virus y el receptor de la célula es clave para saber cuál es el tejido o el órgano que va a afectar de manera específica. Cuando algunos virus infectan al ser humano le puede causar enfermedad al replicarse en las células ya sea porque directamente causen daño en los tejidos infectados o de manera secundaria debida a la reacción del propio sistema inmune para contraatacar, que acaba dado una repercusión clínica a veces contraproducente. Tipos de infección: - **Local**: muchos virus dan una infección local en la puerta de entrada, siendo este el caso de los rinovirus, que son virus respiratorios más frecuentes en resfriados comunes. También los rotavirus, que causan enteritis. Dan este daño local en la misma puerta de entrada. NO se produce una diseminación vía hematógena; es decir, no hay viremia y el virus se queda en la misma puerta de entrada.Por este motivo la infección también es más corta al no haber viremia. Esta infección a nivel local se suele resolver de modo que el virus desaparece, no quedan latentes. - **Sistémica**: el daño celular se da en un sitio lejano al de la puerta de entrada, por ejemplo, el virus del sarampión o el de la rubéola, cuya puerta de entrada es respiratoria pero la afectación va a ser diseminada vía hematógena porque habrá una viremia (el paso de los virus a la sangre), y por eso el periodo de incubación será más largo antes de que se den las manifestaciones clínicas y finalmente se dan las manifestaciones que dan la enfermedad. También puede diseminarse a través de rutas de las neuronas, como en el caso de la rabia. **PROGRESION DE LA ENFERMEDAD VIRAL:** Hay una transmisión, una replicación del virus en la puerta de entrada que se puede quedar allí o diseminarse por una viremia. Puede haber este periodo de **incubación**, que es variable dependiendo de si hay o no viremia, puede ser que haya una replicación y el virus se replica sin manifestaciones clínicas por lo que hablamos de infecciones **asintomáticas**, pero no va a haber repercusión clínica sino que será una infección subclínica. Pero habrá casos que da manifestaciones clínicas. Hablaremos de la respuesta inmunitaria para estos casos en los que ya se produce la infección.  Por otro lado, esta **presentación será detectada por los linfocitos T citotóxicos, pero también participarán en esto NK e interferones**, que se producen por las células infectadas. De modo que las células infectadas acumula en su interior proteínas víricas, y las acumulan tanto en el interior como en la superficie celular durante la replicación, se exponen a través de estos MHC I y esto sirve para que las T citotóxicas puedan reconocer que la célula está infectada, cosa que hacen gracias a los receptores que tienen en la superficie los linfocitos T (TCR). Estos receptores TCR reconocen los MHC, se produce la unión y la célula T libera una serie de factores citotóxicos que atacan la célula infectada. Muchas veces esta respuesta inmune puede ser más dañina para el propio organismo que el efecto que tiene el virus en la célula. Pero no solo contribuyen las células T citotóxicas, si no también los NK, que atacan células que no tienen MHC I, de modo que algunos virus pueden evitar que sus proteínas queden expuestas en la superfície. Es la acción conjunta de estos NK que secretan factores citotóxicos, junto con las células T citotóxicas, que atacan las células infectadas por los virus. Además, las células citotóxicas producen una serie de citoquinas a modo de interferón gamma o TNF y esto contribuye a que las células de alrededor sepan de la presencia de células infectadas. Las células infectadas por virus producen también la liberación de proteínas pequeñas o interferones, que actúan con el sistema inmune para protegerlos, ya que evitan la replicación del virus interfiriendo directamente en su capacidad de replicación. El conjunto de elementos del sistema inmune y la respuesta de las propias células infectadas es lo que da la respuesta inmune, que en algunos casos puede ser más dañina que el propio virus. **LESION CELULAR:** Cuando el virus está infectando dentro puede dar alteraciones de las células; si no se lisan las células pueden haber **lesiones citopáticas** como cuerpos de inclusión por acumulación de las proteínas del virus en las células infectadas. Puede haber diversos tipos de lesiones citopáticas. En los virus que lisan, evidentemente, veremos la **lisis celular,** y a esto puede contribuir la respuesta inmune; el efecto citolítico de los linfocitos T CD8 y de los NK. En la imagen vemos un cultivo celular en el que se observa el efecto citopático de la destrucción de la capa de cultivo celular debido al efecto del virus. Una vez producida la entrada del virus, podemos tener una infección **aguda**, como en el caso de infecciones producidas por virus respiratorios (influenza, por ejemplo) que se resuelven y el virus desaparece completamente. Pero hay otras infecciones que pueden establecerse de manera **crónica**, como la hepatitis B o C. Además, algunos virus establecen infección **latente**, como los herpes. Finalmente, en algunos casos, algunos virus son capaces de acabar evolucionando y transformar las células infectadas en células que primero son displásicas y finalmente neoplásicas; es decir, son virus oncogénicos, capaces de producir neoplasias, como el papilomavirus. **EVOLUCIÓN DE UNA INFECCIÓN VIRAL** **Infecciones agudas que se resuelvan como el virus de la gripe el rinovirus.** **Infecciones crónicas a Menudo genera clínica como el virus de la hepatitis** **infecciones latentes, como el herpes o el HIV** **virus oncogénicos transforman las células hospedadoras en neoplasias. Como ejemplo papiloma virus, Epstein bar virus virus de la hepatitis B Y C, herpesvirus 8 (kaposi sarcoma)** **DIAGNOSTICO: el diagnóstico de virus está dado por varios métodos diagnósticos. Diagnóstico directo e indirecto. Los diagnósticos directos tenemos la detención del antígeno, cultivo celular, amplificación de ácido nucleico prueba conocida como PCR, y microscopía electrónica que se utiliza solo para investigación. Los métodos indirectos se utiliza la serología.**  En la imagen las células verdes están infectadas con el virus que buscamos. También con técnicas de **inmunocromatográfica**. Las de amplificación de ácidos nucleicos permiten detectar de manera cualitativa la presencia o ausencia de un virus y, además, cuantificar (carga viral) cuántas copias de virus hay, cosa que es importante en infecciones crónicas o para ver si el tratamiento evoluciona bien o no. En el cultivo celular, al ver el efecto citopático, penábamos que había un virus, y se identifica el mismo mediante inmunofluorescencia, los anticuerpos están marcados con un flurocromo dirigido a ese virus. En la detección de antígenos hay diversas técnicas, la inmunocromatografía son las que se. Hacen con el coronavirus. La inmunofluorescencia es otra detección, que de hecho hay centros a partir de un aspirado nasofaríngeo se hace la inmunofluorescencia directa, que detecta que células se encuentran infectadas por el virus. **Métodos indirectos:**Hay infecciones que las diagnosticamos mediante la detección de anticuerpos, mediante serología. Muchas de ellas para estas infecciones crónicas como puede ser la hepatitis. Debemos saber que no todas las muestras serán útiles para el diagnóstico de virus. En el caso de las vías respiratorias, un esputo no es demasiado útil, mientras que, si lo será un lavado bronco-alveolar, o aspirados nasofaríngeos. ### PREVENCIÓN Y CONTROL Depende de la exposición y de los tipos de virus, de la manera de transmisión. Pero las precauciones universales de manipulación de muestras de sangre y otros fluidos corporales son las máscaras, guantes, es decir, la **higiene**, a grandes rasgos. Para prevenir la infección puede ser efectiva la inmunización mediante **vacunas**; de las distintas infecciones de etiología vírica hay una que se erradicó que es la viruela, que se erradicó gracias a la inmunización masiva en los años 80. ### IMPACTO **¿QUE OTROS USOS TIENEN LOS VIRUS?** - Como **terapia biológica**: se usan como vectores (son manipulados con ingeniería genética) para poder llevar determinados genes a células diana concretas, son virus defectivos, pero que pueden administrar ácidos nucleicos de manera específica a ciertas células. Esto tendría como uso potencial la terapia para algún cáncer como el de cabeza y cuello, en el que, de hecho, se han usado con éxito adenovirus modificados para su tratamiento. Los adenovirus solo infectan las células cancerígenas, se diseminan en ellas y finalmente lisan el tumor.  - **Vacunas**: se usan, por ejemplo, para inmunizar animales de la rabia. Se podrá dejar en el medio ambiente para que lo ingieran los animales.  - **Terapia génica**: virus asociados a adenoviruspara la fibrosis quística, donde se sustitiye un gen por otro, pero está en ensayos clínicos aún. - **Terapia con bacteriófagos**: como solo infectan bacterias de manera específica, se puede usar para el control de algunas infecciones o biocontrol de enfermedades alimentarias. Se ha usado a nivel experimental en infecciones por pseudomonas multirresistentes, pero también para infecciones como la listeria, que se transmite por alimentos, y se ha propuesto tratar los alimentos con estos fagos. También para el control de granjas, en la agricultura para infecciones por xanthomonas (infecciones vegetales). ### ADDENDUM: CORONAVIRUS - HCoV-229E (alfa) - HCoV-NL63 (alfa) - HCoV-OC43 (beta) - HCoV-HKU1 (beta) Dan infecciones respiratorias más o menos leves, pero con el siglo XXI hemos conocido ya dos epidemias (esta es la tercera, en este caso pandemia a nivel mundial). **El SARS-CoV** (2002) y el **MERS-CoV** (2012) emergieron con unas formas mucho más virulentas. Todos estos virus tienen como **reservorio animal el murciélago,** que son su origen. Pero para llegar al hombre necesitan un **intermediario**,que podría ser un mamífero; en el caso del SARS II, que se originó en China, era un mamífero de pequeño tamaño mientras que en el caso del MERS era un animal de mayor tamaño. En ambos casos se produjeron bastantes muertes (10% de letalidad en el SARS y 35% en el MERS), sin embargo, no tantas como el coronavirus actual. A estos dos coronavirus del siglo XXI, tenemos que añadirle el **SARS-CoV-2,** que es el virus que sufrimos actualmente. Este es bastante más parecido al SARS que se originó en China que, al MERS del 2012, por eso, el nombre científico es SARS-CoV-2. La enfermedad que produce es conocida como COVID-19. **¿Cómo un virus animal salta esta barrera entre especies?** La barrera suele ser especifica, pero hemos visto que desde los murciélagos han pasado a otros mamíferos en el caso del MERS y del SARS del 2002. En este caso sabemos que estos coronavirus tienen una tasa de **mutación** muy elevada que, unida a la facilidad de **recombinación**, hace que estas glicoproteínas que están en su superficie pueden variar fácilmente y sean capaces de infectar nuevos hospedadores. Así, hacen el salto de una especie a otra y, además, logran mayor infectividad respecto al SARS-CoV-1 y al MERS. El posible origen es que se haya dado esta selección natural directamente en el hospedador animal, o en el humano cuando saltó la barrera de especie. La vía de transmisión se vió que se daba mediante los aerosoles.  **PATOGENESIS:** Usa los **receptores del enzima conversor de angiotensina 2** (ACE 2), y este receptor le permite infectar una serie de células concretas, se da la decapsidación dentro de la célula^.^ El receptor **ACE2** se encuentra, entre otras células, en la mucosa del alveolo,donde inicia la infección. Pero sabemos que en algunos casos se produce una tormenta inflamatoria muy importante que es la que va a dar en los pacientes esta clínica tan brusca y grave que en algunos casos acaba siendo letal si no se controla. Por eso, el tratamiento en estos casos suele juntarse con tratamientos antiinflamatorios que van a intentar evitar que se dé esta progresión final, por eso se aconseja que el tratamiento antiinflamatorio se haga en fases iniciales con tal de evitar esta dramática evolución inicial que puede seguir progresando. **DIAGNÓSTICO MICROBIOLÓGICO:** PCR, detectan 2 a 3 genes del coronavirus Antígenos Serología secuencia genómica para determinar la variante específica **PREVENCIÓN Y CONTROL** mascarillas, higiene de manos, distancia física, ventilación vacunas **OPCIONES TERAPÉUTICAS EN INFECCIONES SEVERAS** Remdesivir, Tocilizumab, Dexametasona.