Consanguinité - Amélioration Animale - PDF

AMELIORATION ANIMALE : LA CONSANGUINITE Introduction : - Sélection artificielle différente de sélection naturelle - Modification de la fréquence des gènes → moins de gènes - Diminution de la variabilité génétique - Si nombre limité de reproducteurs → niv...

AMELIORATION ANIMALE : LA CONSANGUINITE Introduction : - Sélection artificielle différente de sélection naturelle - Modification de la fréquence des gènes → moins de gènes - Diminution de la variabilité génétique - Si nombre limité de reproducteurs → niveau de consanguinité augmente ! Limiter la consanguinité en parc : échange entre parcs (coordination), castration chimiques ou définitive, groupe unisexe, … HOMOZYGOTIE Consanguinité = augmentation de l’homozygotie : - Homozygotie = 2 x le même allèle du même gène - Individus reproducteurs homozygotes → allèles transmis à la descendance - C’est l’augmentation de l’homozygotie qui augmente le risque de pathologie (consanguinité ne dit pas d’office pathologie, ça augmente les risques) - Fixation des gènes → recherchés pour fixer les standards de race OU PAS → tares génétiques Fixation de standards → tares Pas de fixation → apparition de tares possibles quand même Homozygotie → 2 types : - Pas d’ancêtre commun chez les 2 parents homozygote → allèles semblables dans descendance - Ancêtre commun chez les 2 parents homozygote → allèles identiques dans descendance PHOTO Parentés = 2 individus sont apparentés s’ils possèdent au moins 1 ancêtre commun. 2 individus apparentés sont reliés l’un à l’autre par une suite d’individus, comprenant l’ancêtre commun, et constituant une chaîne de parenté. La parenté concerne des paires d’individus. Coefficients de parenté = probabilité d’obtenir en tirant au hasard des gènes identiques entre 2 individus A et B. (exemple : 50% entre frères et sœurs, 25% entre grand-père et petite fille, …) Individu consanguin = individu qui a potentiellement des gènes identiques par descendance. Un individu est consanguin si ses 2 parents sont apparentés. Consanguinité = mesure de l’identité entre gènes. C’est la probabilité d’obtenir des gènes identiques (valeur de 0 à 1) chez un individu. GENEALOGIE ET PEDIGREE Caractérise les relations entre individus : - Officiels (société d’élevage) ou non (arbre généalogique) Officiel : pedigree CN, studbook CV, … - Différents types de présentation : arbre, accolade, … COEFFICIENT DE CONSANGUINITE (TUYAU !!!) Calcul de coefficient de consanguinité : 𝟏 𝑭𝒊𝒏𝒅 = ∑ ( )𝒏 𝒙 (𝟏 + 𝑭𝒂𝒏𝒄 ) 𝒊 𝟐 - F ind = coefficient de consanguinité de l’individu - I = le nombre de chemins possibles d’un parent à l’autre - N = nombre d’éléments ou de générations sur le chemin ou chaine de parenté - F anc = coefficient de consanguinité de l’ancêtre → s’il n’y en a pas, on ne le prend pas dans calcul Pour calculer le nombre de chemin possible : 1. On part de l’enfant (individu potentiellement consanguin) 2. Puis on remonte à 1 des 2 parents 3. On remonte jusqu’à l’ancêtre commun (s’il y en a, si plusieurs alors SOMME) 4. On redescend à l’autre parent de l’individu consanguin (mais on ne redescend pas jusqu’à l’enfant !!) En rurale → effet d’accroissement de la consanguinité de 10% en production animale. EFFETS DE LA CONSANGUINITE CHEZ LES ANIMAUX DE PRODUCTIONS Conclusion : - Effets néfastes sur les caractères de production et de reproduction - Baisse de la variabilité génétique (jusqu’à disparition du gène) - Augmentation des tares génétiques - Dépression de la consanguinité = tous les effets néfastes de la consanguinité Limiter l’apparition de la consanguinité en production - Limiter l’utilisation des mâles les + utilisés (et leur descendants) - Système de choix de reproducteurs → logiciel d’accouplement (Optim Bull en Belgique) - Centralisation des valeurs de : Coefficient de consanguinité des individus Coefficient de parentés entre individus Généalogie qui remonte le + loin possible - Choix d’un seuil de consanguinité → variable selon et pays Seuil de consanguinité : - En général, valeurs inférieures à 5% acceptables - Etablir un équilibre entre consanguinité et progrès génétique - Exemple : BBB = 3.25% → grande tares (plus de césarienne, …) Prim’Holstein = 6.25% → moins de soucis/tares En CN et CT → gros pb car accepte jusqu’à 20% … EN LABORATOIRE INBRED Lignée inbred = lignée purement consanguine → 100% consanguinité, homogénéité génétique. Même ancêtre commun et parents. - Recherche = avoir individu homogène, avec 1 seul couple à l’origine - Pour créer 1 lignée consanguine → il faut 20 générations Avantages : - Très bonne connaissance de la génétique - Identification facile des gènes (si différence phénotypique, très facile de savoir quel gène ?) - Faible variation génétique (voir nulle) → facilité de voir les différences - Beaucoup de lignée et de modèles possible/disponible Inconvénients : - Fragilité des individus, avec difficultés d’élevage - Plus grande sensibilité aux mutations et à l’environnement (impact + grand de l’environnement) - Peu représentatif de la population naturelle (voir pas du tout) OUTBRED Lignée outbred : - Colonies de très grande taille - Eviter au max les croisements consanguins - Hétérogénéité génétique - Objectif →